怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析

采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.     

大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术,对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究.从30个RAPD引物当中,筛选出11个具有多态性的引物,共扩增出多态性带224条,多态性条带比率为41.18%,从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物,共扩增出多态性带121条,多态性条带比率为50.21%.对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法,计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0.28和0.32.根据这两种标记的结果,采用UPGMA进行聚类分析,得到与生物学分类地位基本一致的结果.结果表明,在实验稳定性上,ISSR优于RAPD,且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异,RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究.     

长豇豆品种资源的RAPD分析

从30个随机引物中筛选出23个有效引物,共得到140条多态性带.实验平均每个引物扩增6.13条带,多态性条带数为6.09条.平均每个品种显示多态性扩增带64.35条(变幅为26~82),其变异系数为15.62%;平均每条带出现的品种次数为18.39个(变幅为1～39),频率为0.46(变幅为0.30~0.98),其变异系数为71.45%.品种间RAPD扩增带数目有别,其位点变异更大,说明供试品种间DNA序列存在不同程度差异,为根据DNA指纹有效判别品种间遗传差异提供了可能性.根据长豇豆品种DNA分子RAPD系统树图,可将长豇豆品种分为5个品种群,可弥补根据形态性状异同来判别品种的不足,揭示了由于自然和人工选择可遗传性状变异积累、地理隔离歧化和人工杂交强化基因重组等共同作用而形成的品种基因组差异的现实,也启示着品种亲缘关系确定和品种选择选配在成功改良品种中的重要性.     

蜡梅品种的RAPD分析

从200个随机引物中筛选出16个多态性稳定的引物,对38个蜡梅品种进行遗传多样性和亲缘关系RAPD分析.共扩增出154条DNA片段,其中,多态性DNA带98条,占总扩增片段的63.6%.应用Popgene32软件进行Nei相似性系数和遗传距离计算,并利用UPGMA法构建聚类树状图,把供试的38个蜡梅品种分为7个大类,聚类结果与形态分类结果基本一致.结果表明,RAPD标记可用于蜡梅品种鉴定和亲缘关系探讨.     

大蒜种质资源遗传多样性的分子标记研究

本研究利用RAPD和ISSR两种分子标记技术．对中国10个不同地区的大蒜品种进行了种质资源遗传多样性研究．从30个RAPD引物当中．筛选出11个具有多态性的引物．共扩增出多态性带224条．多态性条带比率为41．18％．从12个ISSR引物中筛选出5个具多态性的ISSR引物．共扩增出多态性带121条．多态性条带比率为50．21％．对RAPD和ISSR两种标记分别运用Nei指数法．计算出10个大蒜品种的平均遗传距离为0．28和0．32．根据这两种标记的结果．采用UPGMA进行聚类分析，得到与生物学分类地位基本一致的结果．结果表明，在实验稳定性上．ISSR优于RAPD．且ISSR比RAPD能检测到更多的遗传变异．RAPD和ISSR两种标记可用于大蒜种质遗传多样性的研究．     

东方百合杂交系部分栽培品种的遗传多样性分析

利用125条多态性随机引物对市场上具有代表性的10个东方百合杂交系栽培品种的遗传多样性进行了分析.结果表明：在125条引物中,30条引物能够扩增出多态性片段,引物多态性比例为24%.引物扩增片段数目从3到13条,其中S223可以完全区分10个供试品种.UPGMA法聚类结果表明,10个供试品种之间遗传距离为0.0930～05349,10个供试品种在相似系数0.57处可以分为3类,品种之间遗传变异比较丰富.其中Bernini和Tiber的遗传距离是0.0930,推测两者杂交亲本十分相近;而Aktiva与其它     

不同性别类型黄瓜品种基因组DNA的提取及RAPD标记的初步研究

采用改良的异丙醇沉淀法成功地提取了11个不同性别类型黄瓜品种的基因组DNA.以此作为PCR扩增反应模板进行RAPD分析,结果从22个10bp随机寡核苷酸引物中筛选出2个引物S23和S91在全雌性品种MT700和其他性别类型的品种之间稳定地扩增出多态性.至于该多态性标记是否与黄瓜雌性性别有关,还有待进一步分析.     

