一种适用于胡杨叶片非变性蛋白质提取的方法

为探索适用于胡杨叶片非变性蛋白质的提取方法,以采自内蒙古额济纳旗天然胡杨林中胡杨成熟叶片为材料,采用咪唑法、Bis-Tris法、Tris-HCl法和新构建的Tris-SSAD法4种非变性蛋白质提取策略,分别用于提取胡杨叶片蛋白质样品;随后进行第一维非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(1~(st)-DE:Native-PAGE)。相比之下,只有Tris-SSAD法获得了清晰、条带数目较多的Native-PAGE图谱,且结合第二维变性凝胶电泳(2~(nd)-DE:SDS-PAGE)可成功分离出较多蛋白质复合体亚基或相互作用蛋白质分子,证明了Tris-SSAD法非变性温和提取特性。研究建立并优化了适用于胡杨叶片的非变性蛋白质提取方法,为后续进一步分析蛋白质与蛋白质相互作用及蛋白质复合体功能提供了实验基础。     

牛血超氧化物歧化酶在变性因素影响下的酶活与构象变化

应用圆二色谱（ＣＤ谱），测定了牛血超氧化物歧化酶（ＳＯＤ），在不同变性因素下的构象变化，并和酶活性作了比较。ＳＯＤ的ＣＤ谱分析表明，它是一种含β－折叠较多的酶（４２．３％），其分子的稳定性很高，对变性因素的作用不甚敏感。但是在特定实验条件下，ＳＯＤ的酶活性仍然会发生变化，构象也会发生改变，并且构象变化还早于酶活的降低。     

分形在蛋白质结构分析中的应用

通过介绍分形原理和方法在蛋白质分子结构分析中的应用,表明用分形的方法不仅可以对蛋白质分子结构的复杂性给予定量地描述,而且为人们进一步认识蛋白质的性质和特征提供一些有益的启示和新的信息。     

支持向量机程序SVMProt预测SArs病毒蛋白质的功能

对SARS冠状病毒蛋白质功能的有效识剐将有利于促进SARS传染病治疗药物的开发。应用基于支持向量机原理的SVMProt程序识别SARS冠状病毒蛋白质的功能,通过对SARS冠状病毒中2个已知功能的蛋白质功能的成功预测,说明SVMProt能够有效地应用于SARS冠状病毒蛋白质及其他种类蛋白质的功能预测。对SARS冠状病毒中至今仍未知其功能的蛋白质ORFl3的功能进行了预测,结果显示ORFl3是一种可能与DNA结合的核蛋白并兼有病毒体内结构蛋白的功能。     

基于复合物结构和网络拓扑特性的关键蛋白质识别算法

关键蛋白质的识别有助于从分子水平上理解生命的活动过程,然而仅从拓扑特性角度来识别的关键蛋白质不够精准,因此为了提高识别准确率,结合复合物信息提出了确定蛋白质关键性的指标模型EIC,该模型是基于蛋白质复合物内的局部中心性特性以及网络的全局信息特性来考虑.使用DIP和MIPS两种蛋白质相互作用(PPI)网络作为实验数据集,...     

兔角膜上皮特异性水溶性蛋白质的电泳分析

分离兔角膜上皮和皮肤表皮，提取水溶性蛋白质，采用ＳＤＳ－ＰＡＧＥ以及ＩＥＦ／ＳＤＳ－ＰＡＧＥ技术对其组成进行分析研究，发现兔角膜上皮存在５种主要特异性水溶性蛋白质，其分子量和等电点分别为：Ｍｒ６８２００，ｐＩ７．５；Ｍｒ６１７００，ｐＩ５．１；Ｍｒ５１３００，ｐＩ７．６；Ｍｒ３６３００，ｐＩ８．９和Ｍｒ２５７００，ｐＩ５．７。     

生物化学实验"蛋白质沉淀反应与盐析作用"解析

该文针对生物化学实验蛋白质沉淀反应与盐析作用中一些学生不能科学解释的实验现象进行了详细分析.为学生更深刻地理解理论知识做了必要的铺垫,也为今后的教学提供了宝贵的参考资料.     

酵母双杂交系统的改进和发展

酵母双杂交系统是研究蛋白质间相互作用的一种非常有效的分子生物学方法，具有快速和高效的特点，但也存在一些局限性．人们针对它的缺点相应地进行了一些完善和改进，并衍生出单杂交系统、三杂交系统等一系列相关的技术，从而拓宽了该系统的应用领域．     

蛋白质芯片技术的新进展

基于微阵列技术基础上的蛋白质芯片技术能够在体外直接研究蛋白质的性质和作用,已经被广泛地应用于蛋白质-蛋白质、蛋白质-核酸、蛋白质-小分子药物等方面的研究,并表现出了良好的前景。对蛋白质芯片技术的研究进展和未来前景展望进行了综述。     

A Co—expression System Based on Phage and Phagemid to Select Cognate Antibody—antigen Pairs in vivo

A modified selectively-infective phage(SIP) is developed to facilitate the selection of interacting antibody-antigen paris from a large single-chan antibody(scFv)library in vivo.The system is constructed with a modified helper phage M13KO7 and phagemid pCANTAB 5E.The antigen fused to the C-terminal of N1-N2 domain and the scFv to the N-terminal of CT domain of the gIIIp of filamentous phage are encoded on the phage and phagemid vectors respectively.The phages produced by co-transformants restore infectivity via interaction between antigen and antibody fusions in the cell periplasm.In a model system,the scFv fragment of the anti-hemagglutinin 17/9 antibody and its corresponding antigen are detected in the presence of a 10^5 fold excess of a non-interacting cotrol paris,which demonstrates this system to be very sensitive and facile to screen a large single-chain antibody library.     

