部分化学资源数据库的构建

论述了近期构建的西部植物资源数据库、西部天然药物网络数据库和常用化学数据资源库等化学资源数据库，并对西部天然药物网络数据库中的中药活性成分进行了系列研究．     

基于PCA的参数化间隔双子支持向量机及其在手写体识别上的应用

改进了基于参数化间隔的双子支持向量机算法的预处理过程,在数据预处理阶段使用了主成分分析法对数据进行降维,提出了基于主成分分析的参数化间隔双子支持向量机,从而加快了整个算法的训练速度.公共数据库上的实验结果显示了该算法的优秀分类能力,对高维数据集的降维效果也比较成功.最后,将这种算法应用到手写体数字识别技术上,实验结果显示出该算法较好的分类性能.     

基于RDF的CIM数据存储方案研究与实现

在分析了公共信息模型(CIM)特点的基础上,提出一种基于资源描述框架(RDF)的CIM数据存储方案。该方案主要根据RDF资源、属性、值三元组的思想,把CIM中的类、类属性关联、类实例都当作一种资源,首先通过将CIM模型映射成一个基于RDF思想的数据模型,将CIM模型中复杂的拓扑结构和关系映射组织成几个简单的类,并通过几个简单的关联类组织类间的关系;然后使用面向对象的实时数据库FastDB存储此数据模型,从而避免了CIM模型向关系模型映射时实现关系(继承、聚合、关联)映射所面临的难点。通过采用简洁良好的数据库实体设计,以及选用面向对象的实时数据库,该方案在遵循IEC61970标准的同时,更好地提高了系统的性能和数据访问效率。     

基于专利分析的兰白试验区中药产业创新图谱构建研究

中药产业是兰白试验区支柱产业之一。以合享新创(incopat)专利数据库为基础,对比分析兰白试验区与我国中药产业的专利数据,分析内容主要包括专利申请量、专利技术构成、专利申请人等。基于对全国和兰白试验区中药产业创新情况分析,确定兰白试验区中药产业创新发展的思路、重点技术、创新布局等,绘制基于时间序列的系统描述产业技术创新过程中市场、技术、资源互动的创新图谱,提出兰白试验区中药产业创新发展的政策建议,为政府部门和创新主体提供决策支持。     

贵州省中药资源普查数据库构建研究

目的:通过构建"贵州省中药资源普查数据库",利于中药资源普查成果展示,方便人们了解贵州省中药资源情况,实现资源共享。方法:分别从贵州省中药资源情况分析、数据库功能设计、体现中药资源普查信息关联性的表格设计等方面进行研究。结果:对贵州省中药资源普查数据库的构建做了初步设计。结论:本研究可为今后"贵州省中药资源普查数据库"的构建提供参考,为贵州省中药资源普查工作提供理论数据。     

通用数据传输平台系统设计

提出一种通用数据传输平台设计思想,系统采用了基于数据库同步机制的数据传输技术、支持偶连接与实时网络的传输安全技术、基于数据库日志传输的数据库更新技术、异构传输数据库配置与传输数据配置技术及传输过程设置、传输过程监控技术,实现了大型网络系统中异构数据库信息系统间的数据信息交换及多级网络系统间的数据信息交换.     

基于位图矩阵和双支持度的中药配伍挖掘技术

用数据挖掘技术研究了中药方剂配伍的规律．引入了关注频繁项概念，提出并实现了基于位图矩阵和双支持度技术的BM-DB-Apriori算法来寻找药对药组．位图矩阵技术使得在找频繁k-项集时无需对数据库扫描，双支持度确保频繁项集中不包含那些因太频繁而失去意义的项集．以脾胃方剂库为对象分别使用BM-DB-Apriori和Apriofi两种算法进行实验，实验表明，BM-DB-Apriori算法能够更快速、更准确地挖掘出药对和药组。     

基于网络药理学探究小青龙汤治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制

基于网络药理学探究小青龙汤治疗新型冠状病毒感染(COVID-19)的作用机制。应用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)筛选小青龙汤8味中药的活性成分，运用PubChem、SwissTargetPrediction和TCMSP数据库获取中药的潜在作用靶点；运用OMIM、DisGeNET和GeneCards数据库筛选COVID-19和Delta variant of COVID-19相关靶点；利用Venny 2.1在线工具筛选出小青龙汤靶点和COVID-19靶点的交集并作维恩图；应用Cytoscape 3.7.2软件构建小青龙汤-成分-(COVID-19)-靶点网络；利用STRING数据库收集数据，并在线构建蛋白质-蛋白质相互作用网络；应用Metascape数据库进行基因本体(gene ontology, GO)和基于京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes...     

