Z7 snoRNA：酿酒酵母中一种新的核仁小分子RNA

通过计算机分析国际分子生物学数据库和分子杂交等方法，在酿酒酵母中发现了一种新的核仁小分子ＲＮＡ：Ｚ７ ｓｎｏＲＮＡ。该ｓｎｏＲＮＡ具有ｂｏｘ Ｃ和ｂｏｘ Ｄ等结构元素，并有１４个核苷酸与１８Ｓ ｒＲＮＡ中的一段保守序列互补，属于典型的以核酸序列指导大分子ｒＲＮＡ甲基化的ｓｎｏＲＮＡ类型。Ｚ７ ｓｎｏＲＮＡ指导酿酒酵母１Ｓ ｒＲＮＡ中第５７８位的尿嘧啶核苷酸的核糖甲基化。Ｚ７ ｓｎｏＲＮＡ长８８个核     

一种从基因数据库中识别反义snoRNA基因的新方法

报道一种从国际分子生物学数据库中识别反义ｓｎｏＲＮＡ基因的计算机新方法．介绍新方法的生物学原理及在反义ＳｎｏＲＮＡ新基因发现中的应用．     

酵母snoRNA基因簇启动子的比较分析

报道对酿酒酵母ｓｎｏＲＮＡ基因簇启动子序列的研究结果．通过计算机分析,发现酿酒酵母中Ｚ２Ｚ８和ＳｎＲ１９０Ｕ１４ｓｎｏＲＮＡ基因簇有相似的启动子结构．这两个ｓｎｏＲＮＡ基因簇都是由一个上游的启动子负责整个基因簇的转录,产生多个顺反子ｓｎｏＲＮＡ的前体,然后再加工成熟为各个独立的ｓｎｏＲＮＡ．在启动子保守序列ＴＡＴＡｂｏｘ的上游还发现２个ＲＡＰ１序列,表明ｓｎｏＲＮＡ基因簇的表达可以通过ＲＡＰ１元素与核糖体蛋白基因的表达协同调控．这是在ｓｎｏＲＮＡ基因的启动子中首次发现ＲＡＰ１调控元素．对ｓｎｏＲＮＡ基因簇的进化特点也进行了讨论．     

两种相邻分布的水稻U14 BoxC/D snoRNA

通过对酵母U14BoxC/DsnoRNA保守元件的分析,推测出水稻BoxC/DsnoRNA可能具有的保守序列,进而在水稻第二号染色体上找到可能编码两种BoxC/DsnoRNA的序列.这两个BoxC/DsnoRNA在染色体上相邻分布,具有典型的BoxC和BoxD序列,末端形成茎环结构,这也是BoxC/DsnoRNA一个显著的特点.它们含有一段相同的“引导”序列,此序列能与水稻18S核糖体RNA(rRNA)第414位到第427位互补配对,这两者可能行使相同的功能:介导此配对区域内rRNA的核糖的甲基化.通过实验证明:(1)水稻18S核糖体RNA的配对区域内的确存在甲基化修饰;(2)这两种BoxC/DsnoRNA存在于水稻细胞中.通过序列同源性比较发现与玉米U14snoRNA有很高的同源性.将这两种在水稻中发现的BoxC/DsnoRNA命名为U14.1snoRNA和U14.2snoRNA.编码这两种BoxC/DsnoRNA的基因已被GenBank收录,其编号为AF332622.     

粟酒裂殖酵母--一种良好的真核模式生物(Ⅱ)

粟酒裂殖酵母（Schizosaccharomyces pombe)虽然与酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae)同属子囊真菌，但许多研究表明两种酵母在系统分类，细胞周期，rRNA的生物合成和基因的组织、结构及基因的表达调控等方面并不相同，在某些方面粟酒裂殖酵母与高等动物却有一定的相似性，因此，粟酒裂殖酵母也是一种良好的研究真核生物的模式生物。     

