构型与构象概念的探讨

对立体化学中构型和构象两个概念进行了比较，归纳出两者的异同及联系．对构型异构体和构象异构体的差别做了简单的介绍     

采用密度泛函理论系统表征苷氨酸构象体的研究

采用密度泛函理论,B3LYP/6-311 G**模型化学,计算绘制苷氨酸分子内三个键转动产生的三个自由度的势能面,用于准确和系统表征苷氨酸所有的构象异构体.从势能面上,取得了总共14个苷氨酸构象异构体,其中包括取得一个新的苷氨酸构象异构体.研究所有的苷氨酸构象异构体之间相互转换,并且探讨了苷氨酸构象异构体的对称性问题.     

构造、构型与构象辩析

构造、构型和构象都是表征分子结构的，其中构造是在二维平面上的描述分子结构的，而构型和构象是在三维立体空间描述分子结构的。它们是有机立体化学教学中易混淆的三个概念，尤其是构型和构象，两者之间划不出明显的界线。本文是笔者根据自己多年来的教学体会，对构造、...     

用镧系离子探针研究水溶液中缬氨酸构象

利用镧系离子做~1H NMR探针研究了在水溶液中缬氨酸构象,在搜索构象时,调整构象参数,用计算机进行分析处理。结果表明,缬氨酸分子在水溶液中的构象以一组构象异构体平衡共存,并简单地讨论了三种主要构象百分数与空间几何效应大小的关系。     

紫外线吸收剂邻羟基二苯甲酮优势构象的研究

采用密度泛函法在B3LYP/6-311G(d,p)水平上研究邻羟基二苯甲酮几种构象异构体的相互转化过程。通过研究得到各驻点的几何结构和能量值,发现4种构象异构体在常温下可以相互转换,其中IM1中有分子内氢键,能量最低,为绝对优势构象。为进一步确定其在氯仿溶剂中的优势构象,采用GIAO法在相同的水平上对优化好的中间体进行NMR理论计算,通过将理论计算得到的1 H NMR化学位移值与实验值进行对比,发现构象异构体IM1的1 H NMR化学位移计算值与实验值相符合,从而确定IM1也为实际中的最优势构象。     

天然产物绝对构型的测定

确定手性分子的绝对构型对了解手性分子在生物体系中的功能有非常重要的意义。手性光学法和核磁共振法为确定天然产物绝对构型和构象的有力工具，本文对近几年来这两种研究方法在天然产物绝对构型研究中的应用进行了综述。     

尼克酰胺核苷构象稳定性的理论研究

采用从头算(HF与MP2)和密度泛函理论(DFT)方法,在3-21G 和6-31+G?水平上研究了尼克酰胺核苷(NR)的构象.分别探讨了在气相及液相(水和氯仿)中 NR 分子和一水合物异构体的相对稳定性,分析了溶剂分子的参与对NR异构体的相对稳定性和几何结构参数的影响.结果表明：孤立的NR分子在气相中存在36种稳定构象,其中最稳定的为南式构象NR-S,而最稳定的北式构象为NR-K’,能量比前者高出10.6 kJ/mol (ΔG298K).NR 分子中酰胺基团优势构象为反式,ω,P 或γ参数的改变可以为 NR 分子提供大约8.4~23.7 kJ/mol(ΔG298K )稳定化能.不管是南式还是北式褶皱,最稳定 NR 分子构象中都存在多根分子内氢键,且5’-OH 基团都为顺式构象(γ≈-63°).溶剂效应使一部分NR分子构象相对稳定性降低,而一部分则升高,改变了NR分子各构象的相对稳定性顺序.水分子的加入与酰胺基团结合形成氢键,对NR分子的构型影响较大,而与糖环上羟基结合形成氢键,则影响较小.     

有机物的分子结构和同分异构现象

根据共价键理论，有机物的碳原子都是通过杂化轨道与其它原子成键的，通过不同条化方式：可呈四面体形、平面三角形和直线形等，所以，当碳原子之间或碳原子与其它元素的原子成键形成分子时，分子的几何图形是多种多样的。由于分子结构中不对称因素的存在或化学健的旋转受阻，产生构到异构和顺及异构。一定构型的分子，由C－Cσ键的旋转，相同构型的分子又产生了不同的几何图形，这样又有构象异构现象存在。     

1,4-二氟丁二烯3种构型构象内转换过程的DFT研究

采用DensityFunctionalTheory(DFT)理论方法对 1,4 二氟丁二烯 (DFBD) 3种构型分子构象内转换过程的机理进行了研究 .用QST2方法找到构象内转化过程的过渡态 ,并通过内禀反应坐标 (IRC)计算加以论证 .计算结果表明 ,cis ,cis DFBD ,cis ,trans DFBD和trans ,trans DFBD3种构型分子构象内转换过程的势垒分别为 7.5 7,6 .6 0和 5 .86 (× 4 .19J·mol- 1)     

