藏系绵羊贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊线粒体DNA D-LOOP区遗传多样性研究

为探讨藏系绵羊贾洛类群的起源、进化和遗传多样性,通过对贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊三个群体51只绵羊的线粒体DNA D-LOOP区全序列进行测序分析.结果表明:51条序列长度范围为1032-1331bp,以1181bp为主(含4个75bp重复序列),A％+T％含量大于G％+C％含量,贾洛类群与阿勒泰羊亲缘关系较近,三个绵羊群体有3个独立的母系起源,没有发现羱羊对臧系绵羊贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊起源有贡献的证据.     

家猪核DNA多态标记的克隆与序列分析

在太湖猪各类群遗传多样性RAPD分析的基础上,对太湖猪类群间或与其他猪品种间有差异的核DNA标记位点SANDX 1、SANDX 2及SANDX 3进行了克隆,并对SANDX 2、SANDX 3位点的序列进行了测定及e PCR、BLAST分析.     

一母系遗传非综合征耳聋家系的线粒体DNA突变分析

在问卷调查及家系随访的基础上,在安徽省淮北市收集到一母系遗传非综合征耳聋家系,利用聚合酶链式反应-限制片段长度多态性分析(PCR-RFLP)和测序技术,检测了该家系成员线粒体DNA(mtDNA)上可导致非综合征耳聋的两个突变热点处(12S rRNA基因上的1 555位点和tRNASer(UCN)基因上的7 445位点)的碱基变化,发现该家系所有母系成员的mtDNA上都有A1555G同质型突变,但7 445位点无异常;进而对该家系两个表型明显不同母系成员(一例具有先天性耳聋表型,另一例听力正常)的mtDNA进行全长测序,结果未在mtDNA上发现除A1555G以外的其他位点突变,只发现了27处多态性序列变化,且两成员的mtDNA无序列差异.说明mtDNA上的A1555G同质型突变是该家系部分母系成员致聋的分子生物学基础之一;推测该家系A1555G突变携带者临床表型的差异可能与mtDNA多态性无关,而更可能是核修饰基因与A1555G突变协同作用的结果.     

青海省曲麻莱牦牛的母系遗传多样性及遗传背景探究

为从分子水平上揭示青海省曲麻莱牦牛的母系遗传多样性及遗传背景,对34头曲麻莱牦牛线粒体D-loop区的部分序列进行测定,确定多态位点、单倍型数目、核苷酸多样度及单倍型多样度,并进行系统发育分析。结果表明:在获得的618 bp D-loop序列中,排除1处插入/缺失后,共检测到36处多态位点,其中单一多态位点4处,简约多态位点32处;根据序列间的核苷酸变异共确定了20种单倍型,其中优势单倍型为H1,单倍型多样度(h)为0.952±0.021,核苷酸多样度(π)为0.018±0.009,将测得结果与中国牦牛进行对比,曲麻莱牦牛具有非常丰富的母系遗传多样性。使用NJ法构建的系统发育树结果显示,20种单倍型可以分为2个支系,表明曲麻莱牦牛有2个母系起源。     

内蒙古春秋战国时期古绵羊线粒体DNA分析

为了探讨中国绵羊的起源,对内蒙古凉城县小双古城和板城墓地春秋战国时期24个古绵羊进行了DNA分析,分别扩增并测序了线粒体DNA控制区271 bp和细胞色素6基因300 bp序列.系统发育树和中介网络图结果显示,中国内蒙古地区古绵羊存在3个含有不同频率的单倍型类群A(73.9%),B(17.4%)和C(8.7%),细胞色素b基因的分析结果显示这3个母系世系的分化时间远早于动物的驯化时间,这揭示了中国绵羊有3个不同的母系起源.研究还发现中国古绵羊群体与中国现代绵羊群体的遗传距离最近,并且二者之间的遗传结构极为相似,这表明2500年以来中国绵羊的遗传结构就已经趋于稳定,并对现代绵羊的基因贡献起着非常重要的作用.     

