应用支持向量机预测蛋白质相互作用位点

蛋白质相互作用位点的识别对于突变设计和预测蛋白质相互作用的网络是非常重要的。基于支持向量机学习方法,该文提出一种用于预测蛋白质相互作用位点的有效数据属性抽取方法,该方法利用蛋白质的序列信息、蛋白质残基的可及表面积和进化率来构造向量,通过十倍交叉验证来对数据进行训练和预测。实际计算的结果显示,该方法的准确率为72.19％,比只利用序列信息和进化率信息的方法提高了5.71％。     

基于自然语言处理的蛋白质小分子亲和力值预测

蛋白质与小分子的相互作用研究对药物的研发非常重要,而现有的蛋白质小分子亲和力值的预测方法存在成本高、精度低等问题.为此提出了一种新的蛋白质小分子亲和力值的预测方法,利用自然语言处理技术对蛋白质结构数据与小分子指纹数据进行处理,并利用梯度提升决策树模型进行预测.实验表明,该方法的精度较原有方案有较大提高.     

改进信息离散性度量方法的蛋白质二级结构预测

采用一种信息离散性度量方法对CB396数据集中的蛋白质数据进行二级结构预测,预测准确率达到72.1%.为了提高预测准确率,将FDOD算法结合PSI-BLAST进行多重序列比对,使预测准确率提高到75.6%,证明了该方法的有效性.在此基础上,利用20种疏水标度改进FDOD方法,以减小计算量.最后,结合长程作用,对预测准确性的影响因素进行了讨论.     

基于蛋白质相互作用网络局部相似度的肝癌疾病基因预测

基于人类蛋白质相互作用网络,该文采纳拓扑局部相似度去实现肝癌疾病基因的预测.交叉检验测试结果表明:有22％～29％的目标基因在候选基因中排名前5％,且预测精度均能达到0.7以上.归因于低的计算复杂度和相对高的预测精度,这类疾病基因预测方法可为发现和鉴定疾病基因提供有力的线索.     

一种基于复合物参与度的关键蛋白质预测方法

针对在交互网络上的关键蛋白质识别通常只关注节点在拓扑层面上的一些特性,但关键蛋白质识别过程中有必要结合蛋白质功能方面的信息,提出了一种基于复合物参与度的关键蛋白质预测方法 DPC(Degree of Participation in Complexes),该方法考虑节点在复合物中邻居节点的数量,综合了蛋白质在复合物内部以及在全局总体上的拓扑特性.在酵母蛋白质网络上的实验结果表明,DPC在关键蛋白质识别率方面明显优于其他六种经典的节点中心性拓扑参数,并且DPC能够识别出参与多个复合物的蛋白质,与关键蛋白质的生物意义相吻合.     

蛋白质组学的研究方法

综述了近年来蛋白质组学研究中较为重要的蛋白质分离、蛋白质鉴定、蛋白质相互作用以及生物信息学等技术.     

基于离散增量的蛋白质β发夹模体识别

从蛋白质的氨基酸序列出发,应用离散增量的方法对3088个蛋白质的β发夹模体和非β发夹模体进行了识别.以氨基酸(20种氨基酸和一个空位)和氨基酸紧邻关联为参量,利用10-fold交叉检验的方法进行检验,获得了良好的预测效果.     

不对称Diels—Alder反应区域选择性的理论研究

用半经验量子化学方法MNDO并结合广义微扰理论,在考虑二烯和亲二烯的两对前线轨道相互作用的基础上,研究了不对称Diels-Alder反应不同反应途径的相互作用能,用相互作用能预测了反应优势产物,定量地计算出了不同产物的比例,结果表明理论预测与实验结果一致。     

融合多源信息的人民币汇率预测

通过有效融合与汇率相关的互联网搜索信息和宏观经济信息,提出一个新的汇率预测方法.一方面,根据信息丰富的互联网大数据,将选取的百度指数关键词信息合成能反映投资者关注度的百度综合搜索指数,再利用核主成分(KPCA)方法对宏观经济变量的信息进行提取,合成宏观综合影响指数,最后构建基于多源信息融合的汇率预测模型;另一方面,分别采用BP、KELM和SVM模型进行预测.为减小预测误差,对神经网络连接权重和阈值使用灰狼优化算法(GWO)进行了优化.通过对美元兑人民币汇率进行实证发现,融合多源数据信息之后,使用GWO-BP预测模型能获得更好的预测性能.     

生物网络在生物功能分析中的应用

生物网络作为一种描述分子间关系的系统生物学方法,是理解生物现象内在运行机制的有效途径,尤其为疾病机理的科学阐明提供理论支撑.说明生物网络的意义,介绍特征提取方法,叙述遗传相互作用网络、基因功能关联网络、蛋白质相互作用网络以及代谢网络的特征和应用.不仅能够加深基础研究人员对生物网络结构和功能的认识,而且指引应用研究人员解决现实生活中的许多问题,如疾病诊疗、药物研制和工程菌构建等.     

AH_3分子的立体化学构型

本文用群重迭积分构成了AH_3分子的轨道能级图和结构相关图。利用相关图推测了AH_3分子的立体化学构型,所作的推测与实验和精确的SCF计算的结果一致。提出了预言角锥形AH_3分子键角相对大小的公式,所作的预言与事实相符。该式还能准确地预测含7个价电子的AH_3分子的形状。     

Kalman滤波器在WCDMA功率控制中的应用

介绍一种适合于分组交换WCDMA无线网络的Kalman滤波器功率控制方法.当数据包连续传送时,信道干扰具有时域上的相关性,Kalman滤波器可用来预测干扰功率.通过干扰预测和路径增益的估计,可确定合适的符合SINR要求的发送功率.给出了仿真结果,结果表明,使用Kalman滤波器的功率控制方法可以提高功率控制的性能.     

