利用基因表达谱芯片研究东方田鼠和小鼠感染日本血吸虫前后基因的差异性表达

利用大、小鼠基因表达谱芯片分别研究了Balb/c小鼠感染日本血吸虫7d时肺组织、东方田鼠感染日本血吸虫7d时肺组织、12d时的肺和肝组织基因差异表达方式.结果表明,小鼠感染日本血吸虫7d时肺丝氨酸蛋白酶抑制剂(Serine protease inhibitor) 基因表达上调,同时没有免疫相关基因的表达变化;与之相反,东方田鼠感染日本血吸虫7d 时肺丝氨酸蛋白酶抑制剂基因没有表达变化,非特异性免疫相关基因,如溶菌酶(Lysozym e) 和各类组织蛋白酶(Cathepsin)基因表达上调,而且肺内特异性免疫相关基因如CD74、MHC Ⅱ和MHC Ⅰ等表达上调.这一现象得到东方田鼠感染日本血吸虫12d时肺和肝中特异性免疫和非特异性免疫相关基因的上调表达的进一步证实.而且,东方田鼠感染日本血吸虫12d时肺中丝氨酸蛋白酶抑制剂基因表达下调,肝组织中胰岛素样生长因子-1(Insulin-like growth factor 1,IGF 1)基因表达下调.提示日本血吸虫适宜性宿主小鼠和非适宜性宿主东方田鼠感染日本血吸虫前后两者有相反的基因表达方式.东方田鼠抗日本血吸虫机制可能包括免疫防御机制和阻止虫体获得宿主源促生长发育物质机制.     

香菇漆酶活性及转录表达对不同温度的响应特征

以香菇新808为材料,研究不同温度培养下漆酶活性及其基因表达调控特征.通过平板培养法测定4种温度（20℃、25℃、28℃和30℃）对香菇菌丝圈及氧化圈的影响,通过液体发酵测定漆酶活性,并采用qPCR技术检测漆酶同工酶基因的相对表达量.结果表明:不同温度条件下,漆酶的活性及转录表达存在明显差异.25℃培养条件下香菇菌丝圈及氧化圈最大,漆酶活性最强（114.11 U/mL）;而30℃时的菌丝圈和氧化圈最小,漆酶活性低（47.52 U/mL）.不同温度培养下漆酶同工酶基因出现差异性表达,以25℃为对照组,20℃培养条件下9个漆酶基因（Llac1-3、Llac5和Llac7-11）表达量上调,28℃处理下除Llac5和Llac7基因以外,其余8个漆酶基因表达量发生上调,而30℃处理组6个漆酶基因（Llac1-2、Llac4、Llac7-8和Llac10）表达量下调.表明20℃处理下有助于漆酶基因的表达,而30℃处理下则抑制了其同工酶基因的表达.     

病毒性心肌炎与人类主要组织相容性复合体 多态性的相关性研究

目的 探索主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)等位基因与病毒性心肌炎(viral myocarditis,VMC)的关联性,以阐明VMC的免疫遗传学特征,并进一步探寻VMC发病中的保护基因,为可能的基因治疗提供靶基因探索新途径。方法 创建急性病毒性心肌炎的小鼠模型,通过血清炎症因子IFN-γ水平、心肌组织病理改变及心肌组织MHC基因表达水平的不同反映出病毒性心肌炎与MHC多态性之间有无相关性。结果 在32只病毒组小鼠中,MudoEb 5检测阳性的共有24只(基因频率37.5%),MudoEb 7检测阳性的有9只(基因频率14.1%),对照组中检测出MudoEb5阳性的有 6只(基因频率9.4%),MudoEb7阳性共2只(基因频率3.1%),两种等位基因的表达与对照组相比差异均有统计学意义(MudoEb 5 λ2=20.33 P=0.00 OR=13,MudoEb 7,λ2=5.38 P=0.02 OR=5.7)。结论 MudoEb5、MudoEb7基因型表达水平与COXB3的感染小鼠的病理改变存在正相关,并根据统计学分析,两种等位基因型可能为VMC小鼠的易感基因,其中MudoEb5基因型与VMC的病理相关密切程度更高。     

