大腹圆蛛毒素的双向电泳分析

提取大腹圆蛛毒素,进行双向凝胶电泳(Two Dimension Gel Electrophoresis,2-DGE),经银染法显色及电脑软件分析,结果表明:大腹圆蛛的毒素至少有80种成份,其中大部分显碱性或中性.     

悦目金蛛丝蛋白TuSp1重复模块特征

针对蜘蛛管状腺丝蛋白(TuSp)结构进行克隆和分析,基于悦目金蛛(Argiope amoena,A.amoena)管状腺总RNA,利用简并引物和巢式聚合酶链反应(PCR)技术克隆AaTuSp1编码基因序列1273bp,其包含3个重复单元,每个重复单元编码176个氨基酸,重复单元之间的序列同源性高达97%以上,且富含丙氨酸(Ala)和丝氨酸(Ser),其次是甘氨酸(Gly),组成了一系列PolyT,PolyA,PolyS,SQ和GX模体结构,推测与其独特的力学性能相关.系统进化分析表明,不同于典型蛛丝蛋白MaSp,Flag等,AaTuSp1及近系包卵丝蛋白形成一个独立的进化分支.研究结果为基于TuSp1合成仿生蛛丝提供了新的结构基因蓝图.     

不同折叠类型蛋白中基于密码子的二级结构偏向性分析

在传统的Chou-Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息,计算了200个蛋白(49种全α结构蛋白,69种全β结构蛋白,38种仅α β结构蛋白,44种α/β结构蛋白)中不同密码子对应的氨基酸形成不同二级结构(α：螺旋,β：折叠,C：卷曲)的偏向性参数．通过对这些密码子对应氨基酸二级结构偏向性的分析,得到了氨基酸二级结构偏向性分析中所忽略的同义密码子的蛋白结构信息．这些新的信息量对于指导蛋白质设计以及提高蛋白质二级结构预测的准确率有着一定的作用．     

红外光谱法定量分析蛋白二级结构研究中水汽影响的评估

在红外光谱法应用于蛋白二级结构定量分析研究中,人们一般需要使用二阶导数光谱技术对蛋白酰胺Ⅰ带(1 700～1 600cm-1区域)进行分辨率增强处理,以获得对应于不同蛋白二级结构的红外吸收峰的个数和峰位.水汽在酰胺I带由于存在很强的吸收峰会对二阶导数谱的可靠性产生影响.在实际研究中,一些本属于水汽的吸收峰有可能被错误地指认为某种蛋白二级结构的吸收峰.这是一个长期以来困扰红外光谱法应用于蛋白二级结构定量分析研究的技术难题.作者提出了一种评估水汽影响程度的方法,即利用含水汽吸收的人工合成光谱和实验光谱的二阶导数谱的对比来评估水汽影响,从而达到对蛋白二级结构吸收峰的准确指认.     

蛋白质的二级结构和mRNA的二级结构的相关性研究

利用置信度为95的特征字研究了蛋白质二级结构以及其对应mRNA二级结构，发现蛋白质二级结构和mRNA二级结构有明显的相关性。规则二级结构α—螺旋，β—折叠以及包含有Turn的边界明显倾向于mRNA二级结构的茎区，而避免出现在环区。     

光系统Ⅱ核心天线蛋白CP43和CP47的圆二色和磁圆二色性研究

从菠菜中分离提纯了光系统Ⅱ核心天线复合物ＣＰ４７,利用吸收光谱、圆二色（ＣＤ）光谱和磁圆二色（ＭＣＤ）光谱对二者色素结合状态进行了研究。对ＣＰ４３和ＣＰ４７上色素结合状态的不同进行了讨论。ＭＣＤ光谱是一种高灵敏度的检测色素的光谱手段,适宜于对光合作用中色素－蛋白复合物的研究。     

