时间序列线性建模

本文对序列的特点，时间序列的相关分析法，Ｐａｎｄｉｔ－Ｗｕ建模方法以及ＡＲ统一建模思路进行了讨论，结合实例进行了比较。     

甜菜夜蛾P450基因的克隆及组织特异性分析

为获得甜菜夜蛾Spodopteraexigua(Hübner)P450基因序列并分析其分布的组织特异性,采用同源克隆结合RACE技术克隆得到了该基因的cDNA全序列:全长2565bp,包含1010bp的3’非编码区域和42bp的5’非编码区域,开放阅读框(ORF)长1515bp,编码504个氨基酸,分子量为57.74kD,理论等电点为8.01;包含2个糖基化位点,2～21aa为跨膜结构.同源比对结果表明,SeP450与其它昆虫的P450基因拥有同样的2个保守结构域:CAFG、AG\ET.SeP450与棉铃虫蛾HelicoverpaarmigeraP450同源性最高,达74％;系统发育分析也表明二者亲缘关系较近.同时RT-PCR结果显示SeP450mRNA在中肠、脂肪体等多种组织中都有表达,其中中肠表达量最高.     

重症肌无力患者他克莫司血药质量浓度与CYP3A5基因多态性的相关性研究

探讨全身型重症肌无力(MG)患者他克莫司(FK506)治疗血药质量浓度个体差异与CYP3A5基因多态性的关系.收集临床确诊的难治性全身型MG患者36例,均为OssennanⅡB或美国MG基金会(MGFA)ⅢB型,口服FK506 1～3 mg·d-1,记录患者体质量、他克莫司使用剂量,LC-MS/MS法检测他克莫司全血质量浓度,并利用PCR-RELP法检测患者CYP3A5·3 A6986G多态性,分析血药质量浓度/剂量比与基因型的关系.结果表明:CYP3A5 基因为AA或AG型患者的血药质量浓度/剂量明显低于GG型((44.56±23.21)/(150.14±123.12),P<0.001).可见,在重症肌无力(MG)患者中CYP3A5基因多态性与FK506的血药质量浓度显著相关.根据上述不同患者基因型药物代谢的特点进行剂量调整,或在使用FK506前通过基因型检测更合理地选择患者,有助于提高FK506的临床疗效,减少其副作用.     

尖镰孢菌细胞色素P45055A1与NO相互作用的荧光光谱法研究

以大肠杆菌为宿主表达了尖镰孢菌细胞色素P450 55A1(CYP450 55A1),并采用荧光光谱法研究了其与NO的相互作用.结果表明:在大肠杆菌(DE3)中成功表达了具有酶活性的CYP55A1.在280 nm波长激发下,NO的加入使CYP55A1的荧光逐渐降低,但随温度的变化差异较小;在413 nm波长激发下,NO的加入使CYP55A1的荧光逐渐升高,但加入NADH后其荧光又恢复到原来的值.     

2，4-二氯苯酚与肌红蛋白相互作用研究

用琼脂糖水凝胶在玻碳电极表面固定肌红蛋白（Mb）,研究了Mb与有毒且难降解的有机污染物2,4-二氯苯酚（2,4-DCP）的相互作用．在无氧的溶液中,2,4-DCP与Mb中的血红素形成了配合物,但没有催化反应发生;在氧气饱和的溶液中,Mb催化2,4-DCP羟基化,表明Mb具有细胞色素P450单加氧酶的活性．2,4-DCP的浓度在12．5—208μmol·L^-1。范围内与催化电流呈线性关系,检测限为2．06μmol·L^-1．紫外可见光谱证实2,4-DCP与Mb氨基酸残基之间存在强烈的作用,409nm处峰吸收减小,表明血红素Fe（Ⅲ）／Fe（Ⅱ）的价态发生改变,进一步证明Mb与2．4-DCP发生了氧化还原反应．     

西藏胡黄连根状茎差异表达基因的筛选及分析

 西藏胡黄连是著名的濒危西藏药材, 其粗壮的根茎部是重要的合成和储存药用萜类物质器官,萜类含量显著高于叶部。为克隆西藏胡黄连根状茎和叶的差异表达基因,利用抑制消减杂交技术,构建了根状茎特定的抑制消减文库。从该SSH文库中随机挑取片段不一的阳性克隆测序,采用Blastx进行同源比对,获得了27个表达序列标签（EST）,并获登录号。序列统计分析结果表明,其中有11个EST在GenBank中无同源性序列,推测可能是新基因片断。蛋白质功能分类结果表明,这些蛋白质与翻译、能量代谢、转运与结合、细胞膜合成、氨基酸生物合成及中间代谢6大类蛋白功能有关。为深入研究与萜类生物合成直接或间接相关基因,选择了长595 bp的差异表达EST序列EX172715进行了同源比对和蛋白系统进化分析。结果表明,EX172715具有细胞色素P450单加氧酶的特征结构,与拟南芥的细胞色素P450单加氧酶蛋白的同源性高于水稻和小麦。提供了一组与西藏胡黄连次生代谢相关的新基因库。     

