蝙蝠：大自然中移动的病毒库

正2020年年初暴发了新型冠状病毒肺炎疫情,有科学家认为,病毒的来源可能是蝙蝠。为什么又是蝙蝠?此前,SARS(非典)、埃博拉、中东呼吸综合征等传染病的病源,都指向蝙蝠。相比其他野生动物,蝙蝠体内的病毒多得吓人,可能是多种病毒的自然宿主。这是为什么呢?     

蝙蝠:大自然中移动的病毒库

<正>2019年年末以来,全球多地相继爆发了新型冠状病毒肺炎疫情。科学家认为,病毒的来源可能是蝙蝠。此前,SARS(非典)、埃博拉、中东呼吸综合征等传染病的病原体,也都源于蝙蝠。相比其他野生动物,蝙蝠体内的病毒多得吓人。这是为什么呢?     

新冠病毒谱系或在蝙蝠中已传播几十年

<正>一项最新病毒学研究显示,新冠病毒或在40年至70年前从与之关系最紧密的蝙蝠病毒中分化出来,其意味着产生新冠病毒的病毒谱系,可能已经在蝙蝠中传播几十年了。蝙蝠病毒Ra TG13被鉴定为与新冠病毒关系最密切,同时提示新冠病毒爆发可能源于蝙蝠。但是,研究人员也在穿山甲体内发现了相似的冠状病毒,有观点认为,穿山甲可能是中间宿主。     

你了解蝙蝠吗

正2003年的非典型肺炎和如今的新型冠状病毒肺炎,追本溯源,不论是果子狸还是竹鼠,最终将致命的病毒来源都指向了蝙蝠。一时间,蝙蝠被推向风口浪尖,人们对蝙蝠的憎恶、恐惧,以至想将其斩尽杀绝的欲望达到了无以复加的地步,然而这真的是蝙蝠的错吗?下面这些关于蝙蝠的知识你知道吗?蝙蝠是自然界第二大哺乳类动物,是会飞翔的兽类,种类繁多,数量庞大,分布广泛,全球有900多种,我国有80多种。蝙蝠喜群居,躲在无人到达的峭壁崖缝、深山岩洞以及废弃多年、无人踏入的建筑物的缝隙内或天花板等处,昼栖夜出,从不主动骚扰人类。     

蝙蝠具有“全天候”的免疫系统

蝙蝠是超过100种病毒的天然宿主,其中一些病毒对人类的伤害则是致命的,包括中东呼吸综合征(MERS)、埃博拉病毒等,然而这些病毒却对蝙蝠没有影响,这是什么原因呢?目前一项新的研究发现,这或许与蝙蝠独特的"全天候"免疫系统有关。科学家认为,可以借鉴蝙蝠的这种能力研究出保护人类不受埃博拉等致命疾病伤害的方法。研究人员通过对澳大利亚黑狐蝠的基因和免疫系统进行检测,获得了一些重要发现。研究人员研究了     

SARS-CoV蛋白质组的生物信息学及其进化关系

一种新的冠状病毒 SARS-CoV是引起严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome, SARS)的病原体. 对由SARS病毒全基因组序列推导出的所有蛋白质逐一进行分子量、等电点、分子消光系数等物理化学性质计算, 以及跨膜区和亚细胞定位预测, 辅以保守序列家族数据库搜索, 预测SARS-CoV功能未知蛋白质的功能. 同时, 通过SARS-CoV与其他冠状病毒蛋白质同源序列比较和进化距离计算, 分析SARS病毒的分类地位以及与其他冠状病毒的进化关系. 结果表明, 尽管SARS病毒是不同于其他3组冠状病毒的一种全新冠状病毒, 但在进化关系上更靠近牛冠状病毒BoCoV和鼠肝炎病毒MHV. 为实验测定SARS病毒蛋白质组以及抗SARS疫苗研制提供了参考和帮助.     

SARS-CoV-2将如何进化

<正>跨越不同物种传播,然后又高度适应新宿主——这一进化过程在像COVID-19这样的大流行中扮演了何种角色?严重急性呼吸综合征(SARS,由SARS-Co V病毒引起)疫情始于2002年的11月,持续了8个月,到次年7月基本结束。新型冠状病毒(SARS-Co V-2,简称新冠病毒)有着和SARS病毒高达80%相似度的基因序列,以及一个类似的故事开头,却走向迥然。后者在盛夏销声匿迹,而新型冠状病毒肺炎(COVID-19)     

