应用24个微卫星标记分析SD和Wistar大鼠的遗传多样性

目的 通过SD和Wistar大鼠群体遗传多样性分析,为其质量控制提供基础数据。方法 采用微卫星DNA标记技术,选取分布于21条染色体上的24个微卫星位点分别对12对SD大鼠和Wistar大鼠的DNA样本进行PCR扩增,所得扩增产物经二代测序分型,再利用PopGen32软件、Littleprogram0.6和GenePop分别进行等位基因、平均杂合度、多态信息含量及遗传平衡检验参数的计算。结果 SD和Wistar大鼠群体分别在24个微卫星位点检测到平均等位基因数3、2.95个,平均杂合度为0.434 4、0.426 1,平均多态信息含量分别为0.38、0.37,分别有10、9个位点偏离了Hardy-Weinberg遗传平衡,其中7、4个位点表现为杂合子缺失。结论 SD和Wistar大鼠封闭群遗传多样性略低于理想封闭群水平,需要在种群繁育中注重科学管理监测,避免近交。     

利用微卫星标记分析巢湖鸭群体的遗传多样性

巢湖鸭是我国著名中型蛋肉兼用品种,为了进一步阐明其保种及群体遗传结构状况,通过资源调查摸清了巢湖鸭的外貌特征、生产特性和适宜分布的生态环境,采用26个多态性较好的微卫星标记,检测了巢湖鸭的遗传多样性。结果表明:26个微卫星位点均表现出多态性,总共检测到111个等位基因,平均等位基因数为4.269个;群体多态信息含量为0.526,杂合度为0.610。瓶颈效应分析结果表明:该群体已偏离了突变-漂移平衡,近期可能经历了瓶颈效应,种群数量曾经下降。根据调查结果及遗传多样性检测数据,提出通过原产地保护,从而保护巢湖鸭的建议。     

舟山附近海域3个大黄鱼养殖群体遗传多样性的微卫星分析

利用8个微卫星多态标记分析舟山附近海域3个大黄鱼养殖群体共90个体的遗传多样性。结果显示,8个微卫星位点共检测到等位基因64个,各位点等位基因数(A)范围为5~10个,观测杂合度(Ho)的平均值为0.9111,期望杂合度(He)的平均值为0.8108,多态信息含量(PIC)平均值为0.7800,表明所选择的8个微卫星位点均表现出较高的多态性。群体的遗传多样性分析结果显示,3个群体的平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.891 7、0.900 0、0.941 7和0.738 4、0.743 2、0.821 3,Shannon多样性指数分别为1.467 0、1.449 0、1.800 9,表明3个群体的遗传多样性处于较高水平。HardyWeinberg平衡检验发现只有LYC0015和LYC0009位点处于平衡状态(PHW0.05),其余6个位点都不同程度地偏离了平衡。3个群体的聚类分析表明,岱山和朱家尖西岙网箱2个养殖群体亲缘关系较近,而与舟山市水产所耐低温F2代群体亲缘关系较远。     

贵州马铁菊头蝠群体遗传结构的微卫星分析

利用6对微卫星引物对贵州马铁菊头蝠的等位基因频率、基因杂合度和多态性信息含量进行了遗传检测。结果表明,6对微卫星引物共扩增出18个等位基因。基因频率分布在0.021 0～0.833 0之间。6个微卫星位点的平均杂合度为0.342 7,平均多态性信息含量为0.381 3。分析认为贵州马铁菊头蝠遗传多样性相对较低。     

