一种基于复合物参与度的关键蛋白质预测方法

针对在交互网络上的关键蛋白质识别通常只关注节点在拓扑层面上的一些特性,但关键蛋白质识别过程中有必要结合蛋白质功能方面的信息,提出了一种基于复合物参与度的关键蛋白质预测方法 DPC(Degree of Participation in Complexes),该方法考虑节点在复合物中邻居节点的数量,综合了蛋白质在复合物内部以及在全局总体上的拓扑特性.在酵母蛋白质网络上的实验结果表明,DPC在关键蛋白质识别率方面明显优于其他六种经典的节点中心性拓扑参数,并且DPC能够识别出参与多个复合物的蛋白质,与关键蛋白质的生物意义相吻合.     

基于基因表达数据双向聚类算法的研究

基因组数据的聚类分析,可以从多个数据集中识别与特定的生物学表型相关联的基因。传统的聚类方法仅进行单向聚类,即仅对基因表达谱的特征(基因)或样本进行聚类,没有考虑基因与样本的关联性。针对基因表达数据提出了一种新的无监督双向聚类算法,同时对基因和样本进行聚类。对已提出的聚类性能评价指标进行了改进,利用改进的指标确定双向聚类算法最优的聚类个数。将该方法分别应用到乳腺癌和青少年类风湿性关节炎基因表达数据中,结果显示,与传统方法相比,本方法具有较好的聚类效果。     

复杂网络图中心节点分布的研究

复杂网络图中不同的节点的作用和重要程度不同.节点的中心性度量,可以反映节点在图中的作用以及对其他节点的影响.复杂网络的全局中心节点有时分布较为集中,不能很好地反映网络图各处的重要节点.局部中心点是中心性度量值大于等于它的所有邻居节点的中心性度量值的节点,分散分布在网络图中,分散分布在社区中,是复杂网络中具有大的局部影响力的重要节点.     

智能电网中基于复杂网络的电力光传输网抗毁性分析

为了提高智能电网中电力光传输网的抗毁性,基于复杂网络理论对南京市江北区电力光传输网进行随机性攻击和选择性攻击实验仿真,根据仿真结果给出提高电力光传输网抗毁性的方法.在随机性攻击实验中分析了单个节点失效对网络连通性能的影响,并对枢纽节点进行了筛选,得到需要重点保护的枢纽节点.在选择性攻击中,提出了网络效率相对损失率优先攻击和实时介数优先攻击策略,并从连通能力、网络效率和网络效率相对损失率三方面进行抗毁性评价.实验结果表明,电力光传输网对实时介数优先攻击的抗毁性最差,由此提出了一种重要节点评估与保护方法以提高电力光传输网的抗毁性,并仿真验证了该方法的可行性和有效性.     

无线Mesh网络的在线测量优化

对网络特征进行准确和实时的测量是优化无线Mesh网络性能的基础. 该文提出一种无线Mesh网络在线测量架构以解决测量节点的位置选择问题. 联合考虑无线信号检测能力与信息传输能力,提出基于椭圆割线的测量节点选择方法. 分别以被测量节点和数据处理中心作为椭圆焦点构成测量区域,以测量系统的性能度量为目标函数,在椭圆环中选择最佳测量节点位置. 数值仿真表明,在保障无线Mesh网络在线测量品质条件下,该测量架构实现了检测能力和信息传输能力的综合优化,椭圆割线算法的计算复杂度低于随机选择算法.     

基于Logistic 奇异值分解模型的全基因组关联检测（英文）

从海量的单核苷酸多态性(SNPs)中,挑选出与疾病或某些临床、环境因素有关的位点,仍是全基因组关联研究中的一个重要课题。针对表型-SNP数据构成的二维列联表结构,提出了一个Logistic SVD模型。该模型可以同时考虑所有的SNP。另外,通过刻画SNP基因型在不同疾病表型水平下的分布差异,基于该模型构建了一个SNP检测准则。模拟研究显示,所提出的检测准则比现有的检测方法更加有效。     