Z25，哺乳动物核仁蛋白基因编码的一个新的内含子snoRNA

通过计算机分析和实验鉴定,发现了哺乳动物中一种新的内含子snoRNA． Z25．Z25 snoRNA长为69个核苷酸,具有典型的boxC／D结构元件和末端配对区,一 段长为11个核苷酸的序列与18S rRNA互补,其下游紧接boxD’．按照理论计算,Z25 snoRNA具有指导18S rRNA中A1678(按人18S rRNA编号)2’．0．核糖甲基化的功能． Z25基因位于人、小白鼠和大鼠核仁蛋白(Nucleolin)基因第5个内含子中,揭示出哺 乳动物核仁蛋白基因是一种多内含子snoRNA编码的宿主基因．     

一种酿酒酵母同源重组载体的筛选

将携有mTn-3xHA／LacZ转座子的酿酒酵母文库质粒pHSS6转化大肠杆菌DH5α,挑取单菌落并提取其质粒．将纯化质粒分别用Not Ⅰ酶切后,转化尿嘧啶缺陷型(ura^-)酿酒酵母菌株INVScl,使其同源重组到酿酒酵母基因组中,于SC／ura^-平板上筛选．取长有单菌落酵母的平板进一步筛选重组后上游有强启动子酿酒酵母文库质粒,用近300个质粒转化酵母菌株INVScl,最终得到2株前端有强启动子的酿酒酵母质粒,这2个质粒可作为酿酒酵母同源重组载体广泛应用．     

水稻Hsp70基因第一个内含子中snoRNA基因簇的保守性及分布 …

对水稻,野生稻和茭白Ｈｓｐ７０基因第一个内含子进行ＰＣＲ分析及部分序列测定,分析结果表明植物Ｈｓｐ７０基因内含子编码多个ｓｎｏＲＮＡ的基因组织具有一定的保守性和分布范围,揭示了植物内含子编码的ｓｎｏＲＮＡ在进化过程中具有比脊椎动物和酵母更加丰富的多样性和移动性。     

水稻Hsp70基因第一个内含子中snoRNA基因簇的保守性及分布特点

对水稻、野生稻和茭白Ｈｓｐ７０基因第一个内含子进行ＰＣＲ分析及部分序列测定，分析结果表明植物Ｈｓｐ７０基因内含子编码多个ｓｎｏＲＮＡ的基因组织具有一定的保守性和分布范围，揭示了植物内含子编码的ｓｎｏＲＮＡ在进化过程中具有比脊椎动物和酵母更加丰富的多样性和移动性．     

粟酒裂殖酵母--一种良好的真核模式生物(Ⅰ)

粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)虽然与酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)同属于子囊真菌,但许多研究表明两种酵母在系统分类、细胞周期、rRNA的生物合成和基因的组织、结构及基因的表达调控等方面并不相同,在某些方面粟酒裂殖酵母与高等动物却有一定的相似性,因此,粟酒裂殖酵母也是一种良好的研究真核生物的模式生物.     

Z3, a novel antisense snoRNA fromSaccharomyces cerevisiae

Small nucleolar RNA (snoRNA) is one of the most important elements participating in eukaryotic ribosomal biogenesis. The present report describes the results of the identification of a novel snoRNA, Z3, from yeast S. cerevisiae. Z3 snoRNA is 106 nts in length. It contains box C, D elements and a 13 nt complementarity to 25S rRNA. This antisense segment, together with the downstream box D, guides a 2′-O-ribose methylation of cytidine acid at position 2956th in yeast 25 S rRNA. Z3 snoRNA, encoded by an independent transcribed gene on the chromosome  of yeast, possesses the same functional elements responsible for the rRNA methylation site as that of the intron-encoded U35 snoRNA of vertebrate.     

粟酒裂殖酵母Z15 snoRNA的鉴定及结构与功能分析

运用计算机及实验的方法,在粟酒裂酵母（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ）中发现和鉴定了一个新的,结构特殊的ｓｎｏＲＮＡ－Ｚ１５。该ｓｎｏＲＮＡ由一个独立转录的基因编码,位于酵母２号染色体上,Ｚ１５长达９２个核苷酸,属于反义ｓｎｏＲＮＡ家族,它除了具有典型的ｂｏｘＣ／Ｄ结构元素和末端配对区外,还含有分别与酿酒酵母Ｚ１５和Ｚ２相同的两个反义序列,反映了粟酒裂残酵母Ｚ１５ｓｎｏＲＮＡ基     

Identification and functional analysis of 23 novel box C／D snoRNAs from Oryza sativa

