鸡Cong菌科研究概况

本文论述了鸡Ｃｏｎｇ菌科的研究史范围。笔者认为，它包含两个属；鸡Ｃｏｎｇ菌属和华鸡Ｃｏｎｇ菌属。提出了该科已知种的详目，并对该科的种的分类和鉴定等问题进行了讨论。     

黑蛋巢菌属一新纪录种

文中报道了黑蛋巢菌属Ｃｙａｔｈｕｓ一个中国新纪录种。此种为小笠原黑蛋巢菌Ｃ．ｂｏｎｉｎｅｎｓｉｓ Ｓ．其模式标本产地为日本，新纪录种标本存在山西大学真菌标本室。     

水稻共生菌DX01的分子鉴定及电击转化条件的初步探索

用ＰＣＲ的方法扩增了水稻表面共生菌ＤＸ０１的１６Ｓ ｒＤＮＡ片段,并进行了部分序列的测定和ＢＬＡＳＴ同源序列比较分析,结果表明,该序列３’端５５０ｂｐ与短小芽孢杆菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｐｕｍｉｌｕｓ）１６ Ｓ ｒＤＮＡ的同源性达９９％,５‘端６８０ｂｐ为９８％,故ＤＸ０１应为Ｂ．ｐｕｍｉｌｕｓ。对其电击法转化的部分条件进行了初步的探索,结果表明：当细菌处于Ｄ（６００）为０．９的生长期时,使用ＰＥＢ     

河南的红菇科真菌资源研究(Ⅰ)

红菇科（Ｒｕｓｓｕｌａｃｅａｅ）是担子菌亚门的（Ｂａｓｉｄｉｏｍｙｃｏｔｉｎａ）一个自然类群,在河南山区分布的种类隶属乳菇属（Ｌａｃｔａｒｉｕｓ）和红菇属（Ｒｕｓｓｕｌａ）。本文依据采集的标本,鉴定、整理出乳菇属的种类有１４种,其中食用菌８种、药用菌３种、毒菌５种。此外,它们多是菌根菌,与林业有着密切的关系;还有不少种类的子实体中含有抗癌物质,具有抑制肿瘤的作用。     

云南山地小型真菌生态位宽度及其生态位距离比较

采用香农指数（ＳｈａｎｎｏｎＶｉｅｎｅｒＩｎｄｅｘ）、Ｓｏｒｅｎｓｏｎ指数及ＵＰＧＭＡ法分析了云南六个山地系统４２个样点中分布的２７属小型真菌生态位宽度及其生态位相似性．根据生态位相似性将上述小型真菌划分为四个生态群,论述了不同山地小型真菌属间的功能相关性和对环境适应的相关性．结果表明,在云南六个典型山地系统中主要的优势菌属是青霉属（Ｐｅｎｉｃｉｌｉｕｍ）、拟青霉（Ｐａｅｃｉｌｏｍｙｃｅｓ）、曲霉属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｕｓ）、木霉属（Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ）、枝包属（Ｃｌａｄｏｓｐｏｒｉｕｍ）、葡萄孢属（Ｂｏｔｒｙｔｉｓ）、头孢属（Ｃｅｐｈａｌｏｓｐｏｒｉｕｍ）、镰刀菌属（Ｆｕｓａｒｉｕｍ）、卵孢属（Ｏｏｓｐｏｒｉｕｍ）及地霉属（Ｇｉｏｔｒｉｃｈｕｍ）;这十个属的生态位宽度均大于２００,而且它们之间生态位相似程度较高     

舌蝇共生菌的种系发生及其与宿主在进化上的关系

分析了３个亚属８个种舌蝇的初级内共生菌的１６Ｓ ｒＤＮＡ序列，发现这些初级共生菌属于原细菌的γ－分支并组成其独特的谱系。从３个亚属５个种舌蝇中分离出来的次级共生菌的１６Ｓ ｒＤＮＡ序列几乎完全一致，这些来源不同的细菌是非常相似的，种系发生分析表明它们属于原细菌γ－分支的肠杆菌科，证明不同种舌蝇中的次级内共生菌是舌蝇在种系分化以后独立获得的共生关系。     

