大青杨PuZFP 103基因的序列特征及逆境胁迫的表达分析

[目的]通过研究大青杨(Populus ussuriensis)PuZFP 103基因的序列特征及其在不同组织部位、激素处理与胁迫应答中的表达特性,为揭示PuZFP 103在大青杨生长发育中的功能提供依据.[方法]利用各种生物信息学方法对PuZFP 103基因进行分析,采用实时荧光定量PCR(real time qua...     

丛枝菌根(AM)真菌对大青杨苗木根系的影响

应用丛枝菌根(AM)真菌对大青杨苗木进行人工接种,摩西球囊霉(Glomus mosseae)、根内球囊霉(G.intraradices)、弯丝球囊霉(G.sinuosa)、地表球囊霉(G.versiforme)都与盆栽大青杨苗木形成菌根复合体。菌根化苗木的主根长、地径、侧根数、根生物量均与对照苗木差异显著。苗木生物量的累积与菌根侵染率呈显著正相关(P<0.05),证明大青杨为菌根依赖性树种。G.mosseae和G.intraradices侵染率分别是64.4%和67.4%,侵染效果最好。菌根真菌使苗木根系体积增大、总吸收面积增加,特别是使苗木根系的活跃吸收面积显著增加,其中接种G.mosseae的苗木根系活跃吸收面积比是对照处理的1.64倍。根系中活跃吸收面积比与磷、钾元素含量呈显著正相关。苗木生长的盛期和末期,菌根化苗木根系过氧化物酶活性显著高于对照,而在生长后期却显著低于对照(P<0.05)。由于受菌根真菌的影响,苗木根系多酚氧化酶活性显著高于对照(P<0.05),在苗木生长盛期酶活性最强,不同菌种接种的苗木间差异不显著。     

蝴蝶优化算法对大青杨生长速率预测模型的改进

为提高大青杨生长速率的预测精度,提出一种基于改进的蝴蝶优化算法（Improved Butterfly optimization algorithm,IBOA）与径向基函数（Radial basis function,RBF）神经网络结合的预测木材材性方法。通过使用佳点集法对标准蝴蝶算法中的种群进行初始化,将自适应切换频率和Levy飞行相结合进一步优化人工蝴蝶算法。构建出了新的IBOA-RBF神经网络木材材性预测模型,将得到的结果与其他几种算法优化的RBF神经网络预测结果进行对比。结果表明：基于IBOA-RBF神经网络模型预测效果最好,收敛速度从37步降低到了23步,预测结果误差达到了5.72%,预测精度最高。可见,对蝴蝶算法的改进是可行的,且对相关人员定向培养大青杨起到较大的帮助。     

葛属植物基因组DNA的提取和纯化

采用SDS裂解法提取了葛属植物成熟叶片的基因组DNA,并利用凝胶纯化试剂盒进行了纯化。结果表明,该纯化方法有效,所获得的DNA可用于PCR反应。     

毛白杨成熟叶片基因组DNA提取方法的比较研究

比较了4种毛白杨成熟叶片DNA的提取方法,结果表明,SDS法的提取效果优于CTAB法.其中,SDS-II法步骤较少,操作简便,不易造成实验误差,OD260/280值为1.87,提取的DNA片段长度在20kb左右,提取得率为42μg/g,为4种方法中最高.ISSR-PCR实验的效果表明,SDS-II法提取的DNA可以做为ISSR分子标记的模板DNA.     

不同方法提取水溞基因组DNA的比较

为获取抽提水溞基因组DNA的最适方法,本研究采用酚-氯仿法,CTAB法和试剂盒法3种方法提取水溞基因组DNA,并用琼脂糖凝胶电泳检测DNA提取的效果.结果表明3种DNA提取方法均获得较好的DNA,其中试剂盒方法提取的DNA最为理想,完全可满足后续分子生物学实验.     

利用改良CTAB法提取雪莲果基因组DNA

阐述了利用改良CTAB法提取雪莲果（Smallanthus sonchifolius）基因组DNA的的过程,对提取的DNA经0.8%琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测,表明此法提取的DNA的一级结构完整,浓度较高,其DNA可进一步用于其他分子生物学试验。     

菜心基因组DNA提取及RAPD反应体系的优化

用改良的CTAB法提取菜心基因组DNA,并利用紫外分光光度法测定其纯度和含量,用琼脂糖凝胶电泳法检测DNA的降解状况和纯度．结果表明:此法提取的DNA具有典型的天然DNA分子的标准紫外吸收光谱特点, 且适于进行RAPD分析．RAPD分析的优化反应体系为:25μL的反应液中含有0．8 U的Taq酶,0．28 μmol／L primer,30 ng的DNA,2．0 mmol／L Mg2 ,0．20 mmol／L dNTPs．PCR扩增循环为94℃、5 min;94℃、1 min; 36℃、1 min;72℃、2 min,37个循环;72℃延伸10 min．     

五种提取草珊瑚叶片总DNA方法的比较研究

运用五种方法提取草珊瑚叶片总DNA。结果证明,加入PVP（聚乙烯吡咯烷酮）的改良CTAB法可以有效地提取产量高、质量高的草珊瑚叶片的总DNA。为草珊瑚及其它草珊瑚属植物的起源、分类、亲缘关系分析及品种特征图谱的建立提供可借鉴的依据。     

用改进的CTAB法提取香菇基因组DNA

通过用改进的CTAB法提取27个香菇菌株的基因组DNA,并分别用紫外、琼脂糖凝胶电泳和PCR技术检测提取DNA样品的质量和产量,证明该方法可以用于香菇基因组DNA的提取,为香菇基因组DNA的提取建立了一种简单可靠的新方法.     