应用人工网络对化学传感器CaxPb1-xTiO3薄膜的晶格畸变进行评估

利用人工神经网络对化学传感器的晶格畸变进行了深入研究.实验结果表明:传感原件钙掺杂钛酸铅薄膜材料随合成参数的变化而呈现不同的晶格畸变度,该参数通过X射线粉末衍射精细结构确定,并作为人工神经网络的输出变量;合成参数作为输入变量,以MatlabTM作为操作平台,利用三层识别方法对传感元件的纳米结构进行评估与预测.实验结果与...     

基于灰色系统GM（1,1）模型和Verhulst模型的矿石价格预测对比研究

提出矿石价格预测对于矿山企业的重要性,研究矿石价格走势,预测矿石价格.运用灰色系统GM（1,1）模型和Verhulst模型对近十年银矿石年平均价格进行分析预测,分析对比预测结果,得出GM（1,1）比较适用于矿石价格预测,价格相符度比较高,预测结果能为矿山企业和政府提供相对可靠的价格信息来源.     

基于离散小波变换的膜蛋白跨膜螺旋区段预测

基因组计划所产生的大量蛋白质序列迫切需要从理论上预测跨膜螺旋区段。文中采用基于离散小波变换的方法预测膜蛋白跨膜螺旋区段的数目和位置。以PDB 代码为1KQG的膜蛋白为例,描述了该方法对跨膜螺旋区段的数目和位置的预测分析过程。从最新的MPtopo数据库中随机抽取80条三维结构已知的膜蛋白序列作为测试集 (含325个跨膜螺旋区),采用该方法对跨膜螺旋区段进行预测,其中312个跨膜螺旋区被准确预测到,预测准确率为96.6%。并将预测结果与7种常用预测方法的主要预测结果进行了比较。结果表明,本文提出的方法具有较高的预测准确度。     

基于神经网络误差修正的灰色广义预测控制

提出一种基于神经网络误差修正的多步灰色广义预测控制算法,采用神经网络对灰色系统的建模误差进行预测,同时根据新信息优先的原则,用最新预测误差不断更新神经网络建模数据,对新出现的误差具有动态补偿动力,最终预测值为模型预测值与预测误差之和,有效地抑制模型误差的影响,增强灰色广义预测的鲁棒性.仿真结果验证了该算法的有效性.     

戈壁土路基后期沉降预测方法及误差分析

各种沉降预测的研究已在软土路基进行,而对戈壁土路基这一特殊路基的沉降预测研究较少.以兰新第二双线新疆段工程实测沉降数据为研究对象,分别采用双曲线法、星野法、Asaoka法、GM（1,1）模型四种沉降预测方法,预测戈壁土路基的后期沉降并分析不同时间起点对预测结果的影响.研究表明,常用的双曲线法和Asaoka法的预测精度受预测时间起点影响较大,双曲线法建议恒载期5~6月后为时间起点,Asaoka法建议恒载期1~2月后为时间起点.不同时间起点对星野法和GM（1,1）模型影响较小,其中GM（1,1）模型预测结果最为精确.     

基于小波变换的GM(1,1)-ARMA组合预测模型对悬索管桥的应变预测

ARMA模型采用差分处理对桥梁监测数据进行预测时,会出现数据丢失和预测精度降低的现象.为此,利用小波变换对信号进行离散化处理信息不会丢失的优点,将趋势明显的原始序列离散化,得到不同频带上的块信号.采用灰色GM(1,1)模型对趋势明显的低频信号进行趋势预测,用ARMA模型对平稳的高频细节信号进行细节预测,再将两部分预测值叠加得到最终预测值.对黄河悬索管桥在线监测系统获得的过去一段时间的应变数据进行验证,结果表明所提出的GM(1,1)-ARMA组合模型预测效果明显高于传统ARMA模型,这对实现同类桥梁的预警具有积极意义.     

滑动平均法改进型灰色预测模型在德山开发区电力负荷预测中的应用

利用灰色控制理论对德山开发区电力需求量进行预测.用生成方法对原始数据进行处理,消除了影响电力需求量的众多非重要因素,并从原始数据中挖掘有用的信息,建立微分拟合方程,基于残差修正提出滑动平均法改进型灰色预测模型,增加当年数据的权重,避免数值的过度波动.德山开发区电力负荷预测结果表明该模型能有效提高预测精度.     

客车车轴的应力谱分析与疲劳寿命估算

本文依据我们在“客车车轴随机动态响应及车轴强度的结合研究”一文中所得的计算结果，建立了车轴薄弱环节──轮座部位的计算应力谱模型，并用Ｍｉｎｅｒ线性疲劳累积损伤理论作了ＲＤ＿３轴的疲劳寿命估算，算得其寿命按每年运行２０万公里计，约为３２．８年，即相当于运行里程为６５６万公里。文中试图根据轨道载荷谱所得的计算结果，以车轴为例进行疲劳寿命预估的方法，为进行新型转向架及其它运输机械设计时，不可能得到实测谱的承载部件的寿命估算提供了一种有效的替代方法。