登革病毒GD01/98结构蛋白基因序列及蛋白二级结构初步分析

对登革病毒GD0 1 98结构蛋白基因采用RT -PCR、分子克隆等方法进行测序 ,获得了分离株的结构蛋白基因核苷酸序列 2 419bp ;并通过Internet、用Blast等软件进行同源性分析 ,发现它同泰国分离株最近 ,可能来源于泰国 ;根据核苷酸序列 ,推导蛋白一级结构 ,并用GOR、神经网络 (HierarchicalNeuralNetwork)等方法进行二级结构预测 ,发现有 46 74%氨基酸参与无规卷曲 ,有 31 16 %氨基酸参与α -螺旋 ,没有 β折叠     

胆红素钙对胆汁蛋白二级结构的影响

本文采用二阶导、退卷积及曲线分峰拟合等高分辨红外光谱技术分析了胆汁蛋白结合胆红素钙前后二级结构的变化。结果显示，胆红素钙与胆汁蛋白的相互作用使后者的二级结构有序性增加。     

大腹圆蛛拖丝蛋白基因3'端克隆和序列分析

用PCR(Polymerase Chain Reaction)技术从大腹圆蛛主壶腹腺组织的基因组DNA和RNA中分别扩增获得编码拖丝蛋白基因的3'端基因序列,克隆PCR产物到pDrive载体,经PCR、限制性酶切筛选和序列分析后证明获得了蜘蛛拖丝蛋白基因两个克隆AvDS1和AvRS2.基因序列和氨基酸序列分析表明AvDS1和AvRS2具有拖丝蛋白基因序列和蛋白质氨基酸序列特有的结构特征,氨基酸序列中存在4个motifs-(A)n(GA)n(GFGX)n以及(GGX)n.AvDS1与基因库中已报道的蜘蛛拖丝蛋白基因序列同源性较低,而AvRS2与已经报道的Nephila clavipes拖丝蛋白基因组分-1的同源性可达91%,推测AvRS2是编码大腹圆蛛拖丝蛋白基因组分-1基因片段.比较这两个克隆的核苷酸序列和氨基酸序列,发现它们之间没有同源性.推测它们是同一基因的不同片段,或是编码大腹圆珠拖丝蛋白的两个基因组分. 明AvDS1和AvRS2具有拖丝蛋白基因序列和蛋白质氨基酸序列特有的结构特征,氨基酸序列中存在4个motifs-(A)n(GA)n(GFGX)n以及(GGX)n.AvDS1与基因库中已报道的蜘蛛拖丝蛋 基因序列同源性较低,而AvRS2与已经报道的Nephila clavipes拖丝蛋白基因组分-1的同源性可达91%,推测AvRS2是编码大腹圆蛛拖丝蛋白基因组分-1基因片段.比较这两个克隆的核苷酸序列和氨基酸序列,发现它们之间没有同源性.推测它们是同一基因的不同片段,或是编码大腹圆珠拖丝蛋白的两个基因组分. 明AvD     

虎纹捕鸟蛛神经毒素Huwentoxin-Ⅰ的二级结构研究

Huwentoxin-Ⅰ是一种小分子量的多肽类毒素,它能阻断脊椎动物的神经肌肉接头传递。该毒素分子内含33个氨基酸残基,有三对二硫键。本文报道用圆二色性光谱分析法对该毒素二级结构的测定和分析,并用Creenfield等介绍的方法计算其二级结构中各种成分的含量。结果表明,此多肽分子中,α螺旋约占22—28％,β折叠约占22—35％,而β转角和无规卷曲约占41—49％。实验还表明,此毒素在不同pH条件下的二级结构均比较稳定,将它加热到80℃保温20分钟后再测定其CD光谱,其二级结构成分变化不大。用各种不同的方法对其二级结构进行了预测,结果表明该分子一级结构序列N-末端有一小段β折叠,C-末端有一段α螺旋,分子中部的大部分残基为β转角和无规卷曲构象。     

蜘蛛丝应力—应变行为的分子结构机理

利用激光拉曼光谱技术研究了大腹园蛛牵引丝、蛛网框丝和内层包卵丝的分子构象,分析了蜘蛛丝的分子构象差异对其应力-应变行为的影响,探索了蜘蛛丝优异力学性能的分子结构机理。     

成丝的速度与方式和蜘蛛丝力学性能的关系

为了分析蜘蛛丝的力学性能和成丝条件间的关系,研究了不同速度下人工卷取的蜘蛛牵引丝以及蜘蛛垂直下落时分泌的牵引丝的力学性能.研究结果表明,随着卷取速度的增大,蜘蛛丝的断裂强度有一极大值,在高速卷取时强度的变化较低速时平缓.垂直下落时蜘蛛分泌的牵引丝的综合力学性能优异,但断裂强度不一定大于人工卷取的丝.成丝速度和成丝方式都对蜘蛛丝的性能有很大影响.     

