QSHR中理化参数描述矩阵的病态参数剔除

在定量构效关系（ＱＳＡＲ）研究中各理化参数ｘｉ构成的描述矩阵，由于参数之间的相关性往往呈病态性或奇异性，由此获得的ＱＳＡＲ回归方程则不稳定，本文提出了一种新方法即病态指标剔除法：选择一个适当的临界值α∈（０，１），找出相关系数大于或等于该临界值所涉及的指标，剔除部分病态指标；再作逐步回归从而获得稳定优良的ＱＳＡＲ回归方程，可望在ＱＳＡＲ中广泛应用．     

用神经网络方法对卡巴醌系列抗肿瘤药物的QSAR研究

运用人工神经网络方法研究了卡巴醌（Ｃａｒｂｏｑｕｏｎｅ）系列药物对用Ｌ－１２０１白血病细胞接种的小鼠延长生命的活性，与传统的回归方法进行比较，可得到更为精确的结果，并且在活性预测方面有很好的效果。     

醚对幼鼠毒性的QSAR研究

用25种醚类化合物DFT-B3LYP／6-311G**全优化计算结构参数:分子最高占用轨道(E(HOMO))和最低空轨道能(E(LOMO))、分子次最高占用轨道(E(NHOMO))和次最低空轨道能(E(NLOMO))、分子总能量(ET)、氢原子所带的最高正电荷(QH)、最负原子的静电荷(Q-)、分子偶极矩(μ)和分子体积(V),对幼鼠毒性(pC)进行定量构效关系(QSAR)研究。结果表明: 醚类化合物对幼鼠的毒性与分子总能量(ET)和分子次最高占用轨道能(E(NHOMO))相关性较好,成功地建立了25种醚类化合物对幼鼠毒性的构效关系式,找出了影响醚类化合物对幼鼠毒性的主要结构因素。     

三维定量构效关系最新研究进展

在简要回顾了经典的Ｈａｎｓｃｈ方法的基础上，重点讨论了４种典型的３Ｄ－ＱＳＡＲ方法，即分子形状分析（ＭＳＡ）、距离几何学方法（ＤＧ）、比较分子力场分析（ＣＯＭＦＡ）和假想活性位点阵（ＨＡＳＬ）的基本原理，并介绍了人工神经网络在３Ｄ－ＱＳＡＲ的原理和应用     

一些有机物对蝌蚪麻醉活性的QSAR研究

用DFT-B3LYP方法,在较高基组6-311G*〖KG-*3]*水平下,全优化计算了49种有机化合物。从中获得分子最高占用和最低空轨道能(E_HOMO和E_LUMO)、前线轨道能级差(ΔE=E_HOMO-E_LUMO)、分子次最高占用和次最低空轨道能(E_NHOMO和E_NLUMO)、分子总能量(E_T)、氢原子所带的最高正电荷(Q⁺_H)、最负非氢原子的静电荷(Q^-)、辛醇／水分配系数(log K_OW)、分子偶极矩(μ)和分子体积(V)等描述符。结合文献中标题化合物对蝌蚪的麻醉活性值(log 1/C),由线性回归方法成功建立QSAR模型。其中,方程(2)的复相关系数R²=0.933 2,交叉验证系数q²=0.930 1,标准偏差SE=0.274,Fisher 检验值F=121.800,故其具有较好的预测能力。由此推断,标题物对蝌蚪的毒性作用分为两步,首先穿过细胞壁在细胞内富集,以log K_OW描述;其次与亲核试剂发生亲电反应,以E_LUMO和E_NHOMO表示。     

药物分子设计与定量构效关系研究进展

介绍了药物分子设计与定量构效关系的发展概况与研究进展（２Ｄ－ＱＳＡＲ，３Ｄ－ＱＳＡＲ，ＭＤ－ＱＳＡＲ），为开发新药及化工、医药的发展提供了信息．     

芳烃类化合物对发光菌急性毒性的QSAR研究

采用分子动力学MM+和半经验AM1算法优化并计算24种芳烃类化合物的16种量子化学参数,通过主成分分析法和回归分析法对化合物的量子化学参数进行筛选,所得最佳参数与芳烃类化合物对发光菌的急性毒性进行定量构效关系研究(QSAR)。所建多元线性回归方程的确定系数(R2)和留一法交叉检验系数q2分别为0.83和0.990。毒性实验值与预测值的相关性较好,模型具有良好的稳定性和预测能力。     

脂肪醇结构参数与其物理性质的相关性

以脂肪醇为研究对象,选取3种结构参数,并与脂肪醇热容、沸点、临界温度、临界体积关联,拟合成4个回归方程,其相关系数分别为0．9995,0．9849,0．9716和0．9900,均达到优良级．该方法计算简单,结构选择性达到唯一性表征．为预测脂肪醇热容、沸点、临界温度和临界体积提供了有效的方法．     

分光光度法中汞光度性能与显色剂的定量构效关系(QSAR)研究

现代科学研究产生海量数据,如何从中发现、总结出规律是研究者面临的重要问题之一.以构效关系(QSAR)基本原理为基础,从分光光度法中汞显色剂分子的结构特征出发,选择并利用连接性指数.边缘邻接指数和2D自相关等分子结构参数,通过线性回归方法获得了汞的摩尔吸光系数和最大吸收波长与分子结构参数间良好的线性相关模型.相关系数在0.6～0.8之间,标准偏差为0.20-0.29.     