笼头菌科新属和新种

发现了四川省攀枝花市的属于鬼笔目Ｐｈａｌｌａｌｅｓ，笼头菌科Ｃｌａｔｈｒａｃｅａｅ的新属：内笼头菌属Ｅｎｄｏｃｌａｔｈｒｕｓ，新种：攀枝花内笼头菌Ｅｎｄｏｃｌａｔｈｒｕｓ ｐａｎｚｈｉｈｕａｅｎｓｉｓ予以报道。     

贺兰山蓝丝膜菌菌丝体生长特性的研究

对贺兰山蓝丝膜菌（Ｃｏｒｔｉｎａｒｉｕｓｃａｅｒｕｌｅｓｃｅｎｓ（Ｓｃｈａｅｆ．）Ｆｒ．）菌丝体在纯培养条件下的生长特性进行了研究．结果表明,菌丝体最适生长温度为２０～２５℃,最适生长ｐＨ值为６,长势最好的培养基为ＰＤＡ综合培养基,蛋白胨、葡萄糖为最佳氮碳源     

中国主要红树科植物的分子系统发育

测定和分析了红树科（Ｒｈｉｚｏｐｈｏｒａｃｅａｅ）５属６种植物的ｒＤＮＡＩＴＳ区序列，所构建的ＩＴＳ区分子系统树图表明：红树科植物可形成１个单系的类群．但在部分属种ＩＴＳ序列分析的结果与红树科传统的分类系统有所不同，陆生红树科植物竹节树属（Ｃａｒａｌｉａ）的竹节树（Ｃｂｒａｃｈｉａｔａ）和旁杞木（Ｃｐｅｃｔｉｎｉｆｏｌｉａ）之间的分子差异很大，呈复系演化的特征．旁杞木与红树林主要植物秋茄属（Ｋａｎｄｅｌｉａ）的秋茄（Ｋｃａｎｄｅｌ）和红树属（Ｒｈｉｚｏｐｈｏｒａ）的红海榄（Ｒｓｔｙｌｏｓａ）的关系较近，竹节树则与另一红树林的主要种类角果木属（Ｃｅｒｉｏｐｓ）的角果木（Ｃｔａｇａｌ）呈姐妹群关系．     

关于榆叶梅的系统位置

认为榆叶梅不与Ａｍｙｇｄａｌｕｓｕｌｍｉｆｏｌｉａ（Ｆｒａｎｃｈ．）Ｍ．Ｐｏｐｏｖ同种，而与毛樱桃Ｃｅｒａｓｕｓｔｏｍｅｎｔｏｓａ（Ｔｈｕｎｂ．）Ｗａｌｌ．特别相近，且较毛樱桃进化，其系统位置应属于樱属ＣｅｒａｓｕｓＭｉｌｌ．、矮生樱亚属Ｓｕｂｇｅｎ．Ｍｉｃｒｏｃｅｒａｓｕｓ（Ｋｏｅｈｎｅ）ＹｕｅｔＬｉ、管萼组Ｓｅｃｔ．ＡｍｙｇｄａｌｏｃｅｒａｓｕｓＫｏｅｈｎｅ．其学名应为Ｃｅｒａｓｕｓｔｒｉｌｏｂａ（Ｌｉｎｄｌ．）Ｂａｒ．ｅｔＬｉｏｕ．     

25株SIV/HIV的进化分析及意义

选取了16株SIV和9株HIV毒株,以人T细胞白血病病毒HTLV-1为outgroup,使用CLUSTAL X、PHYLIP及MEGA三种软件对它们的基因组序列及三个主要蛋白(Env,Gag,Pol)序列分别进行了比对分析,用Neighbor-Joining(N-J)方法和Maximum Likelihood(ML)方法分别构建出进化树.结果显示HIV起源于SIV,其中HIV-1的起源与SIVcpz的几种亚型高度相关,HIV-2的起源与SIVsm及SIVmm高度相关.     

