HLA-A2限制性CTL表位肽定量构效关系研究

基于SCORE打分函数，运用定量构效关系的理论和方法研究了HLA—A2限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的定量关系，并建立了SCORE得分与亲和性的定量关系模型，并用外部样本（5个HLA—A2限制性CTL表位九肽）作为预测集用于检验模型的预测能力．基于SCORE打分函数建立的定量模型具有较好的相关性（r=0，9165，RMS=0．38）和对外部样本的预测能力（rpred=0．9847，RMS=0．135）．基于SCORE打分函数，运用定量构效关系研究的理论和方法建立了HLA—A2限制性CTL表位亲和性的定量预测方法，为实验鉴定高亲和性HLA—A2限制性CTL表位提供了理论依据．     

基于COX-2的食管癌广谱CTL表位筛选及鉴定

目的:筛选食管癌广泛高表达蛋白COX-2的HLA-A2/A3限制性广谱CTL表位。方法:运用生物信息学的方法,设计出P66(COX-266-74FLKPTPNTV)和P479(COX-2479-487ALYGDIDAV)两条新的抗原肽。Fmoc固相合成法合成抗原肽,对其与HLA-A2.1和HLA-A3分子的结合力和稳定性进行分析,以MTT实验检测其对三种肿瘤细胞的杀伤作用。结果P479对HLA-A2.1及HLA-A3均有较高的结合力,而P66结合力较低。P479对COX-2 的EC-9706、EC-1的表现出明显的诱导杀伤作用,而P66没有表现出明显的作随着肿瘤分子免疫学与分子生物学研究     

基于改进的人工神经网络方法预测CTL表位

为简化细胞病毒T细胞(cytotoxicity T lymphocytek, CTL)表位鉴定方法,应用改进的人工神经网络方法定量研究了短肽与MHC(major histocompatibility complex)分子结合亲合力的关系,并建立了CTL表位的预测模型,得到了预测模型最优性能参数.用此模型对短肽与HLA-A*0201分子结合的805个预测样本进行了预测,预测准确度达到73.8%.对来自黑色素MAGE-2的短肽与MHC分子的结合亲合力也进行了预测,结果较好.     

HLA-A*0201限制性CTL表位肽的分子力场分析

运用比较分子力场(CoMFA)和比较相似性指数分析(CoMSIA)方法研究了50个HLA-A* 0201限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的关系,另外15个表位九肽作为预测集用于检验模型的预测能力。结果表明,采用CoMSIA得到的构效关系模型(q2 =0.608,r2 =0.987,F=440.4,SD=0. 111)要明显优于采用CoMFA得到的构效关系模型。在CoMSIA计算中,当引入疏水场时,三维构效关系模型得到明显改善,通过该三维构效关系模型,可较精确地估算预测集中15个CTL表位肽与HLA-A* 0201间的亲和力(r2pred=0. 703,SD=0. 368)。通过分析分子场等势面图在空间的分布,可以观察到表位肽分子周围的立体及疏水特征对表位肽与HLA-A* 0201间结合亲和力的影响,从而为进一步对CTL表位肽进行结构改造并基于此进行治疗性疫苗分子设计提供理论基础。     

PRRSV主要蛋白结构分析及其抗原表位的研究

【目的】对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)主要蛋白,即GP5,GP4,GP3,GP2的二级结构进行分析.【方法】在线利用DNA Star软件分析GP2~GP5蛋白的抗原表位,以指导未来的疫苗设计.【结果】:1GP2~GP5的理论等电点PI值分别为10.12,8.42,8.05,8.41,GP2的PI值明显高于GP3~GP5的PI值(p0.05),而在GP3~GP5之间没有明显差异(p0.05);2GP4蛋白和GP5蛋白高抗原指数的基序数量多,形成抗原表位的可能性最大,是设计疫苗的重要靶点.【结论】高致病PRRSV JXA1株的GP4蛋白和GP5蛋白高抗原指数的基序数量多,形成抗原表位的可能性最大,是设计疫苗的重要靶点.     