利用SRAP标记分析黄淮海地区纤毛鹅观草居群的遗传多样性

笔者利用SRAP标记对纤毛鹅观草29个居群进行了遗传多样性分析.本实验利用11对能够在不同居群中扩增出稳定多态性条带的引物进行扩增,结果表明,平均每对引物获得9.34个多态性位点,多态位点百分率为80.47％.GS值在0.583 3到0.967 7之间,平均GS值为0.775 5,这表明,居群之间差异明显,具有较为丰富的遗传多样性.对所有居群进行聚类,可聚为6类,其中大部分来自相同或相似生态地理环境的居群聚为一类;对不同生态地理类群基于Nei氏无偏估计的遗传一致度的聚类分析表明,各生态地理类群间的遗传分化与其所处的生态地理环境具有一定的相关性;而UPGMA聚类分析结果表明SRAP标记技术能较真实地反映纤毛鹅观草居群间的亲缘关系,可以用于纤毛鹅观草遗传多样性研究.     

9个地方鸡种MHC B-G座位多态性及其分子系统进化分析

以我国9个地方鸡为研究对象,对其MHC B-G座位全基因序列进行测序,以揭示这9个地方鸡种MHC B-G基因的遗传多样性,并构建其系统进化树.结果表明,9个地方鸡种MHC B-G基因序列具有较高的遗传多样性,在9个地方鸡种中共存在666个突变位点,其中单一位点突变554个,简约信息112个,共缺失782 bp.核苷酸多样度(Pi)为0.030 79±0.004 39,平均核苷酸差异(K)为182.639.9个地方鸡品种为9个单倍型,单倍型多样度为1.00±0.052.9个鸡种MHC B-G基因Kiumura双参数遗传距离范围为0.010～0.070,鹿苑鸡与新狼山鸡的遗传距离最小,为0.010;茶花鸡与东乡绿壳蛋鸡遗传距离最大,为0.070.根据9个鸡品种MHC B-G基因全序列构建的NJ树和ME树,茶花鸡单独聚为1类,其他8个品种被聚为2大类.Tajima's D值为-1.554 6,且差异不显著(0.10>P>0.05),说明MHC B-G基因为负向选择,不遵循中性进化理论,MHC B-G基因多态性不是遗传漂变的结果,而是自然选择和人工选择的结果.     

川中黑山羊(金堂类群)和藏山羊PRLR基因cDNA克隆及序列分析

根据GenBank中绵羊的PRLR基因序列设计引物,以川中黑山羊(金堂类群)和藏山羊垂体总RNA为模板,通过RT-PCR技术对川中黑山羊(金堂类群)和藏山羊PRLR基因cDNA克隆及进行序列分析,以期为进一步研究该基因与山羊的繁殖性能奠定理论基础.结果表明:川中黑山羊(金堂类群)和藏山羊PRLR基因编码区均长1746bp,均编码581个氨基酸.川中黑山羊(金堂类群)PRLR基因编码区与藏山羊、绵羊、牛、牦牛野猪和人的同源性分别为99.71%、99%、95%、95%、83%和80%.以核苷酸序列构建分子系统进化树,川中黑山羊(金堂类群)先与藏山羊聚为一类,再与绵羊聚为一类,后与牛和牦牛聚为一类,然后与野猪聚为一类,最后与人聚为一类.     

蚶科三种贝类ITS2核苷酸序列分析

对蚶科三种贝类ITS2进行PCR扩增、测序及分析,用Mega3.1软件进行了系统发育初步分析.结果显示:毛蚶、泥蚶和魁蚶的ITS2大小分别为284～288bp、380bp、413～417bp,三种蚶的445个序列比对位点中,共有172个保守位点,245个变异位点,166个简约信息位点,78个单突变位点.系统发育分析结果显示,毛蚶和泥蚶先聚为一支,而后与魁蚶聚在一起.ITS2分析结果显示毛蚶和泥蚶种间的遗传关系较近.     

西藏马线粒体DNA D-loop区的遗传多样性

对西藏拉萨和泽当两个地区23匹西藏马的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)部分片段进行序列分析, 检测出16个单倍型, 包括32个核苷酸多态性位点(其中转换位点31个, 缺失位点1个), 占所分析位点总数的9.27%. 单倍型多样性(h)和核苷酸多样性(π)分别为0.93±0.04和2.51%±0.16%, 表明西藏马的遗传多样性较丰富. 基于23匹西藏马序列以及现代欧亚马群的mtDNA序列, 进行了系统发育分析和多维尺度分析. 结果表明, 西藏马在母系遗传关系上与近东、 中亚以及欧洲家马有较近的亲缘关系, 与东亚的蒙古马以及韩国马亲缘关系较远.     

