氯酚类化合物辛醇／水分配系数定量-结构相关性研究

辛醇/水分配系数（10gKow）是表征有机化合物环境行为重要参数之一。建立了分子连接性指数和logKow与分子表面积的定量-结构关系模型：IgKow=5.38^3Xc^v＋1.03（R=0.963,n=20）AT5=209.72^3Xc^v-41.4538^3Xc＋263.03（R=1.000,n=20）,计算了20个氯酚类化合物的logKow和分子表面积,计算值与实测值吻合的很好。计算多氯酚类化合物的Kow值和分子表面积是可行的。     

分子树拓扑指数与卤代烷标准熵的相关性研究

采用非隐氢图和原子熵价（di)建构分子树拓扑指数（^mT)及其分支指数：叶指数（^m^′TX）和干指数（^mTc）。其中^0TX,^1Tc与88种气态卤代烷标准熵（Sm^θ）显著相关,其复相关系数R为0．9877,明显优于Kier的^0xv,^1xv(其R仅为0．7597）。     

氯代苯酚类化合物分子连接性指数与光催化活性关系研究

对水中有机物定量结构-光催化降解活性相关(QSAR)模型的研究工作较少.用分子连接性指数法成功地建立了11个氯酚类化合物光催化降解反应速率常数与分子连接性指数之间的QSAR模型.二氧化碳生成速率常数模型为:KCO2=43.445Χpc-61.124Χp+76.23(R=0.947,n=9);表观降解速率常数模型为:Kapp=2.85lgKow-2.974Χp-0.13 ( R=0.954,n=11).计算值与实验值吻合的很好,表明所提取的结构参量较好地反映这类化合物的结构特性与光催化活性的关系.取代基相同的条件下,反应速率常数与简单分子连接性指数有很好相关性,这说明化合物的光催化降解性能受分子结构特别是空间因素影响较大.     

一个新的分子连接性指数及其应用

定义了一个新的分子连接性指数δ=Z^V/r,即对Kier,Hall的分子连接性指数进行修改,考虑了氢（H）元素对化合物性质的影响,把H元素也看成一个质点.用这个新的分子连接性指数δ对卤代甲烷的标准生成焓△fHm进行相关性研究,用SPSS拟合,得相关系数为R=0.985,是一个较好的线性相关关系式：△fHm=14313.79-17105.1^0X.     

酚类化合物对硝化颗粒污泥活性抑制的预测模型

基于拓扑理论计算了16种酚类化合物的分子形状指数(mK)以及原子类型电性拓扑状态指数(En).应用多元线性回归及最佳变量子集方法,建立了这些拓扑指数与酚类化合物对硝化颗粒污泥活性抑制的定量结构-活性相关模型.该模型的传统判定系数R2为0.932,逐一剔除法的交叉验证系数R2cv为0.874,通过R2,F,R2Adj,R2cv,VIF,FIT等检验,证明该模型具有良好的稳健性和预测能力.     

苯系统的Randic指数

有机物分子的分子图G=（V,E）的Randic指数R（G）定义为∑uv∈E1/√d（u）d（v）,其中d（u）表示顶点u在G中的度．针对苯系统的规则性,利用平面图中边和面之间的关系,给定苯系统的六边形内面个数和最外层六边形内面个数,得出环状苯系统及凸的苯系统的Randic指数的一些计算公式．     

用手性连接性指数预测手性有机酸的保留指数

在修正分子连接性指数mXtv的基础上,建立能够揭示分子手性信息的手性连接性指数mcXtv.通过多元回归方法研究18种手性有机酸(8种羟基酸和10种氨基酸)的薄层色谱保留指数-RM与mcXtv的定量构效关系(QSRR),经最佳变量子集回归建立最佳二元QSRR模型,其传统判定系数R2为0.915,逐一剔除法的交互验证系数Q2为o.878.结果证明,该模型具有良好的稳健性及预测能力,优于Kier的连接性指数.根据进入该模型的2个手性连接性指数ocXvp,4cXvpc可知,影响手性有机酸保留指数的主要因素是分子的二维结构特征及其手性特征.新建手性连接性指数对手性有机酸的保留指数表征是合理有效的.     

