说说吃菌子

<正>在云南,野生蘑菇被称为菌子。一到吃菌子的季节,市场上出售的可食用的菌子种类多到令人眼花缭乱。作为云南人,我可以一口气说一长串菌子的名称：松口蘑、鸡枞菌、牛肝菌、干巴菌、青头菌、谷熟菌……下面,我介绍3种知名菌子及其食用方式。     

中国对虾成虾肠道微生物区系

对野生健康中国对虾成虾肠道生生物区系进行了研究。从其肠道中分离出４７株菌,它们分别属于弧菌属、发光杆菌属、不动杆菌属、似单胞菌属、黄杆菌属、气单胞菌属、屈挠杆菌属和色杆菌属８个属。其中胞菌属、屈挠杆菌属和色杆菌属的非优势菌属,不动杆菌属和假单胞菌属为次优势菌属,黄杆菌属、气单胞菌属、屈挠杜菌属和色杆菌属为非优势菌属。在对虾的整个肠道中,前肠和中肠的优势菌属为弧菌属,而后肠的优势菌属为发光杆菌属。在     

贵州阿哈湖沉积物中硫酸盐还原菌的时空分布特征

利用PCR扩增和荧光原位杂交方法对贵州阿哈湖沉积物中硫酸盐还原菌(Sulfate-reducing bacteria,SRB)类群和数量的时空分布特征进行了分析。结果表明,秋季沉积物中检测出四个SRB类群(脱硫肠菌属、脱硫叶菌属、脱硫球菌属—脱硫线菌属—脱硫八叠菌属和脱硫弧菌属—脱硫微菌属),而春季沉积物中只检测出三个类群(脱硫肠菌属、脱硫叶菌属和脱硫球菌属—脱硫线菌属—脱硫八叠菌属)。相比秋季,春季沉积环境溶解氧含量较高,且温度较低,这可能导致脱硫弧菌属—脱硫微菌属在春季沉积物中处于不可育状态,由于其活性低而无法检测。秋季沉积物检测出来的SRB类群相比春季沉积物具有更大的分布范围,同时,秋季沉积物SRB数量总体上高于春季沉积物,上述结果指示秋季沉积物环境条件更适于SRB群落。     

内蒙古地区药用大型真菌资源及其多样性

为有效保护和利用药用大型真菌资源,以内蒙古地区的药用大型真菌为对象,通过相似性比较对其多样性进行了分析.结果表明:含10种以上的科为蘑菇科、白肉迷孔菌科、口磨科、球盖菇科、红菇科、多孔菌科、侧耳科;含5种以上的属为鳞伞属、干朽菌属、丝膜菌属、侧耳属、杯伞属、鬼伞属、马勃属、多孔菌属、栓菌属、乳菇属、秃马勃属、鹅膏菌属、...     

滇黔桂的笼头菌科

本文详细描述了来自滇黔桂3个省区的笼头菌科8属11个种及变种,包括尾花菌属2个种,星头鬼笔属1个种,林德氏鬼笔2个,笼头菌属1个,柄笼头菌属1个,散尾鬼笔属1个,三叉鬼笔属1个和假笼头菌属2个种。它们占了全国总数的47.8%。显示了这些地区真菌研究的重要性。同时介绍了这些种类的分布及分析它们的地理成分。     

大戟科4种植物内生真菌分离与抑菌研究

对大戟科4种药用植物大戟、泽漆、乌桕、重阳木内生真菌进行分离鉴定,并检测其抑菌活性。结果表明:4种植物均含有内生菌,乌桕中获得13株内生菌,鉴定12株,分别属于丝核菌属、小菌核菌属、拟盘多毛孢属、小单头孢属、毛壳菌属、壳小圆孢属、棒盘孢属、交链孢属;京大戟中获得9株内生菌,鉴定8株,分别属于镰刀菌和交链孢属;泽漆中获得6株内生菌,鉴定4株,属于交链孢属;重阳木中获得15株内生菌,鉴定了4株,分别属于小穴壳属、壳小圆孢属、拟茎点霉属。茎中均有内生菌,种子和重阳木叶中均未分离到。总计43株内生菌中有11株有稳定的抑菌活性,占总菌株的25.58%,有12株有不稳定的抑菌活性,占27.91%。用绿豆发芽试验检验表明,仅有1株菌在绿豆幼苗上形成病斑,其余均生长良好,且21株表现出对绿豆芽的促进作用。     