丁(鱼岁)遗传多样性的随机扩增多态性DNA分析

利用RAPD分子标记技术对15个丁鱼岁养殖个体的遗传多样性进行分析.选用20个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增,有16个引物可以扩增出稳定且清晰的条带,其中S103、S104和S105为多态引物.16个引物共扩增出65个DNA位点,片段大小在200~3 000 bp之间,其中多态性位点6个,多态位点比例为9.23%.个体间遗传距离在0~0.067 4之间,平均遗传距离为0.028 6.结果显示,丁鱼岁养殖群体的遗传多样性水平较低.     

7个水稻光温敏核不育系品种(系)的RAPD多态性分析

利用RAPD技术，从60个随机引物(10bp)中落选出了31个引物，能在供试的7个水稻光温敏核不育系不同品种(系)间扩增出180条稳定性较好的多态性片段．聚类分析结果显示，7个水稻光温敏核不育系品种(系)明量地聚为三类，其中同属于株1S体细胞诱变来的SV5，SVl0发生了较大的变异，相似系数均小于0．470，而SVl和SVl4变异较小，相似系数均大于0．890．H155与杂交亲本培矮64S的遗传差异较小，与杂交亲本株1S的遗传差异较大．该结果与田间农艺性状相符：另外，从7个水稻光温敏核不育系品种(系)的整体来看，相似系数均较大，说明遗传差异较小，遗传背景单一，从而在很大程度上限制了水稻杂种化势的利用．     

利用形态性状以及SSR标记鉴定4个川西北老芒麦品种(系)

基于23个形态性状和SSR分子标记,对在川西北推广应用的老芒麦(Elymus sibiricus)3个国审品种(‘川草2号’、‘阿坝’和‘康巴’)及1个新品系(‘雅江’)进行了鉴定研究.各品种表型性状与遗传背景差异较明显.新品系‘雅江’表现出优良的农艺性状,在株高、叶长、叶宽、茎粗等形态性状均值显著高于3个对照品种(P<0.05).13对多态性好、特异性强、条带清晰的SSR引物在4个品种(系)共扩增出90条带,其中具有多态性的条带共68条,引物多态性条带比例(PPB)、多态性信息含量(PIC)及Shannon多样性指数(H)的平均值分别为76.32%、0.309及0.451,在供试品种(系)中均表现出较高的多态性.基于形态数据的欧氏距离和基于SSR数据的遗传距离矩阵之间具有较强的相关性(r=0.696,P=0.08),表明联合形态学标记和遗传标记能很好的用于品种鉴定,并且基于形态数据以及SSR分子标记的UPGMA聚类结果基本一致.筛选出4对引物可用于供试品种鉴定,并绘制了DNA指纹图谱.新品系‘雅江’具有明显区别于其它3个主推品种的形态特征和遗传背景,这为川西北高原老芒麦主要品种的遗传关系分析及品种的知识产权保护提供了支撑数据.     

应用RAPD和AFLP标记的方法对甜(辣)椒和番茄品种的多态性分析

应用RAPD和AFLP的DNA指纹图谱方法分析25个甜(辣)椒和22个番茄品种的真实性,并进一步比较RAPD和AFLP的DNA指纹图谱在鉴定亲缘关系较近的品种之间的真实性时的有效性。对于甜(辣)椒品种,AFLP方法中,2个引物组合扩增反应的多态性片段即能将25个品种完全分开。虽然,每个样品的AFLP的扩增产物中多态性片段的百分率为9％,低于RAPD的35％多态性片段的百分率。但是,AFLP的信息量远远大于RAPD的信息量,它的每对引物组合扩增的平均多态标记为5．1,而RAPD仅为2．2。所以,在甜(辣)椒的指纹图谱中,AFLP的有效率是RAPD的2倍。对于番茄品种,每个样品的AFLP的扩增产物中多态性片段的百分率为5．5％,大大低于RAPD的单引物61％多态性片段和双引物58％多态性片段的百分率。它的每对引物组合扩增反应的平均多态标记为2．6,而RAPD中,单引物扩增的平均多态标记为4．2,双引物扩增的平均多态标记为4．4。一个单引物和一个双引物的RAPD扩增反应的多态性片段即能将22个番茄品种中的21个完全分开。所以,在番茄的指纹图谱中,RAPD的有效率是AFLP的2倍。因此,在应用分子标记辅助鉴定品种的真实性时,不同的作物所适用的方法是不同的。     