抗HIV香豆素类化合物的构效关系研究

用AMI方法对20个四环香豆素类化合物进行了电子构型、电荷分布、优势构象的理论研究,着重对其构效关系进行了讨论．结果表明,具有药效作用的分子都有相似的优势构象．它为该类药物分子设计和相关酶结构分析提供了新思路．     

3—甲基—3—戊烯—2—酮构象和振动频率的从头…

以ＳＴＯ－３Ｇ和３－２１Ｇ基组使用从头计算方法对３－甲基－３－戊烯－２－酮的９种构型进行了几何优化，比较了不同构型的稳定性，并讨论了内旋转势垒。计算结果表明：１．有３种可能的比较稳定的构象，２．（ｔｒａｎｓ，ｓ－ｔｒａｎｓ）和（ｔｒａｎｓ，ｓ－ｃｉｓ）两者可能同时存在，并相互转化。３．理论计算的振动频率与实验测量值符合很好。     

立体化学中的几个概念问题

在现有的几本有机化学教科书里,立体化学中的几个概念和术语还不统一,而且某些叫法很易使学生们在概念上产生混淆。就这些问题提出我的看法。一、对映异构体、非对映异构体和构型异构体对映异构体一般是指互为镜像的异构体。通常,不包括构象异构体。可是在有的教     

硝酸酯分子结构和水解机理研究（Ⅱ）─—硝酸乙酯

该文运用ＳＣＦ—ＭＯＡＭ１方法，通过能量梯度全优化计算，求得了硝酸乙酯的反式和傍式两种分子构象，两种构象间的能量差为３．５１ＫＪ／ｍｏｌ。傍式比反式稳定，反式—傍式旋转势垒为２．３４ｋＪ／ｍｏｌ。由ＡＭ１法计算，制作了硝酸乙酯的碱性ＳＮ２水解位能曲线，求得活化能为６３．６０ｋＪ／ｍｏｌ。讨论了水解过程中反应体系的几何构型和电荷分布的变化规律。     

丙氨酸三肽的稳定构象的探究

探究快速地获得丙氨酸三肽的稳定构象。利用Gaussian09程序包中的 H F/6-31G （d ，p ）方法得到丙氨酸三肽势能面。固定二面角φ2、ψ2的度数，改变二面角φ1、ψ1，计算了丙氨酸三肽不同结构的相对能量，这些结构的相对能量的图像趋势大致相同，可知两组二面角之间影响不大。使用丙氨酸二肽稳定构象所对应的骨架二面角的组合，获得丙氨酸三肽的初始构型，使用B3LYP/6-31G（d ，p）方法优化获得其稳定构象。这种方法可为多肽分子寻找稳定构象提供1种简单而快速的方法。     

3-取代吲哚-2-酮类化合物异构体的密度泛函理论计算

用B3LYP／6-31G方法对3-取代吲哚酮类化合物异构体进行了计算．计算分四部分进行：初始模型Ⅰ-Ⅳ的计算;模型Ⅰ的4′位置被甲基取代的计算;完全为E构象模型的计算;模型Ⅰ-Ⅳ乙烯基上的氢被甲基取代的计算．结果表明：以Z构象为稳定构象的分子可能与相应激酶结合时有较高的活性,而以E构象为稳定构象的分子则、活性一般不高．     

N2H4异构化和构象变化的量子化学研究

采用量子化学的方法,通过对N2H4的所有可能的键角和二面角变化过程进行势能面扫描,获得了相应的能量和构型之间的关系,从而研究了N2H4的异构化机理和构象的变化.     

基于量子化学方法研究杯[4]芳烃4种构象与苯二酚异构体的相互作用

采用量子化学方法,构建了4种构象的杯[4]芳烃(Cx4)分别与邻苯二酚、间苯二酚、对苯二酚的构型,采用DFT-B3LYP/STO-3G*基组对构型进行了优化,得到了最优化的超分子构型,通过频率计算得到了超分子相互作用的稳定化能和吉布斯自由能,并对结果进行了讨论,对杯芳烃固定相的研究有很好的指导意义.     

大分子构象态的隧道赝自旋模型

本文根据大分了构象理论和实验结果,提出了大分子构象转变的隧道模型,从微观机制出发, 用量子力学和统计力学描述了构象电子体系;讨论了大分子的构象态、能态以及构象转变时所发 生的相变问题,得出了与现有理论和实验一致的结论．     

分子力学在构象分析中的应用

主要采用MM2对一元取代和二元取代环已烷的构象进行了定量分析.在优化构象下,计算得到的结果与传统观念不相符;因此提出了前优化构象模型法,在前优化构象下的计算结果与传统观念完全一致.所以,可把前优化构象法应用于有机分子的构象分析中.     

金刚烷的交叉三环异构体的构型手性构型和非手性构型数

指出FujitaS.的文章的错误，给出球环化合物异构体数的一般方法。以金刚烷的交叉三环异构体的构型、手性构型和非手性构型数的计算作为说明。