JNY-2中抗肿瘤活性相关蛋白成分的鉴定

目的:鉴定海洋中药魁蚶(JNY-2)中发挥抗肿瘤作用的蛋白成分.方法:运用JNY-2转录组测序reads,de novo组装unigenes,构建JNY-2转录组数据库;通过液质联用技术联合转录组数据,对分离得到的JNY-2活性蛋白组分JNY-2-1中发挥抗肿瘤作用的物质基础进行分析鉴定.结果:通过对海洋中药JNY-2进行转录组测序,共得到142 280 214条reads,de novo组装后得到132 025个unigene,构建了JNY-2转录组ORF数据库;对JNY-2抗肿瘤活性蛋白组分JNY-2-1进行LC-MS/MS分析,产生了574 120个MS/MS二级质谱图谱,与JNY-2 (ORF)数据库比对吻合且因假发现率(FDR)≤1%的有9 101个MS/MS光谱;鉴定得到特征肽段2 381个,最终在活性组分JNY-2-1中鉴定了516个蛋白成分,包含调控生物进程的功能性蛋白和细胞构成蛋白,但无毒素类蛋白成分.结论:从JNY-2抗肿瘤活性蛋白组分JNY-2-1鉴定得到516个蛋白成分,为活性新蛋白的发现及海洋中药JNY-2抗肿瘤物质基础研究提供了重要的科学资料.     

SCORM学习资源的语义相似度度量

在支持SCORM 1.2的基础上 ,对SCORM 1.2学习资源间的联系描述进行充分的挖掘 ,给出了资源实体和资源本体的形式化定义 ,对资源实体、资源本体间的关系类型进行了划分 ,给出了 3种学习资源语义相似度度量的方法 ,并说明了语义相似度度量在导航中的一个应用     

公路仿真系统数据库

从公路仿真系统数据驱动的特点出发，对公路仿真数据库的数据模型和实现方式进行了研究。对象一关系数据模型的建立，解决了对仿真资源动态管理、动态连接的问题。提出基于COM的客户／服务器体系结构，满足了数据封装及数据共享的要求。给出了仿真实验框架和仿真模型的形式化描述，讨论了仿真模型库构造模式。结果表明，该模式能够解决仿真过程数据共享、模型动态构造、复杂实体处理等基本问题。     

一种通用的多数据库间数据抽取方法及应用

为方便从多个异构的数据源中抽取转换数据、并加载到目标数据库,提出一种较为通用的抽取方法,并开发了工具软件.该方法基于客户端的方案,使用数据库驱动程序屏蔽异构数据库间的差异;数据的抽取、转换和加载由数据抽取软件执行;数据的抽取转换基于抽取规则,抽取规则采用可视化方法编辑生成;抽取规则存储于规则库,供多次调用修改;多个抽取任务组成抽取任务队列.开发的抽取工具软件DbBridge,支持从Oracle,SQL Server,SAS,Access,Excel等数据源抽取数据.软件成功应用于某数据仓库的建立及数据迁移工作.     

矿区土地复垦信息系统中时态数据组织方法

基于GIS建立矿区土地复垦信息系统，对矿区土地资源管理和土地复垦规划决策具有重要意义。沉陷地土地资源信息随着煤炭的开采而不断变化。所以，矿区土地复垦空间数据库是一个时态数据库。分析了采煤沉陷地土地资源动态变化的特点，在前人研究的基础上，综合了基于事件和基于特征时空数据模型的特点，建立了一个基于事件和特征的时空数据模型，并进一步给出其相应的数据组织方法。在此基础上，探讨了基于该模型的时空信息查询与分析方法。该模型可以较好地保持特征实体的完整性，数据冗余较少，适合于在现有的GIS软件中组织时空数据。     

