代谢组学：系统生物学的前沿

该书由两位日本学者Masaru Tomita和Takaaki Nishioka共同主编，是一本全面介绍代谢组学现状的书籍，从广义的角度带给读者有关代谢组学的知识。     

代谢组学在中药安全性评价中的应用

作为系统生物学的重要组成部分,代谢组学在中药毒性或安全性评价方面表现出很大的应用潜力。本文综述了代谢组学在中药毒性作用的靶器官、中毒剂量、作用机制、生物标志物以及毒性物质基础等研究领域的作用。尽管尚处于发展阶段,但是代谢组学为中药毒性或安全性评价提供了新的思路和研究方法,可作为中药安全性评价的有力补充。     

代谢组学在疾病诊断方面的研究进展

代谢组学(metabonomics;metabolomics)是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变换规律的科学.目前代谢组学已广泛应用于病理阐述、药物开发、药物毒性研究、疾病诊断、微生物代谢研究等方面.对近5年来代谢组学在疾病诊断方面的研究进行了综述,并对代谢组学研究进行展望.     

代谢足迹技术及在代谢组学中的应用

系统地介绍了一种用于分析生物细胞和组织特异性的新战略——代谢足迹技术以及它在酵母细胞和人体组织中代谢分析的应用．代谢足迹技术是利用直接注射质谱方法,在分析系统中以培养基为介质,监控细胞从生长培养基中消耗营养物以及分泌代谢物至培养基的全部过程．也就是说。这是一种用高通量方法检测由细胞和组织分泌的代谢产物或从环境中吸收代谢物的定性和半定量的通用分析方法．     

代谢流分析技术及其在肿瘤代谢中的应用进展

代谢重编程是肿瘤的一大特征.研究肿瘤代谢有助于解析肿瘤的发生机制并实现个性化治疗.近年来兴起的代谢组学技术,通过全局分析内源性小分子代谢物,表征细胞、组织和体液的代谢轮廓,从而理解生理与病理变化;但稳定同位素标记的代谢流分析技术更能体现细胞代谢网络的动态变化,反映遗传或环境因素扰动下的代谢重编程规律.代谢流分析技术不仅...     

代谢组学及其在药用植物研究中的应用

指出了代谢组学是继基因组学和蛋白组学之后新兴的一门研究生物体内源代谢物的种类、数量及其在内外因素作用下变化规律的组学技术,是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支.近年来,随着代谢组学积累的数据和信息量的增大,其在药用植物学各个领域的应用价值也与日俱增.主要对代谢组学的产生、研究方法和技术及其在药用植物研究中的应用进行了阐述,以期为相关研究提供参考.     

基于代谢组学研究的新策略在体育科学中的应用展望

体育科学的发展离不开生物医学的发展,随着后基因组时代的到来,代谢组学研究的策略在体育科学中有了长足的应用。对代谢组学的含义、产生的背景、研究领域以及代谢组学在体育科学中的应用等方面内容进行了介绍,并对当前代谢组学在体育科学研究中存在的问题以及今后的发展趋势试作了探讨,提出了我国体育科学工作者利用代谢组学研究技术进行功能基因组学研究的必要性和可能性。     

MNR在代谢组学应用

代谢组学NMR的应用。     

应用代谢组学技术预测啤酒发酵过程中的腐败菌

通过超高效液相四级杆飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)的非靶向质谱分析结合机器学习的方法能够预测啤酒是否感染腐败菌。在啤酒发酵过程中,分别添加短乳杆菌Lactobacillus brevis、芽孢杆菌Bacillus、植物乳杆菌Lactobacillus parabuchneri、类布氏乳杆菌Lactobacillus plantarum和葡萄球菌Staphylococcus saprophyticu等啤酒腐败菌的样品并进行代谢组学分析,随后,采用随机森林模型分析代谢组学数据,选取模型的前30%重要特征物质进行通路富集分析。最终发现,发酵初期,胆碱、甘油磷酸胆碱、三乙醇胺、磷脂酰乙醇胺和2-(3-羧基丙酰基)-6-羟基-环六-2,4-二烯羧酸(SHCHC)这些代谢物在腐败啤酒样品比正常啤酒样品中的含量增加,其中：36～48 h腐败啤酒中胆碱的含量高于正常啤酒50%～130%;甘油磷酸胆碱在发酵24 h腐败啤酒中比正常啤酒的含量低10%～30%,随着发酵时间延长,逐渐增加到高于正常啤酒9%以上;三乙醇胺在24 h正常啤酒中的含量最高,比腐败啤酒中的含量高出2～3倍;磷脂酰乙醇...     

感染组学在探索新的抗微生物药物中的应用

在现代医学界,研制新的抗感染药物是一个急迫的任务。由于生物基因组测序的成功,以及各种高通量技术和计算机工具的发展,可以对微生物病原体及其宿主之间的相互作用进行综合性的总体研究,这就构成了感染组学的研究内容。感染组的特征反映出病原体和宿主之间的相互作用,为探索新的抗微生物药物提供了有价值的资料。着重阐述了感染组学及其在探索抗微生物药物中的应用。     

外泌体在肿瘤诊疗中的研究进展

综述外泌体调控各类型肿瘤生物学行为特性,介绍外泌体在肿瘤诊疗中的研究进展,为外泌体在肿瘤精准诊疗领域中的应用提供理论依据.结果表明：外泌体广泛分布于肿瘤患者的血浆、尿液、唾液等各种体液中,来源于外泌体的核酸、蛋白质可介导不同类型肿瘤的生物学行为,在人体内的表达异常或可作为肿瘤早期诊断和预后评估的潜在生物标志物;对外泌体进行加工修饰后,产物可用于肿瘤疫苗制备和靶向药物研发.     