新型冠状病毒结合穿山甲ACE2受体的分子机制

新型冠状病毒病(coronavirus disease 2019, COVID-19)的病原体为新型冠状病毒(COVID-19 virus),以下简称为新冠病毒,也称为severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2).研究认为, SARS-CoV-2可能起源于蝙蝠,但是其中间宿主仍不清楚.目前,除蝙蝠外,穿山甲被证明是唯一携带SARS-CoV-2相关冠状病毒的哺乳动物,因而被认为是可能的中间宿主.本研究利用表面等离子共振实验(surface plasmon resonance, SPR)展现和分析了SARS-CoV-2和两种穿山甲冠状病毒(pangolin-CoVs, GX/P2V/2017和GD/1/2019)分别与穿山甲ACE2(pangolin ACE2, pACE2)和人ACE2(human ACE2, hACE2)受体的结合能力,解析了SARS-CoV-2刺突蛋白(spike, S)受体结合域(receptor binding domain, RBD)与p ACE2复合物的晶体结构,分辨率为2.3?,发现...     

新型冠状病毒的“身份证”信息

正2020年春节,迫使大家都闭门在家的新型冠状病毒究竟是一种怎样的病毒?根据科学家的研究,我们给它编制了一张"身份证"。让我们一起来看看相关信息。姓名:新型冠状病毒新型冠状病毒可以简称为"新冠病毒"。冠状病毒是个大家族。这个家族目前有15个"兄弟",其中有7个可以感染人类。在这7种可以感染人类的冠状病毒中,新冠病毒的年龄最小,它的6个"哥哥"分别是:     

吸血蝙蝠

9世纪的关于吸血蝙蝠的早期报道认为,吸血蝙蝠只攻击马、牛和猪,即便真的攻击人,其概率也是相当小的.但事实并非如此. 2004年9月,秘鲁的康多康奇省发生了令人震惊的吸血蝙蝠袭人事件,大约有2300人被吸血蝙蝠咬伤,其中有上百人感染病毒死亡.2005年5、6月,巴西的帕拉州有700多人被蝙蝠袭击,有30余人死于蝙蝠叮咬后出现的狂犬病.     

最新一轮埃博拉疫情源于两岁男孩？

科学家在2014年8月底宣布，他们之前在几内亚、利比里亚、刚果金和尼日利亚埃博拉疫区进行了为期三周的调查，包括在目前这场疫情（始于2013年12月）的起始地点--几内亚东部的一个偏远村庄捕捉蝙蝠及其他动物进行研究，结果发现这场疫情是由一名两岁男孩引发的。这个男孩被携带埃博拉病毒的蝙蝠咬过之后，又把病毒传给了自己的母亲，母子俩都在不到一周内死亡。随后，病毒由参加葬礼的人们传播开。     

呼肠病毒, 在SARS患者中分离与初步鉴定

严重急性呼吸综合征(SARS)疫情在北京造成了严重后果, 冠状病毒已被广泛认定为导致SARS的病原体. 但是临床和实验提示, SARS病因可能不是单一冠状病毒感染. 本文报道了我们从北京市第1例SARS患者和其母亲的咽拭子中分离出呼肠病毒. 在电子显微镜下, 可观察到典型的呼肠病毒. 血清学实验显示, 38例SARS患者中24例对呼肠病毒呈阳性反应. 针对呼肠病毒的基因保守序列(S2基因片段)设计引物, RT-PCR实验扩增出特异性DNA片段. 进一步DNA序列分析表明是一种独特的呼肠病毒(呼肠病毒科正呼肠病毒属). 初步动物实验显示, 该呼肠病毒可导致非典型样肺炎发生和小鼠死亡. 尽管如此, 呼肠病毒感染是否与SARS疫情有关, 还有待进一步研究才能阐明.     

冠状病毒

冠状病毒在系统分类上属冠状病毒科(Coronaviridae)冠状病毒属(Coronavirus).新发现的SARS病毒属冠状病毒的一个新种.科学家对SARS病毒基因组进行了全面测序分析后发现,其基因组由29730个碱基组成,与已知的三类冠状病毒相差甚远,只有64%的序列相同.可以推测,SARS病毒不是已知病毒的近期变种,而是一种新的冠状病毒.     

疫病的全球化与人类文明进步

正1965年,英国医学研究委员会普通感冒中心负责人、病毒学家泰瑞尔(D. Tyrrell)的团队从一位患感冒的成年人的呼吸道中捕获了一种名为B814的可传播病毒,该论文发表在1966年1月的《柳叶刀》上,它被认为是第一篇冠状病毒的论文。60年代末期至70年代,泰瑞尔带领一群病毒学家一直在从事这项人类毒株和动物病毒的研究,1975年5月,泰瑞尔团队在《国际病毒学》上介绍了其研究的新进展,这种新病毒呈冠状外观,正式命名为冠状(corona)病毒。研究发现,在温带地区,呼吸道冠状病毒感染多发生在冬季和春季。2003年出现的SARS就属于冠状病毒,至2005年,病毒学家在全世界已经发现了5种新的人类冠状病毒。     

