云南省玉米大斑病菌的RAPD分析

 应用7条随机引物对采自云南省不同玉米产区的玉米大斑菌81个菌株的DNA进行了RAPD分析.结果表明,这些菌株共产生60条谱带,其中43条为多态性带,占71.7%.利用UPGMA法对DNA扩增图谱进行聚类分析,以遗传距离0.50为阈值,81个菌株可分为5个遗传群体,表明云南省玉米大斑病菌中具有丰富的种内遗传多样性.然而,这种分子标记所划分的群体与菌株来源地及致病类型间没有直接关系.     

黄海带鱼、小带鱼RAPD和线粒体16S rRNA基因序列变异分析

对黄海带鱼、小带鱼各12个个体进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析,对比多态位点比例、遗传多态度以及遗传距离,并构建Neighbor-joining系统树;通过PCR扩增出线粒体16SrRNA基因,纯化后直接测序,利用生物信息学方法进行序列分析和核苷酸变异比较,结合GenBank上大西洋叉尾带鱼同源序列构建UPGMA系统树.分析结果表明:(1)RAPD技术研究黄海带鱼和小带鱼的遗传多样性具有较高的灵敏度和检出率,带鱼的多态比例和遗传多态度均较小带鱼的低;(2)线粒体16S rRNA基因序列在分析这两物种遗传变异时表现出保守和变异的双重特性,种内变异极小而种间较大;(3)5个随机引物扩增出种特异的RAPD带,可作为种间分子鉴定标记;(4)研究证实带鱼和小带鱼是不同属的两个种,从而在基因水平上支持了Nelson分类系统的观点.     

疣蝗5个种群间遗传分化的RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,在DNA分子水平上对疣蝗5个种群间的遗传差异进行了研究.在23个引物中有6个引物出现稳定的扩增带,扩增总带数为66条,其中53条具多态性,占80.3%,平均每个引物8.9条.利用Nei & Li相似系数和UPGMA聚类法对结果进行分析,发现用该法检测到的遗传差异从南向北是连续性梯度差异,因而建议所研究地区疣蝗是一个单型种.     

油蒿种群遗传分化的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法对油蒿(Artemlsia ordosica Krasch．)的5个种群进行了研究．用15个随机引物扩增出297条清晰谱带，其中285条为多态性谱带．利用POPGENE 32软件对数据进行处理，结果如下：(1)油蒿有着丰富的遗传多态性，多态位点百分率达96％，各种群多态位点百分比在84．6％～90．9％之间．(2)油蒿的种群间分化较小Gat=0．1364，86．36％的遗传变异存在于种群内，各种群的遗传一致度都在96％以上(3)聚类分析显示，地理分布近的种群被聚到了一起，反映了油蒿种群的遗传分化和地理距离有着一定的相关性．     

利用RAPD检测技术推测杂交落羽杉群落间的亲缘关系

采用随机引物扩增多态性DNA（RAPD）技术，对8个可能是杂交墨西哥落羽杉片林样本、其杂交母本-墨西哥落羽杉和杂交父本的同类-柳杉，共计12个样本进行了亲缘关系鉴定和遗传多样性分析，从31个引物筛选出17个随机引物，共扩增出164条带，其中，多态带有162条，占全部条带的98.8%，检测结果表明：在编号为8，11，12的3个柳杉样本中，11号与原杂交父本亲缘关系最近；1，4，9号是杂交墨杉群落的可能性最大；5号可能是未杂交的墨杉纯林，其他群落的样本是否为杂交墨彬尚不能通过本试验得出明确结论。     

两个桂热甘蔗品种(系)的简单重复序列间扩增(ISSR)分子鉴别

利用筛选出的10个简单重复序列间扩增(inter-simple sequence repeat,ISSR)引物对两个甘蔗优良品系的基因组DNA进行扩增,共扩增出126条条带,多态性比率分别是81.7%和80.2%。从中筛选出3对带型分布均匀、多态性丰富且分辨能力强的引物,对两个桂热甘蔗品种(系)进行分子标记鉴别。结果表明,两品种间的谱带基本相同,但均存在桂热2号和桂热3号特有的谱带;这表明了两品种间在DNA水平上存在真实的遗传差异,834、844和846引物利用特殊ISSR标记的存在或缺失鉴别了两个桂热甘蔗品种(系)。此结果为后续应用分子标记方法鉴别甘蔗品种及选育新品种提供重要依据。     

