在大肠杆菌中利用反义RNA抑制乙肝病毒（HBV）X基因的表达

将乙肝病毒（ＨＢＶ）ａｙｗ株完整的Ｘ基因正向重组到原核表达质粒ｐＢＶ－２２１的ＰＬ启动子下游，得到能表达Ｘ蛋白的重组质粒ｐＢＶ－ＨＢＶ（＋）；同时将Ｘ基因反向重组到原核表达质粒ｐＢＶ－２２０的ＰＬ启动子下游，得到能转录Ｘ基因反义ＲＮＡ的重组质粒ｐＢＶ－ＨＢＸ（－）。利用这两个质粒，构建出能同时转录Ｘ基因ｍＲＮＡ和反义ＲＮＡ的重组质粒ｐＥＸ。ＡＮ－ＨＢＸ，并在原核水平上，证实了反义ＲＮＡ对Ｘ基因的表     

hTR基因反义表达质粒构建及序列分析

从人的脐带血管内皮细胞中提取基因组 DNA,通过 PCR方法扩增得到了人端粒酶RNA成分 ( human telomere RNA,h TR)的基因片段 ,扩增产物经酶切克隆到逆转录病毒载体p LNCX上 ,构建了 h TR基因的反义表达质粒 .序列分析结果表明 ,PCR扩增得到的 h TR基因的 DNA序列与所发表的序列完全一致 .构建的反义表达载体中的目的基因正确地反向插入到逆转录病毒载体 p LNCX的克隆位点上 ,构成了 h TR基因的反义表达质粒     

简化的人纤溶酶原饼环区5基因的克隆及其在大肠杆菌中的融合表达

从正常人肝脏组织中提取总RNA,合理设计引物,利用RT-PCR直接得到简化的hPK-5基因.将该基因克隆至原核表达质粒pGEX-1λT,将此重组载体转化大肠杆菌JM109,经PCR、酶切及测序鉴定阳性克隆.用IPTG诱导阳性克隆表达融和蛋白,SDS-PAGE观察表达产物.再通过Western-Blotting鉴定.简化的hPK-5基因的RT-PCR产物为264bp.通过酶切、测序等方法鉴定简化的hPK-5基因正确克隆至原核表达质粒pGEX-1λT中.重组质粒pGEX-1λT/predhPK-5在大肠杆菌中     

烟草反义Mlo基因表达载体的构建

获得烟草反义Mlo基因的植物表达载体pBI 121-Mlo,为进行烟草遗传转化,获得该基因表达的缺陷型植株打下基础.从烟草叶片中提取总RNA,利用RT-PCR技术扩增得到Mlo基因的c DNA,以此为模板设计反义引物,通过PCR扩增出反义Mlo基因,将此反义Mlo基因与T载体连接,测序正确后再将此反义片段与植物表达载体pBI 121连接,构建烟草反义Mlo基因的植物表达载体pBI 121-Mlo.经Kan选择筛选出反义重组菌落,碱裂解法小量提取质粒后,用Xba I和Bam HI双酶切后再进行电泳鉴定.结果表明,目的基因已与植物表达载体pBI 121连接成功.成功构建了烟草反义Mlo基因表达载体pBI 121-Mlo.     

小鼠PICK1与Orai1蛋白质间的相互作用研究

从小鼠脑组织中提取总RNA,RT-PCR扩增PICK1及Orai1的CDS序列,构建原核表达载体GST-PICK1及真核表达载体myc-Orai1,重组质粒经SalⅠ和NotⅠ双酶切鉴定后测序.正确的质粒myc-Orai1在HEK293细胞中表达收获过表达蛋白,GST-PICK1进行原核表达并获得融合蛋白.将纯化后的GST-PICK1蛋白条带切下,进行蛋白质液相质谱分析.后将myc-Orai1蛋白与GST-PICK1蛋白混合,进行GST-pulldown实验,western-blot检测到myc-Orai1的条带.结果表明PICK1与Orai1在体外有相互作用.     

肝癌相关基因MEF2D反义RNA的鉴定及分析

鉴定和分析肝癌细胞中新的天然反义RNA MEF2D-AS根据已建立的双链RNA文库筛选与肝癌相关的反义RNA.通过RT-qPCR验证其反义RNA的存在,采用cDNA末端快速扩增技术获得其全长序列,并检测HepG2细胞经5-Aza-dC处理前后MEF2D基因正反义链表达量的变化.结果显示,成功鉴定出1条全长为1 265bp的新的天然反义RNA,并预测其属于长链非编码RNA(long non-coding RNA,简称为lncRNA),命名为MEF2D-AS.经5-Aza-dC处理后,MEF2D-AS的表达量升高,而MEF2DmRNA的表达量降低.证实了MEF2D-AS的存在并预测其属于长链非编码RNA,且与MEF2D正反义RNA是反相关关系.此研究结果可为进一步探讨肝癌发生机制提供参考.     

基于反义RNA膜计算的欠驱动桥式吊车最优消摆控制

针对欠驱动桥式吊车如何在有效载荷情况下快速定位和消摆这一问题,笔者开展桥式吊车系统数学模型和消摆控制策略的研究,设计一种新型的反义RNA 膜计算(aRNA-MC)优化算法,并将其分别用于最优比例积分微分(PID)控制器和最优滑模控制器的参数估计中.受反义RNA 对细胞内基因表达调控机制的启发,笔者提出的反义RNA 动态...     