恶性疟原虫复合多表位基因的原核表达和多克隆抗体制备

原核表达恶性疟原虫多期多表位基因并制备其多克隆抗体。在前期构建恶性疟原虫复合多期多表位重组真核表达载体的基础上,将测序正确的AMAMEG基因克隆入原核表达载体pGEX4T—1并诱导表达。采用包涵体洗涤的方式纯化目的蛋白,以AMA—1抗体对纯化蛋白进行Western—blot分析。将纯化的融合蛋白免疫小鼠制备多克隆抗体。通过PCR成功获得长度为1 000 bp的恶性疟原虫AMA—1胞外域基因片段,获得了与多表位基因连接后的AMAMEG基因。通过诱导表达,显示在相对分子量约95 000处有预计大小的特异性条带,表明成功表达出融合蛋白。经此纯化的融合蛋白免疫的小鼠能产生特异性抗体,其滴度达到1∶105。纯化的融合蛋白和多克隆抗体为研究新型疟疾疫苗奠定一定的理论和实践基础。     

鸡survivin重组腺病毒载体的构建和体外表达

根据GenBank中鸡survivin cDNA序列,设计引物,从鸡胚组织提取总RNA,利用RT-PCR扩增鸡survivin全长cDNA,经T-A克隆后插入腺病毒穿梭载体、骨架载体,构建腺病毒重组质粒,转染293E4pIX细胞,构建鸡survivin重组腺病毒.T-A克隆的测序结果与GenBank中鸡survivin cDNA完全一致.限制性内切酶分析和PCR表明腺病毒质粒携带survivin基因,Western blot证实重组腺病毒正确表达survivin,survivin基因已被成功重组到腺病毒基因组.     

人白介素6表位疫苗的设计及其免疫原性

构建人白介素6(h IL-6)表位疫苗,研究其免疫原性。利用在线预测工具预测h IL-6线性B表位(Ala69-Asn80);重叠延伸PCR法对h IL-6进行基因融合,克隆到质粒p GEX-6P-1,并在大肠杆菌BL21(DE3)中表达;亲和层析法纯化融合蛋白,鉴定其纯度达95%以上;皮下免疫BALB/c小鼠,ELISA法测定抗血清效价,表位(Ala69-Asn80)移植到白喉毒素转膜区(DTT,Ser305-Ile310),构建的表位疫苗可刺激机体产生针对h IL-6的抗体,抗血清效价达1.0×105。     

家禽三联多表位抗原蛋白的预测

采用生物信息学的知识和表位预测方法对家禽新城疫病毒、传染性法氏囊病毒和传染性支气管炎病毒三种传染性病原体的抗原表位，进行了预测，并对重组抗原进行了预测，为三联多表位疫苗研究奠定基础．     

含T细胞表位和B细胞表位的抗O型FMDV基因工程疫苗诱导豚鼠产生免疫反应

用FMDV疫苗免疫接种是预防口蹄疫的主要手段之一 .研制既含B细胞表位又含T细胞表位的基因工程疫苗对口蹄疫的防治具有更强的保护能力 .用化学方法合成O型口蹄疫病毒 (FMDV)外壳蛋白VP1中 2 1～ 40位肽段的T细胞表位基因 ,与 1 41～ 1 60肽段的B细胞表位基因串联后 ,与 β 半乳糖苷酶基因相连 ,构建成一重组质粒 ,并在大肠杆菌中表达出融合蛋白疫苗 .动物实验表明 ,该疫苗不仅能诱导豚鼠产生滴度很高的中和抗体 ,而且产生大量对病毒专一性T细胞 ,与不含 2 1～ 40肽段的疫苗相比 ,用该疫苗免疫的豚鼠血单个核细胞对FMDV的反应性提高 7倍以上 ,并能抵抗病毒攻击 .说明该疫苗可同时激活体液免疫及细胞免疫反应 ,有较强的保护作用 .     

汉滩病毒囊膜糖蛋白g2基因重组腺病毒的构建与表达

获得汉滩病毒G2 基因 ,构建其重组腺病毒并在HEK2 93细胞中包装表达 ,为研究汉滩病毒基因疫苗提供了实验基础。设计引物采用PCR从含汉滩病毒 \|76 1 1 8株M基因的M5 6质粒扩增出糖蛋白G2 基因片段 ,并将其克隆入腺病毒载体Adeno XviralDNA ,筛选获得重组腺病毒DNA ,转染HEK2 93细胞 ,包装、扩增后得到汉滩病毒G2 基因重组腺病毒原种 ;并在感染细胞内初步表达 ,用ELISA检测表达产物。得到了含汉滩病毒G2 基因的重组腺病毒 ,其滴度约为 1 0 10 pfu/mL ,同时在感染的HEK2 93细胞中检测到汉滩病毒糖蛋白G2 的表达。含汉滩病毒糖蛋白G2 基因重组腺病毒的成功构建 ,为研究汉滩病毒基因疫苗提供了实验基础     

