核酸序列的矩阵表示

提出了用矩阵形式一对一地表示核酸序列的方法．发现通过矩阵运算很容易得到描述核酸序列中单碱基出现概率和碱基相关出现概率的矩阵和值,并且很易推广到多个碱基关联的情况．对于核酸序列的编码区,用这种矩阵方法计算出密码子的使用频率．而且发现用矩阵方法比较核酸序列的同源性非常直观．     

碱基关联模式的统计研究

本文第一部分给出了核酸序列碱基关联的混沌图示．第二部分讨论了各种二碱基关联模式与进化的相关性，发现ＣＣ，ＧＧ，ＴＡ，ＡＴ，ＣＴ等模式的频率与进化有明显的相关性．从ＤＮＡ双链的相互作用能对此结果进行解释．第三部分统计分析了二、三核苷频率分布和ＤＮＡ螺旋结构局部偏差的相关性，发展了前人结果，证实了编码序列螺旋结构在进化中向规整化方向发展。     

核酸序列非编码区关联长度的计算

首次计算ＤＮＡ非编码区的关联长度，发现７０％左右的序列关联长度≤２，约１５％的序列具有中程关联，约１５％的序列为长程关联，并作了初步的理论解释。     

核酸序列中的长程关联和1／f^α噪声

定义了核酸序列的关联函数，并用快速傅立叶变换的方法求出了核酸序列的碱基关联功率谱。结果发现：功率谱的低频端具有１／ｆ＾α涨落。对于大部分包含关联长周期的序列，α的值在１和２之间；而对于Ｇｅｎｂａｎｋ中全部序列，α的平均值约为０．５。     

碱基关联与基因表达水平的关系

研究了Ｅ．ｃｏｌｉ和Ｙｅａｓｔ基因编码区内碱基关联与基因表达水平的关系，结果表明：１）单碱基构成与基因表达水平有一定的关系；２）紧邻、次紧邻碱基间的关联（ｔ≤２）与基因表达水平有较好的线性关系；３）密码子第１位碱基的构成与基因表达水平有关系；４）密码子内１、３位和２、３位碱基之间的关联熵与基因表达水平有很强的关系；５）密码子内各位碱基与相邻密码子第１位碱基的关联熵与基因表达水平有很好的线性关系．     

DNA碱基组成和碱基关联的进化

据ＤＮＡ序列新资料，研究了ＤＮＡ碱基组成和关联与序列进化的关系，进一步证实了关于分子进化信息参数的发现：Ｄ２和Ｘ及其第一子序列的值在粗粒平均的意义下随进化增长，对ＭｙｏｓｉｎＨｅａｖｙＣｈａｉｎ（ＭＨＣ）序列进行了单独的研究，也证实了这个结论，同时研究了信息参数对度的依赖，发现由于碱基组成和关联的漂变造成长序列某些参数值的变小     

核酸重复序列的统计分析

本文研究了252个核酸序列(编码区)的长度大于5的重复片段,发现重复区长度约占序列长的一半,重复片段的出现次数和总长与进化没有相关性,但与信息剩余量 D_1有一定的相关性,并且重复片段的结构(D’1)与序列的进化也有一定的统计相关性.     

随机与无关联序列信息剩余度的分布

本文证明了对于随机核酸序列,2ND_1服从自由度为3的χ~2分布,对于l无关联核酸序列,2(N—l)D_(l 1)服从自由度为9的χ~2分布。     

核酸染料的应用研究进展

核酸染色是核酸研究的重要组成部分,溴化乙锭(EB)是核酸研究中常用的染料,因其自身存在的缺点,目前研究者正不断推出新的核酸染料,以期能找到可完全取代EB用于常规核酸染色的新型染料.本文对EB及近年新推出的一些新型核酸染料的特点进行了总结,并比较了它们的优缺点,为研究中选用何种染料进行核酸染色提供参考.     

核酸非编码序列信息指标的进一步分析

从信息论角度入手,进一步对13类、约1200个核酸非编码序列进行研究。对信息指标作了长度修正,找到了一些非编码区的特殊结构。得到非编码区遵守与编码区一样的进化规律,非编码区进化水平低于编码区的结论。     

艾滋病病毒的核酸检测法

被称为“世纪瘟疫”的艾滋病是获得性免疫缺陷综合症（AIDS）的简称,人类免疫缺陷病毒（HIV）是引起艾滋病的病原体。本文综述了艾滋病的血清学检测方法,尤其对现在普遍采用的三种先进的核酸检测方法PCR、bDNA和NASBA方法的检测原理进行了比较详细的介绍。     

编码序列和非编码序列中核苷酸关联性质的比较研究

定义了核苷酸序列的信息关联和１６种碱基关联，并求得了它们的涨落限。从关联长度和关联强度两个方面研究了编码序列和包含编码区和非编码区的全序列的核苷酸关联性质，并用快速付立叶分析的方法研究了关联的周期性。结果表明，编码序列的信息关联的主极大超过涨落限的７￣１０倍（高等生物），全序列则为１５￣１９倍，主极大强度与进化有一定的相关性，原核大于真核。８０％以上的序列的主极大分布在紧邻和次紧邻范围。当α－ｃｕ     

一类新的二元序列集及其相关分布（英文）

对于奇整数m≥5,构造了一类新的周期为2m-1的二元序列集,并完全确定了衡量新序列集性能的一个重要指m+3标——相关分布.新序列集的最大相关值为22+1,集合容量为22m+2m+1,和著名的Rothaus序列具有类似的相关性质,能适用于无线通信系统如CDMA通信系统.     

脯氨酸顺式肽键与氨基酸序列关联的统计分析

通过对蛋白质空间结构样板库SLCTBASE中包含顺式脯氨酸的序列进行统计分析,发现了顺式肽键脯氨酸与其序列周围氨基酸存在较强的关联。根据单个氨基酸与构象的关联信息,构造了含脯氨酸序列的顺式构象势函数,利用这个构象势可将顺式脯氨酸信噪比由5．4％提高至30％以上。