光谱法研究小分子与蛋白质间相互作用的进展

小分子与蛋白质之间相互作用会影响蛋白质构象变化,研究小分子与蛋白质相互作用的机理,对阐明小分子在生物体内的吸收、分布、代谢等过程具有重要意义。综述了近年来紫外光谱法、荧光光谱法、傅里叶变换红外光谱法和圆二色光谱法等技术在该领域的研究进展,分析了这些方法的特点和应用,展望了外源性小分子与蛋白质之间相互作用的发展前景。     

蛋白质与胆红素相互作用的研究

本文利用纸上色谱法研究了牛血清白蛋白分子与胆红素作用的结合物，同时利用可见吸收光谱法比较了牛血清白蛋白和鸡清蛋分子分别在ＫＨ２ＰＯ４     

蛋白质与蛋白质相互作用预测模型综述

蛋白质作为生命活动的物质基础,通过彼此之间的相互作用来参与生物信号传递、能量和物质代谢及细胞周期调控等,因此,预测蛋白质与蛋白质相互作用(PPIs)有助于从系统角度理解生命过程,同时为细胞机制的研究奠定重要基础。目前,高通量测序技术的进步使研究人员获取了海量的蛋白质相互作用数据。面对大量具有潜在可用性的PPIs数据,国内外研究人员提出了多种PPIs预测模型。文章综述了现有的基于计算的PPIs预测方法,并进行分类,讨论了其各自优缺点。最后对PPIs预测方法进行总结和展望,提出了未来可以深入研究的方向。     

氟喹诺酮类药物与蛋白质相互作用的研究

运用荧光淬灭机理研究了氟喹诺酮类药物洛美沙星，氧氟沙星，衣诺沙星与3种蛋白质(牛血清蛋白，免疫球蛋白，胰蛋白酶)之间的相互作用，计算了两者之间的结合常数和结合位点数，根据实验当中所得的热力学参数确定了它们之间的作用类型，氟喹诺酮类药物的含量与其荧光强度呈现良好的线性关系，在此实验条件下测定了胶囊及人工合成样中洛美沙星和衣诺沙星的含量，其浓度范围分别为0．018～0．878和0．030～3．171μg／mL。     

蛋白质相互作用的研究方法及进展

介绍了蛋白质与蛋白质相互作用的研究方法及进展,包括已经应用的标准技术、物理学方法、最新进展及其他方法.利用蛋白质间相互作用为工具,通过合成可调控转录系统来调整生物系统,可实现对基因功能的微调.     

蛋白质相互作用的研究方法及进展

介绍了蛋白质与蛋白质相互作用的研究方法及进展,包括已经应用的标准技术、物理学方法、最新进展及其他方法。利用蛋白质间相互作用为工具,通过合成可调控转录系统来调整生物系统,可实现对基因功能的微调。     

STIM、Orai及其介导的钙池操纵钙内流?

STIM-Orai介导的钙池操纵钙内流(SOCE)是一种重要的钙信号产生机制.SOCE参与调控机体的基因表达、细胞增殖、器官发育、免疫反应等各类生理活动,并与多种疾病发生密切相关.本文综述了SOCE概念提出,利用RNAi及高通量筛选技术发现2种介导SOCE的蛋白的进程,并从结构和功能方面介绍了STIM、Orai蛋白家族的最新研究进展,为进一步探索STIM、Orai的功能及其相互作用机制提供一些思路.     

酵母双杂交技术筛选与Axin相互作用的蛋白质

肿瘤抑制因子Axin以构架蛋白的形式通过Wnt、JNK、p53、TGF-β、G蛋白等众多信号转导途径参与细胞生长、增殖、分化和凋亡等多种重要细胞命运的调控过程.为了发现Axin新的相互作用蛋白,进一步研究Axin的多功能性,作者通过酵母双杂交技术,将Axin1基因从SpeI单一酶切位点到3′末端的DNA序列构建到pGBKT7载体作为诱饵,对小鼠脑的cDNA文库进行筛选,最后获得28个阳性克隆.通过对这些克隆的测序和对所得序列的生物信息学分析,得到13个与Axin的C末端相互作用的蛋白质,这些蛋白主要参与胚胎发育,肿瘤形成,蛋白翻译后修饰等生物学过程的调节.这一结果为进一步研究Axin的新功能提供了很好的线索.     