菌藻复合生物膜污水反应器中真菌群落结构分析

为探究菌藻复合生物膜反应器中真菌群落结构和组成特征,本文通过提取菌藻复合生物膜总DNA,使用Illumina平台对样本的ITS序列进行扩增子测序。结果表明：共获得真菌有效序列44323条,序列长度主要集中在150-330之间。OUT物种分类注释显示,真菌隶属于4个门,分别为球囊菌门、担子菌门、子囊菌门和壶菌门,其中真菌的优势门为球囊菌门40.00%,次优势门类子囊菌门和担子菌门相对丰度比例分别约24.90%和24.80%;在属水平上,真菌隶属于12个属,分别为盘菌属、黑酵母菌属、曲霉菌属、苏吉雅玛酸乳杆菌属、嗜热真菌属、热子囊菌属、布勒弹孢酵母属、亡革菌属、雷德克拉属和无梗囊霉属等,其中优势属为丰度最高的雷德克拉属39.80%,次优势属为泡质盘菌23.50%。     

利用PCR-DGGE分析茂名油页岩矿区土壤细菌群落组成

为了了解油页岩矿区土壤环境中细菌群落的物种组成结构,以野外多点采集广东茂名油页岩矿区土壤样品作为研究对象,采用改进的SDS高盐提取法提取微生物总DNA,并利用PCR-DGGE技术分析细菌群落菌属种类。结果表明:DGGE指纹图谱中共包含13个操作分类单元(OTUs),它们涉及变形菌门(α-,β-,γ-)、厚壁菌门和绿湾菌门3个细菌门类,其中,α-变形菌有3个OTUs,分别属于Altererythrobacter,Chelativorans和Sphingomonas菌属;β-变形菌有3个OTUs,它们属于Hydrogenophaga和Thiobacillus菌属;γ-变形菌有4个OTUs,它们属于Acinetobacter和Pseudomonas菌属;厚壁菌门有2个OTUs,分别属于Faecalibacterium和Bacillus菌属;绿湾菌门有暂时无法确定菌属的1个OTU。     

海洋细菌在不同基质表面微生物粘膜中的组成

在青岛近岸海区两个不同地点,分别进行浸海挂片实验研究四种不同基质表面（玻片,铜片以及涂有防污漆,防锈漆的玻片）微生物粘膜中细菌组成,从不同基质表面微生物粘膜中共分离323株附着细菌,大多数为杆状或球杆状革兰氏阴性细菌,且大部分具有鞭毛,依据形态及生理生化特征将革兰氏阴性细菌鉴定到属,分别属于气单菌属（Aeromonas),发光杆菌属（Photobacterium),莫拉氏菌属（Moraxella) ,假单 菌属（Pseudomonas),弧菌属（Vibrio)和产碱菌属（Alcaligenes）等12个属,其中气单菌属是优势菌属,不同基质表面,微生物粘膜细菌组成不同。     

中国白粉菌属的聚类分析

为了从现有的白粉菌属分类特征体系出发,客观地研究和评价中国白粉菌属(Erysiphe)的种级分类,根据28个形态学编码性状对66个物种样本进行了类平均法系统聚类分析(UPGMA).结果表明:寄主是白粉菌属种级分类的重要指标之一;白粉菌属下暂不宜分组;不支持将鼬瓣花白粉菌(Erysiphe galeopsidis)分出本属并以之作为模式种建立新白粉菌属(Neoerysiphe)、以及将金丝桃白粉菌(E. hyperici)和车轴草白粉菌(E. trifolii)转入叉丝壳属(Microsphaera)的分类观点.     

应用16SrDNA序列分析对砾石接触氧化反应器中细菌多样性

 运用分子生物学手段,对砾石接触反应器内的典型区域,包括石球表面的生物膜、石球内部污泥及反应器底部的沉淀污泥,通过DNA提取、PCR扩增、纯化与回收、TA克隆、序列测定,基因比对等方法,对反应器内的细菌多样性进行分析。结果表明,系统中主要存在好氧呼吸菌群及厌氧发酵菌群两大类,优势菌群为以呼吸代谢为主的假单胞菌属、以发酵为主要代谢方式的拟杆菌/噬纤维菌菌属和纤毛菌属。同时好氧菌群中还发育有α蛋白菌、β蛋白菌、γ蛋白菌、硝化螺菌属、土壤杆菌属、衣原体属、葡萄糖杆菌属及褐色高温单孢菌属细菌;厌氧菌群中则发育属于螺旋体属、δ蛋白菌、反硝化菌、乳杆菌属;此外,使生物量的增长减少的各种慢速生长菌群也是本系统内的一大特色菌群。生物多样性的存在,是污泥减量化研究的关键。     