反义RNA

1981年美国NIH的Tomizawa在细茵中发现了一种新的RNA分子,即反义RNA。反义RNA是指其核苷酸序列可以与其靶RNA(主要是mRNA)互补杂交产生双链RNA,影响靶RNA的正常加工修饰、翻译等过程,从而调控基因的表达的一类RNA分子。后来的研究均证明在原核生物中普遍存在这种RNA。1984年,Izant和Weitraub将这种RNA定义为反义RNA。随后,1986年Williams发现,在真核生物细胞中也存在自然的反义RNA。不同的     

合成U3snRNA基因上游启动区构建ACC合成酶反义RNA-核酶嵌合基因的植物表达载体

利用反义 RNA和核酶进行基因表达调控是当今植物分子生物学的研究热点之一 .但在转基因植物中 ,利用 RNA聚合酶 型启动区表达效率不高 .番茄 U3sn RNA基因由 RNA聚合酶 来转录 ,具有较高的转录效率 ,为一般转录效率的 1 0 0～ 1 0 0 0倍 .我们人工合成了番茄 U3sn RNA基因上游启动区 ( 1 5 2 bp) ,构建到番茄 ACC合成酶的反义 RNA-核酶嵌合 DNA序列的上游 ,然后将“启动区 -反义 RNA-核酶嵌合 DNA序列”插入到植物双元表达载体p GA6 4 3中 ,并用三亲融合法导入农杆菌 LBA4 40 4中 ,为研究 U 3sn RNA上游启动区增强反义 RNA-核酶基因的表达奠定了基础     

pQE30-bgln原核表达质粒的构建和鉴定

构建重组原核表达质粒pQE30-bgln使之可以在大肠杆菌中表达以获得β-葡糖苷酶,用于提高从植物中提取白藜芦醇的得率.以克隆质粒pUCP67为模板,用降落PCR的方法扩增β-葡糖苷酶基因片段(bgln).利用原核表达载体pQE30构建pQE30-bgln重组质粒,用酶切电泳验证重组结果的正确性,测序检测质粒重组后序列情况.PCR结果显示扩增片段2.2 kb,与预期相同.重组质粒酶切后显示其大小约5.6kb,大小及酶切图谱与预期相同.经测序发现插入片段读码框正确.可用于原核表达的pQE30-bgln质粒构建成功.     

Noncoding RNAs: Different roles in tumorigenesis

A major portion of the mammalian genome is transcribed to produce large numbers of noncoding RNAs(ncRNAs).During the past decade,the discovery of small RNAs,including the microRNAs(miRNA) and small interfering RNAs(siRNA),has led to important advances in biology.The breadth of the ncRNA field of study has substantially expanded and many recent results have revealed a range of functions that can be attributed to the miRNAs and other ncRNAs.For example,H19 RNA,HOTAIR RNA,transcribed ultraconserved regions(T-UCRs),natural antisense RNA,transfer RNA and mitochondrial noncoding RNA have been suggested to play important roles in cancers and other diseases as well as in diverse cellular processes.In this review,we focus on the current status of several classes of ncRNAs associated with cancer with the emphasis on those that are not microRNAs.     

Identification and functional analysis of 23 novel box C／D snoRNAs from Oryza sativa

In a cDNA library generated from rice small nuclear RNAs,30box C/D small nucleolar RNAs (snoRNAs) were identiffied through preliminary screen.Except 7 known snoRNAs such as U14,all snoRNAs were identified in rice for the first time experimentally.Among the 23 novel snoRNAs,11 snoRNAs appear rice-specific,6 snoRNAs are unique to plants,the remaining 6 snoRNAs have their counterparts in both Arabidopsis and yeast or mammals according to the conserved antisense sequencs that guide 2‘-O-ribose methylation of rRNA,17 of the 23 novel snoRNAs were predicted to guide 24 2‘‘-O-ribose methylations at the specificsites of rice 5.8S,18S,25S rRNAs,among which 19 methylated sites were determined by primer extension at low dNTP concentrations.The remaining 6 snoRNAs devoid of rRNA antisense elements may represent novel snoRNA species in rice.The results show that constructing a cDNA library from small nuclear RNAs is an effective experimental approach for novel snoRNA is identification.The novel snoRNAs are important in elucidating the genomic organization and expression of plant snoRNA genes and the mechanism through which 2‘‘-O-ribose methylations took place in rRNAs.     

RNA干扰:双链RNA引起的基因沉默机制——2006年诺贝尔生理学或医学奖成果简介

RNA干扰现象是指一种由双链RNA分子引起的基因沉默现象,在动植物中普遍存在。RNA干扰不仅在生物的抗病毒反应、抑制转座子活性以及其他许多重要生理活动的调节方面发挥至关重要的作用,而且在基因功能研究和疾病治疗方面也具有广阔的应用前景。鉴于上述原因,2名美国科学家——AndrewZ.Fire和CraigC.Mello,因发现RNA干扰现象而获得了2006年的诺贝尔生理学或医学奖。     

Identification and characterization of two novel box H/ACA snoRNAs from Schizosaccharomyces pombe

Ineukaryotes,alargenumberofsmallnucleolar RNAs(snoRNAs)accumulatedwithinthenucleolus playimportantrolesinprecursorribosomalRNA(pre RNA)processingandmaturation[1].AllsnoR NAs,withtheexceptionofRNaseMRP,canbe broadlydividedintotwoexpendinggroups,boxC/D andH/ACAsnoRNAs,basedonconservedsequence elements[2].BoxC/DsnoRNAscontaintwocon servedshortsequencemotifs,boxC(UGAUGA)and boxD(CUGA),locatedonlyafewnucleotidesaway fromthe5′and3′ends,respectively,generallyas partofatypical5′3…