从动物血液中提取基因组DNA方法的比较研究

从血液中提取基因组DNA的传统方法是先得到淋巴细胞,再用蛋白酶K、SDS消化,然后用酚、氯仿抽提,乙醇沉淀．CTAB法提取基因组DNA多应用于植物和微生物,从全血中提取基因组DNA报道甚少．采用改良的CTAB法从全血中提取基因组DNA,并以传统方法和TAKARA Blood Genome DNA Extraction Kit作对照．结果表明：CTAB法可以得到大量的、较完整的基因组DNA,并且纯度达到1．8～2．0,可以满足PCR扩增和限制酶切等实验的要求．     

丝状真菌产黄青霉DNA提取方法的改进

为探索提取产黄青霉基因组DNA的简便方法,采用起始菌体量0.2 g,10 g/L十六烷基三甲基溴化铵裂解液,通过液氮/65℃反复冻融对菌种破壁,代替了液氮研磨,且不需要玻璃珠,操作简便,重复性好,提取的DNA质量高,极大地方便了后续基因操作.     

酒精和冷冻处理对肌肉组织基因组DNA提取的影响

提取基因组DNA的质量对于后续的基因扩增、酶切以及测序等分子生物学研究具有关键的影响,对肌肉组织进行不同的酒精和冷冻处理会显著影响提取DNA的质量。经过-80℃超低温冷冻数日的黄鳝样品解冻,取肌肉组织放入75%酒精处理后提取的基因组DNA完整性差、降解厉害;经过-80℃超低温冷冻数日的黄鳝样品直接取肌肉组织提取的基因组DNA比较完整、降解程度低;活体采取的黄鳝新鲜肌肉组织样品经过75%酒精处理,在-80℃超低温冷冻数日然后提取的基因组DNA质量也较好,电泳条带明晰而锐利,弥散降解带较少。后两种处理方法对黄鳝肌肉组织中DNA酶活性降低显著,因此提取的肌肉组织基因组DNA质量较高,可以有力支持后续的酶切、PCR扩增等分子生物学实验。     

蒲公英药材总DNA的提取

采用改良的CTAB法、SDS法、高盐低pH法提取蒲公英药材基因组总DNA,通过紫外吸收、琼脂糖凝胶电泳检测其纯度与浓度.结果表明,改良的CTAB法所得DNA纯度最高,电泳条带最清晰、完整性好,可作为RAPD,ISSR等分子生物学研究.     

椰子不同组织基因组DNA的提取及质量分析

以椰子植物的叶片和花序组织为材料,探索了应用CTAB微量法分离高质量椰子基因组DNA的方法.结果表明,采用CTAB的缓冲液裂解材料,以及在提取过程中用φ=4%的β-巯基乙醇的改良CTAB法,可有效地控制椰子这种高纤维、易褐变材料和多糖在DNA提取过程中的污染和影响.应用本研究建立的分离方法,可从椰子的叶片和花序2种不同材料中分离得到高质量的基因组DNA,产量分别达0.75 g.L-1和0.65 g.L-1.通过Hind III酶切实验证明,分离出的基因组DNA适用于限制性酶切反应的分析和操作;该方法的建立可有效地应用于椰子和其他棕榈科植物基于DNA的分子生物学研究.     

试剂盒法提取蓖麻基因组DNA的条件优化

利用DNA提取试剂盒提取蓖麻叶片DNA,对其过程进行改良优化,从而获得一种快速、简便的提取蓖麻高质量基因组DNA的方法.在原试剂盒的操作基础上,对乙醇是否冰预冷、消化时间、洗脱液用量、材料用量等条件进行了优化,并对所提取的基因组DNA的浓度、纯度进行了检测.优化后的方法提取到了较高质量的蓖麻基因组DNA.     

甘薯幼苗叶片基因组DNA提取方法的比较研究

以甘薯幼苗叶片为材料,分别采用CTAB法和SDS法对DNA的提取方法进行研究。结果表明,CTAB法更适合甘薯幼苗叶片基因组DNA的提取,所得DNA质量好,纯度高。     

扩展青霉(Penicillium expansum)PF898基因组DNA提取方法的比较

利用CTAB法、SDS改进法和SDS快速法3种DNA提取代表性方法,对扩展青霉(Penicillium expansum)PF898基因组DNA的提取进行比较研究.CTAB法提取的DNA样品纯度最高,SDS裂解法制备的DNA得率最高;CTAB法和SDS改进法所得DNA都可直接应用于限制性酶切分析;3种方法所提取的DNA均能满足扩展青霉PF898脂肪酶基因和18S rRNA的PCR扩增.总体而言,SDS法简便、快速、得率高,是一种理想的扩展青霉基因组DNA提取方法.     

浅谈改良CTAB法提取豌豆基因组DNA

通过改良CTAB法从豌豆（Pisum sativum）嫩叶中提取了基因组DNA,并进行了紫外分光光度计和琼脂糖凝胶电泳分析,结果表明,得到的DNA一级结构较完整,杂质较少,浓度也较高,可进一步用于PCR（Polymerase chain reaction）和酶切等分子生物学实验。