RAPD技术探讨几种家鸭与野鸭遗传多样性及亲缘关系

用RAPD技术分析我国常见家鸭品种（系）金定鸭(I、II、III系)、绍兴鸭、巢湖鸭、大余鸭、莆田黑鸭(I、II系)、连城白鸭、北京鸭,及引进品种番鸭和野鸭斑嘴鸭、绿头鸭基因组DNA的多态性.24个引物中,有19个共扩增出283条带,分子量约在400～2000bp之间,13个样品共有的条带数只有27条.根据扩增得到的RAPD图谱计算了不同样品间的遗传距离（D）和遗传相似系数.绿头鸭、斑嘴鸭与家鸭品种(系)间的遗传距离分别在0.2240～0.3092和0.2880～0.3735之间,方差分析表明两组数据不存在显著差异(p＞0.05).并依据D值由UPGMA聚类分析软件绘制了它们的分子进化树.     

银木和樟树遗传多样性与亲缘关系的RAPD分析

利用RAPD技术分析银木和樟树的遗传多样性与亲缘关系.用筛选出的12条引物从7株银木和7株樟树中共扩增得到91条DNA带,其中多态性条带48条,多态性条带比率为52.7%.根据Nei-Li方法进行的遗传相似性分析表明,银木植株间的遗传相似性系数在0.457～0.781,平均为0.564;樟树植株间的遗传相似性系数在0.646～0.862,平均为0.777;银木与樟树间的遗传相似性系数在0.318～0.531,平均为0.422.根据RAPD结果进行的聚类分析正确地将银木与樟树各聚为一类.这些数据说明银木植株间的遗传多样性大于樟树植株间的遗传多样性,银木与樟树之间的亲缘关系小于两种植物内部个体间的亲缘关系.     

刺五加遗传多样性的RAPD分析

选取我国东北哈尔滨地区刺五加３个居群共４９个单株的新鲜叶片，提取化基因组ＤＮＡ〈使用ＯＰＡ和ＯＰＢ系列８个随机引物进行ＰＣＲ反应，对ＤＮＡ样本做ＲＡＰＤ分析，３个居群多态ＲＡＰＤ位点的百分数分别为９３．５％，９１．３％和９７．６％；３个居的平均遗传距离分别为０．２４１，０．３６３和０．３８８；３个居群两两单株之间的平均遗传距离分别为０．３４５，０．３９０和０．４１２，结果表明刺五加种内居群内和居     

中国对虾遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态DNA技术,对中国对虾的3个野生地理群体--朝鲜半岛西海岸产卵群体及其越冬群体、黄渤海中国沿岸群体和一个人工累代养殖群体进行了遗传多样性研究.用一组随机引物,对每个群体各20尾对虾的基因组DNA进行扩增,共获得110个重复性好且谱带清晰的RAPD标记,68.2%的标记在所有个体间保持稳定的一致性,表明中国对虾的遗传多样性水平偏低.4个群体的多态位点比例在20%～33.3%之间,群体内的遗传多态度为0.0093～0.0307.群体间遗传变异高于群体内.不同群体间遗传变异水平不同,朝鲜半岛西海岸产卵群体及其越冬群体相近且高于黄渤海沿岸群体,累代养殖群体遗传变异度最低.通过成对的遗传距离分析,用非加权的组平均法构建了上述4个群体中国对虾的谱系关系图,该聚类分析的结果与中国对虾在黄渤海的地理分布相吻合.     

基于RAPD技术的红花品种遗传多样性分析

利用RAPD分子标记技术分析了国内11个省的20个红花品种间的遗传多样性.从筛选出的20个引物中,共扩增出209个位点,其中多态性位点178个,平均多态性比率为85.17%.采用成对算术平均数的非加权成组配对法(UPMGA)对Nei’s的一致度进行的聚类分析结果表明川红花和陕红花的遗传距离最近(0.206 5),太空1号和虞城红花的遗传距离最远(0.571 6).在遗传距离为0.38处将20个红花品种分为4个类群.其中云红3号、亳州红花、延津红花、延津大红袍、南阳红花、卢氏草红花、义县红花、白沙1号、太空1号、杞县刺红花聚为一类,该类群中大多数为河南道地红花品种,说明红花不同品种之间的遗传多样性可能与地理分布存在一定相关性.     