环境激素双酚A与蛋白质相互作用的电化学研究

采用电化学法研究环境激素双酚A与牛血清蛋白的相互作用.实验表明牛血清蛋白存在使双酚A的氧化峰峰电流减小.双酚A在加入牛血清蛋白后参与反应的质子数和电子数都为2.牛血清蛋白与双酚A的结合数m=2,结合常数β=5.81 × 1010.由此推测双酚A进入牛血清蛋白的疏水空腔内,使游离双酚A浓度变小.     

用酵母双杂交检测BAR与PDZ结构域的相互作用

用酵母双杂交系统探索P ICK 1分子中BAR结构域与PDZ结构域的相互作用.分别构建了pGAD-PDZ和pGBK-BAR重组子,共转入酵母细胞后,涂布于SD(L eu-,T rp-,H is-)固体平板培养基,经滤纸复印和显色反应,在8 h内观察到只有pGAD-PDZ/pGBK-BAR的表达产物呈阳性,而其它对照pGADT 7/pGBKT 7、pGAD-PDZ/pGBKT 7和pGADT 7/pGBK-BAR均呈阴性反应,说明BAR与PDZ结构域具有相互作用.     

光谱法研究泮托拉唑钠与牛血清白蛋白的相互作用

在优化的实验条件下,运用荧光光谱法和紫外光谱法研究牛血清白蛋白(BSA) 与泮托拉唑钠(PS)的结合作用。研究表明：PS对BSA的荧光有猝灭作用,属于静态猝灭。BSA能运载PS,是一个自发过程,其作用力类型主要为氢键和范德华力。BSA 的亚螺旋域ⅢA是主要结合位置,离酪氨酸残基更近,有正协同作用。PS对BSA构象产生影响,使BSA腔内疏水环境的极性减弱。该实验对揭示药物动力学问题及后续抗菌类药物的研发提供了理论依据。     

钙库调控钙内流信号机制的研究进展

钙库调控的钙内流（SOCE）A--种普遍的信号过程。随着RNA干扰技术的发展,SOCE过程中两个重要分子被确定：STIM1和Orai1。STIM1是内质网Ca。“‘感受器”,钙库排空后,可能会在内质网进行重新分配,并移向质膜,但似乎并不插入质膜。STIM1将信号传递给质膜Orai1蛋白．Orai1是SOCC孔隙形成的亚基。     

BPEL工作流管理系统中人工交互的研究

Business Process Execution Language(BPEL)成为了W eb服务编排的事实标准。BPEL的缺点是缺少对人工交互的支持。随后的BPEL4Peop le规范试图通过扩展BPEL来支持人工交互;但现有的大多数BPEL引擎只支持BPEL规范,并不支持BPEL4Peop le规范,因此它们也都缺少对人工交互的支持。要使现有BPEL引擎支持BPEL4Peop le规范,必须修改现有BPEL引擎,这实现起来比较困难。提出了一种松耦合的解决方案:它利用现有的BPEL引擎,但不对现有的BPEL引擎做任何修改,通过两个组件即用户门户和任务引擎,使得基于现有BPEL引擎的工作流管理系统能够支持人工交互。     

相邻深基坑同期施工的相互影响问题研究

结合一工程实例,采用FLAC3D程序对相邻深基坑同期施工的相互影响进行了研究,分析了相邻基坑的开挖顺序以及相邻基坑间距对基坑支护结构变位的影响,为解决实际工程问题提供理论依据.     

声子之间相互作用对磁场中晶体性质影响的研究进展

综述了近年来对电子在反冲效应中发射和吸收不同波矢的声子之间相互作用对磁场中晶体性质的影响方面的部分工作,在第一节中从磁场中电子一表面光学声子和电子一体纵光学声子系的哈密顿量出发,用线性组合算符和微扰法研究声子之间相互作用对弱耦合磁极化子的基态能量、自陷能和有效质量的影响,在第二节中研究了声子之间相互作用对与表面光学声子和体纵光学声子弱耦合的表面磁极化子的诱生势和有效质量的影响在第三节中研究了相应的声子之间相互作用对与表面光学声子耦合强,与体纵光学声子耦合弱的表面磁极化子的振动频率、诱生势和有效质量的影响,在第四节中研究了声子之间相互作用对与表面光学声子耦合强,与表面声学声子耦合弱的极性半导体中通过形变势的表面磁极化子的诱生势和有效质量的影响.     