检测细胞色素P-450基因族中CYP1A1基因表达的一个简捷方法

NMR1系雄性小鼠被用来研究肺微粒体细胞色素P450家族中一个同功基因CYPlAl在香烟烟雾的诱导下表达．双轮回‘聚合酶链式反应’(PCR)和‘反向转录酶-聚合酶链式反应’(RT-PCR)被用来检测基因CYP1Al的转录水平．代表CYPlAl蛋白活性的7-乙氧基试卤灵-0-去乙基酶(EROD)的活性被用来检测基因CYPlAl的表达．双轮回‘聚合酶链式反应’(PCR)和‘反向转录酶-聚合酶链式反应’(RT-PCR)被用来检测基因CYPlAl的转录水平．测试结果表明在吸入香烟烟雾的情况下。小鼠肺微粒体EROD的活性和基因CYPlAl的转录水平是同步增加的．这个结果不同于以前在同样实验条件的一个自相矛盾的结果，即在CYPlAl蛋白增加时，基因CYPlAl的转录水平却是下降或不变．这说明本文所使用的方法可能要优于以前的实验方法.     

锌指结构基因ZNF302序列的克隆与表达谱分析

从人脑脑cDNA文库中克隆到1条1685nt的锌指蛋白新基因cDNAycb gq ,命名为ZNF302,生物信息学分析表明,ZNF302的C末端含有13个保守的C2H2锌指结构;Northern-blot结果提示这一基因可能存在3．0kb和4.2kb的2种转录本。Unigene软件包分析,该基因定位于19号染色体19q13.2-13.3;cDNA基因芯片检测显示疤痕成纤维细胞经TGFβ1刺激和ECV304细胞经PMA,LPS刺激后,ZNF302基因表达明显升高,提示其与细胞增殖的正调控有关。     

昆虫细胞色素P450的多样性和功能

细胞色素P450是一类广泛存在的催化酶,能够在昆虫体内参与外源性物质的代谢和内源性物质的合成与降解,帮助昆虫进行正常的生理活动。尽管昆虫细胞色素P450的多样性和功能一直是研究的热点,但目前仍缺乏对这个领域的系统总结和归纳。本文综述了昆虫细胞色素P450数量、表达和反应类型的多样性以及细胞色素P450在昆虫中的功能和进化等方面的研究进展,为更好地研究和利用昆虫细胞色素P450的多样性和功能提供有力的参考依据,同时也能促进我们更好地理解昆虫的代谢和生理活动。     

计算机辅助物豆壳过氧化物酶分子序列分析

从生物信息学角度,利用生物大分子数据库（ＧＥＮＥＢＡＮＫ、ＳＷＩＳＳ－ＰＲＯＴ和ＰＤＢ）及软件技术（ＤＮＡＳＩＳ和ＰＲＯＳＩＳ）对豆壳过氧化物酶分子进行了序列分析及结构预测;通过与其它植物及真菌来源的过氧化物酶的比较研究,分析了结构保守性与功能域的关系,从分子水平探讨了植物过氧化物酶超家族的活性位点局部保守序列、折叠模式及序列结构域特征。     

浑沌时间序列建模及其分析

介绍最新提出的浑泡时间序列建模及预测的理论和方法，给出了应用实例，并将其与传统的时间序列建模方法做了多方面的比较，最后提出了浑沌时间序列建模有待深入研究的几个问题．     

中国人HLA-G1的cDNA克隆、序列分析、表达和蛋白质空间结构预测

从中国人外周血单个核细胞、胎盘组织和肝癌组织等样品中克隆了包含完整HLA-G1读框的cDNA;与国外同行获得的该基因及其蛋白质序列比较分析表明,该基因虽然有着细微的种族特异性,但高度保守;并获得了它的截断型重组蛋白,根据蛋白一级结构和同源比较方法,模建了它及其与特异性受体KIR2DL4形成复合体的空间结构模拟,预测了它们之间相互作用的特征.     