取代芳烃对蝌蚪的急性毒性的拓扑研究

以蝌蚪为模型生物，测定了部分取代芳烃类化合物在静态实验系统中的24h急性毒性效应．应用Matlab程序计算了化合物的价分子连接性指数和电拓扑指数，建立了化合物的生物毒性（-1gLC50）与^0x^v，E1，E17的最佳相关模型：-1gLC50=0．109＋0．640^0x^v-0．609E1—0．099E17（R=0．942，F=41．777，x=0．3441）．该模型经Jackknife检验，具有可靠性与稳健性．为定量评估和预测该类化合物的生物毒性提供了理论依据     

拓扑指数与路径数预测单硫醚气相色谱保留指数

在分子拓扑化学理论的基础上,根据分子中原子的特性,用分子中原子的平衡电负性对分子图进行着色,在距离矩阵的基础上结合分子中各原子的支化度构建一组新的拓扑指数NPm（m=1,2,3）,利用多元线性回归技术将单硫醚在4种不同极性固定相的气相色谱保留指数与NPm（m=1,2,3）和路径数（P2,P3）建立相应的定量结构-保留关系模型（QSRR）,并用这种模型对单硫醚的气相色谱保留指数进行预测,结果表明预测结果和实验值吻合较好．     

羧酸类化合物pKa的定量构效关系

对38种有机一元羧酸的电拓扑状态指数（En）及价分子连接性指（mxv）进行了计算,建立了有机羧酸 pKa与拓扑指数的数学模型.最佳七元回归模型为： pKa=6.271+2.391E8-0.470E39-0.171E38+10.082E6-0.730E40-0.192E17+1.867 4xv．其Ｒ=0.967,s=0.299 7,优于文献研究结果.通过Jackknife法检验该模型具有总体稳健性.结果表明,电拓扑指数能够较好表征分子结构特征,有效揭示影响羧酸pKa的本质因素.     

一类细胞凋亡诱导剂的结构特征研究

许多抗癌药物通过引起癌细胞的凋亡来达到治疗目的,因此开发能诱导癌细胞凋亡的药物一直是癌症研究的热点.以153个结构各异的具有caspase-3激活作用的细胞凋亡诱导剂为研究对象,通过三维定量构效关系(3D-QSAR)分析,得到了一个基于位阻场、静电场、疏水场、氢键供体场和受体场参数的最优比较分子相似性指数法(CoMSIA)模型.该模型(Q2=0.51、R2ncv=0.89和R2pred=0.82)具有良好的内部一致性和预测能力,通过对模型的等值线图分析发现:(1)R2取代基提高诱导剂活性的因素包括位阻大、负电性大、有亲水性和具有氢键供体作用;(2)位阻适中和/或具有氢键供体作用的R4取代基,以及位阻小和/或亲水的R1取代基对提高分子的活性是有利的;(3)N-甲基-N-苯基-1-萘胺类细胞凋亡诱导剂具有正电性的A环3号位或C环7号位取代基,以及具有负电性的B环1号位取代基有利于提高诱导剂的生物活性.对该模型的分析更有利于认识细胞凋亡诱导剂的分子特征,并为设计和开发新型细胞凋亡诱导剂提供理论指导.     

烯烃气相色谱保留指数的预测

通过对部分烯烃在不同固定相不同柱温下的1031个样本集的气相色谱保留指数值(RI)与其部分参数关系的研究,发现RI与拓扑指数(mQ)、双键原子杂化状态指数(DHSI)、支链对双键的极化效应指数(PBD)、固定液极性值(CP)及柱温(T)的关系可表示为:^RI=-58.138 57.7460Q-8.2591Q 0.120T 0.807CP 36.460PBD 7.919DHSI(R=0.9989)继以留一法(Leave-one-out,LOO)进行交互检验,相关系数RCV=0.9977,说明所建模型具有良好的稳定性和预测能力,较好地揭示了烯烃类化合物气相色谱保留指数RI随固定相极性、柱温的改变而变化的规律.     

分子电距矢量对酚类物质色谱保留值的分析

用MEDV描述子对102个酚的分子结构进行表征,对MEDV矢量和其气相色谱保留指数之间建立了分子结构-色谱保留值定量关系(QSRR).多元线性回归十参数模型的复相关系数达到了0.943 6,逐步回归九参数模型复相关系数为0.943 6,交互检验的R CV值为0.844 8,表明模型对样本具有一定的稳定性和预测能力.     

Combining docking and comparative molecular similarity indices analysis （COMSIA） to predict estrogen activity and probe molecular mechanisms of estrogen activity for estrogen compounds

Estrogen compounds are suspected of disrupting endocrine functions by mimicking natural hormones, and such compounds may pose a serious threat to the health of humans and wildlife. Close attention has been paid to the prediction and molecular mechanisms of estrogen activity for estrogen com- pounds. In this article, estrogen receptor a subtype （ERa） -based comparative molecular similarity indices analysis （COMSIA） was performed on 44 estrogen compounds with structural diversity to find out the structural relationship with the activity and to predict the activity. The model with the significant correlation and the best predictive power （R^2= 0.965, Q^2 LOO： 0.599, R^2 pred ： 0.825） was achieved. The COMSIA and docking results revealed the structural features for estrogen activity and key amino acid residues in binding pocket, and provided an insight into the interaction between the ligands and these amino acid residues.     

