基因进化过程中核苷酸替代模型的比较分析

DNA序列中核苷酸替代数的估计是测定基因间进化距离的数学统计方法,是研究基因进化的基础.由于DNA分子包含多种序列区域等原因,核苷酸序列的替代模式比较复杂.最基本的核苷酸序列替代模型是p-距离模型J、ukes-Cantor模型、Kimura两参数模型.在此基础上衍生出其它一系列模型,如Tajima-Nei模型、Tamura模型、Tamura-Nei模型等.这些数学模型在拟合DNA序列进化的真实度时各有特点.这些模型中都假定各个位点的核苷酸替代速率一致,但实际情况并非完全如此,而是核苷酸的替代速率近似地遵循Г分布.     

氨基酸突变的统计理论

假定氨基酸突变频率(观察值)决定于两个因子,一是由碱基突变决定的突变系数,二是决定突变型在选择压力下存活水平的相似因子,由此假定出发计算了380对氨基酸的突变频率,在一定的允许误差范围内和观察值符合对数可达95％以上。     

分子进化的基本化学规律

N-磷酰-α-氨基酸在水或有机溶剂中可能同时自组装生成肽及核苷酸,而β-氨基酸或γ-氨基酸在同样条件下则不发生任何反应。这种分子结构的特征是由磷化学的特性所决定的。五配位磷化合物对α-氨基酸及核糖具有专一的化学选择性,这种化学选择性推动了自然选择。     

关于生物分子进化和分子适应策略的研究

从生物的C值矛盾、基因表达调控、基因表达产物的准确性以及DNA的复制方向等分子水平的相关研究来解读生物分子进化和分子适应的策略问题，同时从比较基因组学和分子生态学的角度深入探讨了分子进化和分子适应的研究方向和特点，为进一步研究相关问题提供文献和理论支持．     

核苷酸序列的有序片段和分子进化

定义了核苷酸序列的有序片段（Ｘ１，Ｘ２…Ｘｋ）ｎ，Ｘｉ表示碱基的嘌呤嘧啶分类或强弱健分类，ｎ为重复次数，通过统计分析６．８Ｍｂｐ资料找出全部ｋ＝２，３的有序片段，发现若干有序片段的含量具有较好的进化相关性。     

中立学说和分子进化研究——现代进化学说的前沿动向

进化综合学说曾君临天下在本世纪ZO年代以后，在现代遗传学理论基础上，群体遗传学家、实验进化遗传学家、古生物学家、系统分类学家、生态遗传学家相继携同努力，论证了突变、杂交、隔离，尤其是自然选择在生物进化过程中的重要作用，从而形成了进化的综合学说。由于这个学说格外强调自然选择的作用，故一些学者又称它为新达尔文主义。以果蝇为主要研究材料的实验进化遗传学的代表学者丁．杜布赞斯基于1937年发表了他的著名著作《遗传学与物种起源》，标志着综合学说的成熟（综合学说这个名称是英国进化论大家上赫青黎于1942年提倡的）。…     

猛禽和夜鹰类的线粒体DNA序列比较和分子进化关系的研究

测定和比对了隼形目、鸮形目、夜鹰目的12SrRNA基因片段，长度为415bp．使用MEGA2．1软件构建分子系统树并分析其系统进化关系．数据显示，该基因片段的DNA序列变异丰富，转换和颠换数未随着遗传距离的增加而出现饱和现象，反映出较高真实水平的鸟类系统发育关系．重建系统进化树表明：与隼形目隼科相比，隼形目鹰科与鸮形目、夜鹰目的亲缘关系更近，提示了隼形目隼科和鹰科之间可能存在着较大的遗传变异；与夜鹰目相比，鸮形目和隼形目鹰科鸟类的亲缘关系较近，与传统分类观点相同，不支持将鸮形目和夜鹰目合并为鸮形目的观点．     

猛禽和夜鹰类的线粒体DNA序列比较和分子进化关系的研究

测定和比对了隼形目、鸮形目、夜鹰目的12SrRNA基因片段,长度为415 bp.使用MEGA2.1软件构建分子系统树并分析其系统进化关系.数据显示,该基因片段的DNA序列变异丰富,转换和颠换数未随着遗传距离的增加而出现饱和现象,反映出较高真实水平的鸟类系统发育关系.重建系统进化树表明:与隼形目隼科相比,隼形目鹰科与鸮形目、夜鹰目的亲缘关系更近,提示了隼形目隼科和鹰科之间可能存在着较大的遗传变异;与夜鹰目相比,鸮形目和隼形目鹰科鸟类的亲缘关系较近,与传统分类观点相同,不支持将鸮形目和夜鹰目合并为鸮形目的观点.     