东北三省汉族人群的遗传特征及族源推断研究

为研究东北三省汉族人群17个常染色体STR基因座的遗传多态性,在获得书面知情同意的基础上,研究抽取了东北三省汉族人群中无直接亲缘关系的326份血样卡,其中,辽宁省63份,吉林省107份,黑龙江省156份。使用PowerPlex@21 System荧光扩增试剂盒对17个STR基因座进行基因分型,再利用Modified-Powerstates软件计算其法医学参数。经分析得出,在17个基因座中,13个基因座的个体识别能力及遗传多态性较高,其中D18S51、FGA和PENTA_E 3个基因座尤为突出;剩余4个基因座中,D3S1358和CSF1PO中等,TH01和TPOX较低。同时对东北三省汉族人群和其他14个人群进行族源推断,通过对等位基因频率进行主成分分析、遗传距离计算、多维尺度分析,研究发现14个人群中的所有汉族、云南白族、云南彝族、云南纳西族和韩国均与东北三省汉族的人群之间具有较近的遗传距离,而剩余人群则与目标人群距离较远。     

藏猪起源和品种遗传独特性的研究

以采用聚丙烯酰胺凝胶垂直平板电泳法（ＰＡＧＥ）测定四川、云南两地藏猪血液蛋白多态基因座（Ｔｆ,Ｐａ,ＡｍＩ,Ｃｐ）所得的结果和收集的国内外相关资料为依据,计算了标准遗传距离和遗传独特性,并进行聚类分析和保护等级的划分．结果表明：（１）四川藏猪和云南藏猪属同一品种,均起源于亚洲野猪;（２）利用品种遗传独特性划分保种等级,四川藏猪排在第五位,且仅用４５．４％的品种,对最大基因频率的保护程度可达９８．９７％．     

Genetic analysis on 3′- terminal flanking region of uncoupling protein 3 in different pig breeds

The 3′-terminal flanking region of porcine uncoupling protein 3 (UCP3) was cloned, the sequence data revealed 15 nucleotide substitutions among Landrace and three Chinese native pig breeds named Neijiang, Minpig and Erhualian. The continuous 9 polymorphic sites were checked by PCR-RFLP, the results indicatedthat Erhualian had extraordinary gene frequency, presented most significant difference by χ2 test compared with Landrace, Largewhite, Neijiang and Minpig respectively, significant level compared with Meishan; and Meishan also had significant difference compared with Landrace and Minpig respectively. These results canbe concluded that Taihu pigs have special genetic characteristics among pig breeds.     

长筒石蒜种质资源的ISSR研究

借助ISSR分子标记对长筒石蒜变异类型进行了研究,结果表明:ISSR扩增得到的67个位点中,其中62个位点具有遗传多态性,约占总数的92.5%.因此,长筒石蒜遗传多样性是十分丰富的,可以作为育种材料储备种质资源.从UPGMA聚类图来看,依据花色区分的3种类型,被聚在一起,表明亲缘关系较近.在未来的长筒石蒜种质资源利用中,不同花色的长筒石蒜可以作为品系进行开发.     

Hartley 豚鼠生物净化群体建立及微卫星遗传质量分析

摘要:目的 对现有 Hartley 豚鼠种群进行剖腹产净化,通过遗传检测,确认净化后的种群符合封闭群遗传特征。方法 生产群中不同繁殖单元广泛选择雌、雄个体,按 1 ∶ 1 比例合笼交配,于合笼后 70 d 实施剖腹产手术,仔鼠人工乳饲喂。 用循环交配法繁殖一代,从 F1 代中选取 30 个个体采集耳部组织样本,提取 DNA,应用 18 个豚鼠基因组微卫星位点进行 遗 传 检 测。 结 果 剖 腹 产 共 获 得 85 只 仔 鼠,成 活 56 只,离 乳 47 只 ( 23 雄、24 雌) ,成 活 率65. 9% ,离乳率 83. 9 % ;18 个豚鼠微卫星位点共检测到 81 个等位基因,平均杂合度 0. 5747,平均多态信息含量( PIC)0. 5216。 Hardy-Weinberg 遗传平衡检测,14 个位点符合 H-W 遗传平衡,3 个位点显著偏离 H-W 遗传平衡,1个位点呈现纯合状态。 结论 通过剖腹产对豚鼠种群进行了净化,净化后的群体具备较理想杂合度,属高度多态性群体,符合封闭群实验动物遗传特征。     