新型冠状病毒 SARS-CoV-2电镜图像

正近期,美国国立卫生研究院国家过敏和传染病研究所(NIAID)公布了新型冠状病毒SARS-CoV-2的电子显微镜图像。冠状病毒在电镜下呈球状或椭圆形,病毒上有规则排列的突起,形似皇冠而得名冠状病毒。病毒名称Corona则出自拉丁语,意为"皇冠"。值得注意的是,得到的SARSCoV-2图像同MERS病毒和SARS病毒看起来没有太大的区别。     

SARS相关病毒与鼠肝炎病毒S蛋白的同源暗示一个潜在受体结合区的存在

最近, 一种新的冠状病毒被确定为近期爆发的严重急性呼吸综合征(SARS)的病原体. 虽然人们对人冠状病毒229E已经有了较多的研究, 而且其受体结合位点也被确定在S蛋白第417~547个氨基酸残基之间. 但是, 这一区域与新分离的SARS相关病毒(香港株, CUHK-W1)没有任何同源性. 有意思的是, 已知的各种冠状病毒S蛋白S1亚基的序列比对和进化分析显示, 鼠肝炎病毒(MHV)与SARS相关病毒的同源性最高. 而且, MHV的S蛋白上负责受体结合的重要位点(第62~65和第214~216位氨基酸残基)与SARS相关病毒的相应区域(第51~54和第195~197位氨基酸残基)高度同源. 这些生物信息学的分析结果可能对研究SARS相关病毒的受体结合位点和病毒侵染靶细胞的机理有所帮助, 进而为设计抗病毒药物和疫苗提供新靶点.     

野生蝙蝠体内发现SARS病毒

正如研究人员所担心的．曾引起2003年SARS大流行的病毒仍然存在：香港一个研究小组最近发现了一种与人类SARS冠状病毒同属一类的病毒，这种冠状病毒在鲁氏菊头蝠中感染率极高。     

SARS相关病毒(BJ01株)的全序列及其比较分析

严重急性呼吸综合征(SARS)是一种新发现的急性传染病. 对一株已确认为SARS病原体的冠状病毒(BJ01)进行了全基因组序列测定, 并与其他已知病毒进行了比较分析. 该病毒基因组全长为29.725 kb, 含11个可读框(ORFs), 由1个稳定区和1个可变区组成, 其中稳定区编码RNA依赖性RNA聚合酶, 包括两个ORFs；可变区含有4个蛋白质编码序列(CDSs), 分别编码病毒的4个结构蛋白(S, E, M, N蛋白). 此外, 可变区还包括5个非典型的预测蛋白(PUPs). 此病毒基因的排列顺序与其他已知的冠状病毒一致. 通过与已知RNA病毒的序列比对, 可以确认该病毒属于冠状病毒科(Coronaviridae). 与GenBank中已知的5个SARS相关病毒全基因组序列的比较分析显示, 已在30个核苷酸位置上检出序列差异, 总体突变率为0.1%, 其中15个变异位点在编码区, 可能会导致蛋白质的氨基酸改变(异义突变). S蛋白中已发现3处可能引起该蛋白质物化特征变化的变异, 而该蛋白质可能参与病毒与宿主间的免疫反应. 与病毒包膜形成相关的M蛋白中则已发现两处氨基酸变化. 进化分析表明, SARS病毒可能不是来源于人类, 但没有证据证明是人为制造的. 为了阐明SARS相关病毒的病因学以及排除其他可能的SARS病原体的存在, 仍需进行更深入的研究.     

《自然》2020年度最佳科学图片

正新冠肺炎大流行令2020年非比寻常。人们对科学领域的关注被病毒、疫情和疫苗分去一大部分,但实际上这一年有很多其他出彩的科学成果问世,同样值得瞩目。《自然》的视觉团队精心评选出了2020年度最佳科学图片,以下展示其中9幅图片。第七种冠状病毒新冠病毒引发了毁灭性的全球疫情,是2020年当仁不让的"超级反派"。SARS-CoV-2是目前已知能感染人类的第7种冠状病毒。     

发现罕见橙色蝙蝠

正科学家最近在非洲发现了一种新的蝙蝠物种,其身体和翅膀上的皮毛都呈橙色。这种蝙蝠属于鼠耳蝠属,因在与世隔绝的宁巴山被发现,所以被命名为"宁巴鼠耳蝠"。早在2018年,科学家就在西非几内亚的濒危蝙蝠栖息地发现了这种蝙蝠,但科学家花了两年多时间才确认它是一种新蝙蝠。