基于图神经网络和随机森林的CircRNA-疾病预测

环状RNA(CircRNA)广泛参与人类疾病的进程,其突变和失调与许多人类疾病密切相关．因此,建立一个高效准确的CircRNA与疾病之间的预测算法对于提前对疾病的发生做出预防以及发病后的治疗方案具有重要意义．提出了一种新的基于图神经网络和随机森林的算法预测CircRNA-疾病关联算法,在分层网络表示嵌入部分通过构建异构网络,根据网络图的邻近性,对网络图的节点和边缘进行分层,递归地合并原始图中的节点和边,得到若干具有相似特征的较小子网络．子网络规模随着分层的深入而递减,直至得到最小子网络后,使用node2vec网络图游走算法对其进行预处理,然后将全部节点的特征向量输入至随机森林分类器来识别潜在的CircRNA-疾病关联,从而进行预测．     

一种支持拥塞识别的ad hoc网络DCF协议速率自适应机制

分析了IEEE 802.11 DCF协议虚拟载波检测机制在支持多速率传输方面存在的局限性,以及高速率传输数据分组的重负载条件下多跳ad hoc网络的节点拥塞问题,并在DCF协议框架内提出了一种支持拥塞识别的速率自适应机制.该机制允许接收节点根据信道质量选择可用的最高传输速率,并把此速率值和自身的拥塞状况反馈给发送节点,发送节点根据接收节点的拥塞状况决定发送或退避等待.仿真结果表明,该机制能有效解决ad hoc网络在重负载条件下的拥塞问题,显著提高网络的总吞吐量.     

认知无线电中基于可信度的感知节点集选择

联合谱感知虽然可提高系统的感知性能,但随着感知节点数目的增加,系统资源的占用越来越多,系统传输 效率下降. 该文详细分析了联合谱感知方法的感知性能,得到感知节点集感知性能与感知节点数目和平均接收信噪比之 间的关系,在此基础上给出一种感知节点集的选择方法. 针对认知网络中可能存在的不可信节点对感知节点集选择方法 的影响,提出可有效剔除不可信节点的可信度检测方法. 综合上面两种方法,提出了基于可信度的感知节点集选择算法, 在进行感知节点集选择的同时可有效剔除不可信节点,有效地保证了所选节点集的感知性能. 仿真结果验证了算法的有 效性和可靠性.     

基于连接矩阵的移动Ad Hoc网络可靠性评估方案

移动Ad Hoc网络(MANET)的动态拓扑结构使网络可靠性评估较为困难,为此提出一种基于连接矩阵的MANET可靠性评估方案.首先,确定网络中的源-终节点对和中继节点.然后,根据节点间欧式距离和通信范围来检测中继链路状态,并构建连接矩阵.最后,根据连接矩阵判断网络连接性,以多轮连接性的均值作为网络的最终可靠性.仿真实验中,评估了节点移动模型、网络大小、节点数量和通信范围对网络可靠性的影响,能够为网络设计者提供有力的依据.     

基于深度置信网络和生成模型的驾驶疲劳识别

驾驶疲劳识别研究对预防交通事故提高交通安全具有重要意义.提出了一种基于深度置信网络和生成模型的驾驶疲劳识别方法.为了有效地表示疲劳,采用深度置信网络从人脸图像中提取疲劳特征;结合已标注样本和未标注样本,提出了一种基于生成模型的半监督学习的疲劳识别方法,解决了疲劳识别中的小样本问题.在自建疲劳数据库上,采用该方法进行了驾驶疲劳识别的仿真实验,同时和其他几种方法进行了对比,结果表明该方法具有更高的识别精度.     

一种发现社团结构的快速凝聚聚类算法

为了快速探测复杂网络中的社团结构,提出了基于网络节点耦合度的凝聚聚类算法.首先利用一种优化的聚类中心算法确定初始聚类中心节点,然后根据节点间耦合程度和节点度分别对各社团的节点进行分类和不断调整聚类中心,直至聚类算法结束.实验结果表明,该算法能够快速准确的划分复杂网络中的各社团.     