沟眶象成虫肠道好氧及兼性厌氧菌群的研究

对沟眶象(Eucryptorrhynchus chinenis)成虫的肠道菌群进行了分离和鉴定.结果表明,葡萄球菌属(Sta phylococcus)是优势菌群.同时,还分离出了芽孢杆菌属(Bacillus)、假单胞菌属(Pseidp,pmas)、邻单胞菌属(Plesiomonas)、芽孢八叠球菌属(Sporasarcina)、奈瑟氏球菌属(Neisseria)、耶尔森氏菌属(Yersinia)、埃希氏菌属(Escherichia)、孤菌属(Vibirio)等共9个属.利用纤维素碳源培养基分离到了纤维素降解菌,它们与沟眶象营养及消化生理可能有极为密切的关系.     

Illumina高通量测序分析百合内生真菌群落多样性

百合具有较高的药用食用价值,研究发现它的许多内生菌代谢产物有进一步开发利用的潜能,深入了解百合内生真菌群落结构与多样性,有助于发现新菌种以及具有特定功能的内生菌代谢产物。以ITS区的rDNA为靶标序列,采用Illumina MiSeq测序技术分别对百合叶片(bhy417)、百合茎秆(bhj417)和百合地下鳞茎(bhl417)三个样品的内生真菌群落结构组成和多样性进行测定分析。经过分析有以下结果:三个样品共得到用于后续样品分析的436394条有效序列和122205709个碱基;样品bhy417的内生真菌群落丰富度最大;三个样品之间的内生真菌群落多样性差异不显著、群落结构不同;球腔菌属Mycosphaerella、外囊菌属Taphrina、炭疽菌属Colletotrichum、散斑壳属Lophodermium、壳二孢属Ascochyta、Zymoseptoria属、Catenulostroma属、Phaeophleospora属、Endoconidiophora属、Hormonema属、乌氏霉属Uwebraunia、Capnobotrylla属、丛赤壳属Neonectria、长毛盘菌属Trichophaea等在样品中丰度较高。FUNGuild功能预测结果显示,百合内生真菌包括以下功能菌群:植物病原菌、动物病原菌、腐生菌、未定义腐生菌、内生菌、木材腐生菌、地衣寄生菌等。研究结果表明百合有丰富的内生真菌定殖,其中的植物病原菌以及一些目前还未鉴定出来的菌将可能对百合生防菌以及具特定功能代谢产物的研发提供帮助。     

小单孢菌属分类的研究

从土壤中分离筛选到44株小单孢菌,经全面分类鉴定,分为四个类群26个种。作者提出了有关这个属的类群和种的鉴定依据,并结合分类鉴定的结果,对这个属的主要生理生化特性、拮抗性以及生态分布等问题,提出了一些看法,为进一步研究小单孢菌属的分类和探索小单孢菌属抗生素产生菌的菌源提供一些有用资料。     

高效石油降解菌的筛选及稳定性

为研究不同培养基富集筛选石油降解菌及其稳定性,基于TA克隆分析石油微生物多样性,用不同培养基富集筛选目标石油降解菌,真空冷冻干燥法保藏5 a,研究5 a前后的环境和保藏稳定性。结果表明:TA克隆检测到样品石油中存在8属18种细菌和4种古菌,11个培养基共筛选2属7株细菌,其中高效石油降解菌为XJ09(竿菌属)和XJ15(纤细竿菌p151),降解率分别为54. 2%和64. 5%,XJ02(纤细竿菌)的降解率为34. 5%;环境模拟实验中,XJ09和XJ15的石油降解率分别为50. 8%和53. 4%; 5 a保藏后,竿菌属降解率降低了2. 4%～6. 0%,假单胞菌属降解率下降约一半;不同培养基富集培养的纤细竿菌(XJ02和XJ15)的石油降解能力不同;长期保藏和外界环境都会影响竿菌属的稳定性,而对假单胞菌属的影响更大。     