利用RAPD标记技术对刺槐属（Robinia）种间亲缘关系的分析

用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对刺槐属(Robina)内5种植物进行基因组DNA多态性分析.共选用22个10 bp随机引物扩增出212个DNA片段,进行种间遗传关系分析.片段大小在100～2 200 bp之间,其中多态性谱带为183条,多态率为86.3%;利用UPGMA进行遗传距离计算的结果表明,刺槐、毛刺槐和香花槐分属刺槐属的三个种,红花刺槐和龙槐是刺槐的变型.首次在DNA水平上证明香花槐为刺槐属的一个独立种,且与毛刺槐的亲缘关系较近.为刺槐属植物亲缘关系和系统分类建立了新的分子学证据.     

内蒙古3个绒山羊品种RAPD的初步研究

利用随机扩增多态DNA（RAPD）技术,研究了内蒙古地区3个绒山羊品种的DNA多态性,由此推导它们之间的遗传距离和系统发育关系。在所使用的12种随机引物中,有8种随机引物扩增出多态谱带,共检测到32个RAPD标记,其中有21个发生变异。用Nei的片段公享度公式计算了品种间的遗传距离,用UPGMA聚类法构建了系统发育树。结果表明：内蒙古白绒山羊的3个类群彼此亲缘关系较近,分化不明显;内蒙古白绒山羊与罕山白绒山羊聚为一个大类,辽宁绒山羊和乌珠穆沁白绒山羊聚为一个大类,说明内蒙古白绒山羊与罕山白绒山羊有较近的亲缘关系,乌珠穆沁白绒山羊与辽宁绒山羊的亲缘关系较近。     

两个优良凉蔗品种(系)的ISSR分子鉴别

本研究利用筛选出的10个ISSR 引物对两个甘蔗优良品系的基因组DNA 进行扩增,共扩增出126条条带,多态性比率分别是81.7%和80.2%。从中筛选出3对带型分布均匀、多态性丰富且分辨能力强的引物, 对两个凉蔗品种(系)进行分子标记鉴别。结果表明, 两品种间的谱带基本相同,但均存在02-6和02-186特有的谱带,这表明了两品种间在DNA 水平上存在真实的遗传差异,834、844和846引物利用特殊ISSR 标记的存在或缺失鉴别了两个凉蔗品种(系)。此结果为后续应用分子标记方法鉴别甘蔗品种及选育新品种提供重要依据。     

罗汉果性别相关的RAPD标记

应用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术寻找与罗汉果性别相关的分子标记,筛选了130个10 bp的随机引物,发现有4个引物(S60、S90、S100、S343)能在雌、雄株DNA间扩增出5条差异性片段,大小在300~1 300 bp之间,表明这些特异带可被用来作为性别鉴别的特异性分子遗传标记。     

尾叶桉和细叶桉无性系的RAPD指纹图谱构建

利用ＲＡＰＤ分子标记技术对来自９个起源地点的尾叶桉（ＥｕｃａｌｙｐｔｕｓｕｒｏｐｈｌａＳ．Ｔ．Ｂｌａｋｅ）和细叶桉（Ｅ．ｔｅｒｅｔｉｃｏｒｎｉｓＳｍｉｔｈ）共２２个无性系的研究表明,１３个引物共扩增出１１０个位点,多态性位点９１个,在起源地点间差异显著的多态性位点２５个,各无性系有其特异的ＲＡＰＤ扩增谱带。利用多态性位点的数据矩阵,计算了各无性系间的遗传距离,并构建了无性系间的遗传关系聚类图。     

唐鱼野生与养殖群体遗传多样性的随机扩增多态DNA(RAPD)分析

应用随机扩增DNA多态性(RAPD)技术对唐鱼野生与养殖群体的遗传多样性进行了分析。从40个10BP引物中选取15个用于群体遗传多样性分析,共检测出93个位点,其中46个(49.46%)呈多态;两群体的多态位点比例分别为43.01%和41.94%;用香农指数量化的遗传多样性指数,野生群体(0.23)略高于养殖群体(0.20),平均遗传多样性指数为0.22,群体内和群体间的遗传变异比例分别为85%和15%;群体的遗传相似度高达0.96,彼此间的遗传距离仅为0.04。研究表明,唐鱼目前的种质资源状况令人堪忧,恢复唐鱼有效种群大小、丰富物种遗传多样性是资源保护的基础。     