浅谈大跨度屋面结构建模分析

以某体育馆工程网架为例,对PKPM有限元软件模型的简化建立与分析进行了探讨,提出采用等代刚度梁法对网架部分进行简化建模参与结构的整体计算分析,通过计算分析表明此种方法较为符合实际.     

社会主义核心价值观的序列结构探析

价值观体现人生活实践追求之目标函数,具有应然性和超越性特点。社会主义核心价值观作为价值目标要成为生活中的现实还要经历一个长期的历史过程,这就有一个价值实践过程中的序列结构和轻重缓急的问题。我们初步探析认为:公正是当代中国首要的价值观;基本权利和基本规则的平等是公正的重要体现,也是社会主义社会的应有之义。从这个意义上说,平等优先于自由,它更多体现在经济领域;自由、法治优先于民主。社会主义核心价值观的序列结构是相对的,不是绝对的。公正、平等、自由、法治、民主构成一个相互联系的整体。     

聚对苯二甲酸-联苯二甲酸-乙二酯的分子序列结构与结晶性能

以对苯二甲酸、联苯二甲酸(BBA)和乙二醇为原料,采用直接酯化技术制备了聚对苯二甲酸-联苯二甲酸-乙二酯(PETBB).特性黏度和凝胶渗透色谱(GPC)测试表明得到了高相对分子质量的共聚物.13C-NMR证实PETBB大分子链上所含的BBA与投料比一致;随着BBA摩尔分数的增加,共聚酯中聚对苯二甲酸乙二酯(PET)平均序列长度减小而聚联苯二甲酸乙二酯(PEBB)平均序列长度增大.差示扫描量热(DSC)分析证明PETBB共聚酯自熔体冷却的结晶温度变低,较高BBA摩尔分数的PETBB甚至不能在熔体冷却过程中结晶,表明共聚酯结晶变得困难,但经充分热定型仍能形成晶体;而其熔融温度随BBA摩尔分数的增加而明显下降;玻璃化转变温度则随BBA摩尔分数的增加而升高.     

序列图建模机理与应用研究

研究了序列图在软件设计中的应用问题,解析了其组成和表示,探索了其对象的交互机理和交互原则,分析了其本质与在MDA软件范型中的建模应用,诸如用序列图表示的模型转换性和可追溯性,讨论了序列图与面向对象编程的内在联系.     

软结构双锥天线静态建模力学分析

建立软结构双锥天线的力学模型,从天线内部结构到外部结构进行力学分析,得到边索、环线及各振子的等量关系,并建立力学平衡方程。利用循环迭代的方法计算出双锥天线各部分的结构尺寸,为天线结构设计和工程应用提供数据支撑。计算方法通过实际工程验证,同样适用于其他柔索结构的分析计算。     

电场中微梁结构的建模与分析

研究微机电系统(MEMS)中微梁结构在非线性电场力下的振动问题．重点讨论对非线性电场力的处理方法,建立相应的力学振动模型,用计算机仿真(Simulink)模拟该模型,并用有限元的方法计算梁的振动．最后给出微梁中点对初始位移响应的峰值所对应的振动频率随梁质量和外加电压的变化．     

基于4D表示的DNA序列分析方法

基于DNA序列4种核苷酸的物理化学性质,考虑相邻两个碱基组合形式,提出一种新的DNA序列4D表示.基于这种表示,可以把DNA序列简化成4D空间的一系列点,根据点坐标抽取序列数值特征,再根据数值特征给出方法对DNA序列进行相似性分析.以10个不同物种的a-球蛋白基因的第一个外显子碱基序列的为例子,说明基于4D表示的DNA序列分析方法是有效的.     

鲫血清转铁蛋白推导序列分析及空间结构预测

用DNA Club分析软件推导出鲫血清转铁蛋白序列,并对该序列进行分析.推导的蛋白质长度为807个氨基酸残基,Mw约为90 000.其中半胱氨酸43个,可以组成21对二硫键.疏水性和二级结构几率分析表明:有两个非常相似的结构域分别存在于1-390和390-807区域.旋管结构和螺旋结构的分布区域,均分别集中在上述两个区段中,同样位于两个结构域中,结构也非常类似.证实了转铁蛋白(Tf)由2个同源性较高的结构域(N结构域和C结构域)组成.Tf的三级结构呈"V"字形,每个结构域又各自分为3个小的结构小区(即N1、N2、N3和C1、C2、C3).两个糖基位于N1和C1区,呈"Y"字型结构;铁链位于N2和C2区;受体结合位点R1和R2位于N3和C3区.