基于核磁共振的肾虚痰瘀型2型糖尿病患者血清代谢组学研究

 利用核磁共振技术(Nuclear Magnetic Resonance,NMR)探讨肾虚痰瘀型2型糖尿病患者的血清代谢变化及发生机制。对33例肾虚痰瘀型2型糖尿病患者和50例健康人血清进行核磁共振氢谱检测,通过分段积分后运用正交偏最小二乘判别(OPLS-DA)分析所采集的图谱。结果显示,肾虚痰瘀型2型糖尿病患者与健康人相比血清中多种氨基酸显著降低,包括异亮氨酸、亮氨酸、缬氨酸、丙氨酸、谷氨酸、组氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸、1-甲基组氨酸,差异有统计学意义(P<0.05)。此外,乳酸、柠檬酸、肌酸及肌酸酐也较健康人显著降低,差异有统计学意义(P<0.05)。同时,肾虚痰瘀型2型糖尿病患者血清中α-葡萄糖及β-葡萄糖较健康人增加,差异有统计学意义(P<0.05)。由此得出结论,肾虚痰瘀型2型糖尿病患者代谢成分与健康人存在显著差异,肾虚痰瘀型2型糖尿病患者体内的三羧酸循环及糖酵解途径被抑制,蛋白质代谢异常,支链氨基酸代谢增强。     

癌细胞/组织靶向多肽研究进展

恶性肿瘤是严重威胁人类健康生活的高发性疾病,由于缺乏早期诊断的方法以及放/化疗的巨大毒性,恶性肿瘤仍然是对人类生命健康的最大威胁之一.未来恶性肿瘤诊治取得突破的关键在于早期诊断和靶向治疗,而特异、敏感的肿瘤标志物对此意义十分重大.近年来,肿瘤标志物的研究探索取得了一定进展,尤其是肿瘤靶向多肽类标志物的研究进展较大.本文对近年来恶性肿瘤靶向多肽的筛选、鉴定、应用及未来的发展方向等进行了简要综述,以供从事相关研究的人员参考.     

端粒酶与肿瘤诊断

端粒酶是一种具有逆转录酶特性的DNA聚合酶,临床检测发现在很多恶性肿瘤中都能检测到端粒酶的活性,端粒酶可以作为诊断这些肿瘤的生物学标志.在某些肿瘤中,端粒酶表达会随着肿瘤的进展而上调,因此又可以作为肿瘤恶性程度评价的一个指标.而化疗后端粒酶的变化与临床疗效密切相关,因此也可作为临床疗效及预后判断的指标.     

抑癌基因p16的研究进展

p16是近年来确定的多肿瘤抑制基因，它对细胞周期的负调控作用尤为重要，其突变或缺失会导致对细胞分裂调控的丧失和紊乱，导致细胞的异常增殖，最终形成肿瘤。该基因在各种肿瘤中的作用，目前正越来越引起人们的重视。     

肿瘤抗原在免疫治疗中的应用

介绍肿瘤抗原分类、肿瘤细胞逃逸机体免疫监制的机制、机体抗肿瘤的免疫学机制和肿瘤抗原在免疫治疗中的应用。随着分子生物学的发展,肿瘤抗原在肿瘤免疫治疗方面将发挥重要的作用。     

脑肿瘤干细胞分子生物学研究进展

脑肿瘤干细胞是脑肿瘤组织中存在的一小类具有无限增殖、自我更新和多向分化等干细胞特性的肿瘤细胞。肿瘤干细胞是肿瘤发生、发展、侵袭、转移、耐药、复发等恶性行为的主要根源,只有杀死脑肿瘤干细胞才能彻底治愈脑肿瘤。本文对当前脑肿瘤干细胞研究在分子生物学水平上取得的一些进展进行了综述。     

布鲁菌病的研究进展

布鲁菌病(Brucellosis)是由布鲁菌(Brucella)引起的主要侵害生殖系统的一种全世界广泛分布的人畜共患慢性细菌传染病.患病动物是主要传染源,人与人之间不传播.本研究综述了布鲁菌病的研究现状.     

乳腺癌早诊早治关键技术的研究与应用

当前,乳腺癌已成为威胁中国女性生命健康的最大杀手,并且发病率还在逐年升高.早发现、早诊断并接受及时的治疗,对于改善乳腺癌患者的治疗效果、减少患者的经济负担和国家的卫生支出具有重要的意义.通过介绍郝希山院士团队多年来围绕乳腺癌的早诊早治探索关键技术的优化和应用,展示构建适合中国的乳腺癌早诊早治体系所取得的成果.     

基于气相色谱的铅中毒大鼠尿液代谢指纹图谱研究

代谢组学是近年来新发展起来的一门学科,其在毒理学领域的应用越来越受到关注.本文通过对色谱条件的优化建立了一种基于气相色谱的代谢组学技术,检测铅染毒大鼠内源性代谢物谱变化,并运用主成分分析的模式识别方法对这一变化过程进行分析.发现正常组、低剂量染毒组、中剂量染毒组以及高剂量染毒组大鼠处于不同的空间位置,说明随着染毒剂量的不同,各组大鼠的尿液代谢指纹图谱发生了明显的变化.进一步分析发现,各组大鼠的气相色谱图谱在保留时间为3.5 min和5.5 min时的差异对上述总体差异的贡献最大.表明不同剂量的铅染毒能导致大鼠的尿液代谢指纹图谱发生明显的改变,这种改变能用结合模式识别的气相色谱技术检测出来;气相色谱技术可作为核磁共振技术等其它平台的补充工具用于代谢组学研究.