内蒙古地区主要推广玉米品种遗传多样性研究

用农艺性状与分子标记(SSR)相结合的方法分析了24个在内蒙地区选育的玉米品种遗传多样性.结果表明,用30对玉米SSR核心引物进行遗传多样性分析,共检测到234个等位基因变异,每对引物检测到5~15个多态性片段,平均为7.8个.每个位点SSR多态信息含量(PIC)变化为0.408~0.916,平均多态性为0.876.聚类分析(UPGMA)可将24个玉米品种分为5大类.品种间具有较高的遗传变异性.内蒙古地区主栽玉米品种有着较为稳定的遗传特性,基础遗传资源丰富.这对新品种选育、品种改良和亲本选配有着重要的参考意义.     

双棘黄姑鱼人工繁育群体遗传多样性的RAPD分析

采用22个随机引物对双棘黄姑鱼人工繁育群体的遗传多样性水平进行随机扩增多态DNA（RAPD）分析，共检测出248个位点，其中有104个多态位点，平均多态位点百分率P为41．9％；其个体间的平均遗传距离L为0．0657，平均相似系数S为0．9343，Shannon遗传多样性指数H0为0．2829．通过与其他一些鱼类的RAPD研究结果进行对比，对双棘黄姑鱼人工繁育群体的遗传多样性水平进行了分析评估,文中同时就人工繁育及鱼类种质资源的可持续利用问题进行了初步讨论．     

小麦F2代白粉病抗、感病特性RAPD标记的比较研究

用２０个随机引物,以抗白粉病（７９２０１－１１－７、临远７０６９）和感白粉病（中麦２号、郑８３１）的高产小麦品种为亲本,杂交获得的Ｆ２群体接种白粉病菌１５号小种,并进行ＤＮＡ随机扩增多态性（ＲＡＰＤ）分析．从中选育高产、抗病个体和研究抗感特性在分子水平上的差异．     

Analysis of RAPD and mitochondrial 16S rRNA gene sequences from Trichiurus lepturus and Eupleurogrammus muticus in the Yellow Sea

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique is applied to 12 individuals from each species of the hairtail fishes Trichiurus lepturus and Eupleurogrammus muticus in the Yellow Sea. The percentage of polymorphic sites, degree of genetic polymorphism and genetic distance are compared and the phylogenetic tree is constructed by Neighbor-joining method. The partial mitochondrial 16S rRNA gene is amplified by polymerase chain reaction (PCR) and the PCR products are directly sequenced after being purified. These sequences, together with the homologous sequences of another Trichiuridae species Lepidopus caudatus obtained from GenBank, are used to analyze nucleotide difference and to construct a UPGMA phylogenetic tree by means of biological informatics. Analysis shows: (1) the RAPD technique is a highly sensitive method for investigating genetic diversity in T. lepturus, and E. muticus. T. lepturus exhibits a lower polymorphism and genetic diversity than E. muticus; (2) according to the analysis of the partial mitochondrial 16S rRNA gene sequences, a very low intraspecific variation and considerably high divergence among species were found, which reveals a dual nature of conservatism and variability in mitochondrial 16S rRNA gene; (3) five primers generate the species-specific RAPD sites and these sites can be served as the molecular markers for species identification and (4) it can be proved at DNA variation level that T. lepturus and E. muticus are of two species respectively pertaining to different genera, which supports the Nelson taxonomic conclusion.     