氨磷汀对急性放射性肠炎小鼠NF-κB 通路和VCAM-1、ICAM-1基因表达的影响

目的:研究氨磷汀对急性放射性肠炎小鼠小肠组织中核转录因子kappaB(NF-κB)通路和血管间粘附分子-1(VCAM-1)、细胞间粘附分子-1(ICAM-1)基因表达的影响和意义.方法:将小鼠分成对照组、实验组、氨磷汀腹腔注射干预组,采用6Gy 60Coγ-射线全身辐射,于第1、7、14天分批处死小鼠观察病理改变.实时荧光定量PCR(Q-PCR)方法检测不同时间点对照组、实验组和氨磷汀干预组NF-κB、VCAM-1、ICAM-1基因mRNA表达水平的变化.结果:辐射后实验组、干预组均可见明显黏膜下层微血管损伤,干预组损伤较实验组轻.辐射后第1天实验组、干预组小鼠小肠组织中NF-κB、VCAM-1、ICAM-1基因mRNA表达水平均显著升高(P0.05),干预组升高水平显著低于实验组(P0.05);第7天实验组各基因mRNA水平均呈下降趋势但仍高于对照组(P0.05),干预组达到或接近对照组水平;第14天实验组、干预组各基因mRNA表达水平与对照组比较无统计学差异(P0.05).结论:急性放射性肠炎早期即发生NF-κB、VCAM-1、ICAM-1基因mRNA的表达上调,可能在辐射后微血管损伤中发挥作用,氨磷汀可能通过下调上述基因表达对微血管起到保护作用.     

小鼠子宫内膜LIF基因表达与孕激素的关系研究

白血病抑制因子（LIF）是一种多功能活性的糖蛋白，LIF基因在大多数妊娠第4天的小鼠子宫内膜进行着强烈的表达，然而LIF基因表达调控的机理目前尚不清楚，本实验对130只妊娠4－5d的小鼠LIF基因表达和血清中孕激素水平分别进行了检测，发现12只小鼠（占总数的9．23％）无LIF基因表达，无该基因表达小鼠血清中孕激素水平显著低于其它表达的小鼠。实验结果表明：孕激素可能是LIF基因表达的复杂的调控体系中的一个重要的调控因素。     

非妊娠小鼠子宫内膜白血病抑制因子基因表达研究

白血病抑制因子（LIF）能抑制胚胎干细胞的分化和保持其增殖能力,并与胚泡着床及胚胎早期发育有着密切的关系。经实验证实,LIF基因在子宫内膜中的表达具有高度的时间限制性。采用反转录聚合酶链式反应技术（RT－RCR）对小鼠子宫内膜LIF基因表达进行了研究,结果显示：妊娠第4天小鼠的子宫内膜组织的样本在电泳图的538bp处出现清晰的电泳带,表明该组织有LIF基因的强表达;而在所检测的13只非妊娠小鼠子宫内膜的组织样本中均未发现LIF基因表达讨论了小鼠动情周期中各阶段的孕激素水平对子宫内膜LIF基因表达产生的影响,提出了一定的孕激素水平是启动LIF基因表达的必要条件     

牛至精油对嗜热四膜虫基因表达的影响

牛至精油(Oregano Essential Oil, OEO)具有抗菌、杀菌、抑制寄生虫生长等功效.为了解牛至精油影响细胞生长的分子调控过程,对牛至精油作用下0 h和24 h的嗜热四膜虫的基因表达情况进行分析.高通量转录组测序结果表明,对照组即未加入牛至精油24 h与0 h的样本数据,比较分析后鉴定到了6 297个差异表达基因(包括下调4 232个、上调2 065个),而实验组即加入牛至精油24 h与0 h的样本数据,比较分析后鉴定到7 596个差异表达基因(包括下调6 254个、上调1 342个).通过与对照组差异表达基因的比较发现,实验组特异上调和下调差异表达基因分别有257个和2 329个.GO功能富集发现,特异上调差异表达基因无功能富集,特异下调差异表达基因功能主要富集在RNA加工、蛋白质分解代谢、细胞定位和信号转导等过程.KEGG通路分析发现,特异下调差异表达基因主要涉及细胞自噬及细胞周期等通路.而这些过程或通路上基因表达水平的下调可能会抑制细胞的生长.对通路中7个下调的差异表达基因和3个无明显差异表达变化的基因进行实时荧光定量PCR检测,实验结果和转录组测序数据结果的相关...     