虫草属多元起源的分子生物学证据

测定了虫草属 (Cordyceps)代表种及其相关无性型菌 (anamorphicstate )核糖体rDNAITS区序列 ,并从国际分子生物学数据库中调取相关序列 ,以Phylip35分析软件构建序列距离矩阵和分子系统发育树图 ,结果表明 :虫草属各个种之间ITS区序列差别比较大 ,不能形成一个单系的类群 .冬虫夏草 ,古尼虫草 ,蛹虫草 ,大团囊虫草在系统发育上分别与丝孢纲(Hyphomycetes) ,束梗孢目 (Stilbelaes)的中国被毛孢 ,丝孢目 (Hyphomycetales)的黄绿绿僵菌 ,丝孢目 (Hyphomycetales)的球孢白僵菌 ,担子菌纲的Cyphomyrmexminutus非常接近 ,在树图上分别处于相对独立的分支 ;说明形态学上划分的虫草属并非一自然发生的类群 ,也说明了虫生真菌形态与基因水平进化的不一致性 .     

杨树泛基因组构建与基因组变异分析

【目的】杨树是重要的速生用材、生态防护和碳汇造林树种,也是林木遗传研究的模式树种。开展杨树泛基因组构建与基因组变异分析,可为杨树精准育种和林木泛基因组研究提供理论先导。【方法】 以公开发表的高质量杨树基因组序列为基础,分析不同类型的序列变异,总结变异特征,并构建基于基因和图形结构的杨树泛基因组。【结果】 本研究收集到8个杨属树种和3个二倍体或三倍体杨树杂交品种的基因组序列,3个杂交品种包含7个单倍型亚基因组序列,较好地代表了杨树4个组派的基因组特征。分析结果表明,杨树基因组间存在较多大的结构变异。在基于基因的泛基因组中,共线核心基因、非共线核心基因、次核心基因、非必需基因、特异基因占比分别为12.5%、34.9%、31.4%、16.5%、4.7%。其中,非必需基因在功能上具有较高的多样性。以基因组序列变异为基础构建杨树图形结构泛基因组,大幅提升2代测序数据的变异检测效果。通过泛基因组变异热点分析,鉴定出2个与物候关联的基因位点。【结论】 杨属基因组中存在大量染色体重排,进而增加了基因调控的多样性。杨树组/派间的基因组结构变异可能与物候适应存在关联。基于林木基因组序列的复杂性,在林木泛基因组研究中应注意基因组整合范围与研究目标相匹配,结合基因泛基因组和图形结构泛基因组结果,综合解析林木的遗传变异规律和物种演化特征。     

涉案偶蹄目动物DNA条形码构建

【目的】利用线粒体DNA条形码标记鉴定涉案偶蹄目动物,为解决偶蹄目动物残体、制品的鉴定难题提供技术参考。【方法】对16个偶蹄目动物物种共67份样本,采用试剂盒提取DNA,扩增、测定物种的线粒体DNA的COI基因、Cyt b基因片段;在GenBank上Blast搜索进行同源性分析;利用MEGA 7.0软件分别比较这两个基因片段种内和种间遗传距离,构建系统发育树。【结果】在同源性分析中,西伯利亚狍(Capreolus pygargus)的Cyt b基因片段与GenBank中西伯利亚狍、欧洲狍(Capreolus capreolus)基因序列的同源性均为99.64%~99.82%,该片段不能区分西伯利亚狍与欧洲狍这两个近缘种。其余测序结果与数据库中参考序列一致且相似度较高。对于COI片段,种内遗传距离为0~1.4%,种间遗传距离为1.8%~18.8%。对于Cyt b基因片段种内遗传距离为0~0.5%,种间遗传距离为4.0%~15.8%。两个片段的种内遗传差异均小于种间遗传差异,存在较为明显的条形码间隔。COI和Cyt b基因片段的系统发育树中,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支;不同物种之间界限清晰,每个物种的所有个体均能够形成具有较高支持度的单分支。【结论】基于COI和Cyt b基因片段构建的DNA条形码均可用于对涉案偶蹄目动物的物种鉴定。在物种鉴定中,可采用两个片段联合使用的方式,尤其是对于近缘种的鉴定,以降低错误风险。     

