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蛋白质微秒级折叠过程的快速模拟 《山东科学》2015,28(3):96-103
使用ff12SB力场和广义玻恩(GB Neck2)隐性水模型在GTX670 GPU上对4个蛋白质CLN025 (2ZEI)、MHA6(2I9M)、Trp Cage (1L2Y)、Villin (3TRW)的微秒级折叠过程进行了分子动力学模拟,2ZEI的折叠时间和均方根偏差为5.94 μs和0.897 ,2I9M的折叠时间和均方根偏差为0.191 μs和1.142 ,Villin的折叠时间和均方根偏差为4.23 μs和1.37 ,Trp Cage的折叠时间和均方根偏差为2.48 μs和0.63 。结果表明,蛋白质折叠模拟已经能够通过GPU计算在桌面计算机上实现。 相似文献
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内共振频率设计是将内共振应用于工程的前提,采用哈密顿原理推导了Z型梁-质量块结构的运动控制方程和边界条件,进而得到结构的固有频率。通过调节折叠角度和质量块质量进行结构的内共振频率设计,并给出不同频率比的参数范围。结果表明:随着折叠角度的增加,1阶固有频率逐渐增大,而2阶固有频率具有先减小后增大的趋势。在较大的折叠角度下,调节质量块的质量能够分别满足1:2,1:3,1:4的频率比条件。 相似文献
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北京有句歇后语,“卢沟桥的狮子——数不清”。来到日本的冲绳,我惊异地发一,冲绳的狮子也是数不清的。据说,自从14世纪摆放狮子的风俗从中国传入冲绳后,狮子很快便溶入了冲绳的文化之中。经过数百年的发展,形成了冲绳独特的狮子文化。中国的狮子,面目较为一致,多是雄狮脚踏绣球,雌狮专心与小狮逗耍。而冲蝇的狮子则百狮百态,千狮千面,或站、或蹲、或坐、或卧,表情丰富,活泼可爱。冲绳的狮子可以出现在任何场所。上至县政府、县议会、大型百货公司门前,下至路口、桥头、住户门前都会摆上一对或几对狮子。如门前无处摆放,则将狮子请上房顶、阳台。有的竟登上了公用电话亭和邮筒。各种狮像及狮子造型的旅游纪念品更是充满 相似文献
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徐恒 《南京大学学报(自然科学版)》2004,40(5):548-558
使用非格点朗之万模型和"Go型"氨基酸相互作用模拟了4个小分子量快速折叠蛋白质的折叠行为.从动力学和热力学两方面的探讨中,得到蛋白质CI2的折叠属于两态过程和蛋白质CheY的折叠过程存在中间态和蛋白质1BBL的折叠属于无势垒的"下山"式过程,而蛋白质片断1BDD(第10至第55残基)的折叠则是介于两态过程和"下山"式过程的中间类型.由于使用了相同的模型,物理机制上这些不同折叠类型显然来自蛋白质不同的天然态拓扑结构. 相似文献
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贵州狮子洞与太阳沟1号洞内动物群落结构的比较 总被引:3,自引:1,他引:2
对罗甸狮子洞和赤水太阳沟1号洞内洞穴动物进行了调查和采集,共获标本500余号,隶属3门6纲24目45科58属。并对两洞内的动物群落结构和物种多样性进行了比较,结果表明,太阳沟1号洞的动物群落结构比狮子洞的复杂、多样性指数均高于狮子洞,并对这一差异作了分析。 相似文献
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考虑两个独立且服从指数分布的部件组成的并联系统,研究两个并联系统Σ_1和Σ_2,其中Σ_1和Σ_2有一个部件参数相同,另一个部件参数不同,得到了Σ_1和Σ_2在随机序、似然比序、故障率序和反故障率序意义下的随机比较性质。同时,得到了部件服从成比例故障率模型和韦布尔分布模型的相应结论。 相似文献