S100A10基因在小鼠子宫中的表达及性激素对其表达的调节

S100A10是S100钙结合蛋白家族成员之一,是一种钙依赖性的信号通路的介导分子,近年来有研究表明,它在胚胎植入位点有明显的高表达.文中采用半定量RT-PCR和原位杂交方法,研究了S100A10基因在小鼠中的组织特异性表达,在妊娠初始期胚胎植入位点、妊娠期子宫和正常动情周期子宫中的表达及其受性类固醇激素的调节.观察发现:S100A10基因在小鼠多种组织中都有表达,在卵巢、子宫、睾丸及附睾等一些生殖器官中表达水平尤为高;在妊娠第4天,子宫中S100A10基因表达明显上调,且在子宫内膜植入位点处有非常显著的高表达,其mRNA分布于对系膜侧的腔上皮细胞和功能层的基质细胞,且基质细胞中的信号强于腔上皮细胞,而非植入位点呈现极其微弱的表达;从妊娠第5天直到分娩第1天子宫内都维持恒定的S100A10表达;正常动情周期中,S100A10基因在动情前期和动情期子宫中表达明显上调;卵巢切除模型显示雌激素显著上调S100A10基因的表达,孕激素下调其表达.以上结果提示S100A10可能具有抑制胚胎植入位点腔上皮细胞的过度凋亡和促进基质细胞的增殖与蜕膜化的作用以及参与子宫应激反应过程.     

利用基因芯片分析人era基因表达降低后细胞周期蛋白表达的变化

为了探讨利用RNAi封闭肿瘤细胞系的era基因表达后细胞周期相关蛋白的变化,实验利用Trizol法提取总RNA,用人细胞周期相关基因cDNA芯片检测细胞周期相关蛋白的表达。生物信息学分析结果显示：封闭肿瘤细胞系的era基因表达后,有10条细胞周期相关基因表达上调,7条基因表达下调,为研究人era基因的功能提供了线索。     

橄榄苦苷对染砷小鼠大脑神经免疫相关基因表达的影响

为了研究橄榄苦苷(OP,oleuropein)对染三氧化二砷(As_2O_3)小鼠大脑神经免疫相关基因表达的影响.将昆明小鼠随机分成对照组、As_2O_3组和As_2O_3+OP组,按不同方式灌胃,连续5周后,利用基因芯片技术来评价OP对染砷小鼠大脑神经免疫相关基因表达的影响.与对照组比较,As_2O_3组小鼠大脑白细胞介素(IL, interleukin)家族基因IL-3、IL-10、IL-11、IL-1a、IL-15、IL-20、IL-23a、IL-31、IL-1f6、IL-13、IL-25和IL-24表达下调,IL-17d表达上调;白细胞介素家族受体基因IL-13受体α1(IL-13ral)和IL-2受体γ链(IL-2rg)表达上调,IL-17受体C (IL-17rc)表达下调;下丘脑-垂体-肾上腺轴受体相关基因精氨酸加压素(Avp)、精氨酸加压素受体1B(Avpr1b)、精氨酸加压素受体1A(Avpr1a)、精氨酸加压素受体2(Avpr2)、促肾上腺皮质激素释放激素受体1(Crhr1)、促肾上腺皮质激素释放激素受体2(Crhr2)表达下调,促肾上腺皮质激素释放激素(Crh)和阿黑皮素原α(Pomc1)表达上调.经OP干预后,As_2O_3致小鼠的神经免疫毒性明显减轻,大脑组织白细胞介素家族部分基因和下丘脑-垂体-肾上腺轴受体相关基因的表达水平与对照组表达无差异.OP可降低As_2O_3对小鼠神经免疫的毒性,其机制与影响大脑组织白细胞介素家族部分基因和下丘脑-垂体-肾上腺轴受体相关基因的表达有关.     

