生命密码的突变危险性理论

目的梳理迄今为止多种主体密码起源及进化假说,研究突变危险性理论的本质内容、理论特点和优势并作相应评述。方法文献考证与概念分析。结果揭示了突变危险性理论的本质内容及理论特色。结论生命密码的突变危险性理论有其自身理论体系的简明性和逻辑性,继承了Crick的摆动假说和冻结偶然性理论,并将标准码和反常码的研究纳入了一个统一的理论框架之下。     

无义密码对线粒体密码进化的影响

遗传密码的起源与进化是理论生物学研究的一个基本问题.以线粒体密码为例,讨论密码进化关系构建的不同规则,分析密码进化中重要影响因素——无义密码子的再定义及其逆过程.终止信号与氨基酸间的距离是密码进化关系构建中的关键,在密码进化中无义密码子突变可以频繁进行,存在干涉现象,且进化倾向于无义密码子减少的方向.     

遗传密码的逻辑和稳定性原理

引入突变危险性函数M_D和M_D的统计极值原理,作为分析密码逻辑的出发点。讨论了单密码子近似下密码字典的整体M_D极小化,由拉格朗日乘子法导出了和实验相符的结果。进一步的近似可以导出密码字典中的亲水-疏水畴,也和氨基酸和反密码子的实验资料一致。由密码子相互作用可给出密码子分布和非标准密码。     

古菌起始密码子上游AUG和UAA三联体的频率分布

分析了三联体AUG和UAA(包括UAG和UGA)在古菌基因组起始密码子上游序列的三个阅读框中的频率分布.在阅读框1,三联体AUG在起始密码子上游有非常明显的缺失.与AUG的缺失相反,三联体UAA的频率在起始密码子上游显著增加.与细菌和真核生物基因组比较发现,古菌基因组的上述特征与细菌十分相似.在古菌基因组起始密码子上游序列中,三联体AUG的缺失和UAA频率的增加可以有效地避免古菌基因被错误的翻译起始,提高翻译效率.     

酵母全基因组新的ORF结构的预测

提出了一个预测DNA序列中无内含子的开阅读框架（ORF）的理论方法－终止密码预测法；用酵母全基因组中已知的6260个基因进行检验，预测成功率为99．9％；发现酵母基因编码区和已知的DRF的起始密码子总是位于长距离不出现终止密码的位置序列上游紧邻最后一个终止密码子的ATG；在酵母全基因组DNA中发现了新的长度不小于90个氨基酸的ORF结构2244个。     

用AUG的三联数字推导氨基酸的遗传密码

遗传密码是三个碱基组成不重叠的三联密码子,并且一个三联密码子决定一种氨基酸。现已知道组成蛋白质的氨基酸只有20种,而由四种碱基组成的三联密码子有64种之多。本文用起始密码子AUG的三联数字来推导20种氨基酸一一对应的遗传密码。     

同义密码子非随机使用的理论模型

利用ｋ＝２时分子序列进行模型研究了同义密码子的非随机使用，讨论了密码子使用频率以及信息参数Ｄ１，Ｄ２和Ｘ与选择力参数的依赖关系，另外，考虑到氨基酸相似因子，建立了密码使用频率的一个相似突变模型，研究了同义密码子的非随机使用。     

细胞核密码表进化树的重建

提出距离幅定义规则,重建了标准表与各个细胞核非标准密码表的进化树,说明密码反常不是随机的,现存的非标准密码表都在标准表进化的路径上,密码进化总是倾向于无意义密码子减少的方向.     

遗传密码的信息内涵及其与氨基酸的对应联系

为了探讨遗传密码的起源,本文系统考察了四种核苷酸和各类密码子的编码信息、密码子与氨基酸的对应分类关系,发现：①四种核苷酸的编码能力依交为A＞U＞G＞C;②嘌呤型（PP）、啶型（MM）与嘌嘧混合型（PM）密码子的编码能力表现为PP＞MM＞PM;③氨基酸与碱基型密码子的对应分类关系较为确定,其中PP有酸性、碱性及酰氨型氨基酸,M骨芳香族、杂环族氨基酸;PM有脂肪族氨基酸编码的偏爱性,认为遗传密码与氨基酸对应联系的起源不是随机发生的。     

图书推介

从随机思想、机会的性质、概率论及其应用、确定性世界中的偶然性、随机过程、作为数学学科的概率论、概率论的应用等方面论述了概率论的发展及现状：从统计学的起源、数据分析和精确性问题、现代统计学的诞生、抽样理论、统计学的应用等方面论述了统计学的进展及成果。     