优质红锥种源遗传多样性的RAPD分析

采用从100个随机引物中筛选出的30个有效引物，利用RAPD技术对不同地区的10个不同生态型优质红锥种源进行遗传多样性研究．结果表明：（1）30个有效引物共扩增出290条清晰谱带，平均每个引物扩增出9．67条带．多态性条带为254条，比率为87．59％；（2）10个不同生态型红锥之间的遗传相似系数介于0．5946～0．7148之间，但不同地区红锥也存在着一定的遗传差异（遗传差异在0．2852～0.4054）；（3）用引物S3扩增出的带谱可在一次实验中区别10种不同生态地区的优质红锥，同时S3也可作为10种优质红锥材料的指纹图谱，鉴定优质红锥的种源；（4）聚类分析表明，10种优质红锥种源可聚成3个独立的类群．本文作者对它们的亲缘关系进行了推测．     

榛子种质资源遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记技术,对来自欧洲、美国和我国北方的共48份榛子品种或品系（包括4个种及种间杂种）的遗传多样性进行了分析．从150条随机引物中筛选出24条引物,共扩增出142条清晰可重复的带,其中多态性带130条,比例为91．5％．聚类分析将48份榛子种质分为5组：欧榛、平榛各自列为1组;杂交榛分成2个组;另外一组包括滇榛和藏榛2份种质．研究结果对榛子的种间亲缘关系进行了验证,且为同种不同品种的亲缘关系提供了更为详细的信息．     

利用RAPD标记分析甜瓜种质资源遗传多样性

应用17条随机引物分析了41份甜瓜种质的遗传多样性,结果表明甜瓜存在较大的遗传差异,其遗传距离的变异幅度在0．06-0．48之间,平均为0．31;厚皮甜瓜种质之间的遗传距离比薄皮甜瓜的大,而且厚皮甜瓜不同种质之间也可能存在较大的遗传距离,说明厚皮甜瓜与薄皮甜瓜之间或不同厚皮甜瓜种质之间配制的杂交组合可能有较强的杂种优势．41份甜瓜种质聚为两类：一类包括18份厚皮甜瓜、17份薄皮甜瓜和2份野生甜瓜种质,另一类包括4份厚皮甜瓜种质．     

日本对虾野生和养殖群体遗传多样性的RAPD分析

为加深和丰富对我国最为重要的经济虾类之一日本对虾(Penaeusjaponicus)遗传多样性的认识,分析了日本对虾一个野生地理种群(台湾海峡北部)及其移植到北方水域进行繁育的养殖群体各23个个体的随机扩增DNA多态性.实验选取OPK组20个10bp随机引物中的17个产生效果稳定的扩增结果用于群体遗传多样性分析,在两个群体中共检测出155个位点,野生种群和养殖群体的多态比例分别为85.14%和78.62%.用经修正的Shannon表型多样性指数量化两个群体的遗传多态度,野生种群和养殖群体的遗传多态度分别为0.214和0.201;两群体的遗传相似度为94.20%,遗传距离为0.058.     

云南栽培灯盏花遗传多样性RAPD分析

对采自云南大理、泸西、玉溪等地的12份灯盏花种质资源进行遗传多样性RAPD(random amplified polymorphic DNA)分析和NTSYS2聚类分析.10个RAPD引物在12份灯盏花种质资源种共产生43条DNA片段,其中32条带具有遗传多态性,约占74.41%,12个地方种质资源被聚为2个大类,野生居群被聚为一类,栽培灯盏花聚为一类,其中栽培灯盏花有4大亚类.云南栽培灯盏花种质资源遗传多样性丰富,遗传关系与其采集地的地理分布具有密切关系,但并非严格按地理界限聚在一起.     