Gene expression profiling under different photoperiod/temperature conditions in a photoperiod-/thermo-sensitive genic male sterile line of rice （Oryza sativa L.）

A photoperiod-sensitive genic male-sterile (PSGMS) line was found in 1973 as a spontaneous mutant of the rice variety Nongken 58 (Oryza sativa ssp. japonica) in Hubei Province, China[1]. The fertility of this line was determined by day length and temperat…     

SO2对大鼠肺基因组表达谱的影响——环境表达不稳定基因组存在的证据

采用A ffym etrix的基因芯片(RAE 230A)研究了SO2短期(56 m g/m3,6 h/day,for 7 days)及长期(14 m g/m3,1 h/day,for 30 days)吸入后对大鼠肺基因表达谱改变的影响.结果表明,与其相应的对照组相比,SO2短期吸入后表达上调的基因有31个,其中包括18个已知基因和13个新基因,而表达下调的基因有30个,其中包括19个已知基因和11个新基因;SO2长期吸入后表达上调的基因有173个,其中包括79个已知基因和94个新基因,而表达下调的基因有85个,其中包括46个已知基因和39个新基因.由此结论:1)高剂量短期吸入与低剂量长期吸入SO2在体内的作用机理不同;2)短期吸入SO2的大鼠肺基因表达谱与其对照组相比,氧化磷酸化相关的一些基因发生了变化,这表明高剂量短期吸入SO2可能导致线粒体功能的恶化;3)长期吸入SO2的大鼠肺基因表达谱与其对照组相比,表达有差异的基因涉及到脂肪酸代谢、免疫、炎症、氧化应激、原癌基因、肿瘤抑制基因和细胞外基质等,表明低剂量长期吸入SO2在体内的机理要更为复杂.本研究证明,在基因组中存在一些基因,它们的表达对环境污染物很敏感,可被称为环境表达不稳定基因组.     

Preventive effects of Xin-Kang oral liquid on viral myocarditis in mice

To investigate the preventive effects of Xin-Kang oral liquid on myocarditis induced by Coxsakie virus B ( CVB) > the medicine was given to mice two days prior to the challenge of mice with the CVB to induce myocarditis. The oral liquid was continuously given to mice for 20 days and quantitative histological changes at various stages of the myocarditis were observed. The pathological changes on the cardiac surface were significantly reduced in Xin-Kang treated mice compared to those in control group (P<0. 01). and the occurrence of severe myocardium damage ( massive cardiac tissue death and degradation) was less in the Xin-Kang group than the groups either challenged with CVB or treated with interferon. The group treated with 0. 015g per gram body weight per day showed significant improvement over the viral group (P<0.01). The results proved that Xin-Kang could protect the cardiac muscle from viral infection and accelerate recovery of damaged cardiac tissue.     

低功率毫米波辐射对HL60细胞基因表达谱的影响

摘要：研究低功率毫米波辐射对HL60白血病细胞基因表达谱的影响。应用基因芯片检测频率41.32GHz的毫米波辐射HL60白血病细胞和未辐射毫米波HL60白血病细胞组基因表达差异,并进行RT-PCR方法验证IL-7、EGF和LGALS3基因变化。 结果与对照组比较,毫米波辐射60min后,HL60细胞增殖,基因芯片检出基因表达上调18个和下调306个,在下调的基因中,RT-PCR 检出IL-7、EGF和LGALS3基因下调与基因芯片结果一致。表明低功率毫米波可导致HL60细胞基因表达谱发生变化,这些变化的基因与HL60细胞增殖功能相关。提示基因表达变化是低功率毫米波辐射HL60细胞所致生物学反应的重要因素。     

DRD1基因敲除影响雄鼠生育的分子机理研究

目的 研究DRD1基因敲除引起雄鼠生殖功能下降的机制.方法 本研究以DRD1基因敲除鼠(KO)和野生鼠(WT)为研究对象,对8周龄KO与WT雄鼠进行基因型鉴定,测体质量并计算睾丸系数,一侧睾丸HE染色观察形态,另一侧睾丸TRIzol法提取RNA,通过qRT-PCR反应,采用相对定量法,分析与生殖密切相关基因的表达差异倍...     