应用RAPD技术对新疆布顿大麦遗传多样性的研究

利用RAPD分子标记，通过40条10碱基随机引流，对32份新疆布顿大麦进行了遗传多样性评价。在40个10碱基随机引物中，有22个引物（占55％）的扩增产物具有多态性，每条多态性引物能产生1－7条多态性DNA带纹。40个引物共扩增227条带，其中95条（占41．9％）具有多态性，平均每条引物能产生1．7条多态性DNA带纹。基于RAPD技术计算了32份布屯大麦间的遗传相似系数（GS）变化值为0．427－0．848，平均值为0．681，利用不完全加权算术平均数（UPGMA），采用1－GS矩阵对其进行遗传聚类，结果表明，RAPD标记将32份参试材料区分为3类（或亚类），来源于新疆北部的20份材料有17份材料（占85％）聚入Ib亚类，而第Ia亚类则主要来自于新疆中部的一些材料。研究表明，RAPD标记揭示的新疆布顿大麦间的遗传多样性与其地理来源紧密相关。     

中药溪黄草及其药用近缘种的RAPD分析

运用１４个有效的１０ｍｅｒ寡核苷酸引物对中药溪黄草原植物线纹香茶菜Ｉｓｏｄｏｎｌｏｐｈａｎｔｈｏｉｄｅｓ及其药作近缘种基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增,共检出１９４个位点．其中单态位点１４个,占７２％;多态位点１８０个,占９２８％;分类群特有位点１０８个,占５５７％．用ＵＰＧＭＡ法对分类群间的Ｊａｃａｒｄ相似性系数和遗传距离进行聚类分析．结果表明,狭基线纹香茶菜和细花线纹香茶菜与溪黄草的亲缘关系较近,而溪黄草与线纹香茶菜、狭基线纹香茶菜、细花线纹香茶菜之间的亲缘关系远．可用ＲＡＰＤ技术对中药的正本清源、真伪品及质量进行研究．     

高压对大麦种子萌发的影响及诱变的DNA分子指纹分析

利用不同静水压力处理萌动的大麦种子, 保压2 h, 发现高压对大麦种子萌发及幼苗生长均有一定的抑制作用,大麦发芽率和成苗率明显下降,压力达到200 MPa时不再有幼苗成活. 高压处理后 幼苗中出现了表型发生变异的植株,选取不同压力处理中表型变异最明显的3棵单株： P₁,P₂,P₃,, 以ISSR(inter simple sequence repeat) 和RAPD(random amplified polymorphic DNA)手段对其进行DNA指纹图谱分析, 用选取的21个ISSR引物和19个RAPD引物分别扩增出391和229条带,多态性条带比率 (PPB)分别为4993%和5859%,在 P₂和P₃中,两种标记分别扩增出112和113多态条带,ISSR检测中原种与P₂的平均绝对距离系数为0.136　1, 与P₃的平均绝对距离系数为0.116　5. RAPD检测中原种与P₂的平均绝对距离系数为0.151 3,与P₃的平均绝对距离系数 为0.195　9. 结果显示, 原种与P₂,P₃在ISSR和RAPD的检测中DNA的多态性十分明显. 本研究进一步证实, 高压是诱导种子植物变异的一种行之有效的新方法.     

墨西哥落羽杉无性系RAPD指纹图谱的构建

利用随机多态扩增DNA(RAPD)分子标记对53个墨西哥落羽杉无性系的研究表明:31个随机引物共扩增出了241条谱带,其中118条谱带在无性系间呈现多态性,多态位点占48.96%;用POPGENE软件对无性系进行遗传分析,得出无性系间的遗传距离为0.271~0.537,说明无性系间的遗传差异相对较大。通过聚类分析将53个优良无性系分为两大类,同时利用RAPD分子标记构建了53个无性系的指纹图谱,可对墨西哥落羽杉优良无性系进行区分和鉴定。