植物病毒、类病毒分子进化研究的现状和展望

对植物病毒、类病毒的分子进化进行了综述，通过分析和比较其全碱基序列，探讨了病毒、类病毒内部的亲缘关系和进化关系。     

蛋白质中三联氨基酸数与二级结构数的模型研究

蛋白质的一级结构或序列与二级结构的关系在蛋白质结构研究中是很重要的,通过建立模型的方法来研究这种关系.在文献中已有的模型(蛋白质一级结构中的二联氨基酸与蛋白质二级结构的模型)的基础上,建立了蛋白质一级结构中的三联氨基酸个数与蛋白质二级结构个数模型.该模型能够较准确地反映蛋白质的一级结构或序列与蛋白质的二级结构的关系,比较适合应用于氨基酸序列长度变化较大的建模数据,同二联氨基酸与二级结构模型比较,由于三联氨基酸含有更多氨基酸之间的耦合信息,该模型的拟合精度更高.由于蛋白质一级结构中的三联氨基酸的种类数很大(为4 200),用以建模的变量数就很大,同时从DSSP数据库得到的样本量也很大(为11 600),用以建模的数据量很大.研究结果表明,PLS变量筛选法是一种建立大数据模型有效的方法,可有效地处理变量数为4 200,样本数为11 600这样大数据量的建模问题.     

乙酰乙酰氨基酸合成方法的改进

由氨基酸合成蛋白质或多肽时,使它的氨基与苄氧羰基或乙酰乙酰基等结合,作为保护基团,使它的羧基成为单一转化中心,反应完成后,可通过还原等方法将保护基除去.制备乙酰乙酰氨基酸的方法过去主要采用氨基酸的水溶液,在等当量的氢氧化钠存在下,与双烯酮(diketene)在0℃左右的低温下进行反应:     

燕麦中蛋白质的提取、纯化及氨基酸成分分析

利用不同浓度的NaCl溶液和复合酶对燕麦蛋白质进行提取试验,结果表明:最佳的工艺条件为,温度40℃,盐浓度8%,复合酶用量3.5 g(U/g),反应时间4 h;燕麦蛋白质提取率为67.5%,蛋白质纯度达到91.4%,蛋白质含量为15.2%.燕麦蛋白质氨基酸分析表明:氨基酸含量丰富,尤其是人体所必需的氨基酸齐全,比例适当.     

磷酰化氨基酸的特性及应用前景

综述了磷酰化氨基酸的研究进展．磷酰化氨基酸能够发生自身活化成肽、成酯、磷上酯交换和磷酰基的N→0迁移等化学反应，对解释一些生命现象和探讨生命起源具有重要的作用，同时，在生物技术、医药等领域也展示了广阔的应用前景、     

蛋白质规则二级结构中亲疏水氨基酸紧邻关联特性

将氨基酸椐亲 -疏水性按 5度简并进行分类 ,然后映射于蛋白质规则二级结构中 ,对规则二级结构中氨基酸的亲 -疏水性紧邻关联作了统计分析 ,并给出规则二级结构中亲 -疏水氨基酸的位置择优规律性     

离子交换分离混合氨基酸实验方法的改进

离子交换层析分离混合氨基酸是生物化学或生物制药工艺学实验课程中一个重要的制备性实验,为了更好地提高该实验对学生基本知识及综合能力的培养,作者改进了原有的实验教学设计,优化编写了新的实验教材,减少试剂消耗及实验耗时。氨基酸洗脱差异明显,洗脱原理更为多样,教学效果大幅度提高。     

中药薄荷草中氨基酸的测定

用日立835-50型氨基酸分析仪对苏北产薄荷的叶、茎及整株进行了游离氨基酸的分析，结果表明，薄荷中含16种氨基酸，叶、茎及整株中游离氨基酸的总含量分别为9．805％、3．995％和7.005％，其中6种为人体必需氨基酸。     

甜杏仁中微量元素及氨基酸成分的分析

用电感耦合等离子体发射光谱仪、氨基酸分析仪分别测定甜杏仁中的微量元素及氨基酸的含量,结果显示含有17种氨基酸,总量为27.259 g.100g-1,人体必需的八种氨基酸种类齐全,总量为8.691 g.100g-1;并含有多种人体必需的微量元素。     

川明参与北沙参中氨基酸的测定

测定了中药川明参和北沙参中氨基酸的含量和组成。结果表明：川明参和北沙参至少含１３种氨基酸，其中含丰富的天冬氨酸和谷氨酸，还含有人体必需的七种氨基酸，为全面深入地研究和开发这两种药物提供了参考依据     

红鳌鳌虾胚胎发育过程中蛋白质含量及氨基酸组成的分析

采用生物化学方法对红整鳌虾胚胎发育过程中蛋白质与氨基酸的组成进行了测定和分析。总蛋白与总氨基酸的含量均呈下降趋势。总蛋白由受精卵期的65.32%(占干重)降低到准备孵化期的40.28%;总氨基酸含量由受精卵期的58. 05%(占干重)减少至准备孵化期的47.49%.必需氨基酸(除Met外)的变化与总氨基酸含量呈显著性相关，且变异系数在8.25-13.34%之间;非必需氮基酸中Glu,Asp的含量较高，Cys的含量较低。蛋白质和氨基酸不仅是红鳌鳌虾胚胎发育的构建物质而且在胚胎发育过程中提供能量。