5个棘胸蛙养殖群体微卫星遗传多样性分析

养殖群体繁殖过程往往受到人为干扰,经过多年养殖后容易出现近亲繁殖现象,影响养殖效益。为了解棘胸蛙Quasipaa spinosa养殖群体的遗传多样性,评估棘胸蛙的遗传现状,本研究选用9个微卫星分子标记对5个养殖群体(江西、浙江、广西、广东、福建)148个实验样本进行遗传多样性分析,结果显示：9个微卫星位点在5个养殖群体中共检测到46个等位基因位点,其中,平均等位基因和平均有效等位基因数分别为5.111和2.702,平均观测杂合度和期望杂合度为0.182和0.589,平均多态信息含量为0.536;养殖群体内观测杂合度和期望杂合度分别在0.130～0.230和0.353～0.468,且观测杂合度均小于期望杂合度。广东和广西群体遗传相似度最高(0.819),福建和江西群体的遗传相似度最低(0.441),与利用MEGA软件构建UPGMA进化树结果相一致。实验结果揭示棘胸蛙养殖群体已经存在一定的近亲繁殖现象。建议在人工养殖棘胸蛙的过程中,应尽量扩大选种范围,避免近亲繁殖;同时,定期从外地良种场引进良种作为繁殖亲本,提高亲本遗传多样性。     

基于微卫星标记的中华蜜蜂5个自然群体遗传多样性分析

【目的】分析中国四川阿坝、黄土高原、海南岛、浙闽丘陵、滇南地区等地的中华蜜蜂(Apis cerana cerana)自然群体遗传多样性。【方法】提取样品基因组DNA后进行PCR扩增,并用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。通过计算15对微卫星标记在5个中华蜜蜂自然群体中的等位基因数、多态信息含量、期望杂合度、观测杂合度、遗传距离、遗传相似系数和遗传分化系数,进而评估各中华蜜蜂种群遗传多样性和各种群间遗传分化。【结果】15个微卫星位点共检测到64个等位基因,每个位点的等位基因数平均为4.266 7个,单个位点的等位基因数为2～6个。各群体平均等位基因数为2.6～3.066 7个,平均观测杂合度为0.550 3～0.664 3,平均期望杂合度为0.524 4～0.566 7,平均多态信息量为0.410 3～0.492 7。四川阿坝群体与黄土高原、海南岛、浙闽丘陵、滇南地区等地群体在Acc001,Acc096,Acc131等3个位点上存在明显分化;黄土高原群体与海南岛、浙闽丘陵、滇南地区等地群体在Acc114,Acc121,Acc132等3个位点上表现出一定程度的遗传分化;海南岛群体与浙闽丘陵、滇南地区两地群体在Acc001,Acc002,Acc004,Acc131,Acc132等5个位点上均表现出较强的遗传分化;浙闽丘陵与滇南地区群体间在Acc002,Acc121,Acc131等3个位点上遗传分化极明显。5个中华蜜蜂自然群体之间的遗传距离在0.160 1～0.491 0之间。【结论】5个中华蜜蜂群体遗传多样性丰富,群体间遗传分化明显。     

实验用猫的应用及标准化

猫作为中型实验用动物,拥有独特的生理学及解剖学特性,被广泛应用于生物、医药等领域的研究.猫可用于制备多种疾病动物模型,在神经系统、降压实验等研究方面,具有不可替代的作用.近年来,我国在猫的实验动物标准化方面虽有所进展,但相对缓慢.本文主要对实验用猫的应用现状和国内外实验用猫标准化进展进行探讨.     