裂足轮虫还是裂足臂尾轮虫

通过分析比较了裂足轮虫(Brachionus diuersicornis)、方型臂尾轮虫(B．quadridentatus)、壶状臂尾轮虫(B．urceus)、矩形臂尾轮虫(B．1eydigi)、萼花臂尾轮虫(B．calyciflorus)等5种轮虫的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI）的部分序列，并结合4种海水臂尾轮虫的序列数据，用西氏晶囊轮虫(Asplanchna．sieboldi)作外群构建UPGMA树和NJ树，探讨了烈足轮虫的分类学问题，认为将裂足轮虫归属千臂尾轮虫属市为合适。     

内生真菌JSM 10的分离及鉴定

以蛇足石杉为材料,经过严格的表面消毒,分离纯化得到1株内生真菌JSM 10.对JSM 10进行培养特征、显微形态观察和基于ITS序列的系统发育分析.结果表明：菌株JSM 10和Fusarium属的 Fusarium oxysporum菌株系统发育关系最为密切,聚在同一个小枝上,相似程度为99%.因此,从系统发育分析来看,JSM 10应为Fusarium oxysporum菌株.     

苏铁在种子植物进化中的位置：分子生物学的证据

用大分子rRNA快速测序法测定了苏铁(Cycas revoluta Thunb.)、水松[Glyptos-trobus pensilis(Staunt.)Koch]和南方红豆杉[Taxus mairei(Lemee et Levl)S.Y.Hu]三种裸子植物Ls-rRNA5′端区108个核苷酸的序列。用这些数据构建的rRNA系统树揭示了苏铁与水松和南方红豆杉构成一个关系密切的姐妹群,而所分析的被子植物都为另一自然类群。另以绿藻作为种子植物群外参照物种,表明苏铁这一位置并不是由于一个特异的进化速度所造成的。这一结果支持了苏铁与松杉类为一自然群类,它们的分歧发生在裸子植物与被子植物分歧之后的假说。     

粗毛栓菌atp9基因的克隆、表达及序列分析

ATP合酶是生物体内能量代谢的关键酶,参与多种氧化磷酸化和光合磷酸化反应.atp9基因是ATP合酶的重要组成部分,其编码了ATP合酶A亚基上第9亚单位,与呼吸作用和光合作用密切相关.本研究利用atp9基因在进化过程中高度保守的特点,据已知近缘真菌基因序列,设计并合成了一对引物,以粗毛栓菌mRNA反转录得到的cDNA第一链为模板,PCR扩增得到atp9基因完整序列,并连接于原核表达载体pET32a(+)上.测序与序列分析表明:该克隆片段全长222 bp,共编码73个氨基酸,翻译的蛋白质分子量是7.35 kDa.转化大肠杆菌后经IPTG诱导,可高效表达外源融合蛋白,分子量大小与预测结果一致.经过同源比对和进化树分析,该克隆基因编码的氨基酸序列与可可丛枝病菌(Crinipellis perniciosa)和瓣环栓菌(Trametes cingulata strain ATCC 26747)中相对应的氨基酸序列相似度最高.本实验为未来进一步研究粗毛栓菌atp9基因和其蛋白功能,阐明其调控和作用机制奠定了基础.     

松材线虫病死木中真菌和细菌的分离

从来自江苏省和浙江省几个疫区的松材线虫(PWN)病病死木的木质部中分离出111个真菌菌株，经鉴定种类为木霉(Trichoderma spp．)、轮枝霉(Verticillium spp．)、青霉(Penicillium spp．)、镰孢霉(Fusarium spp．)、曲霉(Aspergillus spp.)、毛壳菌(Chaetomium spp．)、茎点菌(Phoma spp．)、短梗单孢霉(Dicoccum sp．)、头孢霉(Cephalosporium sp．)、交链孢霉(Alternaria sp．)，这些真菌约占分离真菌总数的60％；在43％的未鉴定菌中，除3个菌株为有孢菌外，其余均是无孢菌。可以分离出真菌的病死木占56．42％，从病死木中可分离出细菌的比例达86％，可同时分离到真菌和细菌的比例为43．6％。     

一些具有较多边数图的临界群

图的临界群是图生成树数目的一个加细,图的临界群的阶数恰为该图的生成树的数目.确定了一些具有较多边数图如Kn-K1,m,Kn-Km,Kn-mK2,Kn,n-nK2的临界群的结构,证明了这些图的临界群不是一个循环群,而是多个循环群的直和.