汉滩病毒G1重组腺病毒的表达及其免疫学特性研究

将汉滩病毒(HTNV)囊膜糖蛋白G1重组腺病毒(Adeno-G1)感染VeroE6细胞,用IFA法检测其表达产物;并进一步将其免疫Balb/c小鼠。结果可检测到HTNV糖蛋白G1在VeroE6细胞中表达;用该重组腺病毒免疫小鼠,结果表明免疫小鼠体内可诱导产生抗汉滩病毒G1特异性抗体,同时微量细胞培养中和实验结果表明重组腺病毒还可刺激机体产生低水平的中和抗体,但淋巴细胞增殖反应不明显。说明Adeno-G1免疫小鼠后,主要刺激机体产生特异性的抗HTNV体液免疫应答,但刺激机体产生特异性的细胞免疫应答不明显,为HTNV基因工程疫苗的研究提供了实验基础。     

汉滩病毒M,S基因不同拼接方式原核表达效果比较研究

为了比较汉滩病毒囊膜糖蛋白G1与核蛋白(NP)主要抗原位点片段不同拼接方式的原核表达效果，将汉滩病毒76—118株M基因编码G1的片段与S基因编码区5’端约O．7kb的片段连接，克隆入pGEX一4T2，构建嵌合基因原核表达栽体pGEX-4T2-G1S0．7，pGEX-4T2-S0．7G1，在大肠杆菌XLl一Blue中诱导表达GST—G1S0．7或GST—S0．7G1融合蛋白。经IPTG诱导后，ELISA活性测定结果表明，两种融合蛋白均可与抗汉坦病毒NP的mAb特异性结合，融合蛋白GST—G1S0．7还可与抗汉滩病毒糖蛋白的mAb特异性结合。Western blot结果显示，诱导出G1S0．7或S0．7G1与GST的融合蛋白，其中G1S0．7嵌合基因的表达产物降解较少。研究证明：两种拼接方式的嵌合基因均可在大肠杆菌中表达出有生物学活性的融合蛋白，但表达效果不同，为汉滩病毒基因工程疫苗的研究奠定了基础。     

Screening of HLA-A2 restricted CTL epitopes using molecular simulation

Immunity is one of the functions a body has to iden-tify and eliminate foreign antigens. As one of the surfacemolecules of antigen presenting cells, major histocom-patibility complex (MHC) will exert essential effects dur-ing the antigen presenting procession, and the presenting of MHC-Ⅰ peptide complex is regarded as the prelude to activate the cytotoxic T lymphocytes (CTL) which play an important role in the anti-tumor and anti-virus responses. As we know, CTLs can only identify the co…     

汉坦病毒囊膜糖蛋白G2在毕赤酵母GS115中的表达及鉴定

构建了编码汉坦病毒囊膜糖蛋白G2基因的重组质粒,在毕赤酵母中表达,为汉坦病毒基因工程疫苗的研究提供实验基础。利用PCR法从含汉滩病毒76-118株M基因的M56质粒中扩增编码糖蛋白G2的基因片段,克隆入酵母分泌表达载体pPICZαA,构建重组质粒pPICZαA-G2。酶切鉴定挑取的阳性克隆,转化入GS115工程菌,在含100μg/mLZeocin的YPD培养基上筛选。挑选单菌落,PCR鉴定阳性克隆,用0.5%甲醇诱导表达,并利用SDS-PAGE及Western-Blot鉴定表达产物。序列分析表明所获得的基因片段与编码汉滩病毒76-118株囊膜糖蛋白G2的基因一致;100μg/mLZeocinYPD培养基上筛选出含pPICZαA-G2转化子,PCR鉴定为阳性克隆;SDS-PAGE可见约70kDa处有目的蛋白表达条带,经Western-Blot证实该条带为汉滩病毒囊膜糖蛋白G2。成功地构建了重组酵母表达载体pPICZαA-G2,并在毕赤酵母中初步表达成功,为今后汉坦病毒囊膜糖蛋白G2表达纯化以及基因工程疫苗的制备奠定了一定基础。     