用微卫星技术研究珠江流域三个野生大眼鳜群体的遗传多样性

采用微卫星标记技术,探讨了广西右江、左江及红水河三江段野生大眼鳜群体的遗传多样性。采用生物信息学方法,自主开发了4对大眼鳜微卫星DNA引物,此外,还从28对鳜属微卫星通用引物中筛选出15对,19对标记均表现为高度多态性。对32尾右江(YJ)、35尾左江(ZJ)及36尾红水河(HSH)三地理群体野生大眼鳜进行遗传多样性分析,总群体的固定指数Fix范围为0.001 4~1.000,表明19个位点在总群体内表现为杂合子缺失,其对环境的应对能力有所下降。遗传参数统计结果表明,总群体观测等位基因数(Na=19.4737)、香农指数(I=2.399 8)、平均杂合度(Ave Het=0.720 6)、多态信息含量(0.447PIC0.947)均显示:在哈温平衡下,大眼鳜3群体遗传多样性丰富;但3群体遗传多样性存在差异,红水河群体的遗传多样性比左江群体、右江群体的遗传多样性丰富,左江和右江群体的遗传多样性水平较为接近。群体间遗传分化水平较大(0.15群体间近交系数Fst=0.153 90.25),15.39%的遗传变异来自于群体间,84.61%的遗传变异来自于群体内,群体内近交系数Fis为0.576 1,各座位的基因流Nm分布范围较广(0.147 4~8.909 1),平均Nm值为1.374 5,表明3群体间属于中等遗传分化水平,基因流基本顺畅,群体内的近交系数较高,容易引起遗传结构的变化。基于Nei's遗传距离的聚类分析显示左江群体与右江群体首先聚为一支,再与红水河聚为一支,符合其在地理位置上的关系。     

对家畜遗传育种研究中微卫星标记的分析

近年来，微卫星标记以其独特的优点和特点而被广泛应用于家畜遗传育种研究的各个领域。本文分析了微卫星标记的产生卡几粤及其优点，并指出了他在家畜遗传育种研究中的应用。     

长白猪微卫星标记的遗传多样性

采用ESTMS20,SW2570和S0002等3个微卫星标记对长白猪进行了遗传多样性的研究。结果发现,3个卫星标记在长白猪中均具有多态性,遗传杂合度分别为0.69,0.70和0.41,多态信息含量分别为0.64,0.68和0.38。以上结果表明,这3个微卫星标记在长白猪群体中属于高度多态性座位,可以用于长白猪遗传多样性的评估。     

小麦异交群体的遗传趋异分析

用太谷核不育小麦构建小麦异交群体DNSI,对株高,穗粒数,千粒重,小穗密度分别进行单性状集团岐化选择,经过四代,各选择处理已表现出一定趋势,从平均数看,选择性状表现几乎与预期进展一致,向上选择的平均数总大于向下选择,统计分析结果表明,各代选择进展大小不同,其它性状也发生了程度不同的显著变化,分析性状的变异系数发现,随选择的进行遗传变异没有发生明显的降低,某些处理甚至表现出升高的趋势,说明选择没有引起群体遗传结构的破坏,另外,方差分析表明,群体间差异达显著水平,说明群体发生了一定的遗传趋异,主成分遗传距离和聚类分析进一步表明,群体间关系随世代发生着不规律的变化。     

论舒尔茨的人口质量经济学

舒尔茨的人口质量经济学建立在知识和技能进步的理论基础之上,提出了两个重要结论:土地是可以被技能所替代,孩子的数量可以被孩子的质量所替代.人口与土地的食物生产能力的比例不是一个固定的常数,而是随知识和技能的进步而变化.由于知识和技能的进步,同样面积的土地可以养活更多的人口.与马尔萨斯控制人口数量的政策主张不同,舒尔茨强调提高人口质量.     

广西汉族、壮族8项遗传学特征的比较

调查了广西柳州市1 164名大学生(汉族705人,壮族459人)卷舌、翻舌、眼睑、前额发际、发旋、耳垂、拇指类型、小拇指弯曲等8项遗传学特征,进行统计分析,并与其他地区民族进行聚类分析.结果显示,在广西汉族、壮族间,卷舌、发际、小拇指弯曲民族间差异显著,而拇指类型、翻舌、眼睑、耳垂、发旋民族间差异不显著.聚类分析结果表明,广西汉族、壮族间遗传距离最近,广西汉族、壮族分别与贵州仫佬族间的遗传距离(0.470 6,0.512 5)最远.     