The combined genotypes effect of ESR and FSHβ genes on litter size traits in five different pig breeds

Estrogen receptor (ESR) and Follicular-stimula- ting hormone beta subunit (FSHb) genes were chosen as candidates to determine whether they control litter size and some other reproductive traits in swine. 269 sows from five different pig breeds were genotyped by an established PCR- RFLPs protocol at both ESR and FSHb loci. The effects of both ESR and FSHb on pig reproductive traits, including total number born (TNB) and number born alive (NBA), are analyzed by SAS software (version 6.12). These computation results demonstrated that both ESR locus and FSHb locus are the major genes influencing litter size in pigs. The sows of BBBB combined genotype of ESR and FSHb loci generally produce 1.85—3.01 TNB and 2.0—3.0 NBA more than those of ABAA combined genotype. The notable effect of ESR locus and FSHb locus on litter size of pigs have made it possible to improve the pig reproduction by Marker-assisted selection (MAS). Moreover, introgression of the beneficial alleles into commercial pig breeding lines, in which the alleles were not present, will improve greatly the economically important reproductive traits and efficiency of pig production.     

油蒿种群遗传分化的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法对油蒿(Artemlsia ordosica Krasch．)的5个种群进行了研究．用15个随机引物扩增出297条清晰谱带，其中285条为多态性谱带．利用POPGENE 32软件对数据进行处理，结果如下：(1)油蒿有着丰富的遗传多态性，多态位点百分率达96％，各种群多态位点百分比在84．6％～90．9％之间．(2)油蒿的种群间分化较小Gat=0．1364，86．36％的遗传变异存在于种群内，各种群的遗传一致度都在96％以上(3)聚类分析显示，地理分布近的种群被聚到了一起，反映了油蒿种群的遗传分化和地理距离有着一定的相关性．     

凉山州景观园林乡土树种研究

本文对具有较高观赏价值、适宜凉山气候特点,迄今尚未开发利用的凉山境内部分景观园林乡土树种进行了重点推介,以资在创建西昌森林城市过程中,供政府相关部门和有志于凉山优良乡土树种开发的同行参考。     

内江猪与伍隍猪类缘关系的血红素结合蛋白(Hp)、血红蛋白(Hb)多态性研究

采用聚丙烯酰胺凝胶垂直平板电泳法对内江猪、伍隍猪及其对照荣昌猪、杜洛克猪的Hp血清型和Hb进行分型研究,检出了HP~1、HP~2、HP~3三个等位基因控制的6种基因型和4种变异型,根据基因频率计算出四种类群的标准遗传距离并按最短距离法聚类,伍隍猪与内江猪遗传距离最近为0.00203、伍隍猪与荣昌猪为0.00333,伍隍猪与杜洛克最远为0.00850。显示伍隍猪与内江猪有紧密的类缘关系。在HP基因型种类分布上,伍隍猪为4+4种,即存在1—1~F、1—3~F、1~F—3和3—3~F等四种基因型的变异型,而内江猪为5+1种,只有1—3一种变异型存在,揭示两者除同一性外存在一定差异性。卡方检验表明,伍隍猪基因型分布偏离Hardy—Weinberg平衡规律,HP~1—1纯合子频度偏低HP~1—2偏高是失衡的主因,对此进行了讨论,四类群猪Hb均无多态性。     

杂交水稻三个基因位点的遗传研究

研究了野败型杂交稻（Oryza SativaL.)两个籼稻（Indica)组成三对性状的遗传特性及其基因位点间的相互关系。本研究中酯酶同工酶E12A的存在对缺如，芽鞘的紫色对绿色和柱头的紫色对绿色分别是显性。三对性状分别受三个基因位点的三对等位基因控制，表现出典型的孟德尔遗传特征。三个基因位点间存在着明显的连锁关系，其排列顺序是紫色芽鞘基因位点（Pc)－紫色柱头基因点（Ps)－酯酶同工酶基因位点03（Est－3）。