用TT势计算氢分子的相互作用势

用Tang Toennies(TT)势模型计算了H2 H2的相互作用势,其结果与文献数据符合较好,说明TT势模型对于H2 H2的相互作用势也是适用的.     

碳纳米管分子动力学模拟的经验势函数研究

针对经验键序势函数没有考虑到碳纳米管原子间长程非键作用的问题，提出了一种新的势函数表达式．该表达式结合了经验键序作用势和雷纳德-琼斯势的特点，能够计算碳原子间的短程相互作用和长程相互作用，更准确地计算出碳纳米管的原子间作用势能．使用分子动力学模拟方法，研究了单壁碳纳米管原子间的互作用势和杨氏模量．研究结果表明：碳纳米管的单位原子势能随直径的增大而减小，管间作用势能随距离的变化曲线呈U字形，杨氏模量为0．935TPa左右．模拟计算结果与实验结果和其他理论计算结果吻合得很好，说明改进的势函数模型可准确模拟碳纳米管的力学性质。     

H原子通过碳纳米管的分子动力学模拟

利用Brenner(#2)半经验多体相互作用势和分子动力学模拟方法研究了氢原子在单壁碳纳米管中的运动.对温度为10K时,初始入射动能分别为1,5,10,15,20,30eV的H原子以不同的入射角度进入碳纳米管进行模拟,观察了氢原子与碳纳米管的吸附情况及在碳纳米管中的运动,并讨论了不同入射能量和入射角度对氢原子在碳纳米管中吸附的影响.结果表明,在能量为20eV时H原子能够很好的吸附在碳纳米管管壁上.     

高压下MgO状态方程的分子动力学研究

利用引入呼吸壳层模型BSM（Breathing Shell Morid）的分子动力学（MD）结合离子间相互作用势模拟了MgO的状态方程．温度300K时模拟的MgO体积压缩率和实验值基本一致，且模拟的状态方程和实验值也吻合得很好，并进一步模拟了更高压强更高温度下MgO的状态方程．     

用多极矩展开方法计算H2分子间的相互作用对势

分子间相互作用对势是利用分子动力学研究物态性质的重要基础．作者利用多极矩展开方法，获得了H2-H2的从头算相互作用对势．采用从头算分子结构程序，先计算了3种不同数目特定构型下的相互作用势，再由此荻取多极矩的展开系数，构造相互作用对势，并对不同的展开方法下荻取的H2-H2的相互作用对势进行了分析比较．     

贵金属Au宏观物性的分子动力学模拟计算

用分子动力学方法对贵金属Au进行宏观物性的模拟计算,模拟采用Johnson提出的原子相互作用势及嵌入原子模型参数的计算方案,得到了贵金属Au的嵌入原子模型参数,用该模型计算了Au的体积模量、剪切模量、弹性常数及低指数晶面的表面能.结果表明,计算值与实验值符合的比较好.     

分子动力学中势函数研究

选用合适势函数来描述系统内原子间的相互作用是进行分子动力学模拟的基础．本文概要回顾了历史上出现的各种原子间互作用势函数．对各种势模型的理论背景、具体形式、应用范围、特点进行了分析评述．     

分子动力学中势函数研究

选用合适势函数来描述系统内原子间的相互作用是进行分子动力学模拟的基础.本文概要回顾了历史上出现的各种原子间互作用势函数.对各种势模型的理论背景、具体形式、应用范围、特点进行了分析评述.     

球对称分子SF_6、CH_4相互作用势的理论研究

利用Tang-Toennies势模型(以下简称TT势),计算了SF6-SF6、CH4-CH4球对称分子之间的相互作用势,得出的结果与Morse-Morse-Spline-van der Waals(以下简称MMSV)势得出的结果进行了比较。比较发现TT势相对于其它势模型而言是一种简单、可靠的势模型。     

白蛋白和石墨烯的结构及其相互作用的分子动力学模拟

采用分子动力学模拟的方法分析研究了白蛋白与石墨烯表面的相互作用.分子模拟过程采用Gromacs软件进行运算及数据采集分析,并采用VMD软件实现结构的可视化.首先,建立周期边界条件,在边长为9 nm的有限空间中采用恒温恒压系综,对ffgmx力场条件下的白蛋白原始真空构象进行优化,使其在水相中达到平衡态.然后,以水相中得到的稳定的白蛋白作为模型,构建与石墨烯相互作用的总体构象及界面.最后,在周期性边界条件下,经过500 ps的动态过程,完成了白蛋白在石墨烯表面的吸附.对能量、残基轨迹、扭转角等数据进行分析总结,确定了白蛋白在石墨烯表面的吸附位点为白蛋白序列中90~97号肽段90ALA-91GLY-92ILE-93THR-94SER-95ASP-96PHE-97TYR.