70种单质标准熵的研究

用lgM、(lgM)2等分子参数为独立参量,通过回归方法建立数学模型来预测70种单质的标准熵[Sm0/(J.mol-1.K-1)],其回归方程为:Sm0=-5.056 20.704lgM 4.019(lgM)2,R=1.000.其预测结果表明该模型的原理简单,方法实用,结果可靠.     

用比较分子力场和比较分子相似性指数分析方法对氮蒽类化合物抗癌活性的三维定量构效关系研究

用比较分子力场(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)对一系列与DNA结合的氮蒽类化合物的潜在抗癌活性进行了3D定量构效关系的研究,对模型中的一些参数进行了优化以期得到最好的三维定量构效关系模型,优化结果显示用CoMSIA构建的模型优于用CoMFA构建的模型.通过CoMSIA分析,用训练集所建立的模型有较好的统计性(20个化合物,q2=0.666,r2=0.916),测试集化合物的预测活性与实验值有很好的一致性.本文还给出了主要分子力场的等势线图.     

A novel molecular distance edge vector as applied to chemical modeling of quantitative structureretention relationships： Various gas chromatographic retention behaviors of polychlorinated dibenzofurans on different polarityvarying stationary phases

Based on the identical group as a pseudo atom instead of a typical atom, a novel modified molecular distance-edge （MDE） vector μ was developed in our laboratory to characterize chemical structure of polychlorinated dibenzofurans （PCDFs） congeners and/or isomers. Quantitative structure-retention relationships （QSRRs） between the new VMDE parameters and gas chromatographic （GC） retention behavior of PCDFs were then generated by multiple linear regression （MLR） method for non-polar, moderately polar, and polar stationary phases. Four excellent models with high correlation coefficients, R=0.984--0.995, were proposed for non-polar columns （DB-5, SE-54, OV-101）. For the moderately polar columns （OV-1701）, the correlation coefficient of the developed good model is only 0.958. For the polar columns （SP-2300）, the QSRR model is poor with R=0.884. Then cross validation with leave-one out of procedure （CV） is performed in high correlation with the non-polar （Rcv=9920.974） and weakly polar （Rcv=921） columns and in little correlation （Rcv=0.834） with the polar columns. These results show that the new μ vector is suitable for describing the retention behaviors of PCDFs on non-polar and moderately polar stationary phases and not for the various gas chromatographic retention behaviors of PCDFs on the different polarity-varying stationary phases.     

酚类化合物色谱保留指数的估计与预测

用根据非氢原子类型分类、基于非氢原子相对电负性和非氢原子间距离等进行计算得到的分子电性距离矢量(MEDV)为描述子,对酚类化合物结构进行表征.用多元线性回归(MLR)方法,研究并建立了酚类化合物定量结构-色谱保留(QSRR)关系的10变量模型,其相关系数为0.9512;采用SPSS统计处理软件对变量进行逐步回归(SMR)筛选后,建立了8变量的QSRR模型,其相关系数为0.9508.上述模型对102种酚类化合物色谱保留的预测值与实验值能较好吻合,留一法交互检验的结果分别为Rcv=0.9269和Rcv=0.9377.结果表明所建模型具有良好的稳定性和预测能力.     

西部小城镇供水厂站制水成本分析

在参考现有的国内供水厂站费用指标及国内外费用指标费用模型的基础上,结合重庆市城镇的人工和材料价格,得出重庆市小城镇给水取水工程和净水工程的造价指标值和造价公式,再根据西部其他地区的设备运杂费费率及调整系数即得到适用于西部小城镇的供水厂站投资估算指标.最后,在分析成本构成的基础上,结合投资指标费用模型,对西部小城镇供水厂站的制水成本进行了分析,得到了西部小城镇供水厂站的单位制水成本.     

Holographic QSRR of polychlorinated dibenzofurans

A new molecular representation, molecula rhologram, is employed to investigate the quantitative relationships between gas chromatographic retention indices (GC-RI) and molecular structures of polychlorinated dibenzofurans (PCDFs). Together with application of partial least squares (PLS) regression, the quantitative structure-retention relationship (QSRR) model is constructed for GC-RI of 135 PCDFs. This new QSRR model presents high statistical quality and predictive value with crossvalidation correlation coefficient q2Loo values of 0.998, and non-crossvalidationcorrelation coefficient r2 of 0.998. 100 PCDFs are selected randomly as training set and the rest as testing set. The resuit of PLS regressive analysis of training set yields r^2 of 0.998 and q2Loo of 0.997. The GC-RIs of testing set are predicted, and the correlation equation indicates that the model based on training set has excellent ability to predict the GC-RIs of PCDFs in testing set.