41条牦牛CDS序列的密码子偏好性分析

密码子简并性特征造成了不同物种密码子使用偏好性不同．在对牦牛功能基因组学研究的基础上，利用EMBOSS中的CUSP程序、SMS2中的Codon Usage程序和软件CodonW对牦牛功能基因的41条CDS序列进行了密码子偏好性的分析，并与人、普通牛、猪等物种进行了比较基因组学研究．结果显示：TTC、TTG、CTC、CTG、ATT、GGA、GGG等27个密码子为牦牛的偏好性密码子．研究结果为以后进一步开展牦牛新基因的发现、功能基因表达调控研究，蛋白质结构和功能的预测以、与其他牛种的比较基因组学研究以及牦牛分子标记育种等工作，提供了理论基础．     

冻结壁的有限元分析

本文指出了以往冻结壁设计所存在的问题,认为用有限元法求解冻结壁应力和位移比较恰当。介绍了冻结壁有限元分析的基本理论、计算成果及其分析。提出了水平不动面的概念,并据此求冻结壁的绝对位移值。提出了用有限元法与现场观测相结合的办法推算冻土物理力学性质、并根据所求出的冻土物理力学性质进行冻结壁设计或予测未来井筒的井帮位移值。     

线粒体非标准密码表的进化稳定性

根据突变危险性极小化的方法,导出各物种线粒体非标准遗传密码表的总体突变危险性极小表,证明了各非标准遗传密码表是在一些约束条件下的总体突变危险性极小表,体现了分子进化遵循稳定性原理,并受冻结偶然性制约.     

细胞核非标准密码表的进化稳定性

根据突变危险性极小化法,导出现有相关物种的细胞核非标准遗传密码表的总体突变危险性极小表,证明了各非标准遗传密码表是在一些约束条件下的总体突变危险性极小表,这体现了分子进化遵循稳定性原理,并受冻结偶然性制约.     

古钧瓷和现代钧瓷的指纹元素分析

将 30个古钧瓷、现代钧瓷的釉和胎等样品进行中子活化分析 (NAA) ,测定每个样品中 36种元素的含量。从中选取 7种指纹元素 ,用指纹元素分析法分别研究了古钧瓷釉和胎的起源。结果表明 ,这批时间跨越6 0 0年 ,釉色迥异 ,出自众多不同窑口的古钧瓷有着长期、稳定、基本相同的原料来源。初步分析了古钧瓷与古汝瓷相近的起源关系。发现现代钧瓷少数与古钧瓷相似 ,而多数与古钧瓷疏远     

冻结管断裂位置的确定

立井冻结法施工中 ,冻结管因受到冻结压力、弯曲应力及摩擦力等力的作用 ,经常会发生冻结管破裂、透水淹井等事故。为了解决这类问题 ,依据经典力学的基本理论 ,通过对冻结管的受力分析 ,建立了冻结管的强度准则 ,找出了冻结管最可能发生断裂的理论位置 ,并举例说明了该理论的正确性和适用性 ,对工程设计及施工现场具有较大的指导意义     

基于遗传算法BP网络的冻结方案优化设计

多圈管冻结方案设计与优化是深井冻结法凿井的一项关键技术,现今的理论和实践尚未成熟和完善,为此提出了基于遗传算法优化BP网络结构进行多圈管冻结方案的优化设计算法,将该算法求解的多圈管冻结设计方案与原方案进行了比较分析,表明了这种算法达到了较好的优化设计效果,为多圈管冻结方案设计及其优化提供了重要参考。     

冻结管断裂位置的确定

立井冻结法施工中,冻结管因受到冻结压力、弯曲应力及摩擦力等力的作用,经常会发生冻结管破裂、透水淹井等事故。为了解决这类问题,依据经典力学的基本理论,通过对冻结管的受力分析,建立了冻结管的强度准则,找出了冻结管最可能发生断裂的理论位置,并举例说明了该理论的正确性和适用性,对工程设计及施工现场具有较大的指导意义。     

万福矿井冻结壁稳定性分析

本文考虑了冻土的非线形特点,运用非线性弹塑性理论与有限元数值分析研究了万福井筒冻结壁的应力场位移场,得出了比较合理的结果,该方法可以作为深井冻结壁结构设计的参考.     

古钧瓷起源的指纹元素分析

选取４３石钧瓷等样品用于中子活化分析，测定每个样品中３６种元素，从中选取７种指纹元素，用指纹元素的分析法分别研究了古钧瓷釉和胎的起源，研究了古钧瓷与古汝瓷相近的起源关系，少数现代钧瓷与古钧瓷接近，多数与古钧瓷疏远。