邻苯二甲酸二甲酯降解菌的研究进展

邻苯二甲酸二甲酯(Dimethyl Phthalate,DMP)是工业上使用量最大的塑化剂之一,大量的DMP释放到环境中并长期残留,造成严重污染,威胁人类健康.目前公认的最有效的降解方法是利用微生物的代谢途径将DMP作为碳源进行降解,最终转化为无危害的其它物质.我国的科研学者已经发现具有DMP降解能力的微生物有40余种,包括真核微生物和原核微生物.通过对这些菌种的属水平、降解速率及降解条件对比分析发现,这些DMP降解菌既具有一些共性,也有各自独特的特性.根据这些共性和特性,推测出一些至今未被发现的现象,同时希望对今后DMP降解菌的深入研究提供一定的数据支持.     

东北红豆杉紫杉二烯合成酶cDNA克隆及其与紫杉醇产生菌基因组DNA的Southern杂交(英文)

为进一步研究紫杉二烯合成酶的作用机理和紫杉醇生物合成代谢调控机制,采用RT-PCR技术从东北红豆杉(Taxus cuspidata)树叶中获得了紫杉二烯合成酶基因片段,将该片段克隆在载体pGEMT-easy vector上,并转化到E.coliJM109中,经EcoRI酶切鉴定后,对阳性克隆进行序列测定,获得紫杉二烯合成酶基因片段长度为909 bp,编码303个氨基酸,与GenBank中收录的紫杉二烯合成酶的同源性达到98%;对获得的紫杉二烯合成酶基因和紫杉醇产生菌HQD33基因组DNA进行了Southern杂交。结果初步证实了紫杉二烯合成酶存在于通过内生真菌发酵生产紫杉醇的生物合成途径中。为利用分子生物学手段研究通过内生真菌发酵生产紫杉醇生物合成的代谢调控和构建高产紫杉醇基因工程菌株提供了强有力的理论指导。     

东北红豆杉细胞GGPPS基因cDNA的克隆

牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶是红豆杉细胞紫杉醇生物合成途径中的关键酶。试验采用RT-PCR技术从东北红豆杉中克隆GGPPS基因片段,将GGPPS基因片段与pMD20-Tvector连接,转化E.coli DH5α,对阳性克隆进行序列测定。生物信息学分析结果表明,获得GGPPS基因片段长度为371 bp,与GenBank中收录的GGPPS同源性达到99%。为从内生真菌紫杉醇生物合成途径中克隆关键酶基因和高产紫杉醇基因工程菌株的构建提供了借鉴。     

油菜素内酯合成途径相关基因的研究进展

油菜素内酯是一种甾类化合物,广泛存在于各类植物中,对植物生长发育起积极作用,有助于植物有机物的积累,并且能够显著提高植物抗旱性、抗盐性.植物中油菜素内酯合成途径的研究在一定程度上已较为完善,其途径中相关基因的功能也在逐步研究中,发现这些基因也能够起到一些重要的生物学作用.将近年发现的油菜素内酯合成途径中各基因的生化功能进行介绍,并对这些基因在不同生物学过程中各自的功能进行综述,旨在为后续的研究中在更多植物中对这些基因进行更好地分析和利用提供可行性帮助和理论参考.     

蒺藜苜蓿SBP-box转录因子基因家族全基因组分析

从全基因组水平研究蒺藜苜蓿SBP-box转录因子基因家族,系统地鉴定出22个SBP-box家族基因,根据基因结构分析、结构域的差异和系统发育分析将这些SBP-box基因分成5个亚家族.基因比较分析表明SBPbox基因家族扩张主要是通过部分复制及串联重复事件来实现的.基因表达模式分析表明蒺藜苜蓿SBP-box基因具有器官特异性并且参与干旱胁迫反应.这些结果为进一步研究蒺藜苜蓿SBP-box家族基因的功能与进化提供理论参考.     

源于微生物的抗逆基因研究进展

抗逆微生物可以在不利生存的逆境条件下生长,有关抗逆基因的研究受到广泛关注.在耐盐基因、耐碱基因、耐酸基因、耐热基因、抗辐射基因、抗高渗基因、抗干旱基因等方面取得的研究成果表明,微生物抗逆性基因具有重要的应用价值.     