白藜芦醇诱导HepG2细胞凋亡中线粒体差异蛋白鉴定

为研究线粒体在白藜芦醇诱导人肝癌细胞系HepG2细胞凋亡中的作用机制。分离提取白藜芦醇处理的HepG2细胞及对照组细胞的线粒体蛋白质,双向电泳分离差异蛋白质,飞行时间质谱鉴定差异蛋白点,摸索并建立了一种有效分离提取细胞线粒体蛋白质和双向电泳的方法。初步分析鉴定了四个显著性差异蛋白,着丝粒蛋白Kinesin protein和CENP-E降低,证明白藜芦醇对细胞周期及细胞骨架的调节作用,Peptidase (mitochondrial processing)表达降低,线粒体核糖体蛋白L7/L12（Mitochondrial ribosomal protein L7/L12, MRP L7/L12）表达升高,表明白藜芦醇诱导HepG2细胞与其对线粒体功能的影响有关。     

差异蛋白质组学的分离鉴定技术

文章综述了差异蛋白质组学中主要分离技术如双向电泳、差异凝胶电泳、多维色谱技术及以质谱为基础的分离鉴定技术。     

基于网络拓扑和多种生物信息融合的关键蛋白质识别算法

关键蛋白质的识别有助于了解细胞存活的基本需求,并为疾病治疗找到新方法,但是蛋白质自身携带着复杂的生物特性,仅依赖网络拓扑特性不能精准地判断其关键性.因此,提出一种新方法来提高识别关键蛋白质的准确率.首先,考虑网络拓扑特性以及蛋白质在不同亚细胞中的重要程度,定义了SNC方法;其次,利用蛋白质在亚细胞与复合物信息中的特性定义了SIDC方法;最后,通过融合网络拓扑结构和多源生物信息,提出了关键蛋白质识别算法CTB.在YDIP、YMIPS和Krogan数据集上利用精准率-查全率等多种评估方法进行实验,结果表明CTB算法提高了识别关键蛋白质的性能.     

大麦籽粒蛋白质及其组分含量的遗传研究

用７个蛋白质含量不同的品种，以不完全双列杂交的酱模式配成１２个Ｆ１，对大麦籽粒蛋白质及其四种组分含量这五个性状的遗传参数进行了研究。结果表明，醇溶蛋白含量主要由加性效应控制，蛋白质和谷蛋白含量主要由非加性效应控制；球蛋白和清蛋白含量是由加性和非加性效应共同控制的，但对不同的性状，二者所起遥作用是不等的。     

A Statistical Analysis of Protein—Protein Interaction with Knowledge—Based Potential at Residue Level

Protein-protein recognition is an important step in biological processes, which still largely remains elusive. The inter-residue contact potential, CPij, describes the propensity of contact between two types of residue. In this study, several different CPij variants were examined with the objective of discriminating the binding potential of surface pairs. Using solvent mediated inter-molecule contact potential (SM-IMCPij), an evaluation model was deduced and tested. Using the evaluation model it was found that the SM-IMCPij gives a better performance than either residue mediated IMCPij(RM-IMCPij) or folding-residue contact potential (FCPij). The results suggest that the evaluation model provides a fast, effective, and discriminative method for the evaluation of proposed binding interfaces.     

一种检测蛋白质相互作用的双荧光共定位系统

自发荧光蛋白以快捷灵敏、即时检测和无需破坏活细胞的特点在蛋白质相互作用的研究中得到广泛应用.从发光水母Aquoria victoria中分离的绿色荧光蛋白(GFP)和从珊瑚Discosoma sp.中分离的DsRed红色荧光蛋白是自发荧光蛋白的典型代表.本研究开发一种基于GFP和红色荧光蛋白(RFP),并可通过待检测蛋白在细胞内表达的空间位移变化产生共定位的双荧光共定位检测系统.该系统为克服两种荧光蛋白光谱渗漏带来的非特异性结果的干扰,将核仁定位信号(NoLS)和出核信号(ABL)分别连接到RFP和GFP.具有定位信号的GFP和RFP的待检测蛋白对可分别在细胞核内和(或)细胞核外表达,伴随它们的相互作用,荧光共定位的现象会产生在细胞内特定的区域.利用抗凋亡蛋白Bc1-2和Bak-BH3短肽作为蛋白对测试该系统,荧光共定位现象明显,系统灵敏可靠.     

人的三种记忆方式

俄罗斯生物学家亚历山大·卡缅斯基认为，人的记忆方式有三种：遗传记忆人的第一种记忆为遗传记忆。因为在生殖细胞（卵细胞和精子）中已经“记录”下任何一种生物的构成和活动原理，而这一“活动细则”将作为一组基因随着生殖细胞世代相传。遗传记忆的信息容量非常大，约为10的10次幂个信息单位。而要记录下一个人构成的全部信息，总共只需其基因的2%，那其余的98%是怎么回事呢？原来，有一部分基因我们是从当时尚未进化成人的先祖那里继承下来的。甚至可以这样认为，这一部分基因是自然界的储备基金。在通常情况下，它们是不活动的；但地…