In a cDNA library generated from rice small nuclear RNAs,30box C/D small nucleolar RNAs (snoRNAs) were identiffied through preliminary screen.Except 7 known snoRNAs such as U14,all snoRNAs were identified in rice for the first time experimentally.Among the 23 novel snoRNAs,11 snoRNAs appear rice-specific,6 snoRNAs are unique to plants,the remaining 6 snoRNAs have their counterparts in both Arabidopsis and yeast or mammals according to the conserved antisense sequencs that guide 2‘-O-ribose methylation of rRNA,17 of the 23 novel snoRNAs were predicted to guide 24 2‘‘-O-ribose methylations at the specificsites of rice 5.8S,18S,25S rRNAs,among which 19 methylated sites were determined by primer extension at low dNTP concentrations.The remaining 6 snoRNAs devoid of rRNA antisense elements may represent novel snoRNA species in rice.The results show that constructing a cDNA library from small nuclear RNAs is an effective experimental approach for novel snoRNA is identification.The novel snoRNAs are important in elucidating the genomic organization and expression of plant snoRNA genes and the mechanism through which 2‘‘-O-ribose methylations took place in rRNAs.     

核仁小分子RNA基因的起源初探

通过分析、比较含ＢｏｘＣ／Ｄ和含ＢｏｘＨ／ＡＣＡ这两类ｓｎｏＲＮＡ的一些代表与几种剪接体ｓｎＲＮＡ的序列和二级结构特征，研究它们的进化关系，并探讨ｓｎｏＲＮＡ是起源于内含子还是后来才插入到内含子中这一与ｓｎｏＲＮＡ的起源密切相关的问题．结合对剪接体ｓｎＲＮＡ起源的有关研究，提出两类ｓｎｏＲＮＡ最初是起源于原始Ⅱ类内含子中的不同部分的观点．     

C1 SnoRNA，水稻中一种新的核仁小分子RNA

通过计算机分析国际分子生物学数据库和ｃＤＮＡ序列分析等方法，在水稻（Ｏｒｙｚａｓａｔｉｖａ）中发现了一种新的核仁小分子ＲＮＡ：Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ．该ＲＮＡ具有ｂｏｘＣ，ｂｏｘＤ和末端碱基配对区等典型的核仁小分子ＲＮＡ结构特征；并有１４个核苷酸与水稻１８ｓｒＲＮＡ中一段保守序列互补．推测Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ可能在１８ｓｒＲＮＡ甲基化过程中起重要作用．编码Ｃ１ＳｎｏＲＮＡ的基因位于水稻Ｈｓｐ７０基因的第一个内含子中．这是在水稻中发现的第一个由基因内含子编码的ＳｎｏＲＮＡ．     

简便分离鉴定酵母细胞总RNA的方法

针对酵母具有细胞壁的特点,建立了一种简便、快速、有效分离鉴定酵母细胞总RNA的方法,并对三种便于提取酵母细胞总RNA的方法进行比较,所提取的总RNA质量高,可用于进一步分离mRNA,PCR扩增以及do或Northern杂交。     

小分子RNA家族中的新成员--microRNA

近来,人们在多种生物中发现了一类新的小分子RNA——microRNA(miRNA)．miRNA是20～24nt的单链RNA,在进化上具有高度的保守性,它通过与靶mRNA不完全互补配对,抑制蛋白翻译,调节内源基因表达,在基因调控中扮演了重要的角色．miRNA和siRNA(small interferenceRNA)在生成机制、作用途径等方面关系密切,它们既有区别又相互联系．小分子RNA的研究将是今后分子生物学的研究热点之一．     

产甘油酵母菌株的分离与鉴定

针对西部极端微生物资源开发,从川西北高寒草地野生花粉中分离耐高渗的酵母菌株,通过采用形态和生理生化试验对分离出的3株编号为SCU-1、SCU-2、SCU-3的酵母菌株进行鉴定,初步鉴定3个菌株为：粉状毕赤酵母(Pichia farinosa)、克鲁丝假丝酵母(Candida kru-sei)、酿酒酵母(Saccharomyces cereuisiae),通过对3株酵母菌株的产甘油鉴定结果显示,耐高渗粉状毕赤酵母可通过产生甘油适应外界渗透压变化。