中医药治疗便秘的用药规律及网络药理学探析

基于数据挖掘及网络药理学方法,探究中药治疗便秘的用药规律并分析核心中药的作用机制。通过检索中国知网、维普数据库、万方数据库中有关中药复方治疗便秘的文献,筛选符合要求的文献并提取数据,对中药复方的药物频次、关联规则及聚类进行分析。基于中药系统药理学数据库与分析平台获取核心药物的化学成分及靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD等数据库获取疾病靶点,借助Venny平台获取潜在靶点,采用STRING数据库、DAVID数据库进行相关机制分析。基于AutoDock软件进行分子对接。结果表明:筛选出复方85个;使用频次在10以上的有25味药,其中白术的使用频率最高;关联规则挖掘出白术-黄芪、白术-黄芪-当归分别是支持度最高的组合;聚类分析可将药物分为5类;挖掘出核心中药白术、当归、枳实和火麻仁。网络药理分析显示,核心中药治疗便秘的机制是化学成分作用于AKT1等靶点,进而调节癌症通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路、p53信号通路等发挥治疗作用。该研究为中医药治疗便秘的用药规律提供了理论基础,为治疗便秘的中药复方的开发与发展提供了思路。     

面向资源融合网格的语义数据融合

网格中的数据资源多种多样,为用户提供具有语义支持的、按需访问的数据服务是资源融合网格中数据融合的关键问题。本文提出了基于本体的语义数据容融合方法ODSF;该方法中的基本元素是数据对象,通过数据对象和领域本体之间的映射关系来表达数据对象的语义,使用嵌套关系模型来表达数据对象的模式信息,通过一个网格节点中集成的所有数据对象作为下一个节点的数据对象来实现数据资源由粗到细的融合;定义了ODSF的语义模型,给出了虚拟数据库的查询执行过程和算法,可以为使用者提供具有语义支持、服务质量保障的数据访问服务;通过原型系统验证了ODSF中理论和关键技术的正确性和可行性。     

一种无线环境监测数据采集与推送系统

针对自然灾害易发区环境监测的现状,设计了一种无线环境监测数据采集和推送系统,给出了系统的总体结构以及各主要组成监测单元的构成.一方面,结合传感网节点资源紧张的特点,提出了基于消息队列遥测传输协议的信息推送方案;另一方面,为了避免监控中心下达的配置命令等指令数据被非法监听甚至纂改,改进了现有的洋葱路由协议,在通信实体间预先建立安全的通信链路,从而确保了数据在各种通信实体间的安全传输.     

基于网络药理学和分子对接研究十味益脾颗粒的作用机制

为了挖掘十味益脾颗粒中治疗脾虚食滞症的主要药效成分及其作用机制,通过相关文献以及中药系统药理学数据库与分析平台获取十味益脾颗粒中10味药材所含的主要化学成分并构建化学成分库,通过多个数据库构建相关靶点库;运用Genecards数据库、OMIM数据库、TTD数据库搜索积食、健脾有关的疾病靶点;通过化学成分-潜在靶点网络筛选关键成分和关键靶点,构建中药-关键成分-关键靶点-疾病网络筛选核心成分和核心靶点;使用SwissADME数据库对核心成分进行分析;采用CB-Dock网站进行分子对接。结果表明,槲皮素、茯苓酸A、茯苓酸C、β-谷甾醇是十味益脾颗粒中的核心成分,CA2、PTGS1、PTGS2是十味益脾颗粒作用的核心靶点。分子对接结果显示核心成分与核心靶点的亲和作用较好。该研究为深入诠释十味益脾颗粒的作用机制和临床应用提供了理论基础和数据支撑。     

基于超球面支持向量机的综合传动状态判别

以油液光谱分析数据为基础,建立了基于超球面支持向量机的综合传动状态判别模型。利用主成分分析法,对油液光谱分析数据进行预处理,并进行主成分提取的研究分析。研究了参数的变化和异常样本对模型性能的影响。实验研究表明,基于超球面支持向量机的状态判别模型准确可行,能实现综合传动的状态判别。     

基于支持向量的判别准则的比较

在经典线性判别分析(LDA)和软间隔支持向量机(C-SVM)的基础上,提出了支持向量判别分析(SVDA)和基于支持向量的极大化间隔判别分析(MSVDA).为了说明SVDA和MSVDA对分类问题的有效性和实用性,利用UCI数据库中的Wine数据和Iris数据进行了对比实验.实验结果表明,总体上,SVDA和MSVDA均比LDA有效.     

一种基于最小支持度的轨迹隐私保护方法

为提高发布轨迹数据的隐私保护程度和数据可用效率,提出了一种基于最小支持度的轨迹数据隐私保护方法support-set.在满足最小支持度的条件下,使用距离最近的归纳化集合代替真实的位置点,通过最小化原始轨迹数据库和匿名化处理后的轨迹数据库之间的距离,能够保护用户的隐私信息和提高数据的可用性.最后,通过实验验证了提出方法的...