Analysis of gene expression patterns with cDNA microarray during late stage of spermatogenesis in mice

The differentiation process of round spermatids to spermatozoa during the late stage of spermatogenesis is called spermiogenesis. To explore spermiogenesis-related genes, cDNA microarray was used to study expression patterns of 1176 genes in pachytene spermatocytes, round spermatids and elongating spermatids of Balb/c mice. The results showed that 208 genes were detected in all the three cell types. Most of them were down-regulated from pachytene spermatocytes to round spermatids and elongating spermatids. However, up-regulation of 7 genes expression in round spermatids and 3 genes in elongating spermatids were found. Expression of 7 differentially expressed genes in cDNA arrays was further confirmed by semi-quantitative RT-PCR study. The RT-PCR results indicated that the expression of 6 genes was consistent with that in cDNA arrays, only one gene did not show differential expression by RT-PCR. These results may provide important clues for studying of expression, regulation, and function of spermiogenesis-related genes.     

大鼠肝再生中肝细胞基因表达与DNA裸露的相关性研究

为了解大鼠肝再生中肝细胞的基因表达与DNA裸露的相关性,分离大鼠肝细胞,提取裸露DNA,用SOLEXA方法对DNA测序,用BWA软件拼装测序片段,用IPA软件分析拼装的基因种类和作用,用Rat Genome230 2.0芯片检测基因的转录情况.研究表明,大鼠肝再生的12h(PH后12h),肝细胞的裸露DNA涉及16 912个基因,1 701个基因发生了有意义裸露量变化.其中,25个基因的裸露量上调,1 676个基因的裸露量下调.与Rat Genome 230 2.0芯片的检测的基因转录比对表明,肝细胞的AKR7A3,BMYC,CDC25B等26个基因的裸露量和表达量均下调,表明大鼠肝再生12h时,这些基因的表达可能受染色体结构调控.     

Mitochondrial DNA that escapes from autophagy causes inflammation and heart failure

Heart failure is a leading cause of morbidity and mortality in industrialized countries. Although infection with microorganisms is not involved in the development of heart failure in most cases, inflammation has been implicated in the pathogenesis of heart failure. However, the mechanisms responsible for initiating and integrating inflammatory responses within the heart remain poorly defined. Mitochondria are evolutionary endosymbionts derived from bacteria and contain DNA similar to bacterial DNA. Mitochondria damaged by external haemodynamic stress are degraded by the autophagy/lysosome system in cardiomyocytes. Here we show that mitochondrial DNA that escapes from autophagy cell-autonomously leads to Toll-like receptor (TLR) 9-mediated inflammatory responses in cardiomyocytes and is capable of inducing myocarditis and dilated cardiomyopathy. Cardiac-specific deletion of lysosomal deoxyribonuclease (DNase) II showed no cardiac phenotypes under baseline conditions, but increased mortality and caused severe myocarditis and dilated cardiomyopathy 10 days after treatment with pressure overload. Early in the pathogenesis, DNase II-deficient hearts showed infiltration of inflammatory cells and increased messenger RNA expression of inflammatory cytokines, with accumulation of mitochondrial DNA deposits in autolysosomes in the myocardium. Administration of inhibitory oligodeoxynucleotides against TLR9, which is known to be activated by bacterial DNA, or ablation of Tlr9 attenuated the development of cardiomyopathy in DNase II-deficient mice. Furthermore, Tlr9 ablation improved pressure overload-induced cardiac dysfunction and inflammation even in mice with wild-type Dnase2a alleles. These data provide new perspectives on the mechanism of genesis of chronic inflammation in failing hearts.     

菠菜SoNAC转录因子家族的全基因组鉴定与分析

采用生物信息学分析方法,从菠菜基因组中筛选鉴定了57个菠菜NAC转录因子,并对其基因结构、编码蛋白和系统进化进行了分析;通过荧光定量聚合酶链式反应qRT-PCR分析,研究了高温和盐处理后菠菜叶片中NAC基因的表达模式.研究结果显示:菠菜NAC转录因子可以被归入2组17个亚组,GroupⅠ包含10个亚组,GroupⅡ包含...