基于文化差分进化算法的最小二乘支持向量机及QSAR建模

针对最小二乘支持向量机最佳算法参数难以确定的缺陷,提出了基于文化差分进化算法的最小二乘支持向量机(Cultural Differential evolution Algorithm Least Square Support Vector Machine,CDE-LSSVM)。该算法通过新型的文化差分进化算法优化确定最小二乘支持向量机核宽度参数和惩罚系数,建立具有良好预测性能的模型。同时,针对药物定量构效关系(Quantitative Structure-Activity Relationships,QSAR)模型具有高度非线性、变量之间存在相关性的特征,采用CDE-LSSVM建立HIV-1蛋白酶抑制剂的药物定量构效关系模型。模型具有很好的拟合精度与预测精度,且优于最小二乘支持向量机、BP神经网络和径向基神经网络。     

定量构效关系研究进展及其应用

定量构效关系是目前国际上一个比较活跃的研究领域.本文简要介绍了定量构效关系的发展历史及定量构效关系研究中常用方法等,其中较为详细地介绍了三维定量构效关系中广泛应用的CoMFA方法.综述了定量构效关系在环境污染物分析以及在农药、医药设计中的应用,并对定量构效关系研究的发展趋势进行了展望.     

药物分子设计中定量结构-活性关系计算方法的研究

【目的】发展一种新的定量结构-活性关系(简称"构效关系"QSAR)计算方法。【方法】双层QSAR预测模型的第1层是分子的理化性质参数,第2层是分子片段结构参数。两组权重系数{ak}和{bl}分别指派给理化参数和片段参数。在双层QSAR预测模型中引入迭代的双最小二乘(IDLS)计算方法,把单层次的构效关系发展成二层次、双方向的预测网络;在训练集中两组系数用最小二乘法(或偏最小二乘法、主成分分析等)交替求解,直至收敛。【结论】二层次、双方向的QSAR预测模型不仅能够提高预测能力,具有一定的信息反馈和学习功能,而且赋予QSAR更多的信息分析能力。     

基于3种建模法的食源性 ACE抑制二肽 QSAR 研究

以自组建的食源性血管紧张素转化酶（angiotensin I‐converting enzyme ,ACE）抑制二肽为研究样本,采用氨基酸描述子VHSE（principal component score vector of hydrophilicity ,steric ,and electronic properties）对ACE抑制二肽进行表征后,比较偏最小二乘（partial least square regression ,PLS）、支持向量机（support vector machine ,SVM）及主成分分析（principal component analysis ,PCA）‐SVM相结合的3种建模方法对ACE抑制二肽的QSAR（quantitative structure‐activity relationship）建模。结果显示,对于食源性ACE抑制二肽,3个模型的拟合能力无明显差异,SVM模型的预测能力略强;对其进行权重投影分析发现,C末端氨基酸较N末端氨基酸对其活性的影响更为明显。     

基于MATLAB环境的辅助农药分子设计计算机系统

开发了基于MATLAB环境的辅助农药分子设计计算机系统.系统采用模块化设计,人机界面友好,并针对农药分子设计过程中定量构效关系研究(QSAR)的特点,实现了多种QSAR建模算法的集成.应用表明系统对新农药分子设计具有一定指导意义.     

新型氯喹酸酯类除草剂的定量构效关系分析

为了寻找活性更高和作用更温和的除草剂,研究了氯喹酸(3,7-二氯-8-喹啉羧酸)酯类衍生物的结构与活性的关系。合成了12种相关酯类衍生物,并测定了这些酯的生物活性。用Hansch多元线性回归分析方法建立了3个相关的定量构效关系(QSAR)方程。QSAR方程表明,此类化合物的生物活性与取代基的空间效应和电子效应参数呈线性关系,而且综合两种效应的构效关系方程优于单一效应的构效关系方程。对QSAR方程分析结果表明,烯丙基(—CH_2—CH=CH_2)取代的氯喹酸酯是活性最高且作用温和的除草剂。     

自相关拓扑指数与取代芳烃化合物理化参数的定量关系

采用自相关拓扑指数为分子描述符，研究取代芳烃化合物的水溶解度和脂水分配系数与分子拓扑结构的定量关系，建立了良好的构效关系方程，为研究有机污染物的理化性质、环境行为提供了一种有效的方法．     

中位芳基吡唑卟啉荧光量子产率与分子结构的定量关系研究

化合物的发光性能主要由该物质的分子结构确定.卟啉作为重要的光化学和光生物学化合物一直备受关注.从实验室合成的中位芳基吡唑卟啉的分子结构描述参数出发,着重考察了前线轨道能级、旋转半径等参数与卟啉荧光量子产率之间的关系,并建立了各参数与该类化合物荧光量子产率之间的线性模型,从理论上定量阐述了不同取代基对化合物荧光量子产率的影响.     

固体化合物中阳离子的标准熵与原子参数的相关性研究

基于统计热力学的配分函数,提出原子结构参数Qi=(ni-1)0.5·mβii,βi=0.075n-0.5i.Qi对基态原子及其简单离子实现唯一性表征,并与70种固体化合物中阳离子标准熵(Sθm)具有良好的相关性:Sθm=-13.8818+31.1548Qi,r=0.9949;引入mi的线性方程为:Sθm=-12.8366+30.2386Qi+0.0848mi,R=0.9959.它的估算值与文献值非常吻合.