草果病害的初步研究

本文对草果真菌以及细菌病害作了初步调查分析。于不同季节从病株的枝、叶、花、果上取样分离、培养和鉴定,发现在草果植株上的真菌有19个属,均为半知菌类,但以茎点霉属的茎点霉菌和镰刀菌属的镰刀菌造成危害较明显。回接表明,镰刀菌属的冬3-8号是病原菌。发现感染草果的细菌有假单胞菌属和欧文氏菌属。主要导致花腐,但其危害面不及真菌类。     

北极深海沉积物中嗜冷细菌的系统发育分析

从北极白令海深海沉积物中分离得到19株嗜冷细菌,通过测定16S rDNA序列对它们进行了分类鉴定及系统发育分析,并且与从热带西太平洋“暖池”区沉积物中分离的嗜冷细菌进行了比较.结果表明,由北极海底沉积物中分离得到的细菌主要属于γ-变形菌(γ-Proteobacteria),此外还有少量的α-变形菌和革兰氏阳性菌.在γ-变形菌中主要的菌属为假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas),假单胞菌属(Pseudomonas)和希瓦氏菌属(Shewanella).与西太平洋“暖池”区沉积物中的嗜冷细菌的比较分析表明,假交替单胞菌属和假单胞菌属在两个海域中普遍存在,而希瓦氏菌属的分布则表现出一定的地域性.系统发育分析表明,相同菌属但来自北极和西太平洋海域两个不同环境的嗜冷细菌在系统发育树中的位置都相对独立,有的还形成了独立的分支,说明其分子进化过程可能受到生存环境条件的影响.     

武夷冻茶霉菌菌相分析及优势菌ITSrDNA鉴定

为研究武夷冻茶霉菌的分布情况,采用镜相分析和PCR（polymerase chain reaction）技术对霉菌进行菌相分析及优势菌种鉴定。结果表明,冻茶中主要菌属有曲霉属、毛霉属、根霉属和青霉属,其中青霉属为优势菌属;对随机分离纯化的青霉进行ITSrDNA鉴定,鉴定结果为壳青霉（Penicillium.crustosum Thom）。分析结果可为微生物污染途径分析以及改进冻茶的冷藏工艺条件提供理论依据。     

桉树林分枯落物分解微生物的种类和数量

通过不同地点、不同时期采集桉树枯落物样品,对其进行微生物的分离、纯化与鉴定。分离共获得195株微生物菌株,其中细菌129株分属于10属,主要为芽孢杆菌属(Bacillus)、假单胞杆菌属(Pseudo-monas)、利斯特菌属(Listeria)等;放线菌23株分属于链霉菌属(Streptomyces)、诺卡氏菌属(Nocardia)、小单孢菌属(Micromonospora);真菌44株分属于12个属,主要为镰刀菌属(Fusarium)、头孢霉属(Cephalos-porium)、丝核菌属(Rhizoctonia)等。分析表明:桉树枯落物中微生物数量和种类丰富,表现为细菌数量最高,真菌次之,放线菌最少;不同时期三大菌数量变化不明显;另外,混交林中的三大菌数量比纯桉林中的高。     

重楼根内生细菌的多样性分析及促生菌的筛选

采集湖北地区代表性重楼种植园的重楼植株,并从0.1 g根中分离获得115株内生细菌. 16S rDNA序列分析结果表明,这些内生细菌归属于3个门、5个纲、7个目、11个科和12个属.其中,短食单胞菌属(Stenotrophomonas)为优势菌属(33.9%),而肠杆菌属(Enterobacteriaceae)、潘多拉菌属(Pandoraea)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、短杆菌属(Brevibacterium)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、拟杆菌属(Bacteroides)、波氏菌属(Bosea)为劣势属.进一步通过与小麦幼苗共培养,筛选到4株促生菌,包括克雷伯氏菌属菌株HBR11019、假单胞菌属菌株HBR11015和HBR11017、芽孢杆菌属菌株HBR31040.其中HBR11019菌株的促生作用最强,与其共培养的小麦幼苗的株高、根长、鲜重、侧根数目分别是对照的2.6倍、2.1倍、5.7倍和1.0倍.本研究为深入分析不同产区重楼内生菌的差异以及利用促生菌改良重楼种植技术的研究奠定了基础.