鸡新城疫病毒HN蛋白多表位抗原的表达与免疫原性研究

有效抗原及表位的预测和筛选是疫苗研究的基础,在对鸡新城疫病毒HN蛋白抗原表位预测的基础上,对多表位抗原进行表达与免疫原性测定。根据生物信息学表位预测方法获得的家禽新城疫病毒抗原表位,利用PCR技术合成基因,构建pBVIL1-HN重组载体,转化大肠杆菌HB101,进行基因工程表达;经纯化蛋白后免疫小鼠,抗体滴度用酶联免疫吸附方法测定,确定抗原的免疫原活性。结果表明,多表位抗原基因经测序结果正确,融合基因在大肠杆菌得到高效表达,电泳纯融合多表位抗原经三次免疫得到抗血清,抗体滴度为1：8000。鸡新城疫病毒HN蛋白多表位抗原得到高效表达,且具有良好的免疫原性。     

重组GATA4腺病毒的构建及心肌细胞感染

利用AdEasy腺病毒表达系统构建了GATA4基因过表达腺病毒.编码大鼠GATA4基因的目的片段克隆入pAdTrackcmv质粒,pAdTtrackcmv-GATA4穿梭质粒经PmeⅠ线性化后转入含pAdEasy-1的BJ5183菌进行同源重组.pAdEsay-GATA4重组质粒经卡那霉素抗性筛选及PacⅠ酶切鉴定.pAdEsay-GATA4转入293A细胞进行包装,产生具有感染性的重组病毒.Ad-GATA4重组病毒感染HeLa及乳鼠心肌细胞,通过免疫印迹及实时定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测GATA4表达及促心肌肥大效应.Ad-GATA4重组病毒感染乳鼠心肌细胞后,诱导心肌细胞表面积明显增加,ANF表达明显增强.结果表明,Ad-GATA4腺病毒成功感染心肌细胞并诱导了大鼠心肌肥大表型的出现.     

高表达miR-122腺病毒载体构建与功能检测

利用改造后的腺病毒表达载体pDC312-cmv,构建含有8个miR-122表达框的重组腺病毒载体p-8miR-122,通过RT-PCR、ELISA、Sourthern blot验证重组载体高表达miR-122水平及抗乙肝病毒活性的能力.结果表明:重组腺病毒载体p-8miR-122构建成功且可高表达miR-122.并且,为鉴定重组腺病毒高表达miR-122水平及抗乙肝病毒活性的能力,本文还分别对空载体pDC312-cmv和重组腺病毒载体p-8miR-122进行腺病毒包装、扩增、纯化和TCID50滴度检测,其结果表明:纯化后的对照腺病毒和重组腺病毒滴度分别高达3×1010IU/mL和1×1011IU/mL,重组腺病毒与对照病毒相比具有miR-122高表达和抗乙肝病毒活性的能力.     

重组Nkx2．5腺病毒的构建及心肌细胞感染实验

利用AdEasy腺病毒表达系统构建了Nkx2．5重组腺病毒．Nkx2．5基因克隆入pAdTrackcmv质粒,pAdTtrackcmv—Nkx2．5经Pme I线性化后转化含pAdEasy-1的BJ5183菌进行同源重组,以构建pAdEsay-Nkx2．5重组质粒．pAdEsay—Nkx2．5转染293A细胞进行病毒包装．以Ad-Nkx2．5重组腺病毒感染Hela及乳鼠心肌细胞,检测了Nkx2．5蛋白表达及对下游ANF和β-MHC基因的表达调控;并采用感染病毒的H9c2心肌细胞经H2O2处理建立细胞凋亡模型,采用噻唑蓝法和荧光染色法检测了细胞存活率和凋亡细胞的形态变化．结果显示,Nkx2．5过表达能抑制H2O2诱导的H9c2细胞凋亡．     

汉滩病毒S基因0.7kb片段与M基因G2片段不同拼接方式嵌合基因原核表达产物的初步比较

比较汉滩病毒S、M基因部分片段的嵌合基因不同拼接方式表达产物的活性。构建了嵌合基因原核表达载体pGEX-4T-1-S0.7G2,并与已构建的pGEX-4T-1-G2S0.7的诱导表达产物进行了比较。结果表明,融合蛋白同时保持亲本蛋白的结合活性,且前者表达产物的结合活性始终比后者低。研究表明,嵌合基因的不同拼接方式对融合蛋白的活性可能有一定的影响。