黄河三角洲柽柳群体遗传多样性RAPD分析

采用随机扩增多态DNA(RAPD)分子标记技术,分析了黄河三角洲主要优势树种之一柽柳(Tamarix chinensis)3个天然群体的遗传多样性及遗传分化。结果表明:26条随机引物扩增出105个可分析位点,多态位点百分比40.07%,Nei的基因多样度(h)为0.4061,Shannon多样性指数(I)为0.5917,基因分化系数(Gst)为0.0507,基因流值为9.3564。分子方差分析(AMOVA)表明,在总遗传变异中,群体间遗传变异占7.17%,群体内占92.83%。说明柽柳物种内存在较高的遗传多样性,群体的遗传变异主要存在于群体内,群体间基因交流频繁,遗传距离与地理距离具有显著相关性。     

利用RAPD标记对中国石竹属植物亲缘关系的研究

利用RAPD标记研究了中国石竹属10个种和10个栽培品种亲缘关系。39个随机标记共获得242个多态位点，聚类分析结果表明可分为野生种和栽培品种2大类群，两类群的Nei(1978)遗传距离为0．4698。野生种可分为生长于湿润草甸和生长于干燥山地两类群，遗传距离为0．2428。     

丁鱼岁遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析

利用RAPD分子标记技术对15个丁鱼岁养殖个体的遗传多样性进行分析.选用20个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增,有16个引物可以扩增出稳定且清晰的条带,其中S103、S104和S105为多态引物.16个引物共扩增出65个DNA位点,片段大小在200~3 000 bp之间,其中多态性位点6个,多态位点比例为9.23%.个体间遗传距离在0~0.067 4之间,平均遗传距离为0.028 6.结果显示,丁鱼岁养殖群体的遗传多样性水平较低.     

Clones identification of Sequoia sempervirens (D. Don) Endl. in Chile by using PCR-RAPDs technique

A protocol of polymerase chain reaction-random amplified polymorphic DNAs (PCR-RAPDs) was established to analyse the gene diversity and genotype identification for clones of Sequoia sempervirens (D. Don) Endl. in Chile. Ten (out of 34) clones from introduction trial located in Voipir-Villarrica, Chile, were studied. The PCR-RAPDs technique and a modified hexadecyltrimethylammonium bromide (CTAB) protocol were used for genomic DNA extraction. The PCR tests were carried out employing 10-mer random primers. The amplification products were detected by electrophoresis in agarose gels. Forty nine polymorphic bands were obtained with the selected primers (BG04, BF07, BF12, BF13, and BF14) and were ordered according to their molecular size. The genetic similarity between samples was calculated by the Jaccard index and a dendrogram was constructed using a cluster analysis of unweighted pair group method using arithmetic averages (UPGMA). Of the primers tested, 5 (out of 60) RAPD primers were selected for their reproducibility and high polymorphism. A total of 49 polymorphic RAPD bands were detected out of 252 bands. The genetic similarity analysis demonstrates an extensive genetic variability between the tested clones and the dendrogram depicts the genetic relationships among the clones, suggesting a geographic relationship. The results indicate that the RAPD markers permitted the identification of the assayed clones, although they are derived from the same geographic origin.     

基于RAPD技术的红花品种遗传多样性分析

利用RAPD分子标记技术分析了国内11个省的20个红花品种间的遗传多样性.从筛选出的20个引物中,共扩增出209个位点,其中多态性位点178个,平均多态性比率为85.17%.采用成对算术平均数的非加权成组配对法(UPMGA)对Nei’s的一致度进行的聚类分析结果表明川红花和陕红花的遗传距离最近(0.206 5),太空1号和虞城红花的遗传距离最远(0.571 6).在遗传距离为0.38处将20个红花品种分为4个类群.其中云红3号、亳州红花、延津红花、延津大红袍、南阳红花、卢氏草红花、义县红花、白沙1号、太空1号、杞县刺红花聚为一类,该类群中大多数为河南道地红花品种,说明红花不同品种之间的遗传多样性可能与地理分布存在一定相关性.     

怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析

采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.