双棘黄姑鱼人工繁育群体遗传多样性的RAPD分析

采用22个随机引物对双棘黄姑鱼人工繁育群体的遗传多样性水平进行随机扩增多态DNA（RAPD）分析，共检测出248个位点，其中有104个多态位点，平均多态位点百分率P为41．9％；其个体间的平均遗传距离L为0．0657，平均相似系数S为0．9343，Shannon遗传多样性指数H0为0．2829．通过与其他一些鱼类的RAPD研究结果进行对比，对双棘黄姑鱼人工繁育群体的遗传多样性水平进行了分析评估,文中同时就人工繁育及鱼类种质资源的可持续利用问题进行了初步讨论．     

十一种重楼属植物的RAPD分析

作者利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术，对重楼属植物11个种的遗传多样性进行了分析．12个引物共扩增出86条带，其中有82条(95．3％)表现出多态性，说明重楼属植物有很高的遗传多样性．用UPGMA法则构建分子系统树，并把11个种划分为6组．     

RAPD分子标记与群体遗传多态性分析

综述了ＲＡＰＤ分子标记技术的基本原理和基本方法,并介绍了该技术在群体遗传多态性研究中的应用及分子数量分析方法。     

新疆野生啤酒花DNA提取及RAPD反应体系的建立

采用2种方法提取啤酒花的基因组DNA,并分析了样品的不同状况和是否纯化对所提DNA质量及其RAPD扩增效果的影响。结果表明：采用改进的高盐低pH法优于CTAB法。以此法所提DNA为模板进行随机扩增多态DNA(RAPD)试验,分别测试了Mg2 ,dNTP、Taq酶、模板DNA浓度和退火温度对反应结果的影响,最终确定了野生啤酒花RAPD反应的最佳体系。     

日本囊对虾人工诱变子一代遗传变异的RAPD分析

以性腺成熟的日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)作为亲代,进行不同剂量的60Co-γ射线照射.采用RAPD技术对诱变子一代的无节幼体基因组DNA多态性进行了检测.从20个随机寡核苷酸引物共检测177个位点,其中多态位点152个,占85.9%.单个引物获得的标记为6～12个,平均8.85个,分子量在150～2 500 bp之间.遗传相似系数用Nei的计算方法进行计算,遗传距离则用Lynch的计算方法进行计算.实验数据表明:诱变子代与正常对照组相比,遗传多样性水平较高,诱变产生了较为显著的变异.研究结果证实:在对虾大规模养殖,种质质量严重退化的情况下,人工诱变能够促进基因组更加广泛的变异,为新品种的选育打下坚实的基础;同时证明RAPD技术在检测遗传差异方面具有较高的灵敏度和分辨率.     

真藓科(Bryaceae)植物RAPD反应体系的建立

真藓科植物的分子系统学研究是藓类植物研究中的新热点,RAPD是分子系统学研究中被广泛采用的一项重要技术.为了开展真藓科植物的分子系统学研究,通过单因素实验结合正交实验建立了适于该科植物的RAPD最佳反应体系:dNTP为0.2 mmol/L,随机引物0.4μmol/L,Taq DNA聚合酶1.25 U,Mg2 为2 mmol/L,模板DNA为50 ng,扩增体系为25μL.确定扩增程序:95℃预变性7min;94℃变性1min,36℃退火1min,72℃延伸2 min,40个循环;72℃终延伸7 min.并利用该体系从200条随机引物中筛选出了31条高度多态性的引物.     

短枝木麻黄地理种源遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD分子标记对35个短枝木麻黄（Casuarina equise fifolia）种源的遗传多样性和亲缘关系进行了分析．15个随机引物共扩增了出201条DNA带．其中148条为多态性带，占73．63％．平均每个引物扩增出9．9条多态性带．种源的Shannon’s多样性指数为0．4354，Nei’s基因多样度为0．2884，表明短枝木麻黄种源的遗传多样性水平较高．35个种源彼此的遗传距离在0．0884～0．7539之间，平均0．4045．经过UPGMA聚类分析将35个种源划分为A、B、C、D、E、F6个类群。其中A群5个种源，B群17个种源，C群4个种源．D群2个种源，E群1个种源．F群6个种源．