蜘蛛丝的结晶结构及其取向

研究和分析了大腹园蛛的牵引丝、内层包卵丝的结晶结构及其取向,探索了大腹园蛛丝纤维分子链的排列状态、结晶结构和蜘蛛丝力学性能间的关系。     

大腹圆蛛包卵丝的化学组成与物理机械性能

分析了大腹圆蛛包卵丝的氨基酸组成，包卵丝中极性氨基酸含量较高，小侧基氨基酸含量较少，利用SEM及计算机图像处理技术分析了大腹圆蛛包卵丝的形态结构特征，包卵丝的断面形状基本为圆形，包层包卵丝的细度约为内层包卵丝的2倍，并且外层包卵丝的纤维断面内有许多无规分布的纳米级孔隙，经冷冻干燥后，孔隙率增加了2倍左右，在此基础上，研究了大腹圆蛛包卵丝的拉伸机械性能，光泽和热性能，初步探索了性能的形成机理，大腹圆蛛内层包卵丝具有比其他功能蜘蛛丝和丝素纤维好得多的力学性能，其强度高，伸长率大，韧性好，包卵丝在光泽和热性能方面与蚕丝丝素纤维有一定的差异。     

基于模拟退火算法的蛋白质空间结构预测

模拟退火是一种通用的启发式优化算法，将模拟退火思想用于求解蛋白质结构预测问题，计算结果表明利用SA算法得到的解优于目前常用的遗传算法和MonteCarlo方法．     

米泉园蛛雄性新发现(蜘蛛目:园蛛科)

首次在中国新疆发现米泉园蛛Araneus miquanensis Yin,Wang,Xie & Peng,1990雄性,对其形态特征进行了描记.标本保存于河北大学博物馆.文中所有测量单位为mm.     

计算机辅助解析FTIR定量研究蛋白质构象的应用进展

综述了计算机辅助解析傅里叶变换红外光谱在蛋白质构象定量研究中的应用进展,简要介绍了红外光谱测定及二阶导数谱、去卷积和曲线拟合等计算机数学处理方法.对已有的研究结果进行了分类总结,最后讨论了该领域中存在的问题和发展方向.     

人膜蛋白CD81的原核表达与纯化

以高效原核表达载体pCold TF为载体骨架,应用PCR、限制性酶切、连接等分子生物学方法,将pCold TF中的六聚组氨酸(His-Tag)序列替换为限制性酶切位点SpeⅠ序列ACTAGT,构建不含His-Tag序列的新载体pL118.以此载体表达蛋白时,通过PCR引物在目的基因3′端添加His-Tag以利于融合蛋白的纯化以及融合蛋白中的Trigger Fac-tor(TF)助溶蛋白的去除.应用pL118对人膜蛋白CD81进行原核表达与纯化,并使用Fac-tor Xa蛋白酶去除CD81融合蛋白中的TF助溶蛋白,获得3′端含有His-Tag的CD81蛋白.人膜蛋白CD81的表达纯化,为CD81靶向药物筛选、抗体制备及深入研究CD81的功能奠定了基础.pL118载体的构建以及CD81蛋白的表达纯化为表达困难的基因实现原核表达提供了一种新的思路和方法.     

药用蜘蛛养殖技术研究

本文介绍了蜘蛛的药用价值与生物学特性,详细分析了蜘蛛的人工养殖及饲养管理技术,还对蜘蛛的疾病防治及蜘蛛的采收与加工做了深入的讨论。     

蛋白质二级结构的统计力学研究

本文将Zimm-Bragg模型推广到实际多肽链，建立了蛋白质二级结构的统计力学形式，着重讨论了如何依据统计力学预测蛋白质二级结构的问题。