多射频无线ad hoc网络的复杂网络效应

对复杂网络与无线ad hoc网络的机理分析表明,一定条件下的无线ad hoc网络具有复杂网络效应。该文在验证多射频节点组建小世界无线ad hoc网络可行性基础上提出多射频节点的控制策略。文中提出的策略考虑到节点的设计,并根据网络环境及节点的聚类系数来控制多射频节点的部署。仿真实验表明,该策略优化了网络的拓扑结构,增加了网络的鲁棒性,对进一步优化网络性能具有理论与实际意义。     

攻击检测安全LEACH路由协议

提出一种基于攻击检测的安全LEACH协议S-LEACH.该协议根据LEACH协议的特点,采用在簇头选举和数据传输阶段在数据包尾部捎带检测参数信息的方法,通过节点能量和接收信号强度值,综合判断传感器网络中的HELLO flood攻击和Sybil攻击;同时针对簇头节点和簇内节点的攻击,分别设计了2种检测方法,提高了检测精度.最后在NS-2软件中建立了WSN真实网络空间的Jakes信道模型,利用该模型验证了S-LEACH协议的安全性.     

浅谈沥青路面检测技术的现状及发展研究

目前施工过程中缺乏沥青路面非均匀性实时检测控制的方法和标准,仅有的检测指标不能有效监控、检测沥青路面施工过程中的质量变异,需要建立一套能全面反映路面非均匀性的测试方法、指标和标准。本文研究了我国现行的检测方法的不足,分析了目前国内外的先进研究成果,可以将这些成果应用于沥青混合料的均匀性检测和沥青路面的非均匀性检测,以指导沥青路面施工,对控制施工质量具有重要的现实意义。     

基于活跃点的社区跟踪算法

针对复杂网络社区跟踪中存在忽略演化时域因素以及忽略网络成员演化差异性不足等问题,提出一种社区跟踪方法.对相似函数添加时域信息,并考虑网络演化的平滑性与节点间的差异性,提取网络中的活跃节点进行社区跟踪.实验表明,该算法在DBLP数据集上能比其他社区跟踪算法更好地发现社区演化过程,且找到的社区信息相似度较高.     

具有复杂网络特性的无线传感器网络的谣言传播机制的查询方法研究

为了降低无线传感器网络的通信开销,减少搜索目标节点的查询次数,以提高无线传感器网络的生存周期;提出了构建具有小世界特性和幂律分布的复杂网络的网络结构,引入谣言传播机制.结合择优连接机制,建立一种新的查询方法.借助GPL模型的拓扑模拟器BRITE产生了不同尺度的仿真网络.针对查询通信开销和算法覆盖度两个重要指标,测试传统的flood-ing算法和本文的方法,结果表明,本文的查询方法的通信开销小于flooding算法的一半,算法覆盖度与flooding算法相当.     

海峡西岸繁荣带城市中心性研究--以福州为例

根据福建省和福州市有关统计资料,运用定量分析的方法对20世纪80年代中后期以来作为建设海峡西岸繁荣带重要节点城市--福州市的城市中心性进行初步分析,发现其经历一段波动发展后平稳增长;并探讨了福州城市中心性波动的原因,最后提出提高福州城市中心性的建议.     

基于随机生存森林与网络拓扑信息的食管癌风险预测

为精确预测食管癌病人的存活风险,通过构建食管癌编码基因(mRNA)和非编码基因(ncRNA)共表达网络,利用随机游走挖掘网络节点的拓扑权重,并与随机生存森林(RSF)整合,构建食管癌风险预测模型.结合5倍交叉证实和独立数据集验证,利用C-index评估算法预测性能.识别出了用于构建风险预测模型的最优lnc RNA分子标签,并实现了食管癌生存风险的精确预测.     

IEEE 802.11 DCF协议的非同步退避建模与分析

在IEEE 802.11分布式协调功能(DCF)协议的单跳无线局域网环境中,数据包冲突会在网络节点间产生非同步退避现象.以固定长度的物理层时隙为状态转换的单位时间,考虑节点冻结期经历的状态,提出一个新的三维马尔可夫链模型以分析非同步退避现象对协议吞吐量的影响.由该分析模型得出的结果在IEEE 802.11 DCF协议的两种数据包传输机制下都表现出与仿真结果较好的一致性,并且随着网络节点数增加,与已有参考模型相比也具有较高的准确性.