磁体

<正>形形色色的趋磁性细菌是一个迷人的微生物类群,在磁场中这个类群的微生物本身都呈现出一定方向的指向能力.在北半球,这些细菌朝北指向,并朝着磁场的S极方向游动,在南半球这类微生物的情况正相反.这种称为趋磁性的行为可能是由于细菌在其细胞内与膜结合的结构中沉积有磁性矿物质的颗粒——即磁体的缘故.虽然,在不同的菌种中所存在的磁体其形状和组成可能不同,但它们的大小都有一个较窄的范围,并都具有一个稳定的两极磁铁的性质（即具有永久的N极和S极）.对这类微生物的研究,由于许多种类难以培养而受到了阻碍.然而,最近由于分离到了几个新菌株而获得了一些成功.此外,为了获得非培养类型（例如,毛吸管法;Wolfe等1987）的无菌培养物,所有包括应用磁场的巧妙方法已经设计成功.正是通过这些努力,连同场的研究,关于趋磁性细菌的生理学、生态学和进化方面都有了一些新发现.根据它们氧的需要以及在磁体中的磁性矿物质至少可以把趋磁性细菌分成3种不同的生理类型.实际上,不同生理类型的数量多少及其分布并不取决于一种对沉积物的天生需要,而取决于铁、氧和硫化物的可利用性.此外,磁体可能对它们环境的磁性具有很大的影响,并已经发现保存在古代的沉积物中.从进化的观点来看,磁体存在于两个系统以上不同细菌世?     

斑马鱼HAS2基因的克隆、抗体制备及分析

HAS2是斑马鱼心脏发育的一个标志基因,为了利用斑马鱼动物模型进一步研究HAS2基因在心脏发育中的功能,采用生物信息学结合RT-PCR的方法获得了斑马鱼HAS2基因的片段.将所得的片段插入原核表达载体pGEX-4T-1中,并将重组质粒(pGEX-4T-1-HAS2)转化大肠杆菌(E.coli)BL21,IPTG诱导表达GST-HAS2融合蛋白;通过尿素洗涤沉淀蛋白并切胶回收纯化融合蛋白,免疫新西兰大白兔制备多克隆抗体,并用Western blot检测抗体活性.生物信息学分析结果表明:斑马鱼HAS2基因的开放阅读框含有1658 bp,编码552个氨基酸;SDS-PAGE电泳分析显示,IPTG诱导表达的融合蛋白相对分子质量约为4.5×104;Western blotting分析表明,制备的抗体具有良好的特异性.     

土壤微生物群落结构影响因素的探讨

土壤微生物群落结构影响土壤生态系统的功能,对影响土壤微生物群落结构的因素进行研究具有很重要的意义.基于对已有研究成果的分析,对影响微生物群落结构的影响因素进行系统分析.研究表明,不同林地类型对土壤微生物数量和种类影响具有明显不同,土壤微生物群落结构随着植被自然恢复演替而演替,土壤微生物总量在不同植被下均表现出明显的根际效应;土壤微生物均匀度指数和丰富度指数在不同有机质含量的土壤间差异较大,不同pH范围内具有不同的土壤微生物群落结构;土壤水分通过影响土壤溶液的浓度、含氧量和理化性质,对土壤微生物群落结构产生影响;温度的变化可以使微生物群落结构发生改变;施肥种类和数量的不同,对土壤微生物群落结构的影响不一致,矿区不同区位段侵蚀土壤微生物活性指标均存在一定程度上的差异.     

三江平原大豆根系和水稻根系土壤细菌的分离与鉴定

大豆根系和水稻根系土壤的微生物类群中,细菌数量最多,放线菌数量次之,真菌数量最少,且根系土壤微生物总数明显高于根外土壤微生物总数.对三江平原大豆根系和水稻根系土壤中的细菌进行分离,根据细菌个体特征、菌落形态特征及其生理生化特性进行初步鉴定.结果表明,大豆根系土壤中主要分布着芽孢杆菌属、黄单胞菌属、气单胞菌属、甲基单胞菌属、假单胞菌属、根瘤菌属6个菌属;水稻根系土壤中分布着微球菌属、黄杆菌属、根瘤菌属、奈瑟氏球菌属、葡萄球菌属5个菌属.同时,探讨了土壤部分理化性质对大豆和水稻根系细菌数量的影响,明确了根系细菌数量与土壤含水量、有机质含量、pH等有一定的相关性,对今后大豆和水稻田间施肥,提高粮食产量具有一定的指导意义.