河北省人口素质与环境关系的研究

在河北省人口素质与环境现状的基础上，从社会经济发展的角度分析了影响人口健康素质的环境因素，以及人口的科学文化素质与环境建设的关系，揭示了人口素质与环境相互作用的规律。运用持续发展的理论，提出协调人口、环境与发展的途径。     

基于Logistic种群模型的城市流浪猫数量研究

流浪猫是城市居民最为关心的社会问题之一。本文应用Logistic种群模型建立了城市流浪猫数量研究模型,分析了随时间发展流浪猫数量的变化趋势,根据有关资料数据,给出模型算例,在此基础上预测了某城市流浪猫数量发展趋势。     

基于非随机初始种群遗传算法的分类规则挖掘

数据挖掘中分类问题一直是数据挖掘领域中研究的热点问题,先后提出了各种分类算法;其中遗传算法被认为是一种高效的分类算法.但是,传统的GA存在着易于陷入局部最优,致使得到的分类规则概括性不强的问题.提出了一种基于非随机初始种群的遗传算法分类规则挖掘算法.算法利用均匀种群方法生成非随机的初始种群,并通过均匀算子确保连续迭代过程中种群的多样性,从而达到防止GA早熟的目的.采用两个标准的公共领域的数据集验证了算法的有效性.实验结果表明,该算法能消除遗传算法在分类挖掘任务中收敛于局部最优的局限性,且能快速挖掘出易于理解的分类规则,提高对知识的理解力.     

改进遗传神经网络在水质评价中的应用

根据地表水环境质量评价标准,选取5项监测指标作为评价因子,在各指标对应级别取值区间内按均匀分布方式随机内插生成训练样本,采用改进自适应交叉和变异算子的遗传算法对BP网络连接权和阈值进行优化,以长江口某河段水质评价为例,阐明了该方法在水质评价中的作用,并与综合指标法进行比较;结果表明:该方法具有较好的客观性和实用性,能有效地对地表水环境质量进行评价,丰富了水质评价的方法体系,为地表水环境管理与决策的提供依据。     

Population Genetic Structure and Genetic Differentiation of the Pufferfish Takifugu Rubripes and Takifugu Pseudommus Revealed by RAPD Analysis

RAPD analysis is used to assay the population genetic structure and genetic differentiation of pufferfish T.rubripes and T.pseudommus.One hundred and twenty fragments are aplified with 21 random sequence 10-mer primers.The proportion of polymorphic fragments of T.rubripes populations from the coast of China(TRC),the coast of Japan(TRJ),general population of T.rubripes both from China and Japan(TRCJ),and the population of T.pseudommus are 31.7%,33.3%,35.0%and 39.2% respectively.The mean expected heterozygosities of the four populations are 0.116,0.125,0.126,and 0.144,respectively.Low genetic distances(ranging from 0.0118 to 0.0309)and Fst estimates(0.020 to 0.024) among the populations indicated that there is no significant differentiation between T.rubripes and T.pseudommus and suggested that only one species is involved.     

遗传算法种群多样性的度量

针对遗传算法的过早收敛问题,从种群个体、基因两个方面给出了遗传算法种群多样性的度量方法,并在此基础上提出了一种基于大变异操作的遗传算法．实验结果表明该方法在问题求解的精确度以及收敛性方面取得了很好的效果．     

西部地区人口城镇化质量研究

立足新型城镇化的"人本"视角,从人口、消费、教育、就业等八大方面,构建了包含26个基本指标的西部地区人口城镇化质量测评体系,运用主成分分析与聚类分析相结合的方法,对西部12个省、自治区、直辖市2015年人口城镇化质量做出实证测评.研究表明,西部地区人口城镇化质量差异较大,且呈现明显的区域聚类特点;各省份均有不同的发展特色;教育经济和产业医疗是决定西部地区人口城镇化质量的先决因素,人居环境与人口潜力是衡量各省份后期城镇化质量的关键.因此,提升人口城镇化质量应当把教育、经济与就业因素放在优先发展的战略位置,同时不能忽视人居环境与人口增长.