光谱法研究穿琥宁与牛血清白蛋白的相互作用

穿琥宁(PDS)是一种药物,被广泛用于治疗病毒性肺炎,病毒性上呼吸道感染等的消炎药,被誉为"中药抗生素".在优化的实验条件下,运用荧光和紫外光谱法,在不同的温度下研究穿琥宁与牛血清白蛋白(BSA)的相互作用及共存金属离子的影响.用Stern-Volmer,Lineweaver-Burk和双对数方程计算了速率常数(Kq),表观猝灭常数(Ksv),结合常数(KA),静态荧光猝灭缔合常数(K_(LB))和结合位点数(n).结果表明:穿琥宁能结合BSA.由于生成PDS-BSA复合物,穿琥宁对BSA的猝灭是静态猝灭机理.热力学参数表明是一个自发过程,其作用力类型主要为静电作用力.至少一个结合位点.BSA的亚螺旋域ⅡA和ⅢA是主要结合位置,离酪氨酸残基更近,无药物协同作用.穿琥宁对BSA构象产生影响.Pb~(2+)、Mn~(2+)、Ni~(2+)和Cu~(2+)对PDS与BSA结合产生竞争作用,增强药效.Cr~(3+)对穿琥宁与BSA结合产生促进作用,延长药效时间.该研究结果对揭示药物动力学问题及新的抗病毒类中草药的研发提供了理论依据.     

HIF-1调控小鼠bace1基因的转录表达

阿尔茨海默症的一个关键致病原因是大脑中淀粉样蛋白（A13）的过度产生或堆积．Aβ是由其前体蛋白APP经β-和γ-分泌酶依次水解而生成的，但对于这些分泌酶基因表达的转录调控的了解还很少．由于大脑发生缺氧／缺血会造成Aβ的产量增加，而缺氧时所激活的转录因子HIF-1（Hypoxia-Inducible Factor 1）会调控下游多种基因的表达，我们对HIF-1是否参与调控β-分泌酶的表达进行了研究．对小鼠β-分泌酶基因bace1的调控序列进行分析，发现其中含有一个缺氧应答元件（Hypoxia-Responsive Element，HRE）．我们的数据显示，HRE突变片段启动报告基因荧光素酶表达的活性比正常序列片段的启动活性明显降低．电泳迁移率的变动分析（EMSA）实验进一步证实，HIF-1可以与小鼠bace1中HRE元件相互作用．当在哺乳动物细胞中过度表达HIF-1时，BACE1的mRNA水平和蛋白质水平均有明显的增高．这些结果表明小鼠bace1基因的表达受转录因子HIF-1的调控．鉴于目前阿尔茨海默症研究领域都把抑制BACE1作为首选治疗靶位，HIF-1因而有可能成为治疗AD的一种药物靶点．     

miR164a及其靶基因PeNAC1相互作用研究

miRNA参与了生物体重要的基因表达调控过程,其中miR164通过对标靶NAC(NAM/ATAF/CUC)基因家族的精细调控,在植物激素信号传导、生长发育以及胁迫应答中起着重要作用。为了验证杨树中miR164a和其预测靶基因PeNAC1间是否也存在这一相互作用,笔者采用PCR技术克隆了毛果杨(Populus trichocarpa)miR164a的前体序列Ptc-MIR164a,并通过RNA fold(http://rna.tbi.univie.ac.at/)在线软件对其进行了miRNA二级结构分析。结果表明:该序列能形成典型的二级茎环结构,预示其在细胞内能被加工为成熟的miR164a。进一步借鉴动物细胞miRNA研究中荧光素酶报告基因法,利用高效的杨树原生质体瞬时表达体系,验证了Ptc-MIR164a对其预测靶基因PeNAC1的标靶作用; 同时,也建立了一种比较简单、直观的植物miRNA靶标基因的鉴定方法。