中国人HLA抗原中DQA基因的PCR-RFLP方法分型探索

人类的白细胞膜上存在着一类与组织免疫相容性有关的抗原，统称为HLA抗原．本文报道了用PCRRFLP方法．对我国少量人群HLA抗原基因群中DQA基因的分型探索情况，为在我国普及开展这方面的工作提供一点可借鉴的资料。     

一种以测序为基础的基因分型方法的建立

设计了一种自动化的基因分型方法，能够直接利用PCR产物的DNA测序结果作为数据，通过自动化基因分型程序（automatic genotyping program)与一个含有其等位基因序列的数据库进行比较，来完成高精度的基因分型工作。用这种方法对50个随机挑选的中国南方人的HLA－DPB1基因进行了基因分型，证明该方法是可行的，并从中发现了2个不明确杂合子以及一个新的等位基因序列。随后对这些样品克隆测序，发现除了2个不明确杂合子得到了 进一步的区分外，其它样品都与前面的分型结果一致，显示了96％的精确性。通过以上的研究表明，成功建立了一种高精度的、基于序列的分型（sequence-based typing)方法。既然该方法能成功分型HLA－DPB1基因，预示了该方法同样能应用于其它基因的分型。该AGP程序可以在http:/genome.zsu.edu,cn免费下载。     

HLA DQ位点多样性模拟分析及其PCR—RFLP分型

选择２７个识别序列为４ｎｔ的限制性内切酶,通过计算机对最新获得的１９个ＤＱＡ１和３５个ＤＱＢ１等位基因第２外显子中的一段序列进行模拟酶切分析,根据酶切格局数目及各格局所代表的等位基因数的均衡性,确定酶的优先次序,在此基础上进行ＰＣＲ－ＲＦＬＰ模拟分析,确定最佳的酶组合。结果表明,分别采用４个和６个酶的组合,可有效鉴定ＤＱＡ１和ＤＱＢ１等位基因。同时通过比较分析ＤＱＢ１各等位基因核苷酶位点的变异系数     

HLA基因多态性与法医学

人类白细胞抗原,简称HLA,基因定位于人类第6号染色体短臂上,是人类最复杂的显形多态遗传系统,基因型可达108之多,在法医学物证鉴定中有着广泛的应用前景,是理想的人类遗传学标记.本文就其基因多态性的研究进展和在法医学中的应用作一综述.     

HCV基因分型与血清分型相关性的研究

目的 探讨HCV血清分型和基因分型的相关性及临床意义。方法 HCV血清学分型应用ELISA法；HCV基因分型应用型特异性PCR法。结果 1．血清学分型率为52．38％（88／168），其中血清1型阳性率为48．86％（43／88），血清2型阳性率为34．09％（30／88），血清（1＋2）混合型阳性率为17．04％（15／88）。基因分型率为54．17％（91／168），其中基因Ⅱ型阳性率51．64％（47／91），基因Ⅲ型阳性率为31．86％（29／91），基因（Ⅱ＋Ⅲ）混合型阳性率为16．48％（15／91）。结论 兰州地区HCV以血清1型即基因Ⅱ型为主，其次是血清2型即基因Ⅲ型以及血清（1＋2）型即基因（Ⅱ＋Ⅲ）型。     

基于HLA仿真数据收集方法的研究

论述了HLA下的仿真数据收集问题、数据收集内容以及数据收集方法的基本要求,通过分析已有的HLA数据收集方法分别给出了他们的优点和不足,为进一步的研究奠定了基础.     

Apo E基因multi-ARMS与PCR-RFLP分型法的比较研究

目的：以聚合酶链反应——限制性酶切片段长度多态性（PCR-RFLP）方法作为参照，建立一种ApoE基因分型方法。方法：以基因组DNA为模板，用PCR-RFLP法和等位基因特异性复合PCR方法（Multiplex Amplification Refractory Mutation System,multi-ARMS）检测了75例个体的ApeE基因型。结果：共检测出5种常见的ApoE基因型：ε2/2,ε3/3,ε2/3,ε3/4,ε2/4。两种方法所得的结果完全一致。结论：说明multi-ARMS方法快速简便、准确可靠，具有失言应用价值。     

戊型肝炎病毒基因分型的研究进展

戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)是一种能引起急性、自限性病毒性肝炎的RNA病毒.主要经粪-口、血液等途径传播,常引起暴发性流行,或呈散发性流行.目前,HEV基因型分型不明确,给戊型肝炎的诊断、预防、流行病学调查及交流造成了一定困难.文章综述了戊型肝炎病毒基因分型的研究进展,目的是为HEV的研究奠定基础.     

应用液态悬浮芯片技术建立HPV基因分型方法

目的 应用液态悬浮芯片技术,建立一种新的人乳头瘤病毒(HPV)基因分型方法.方法 应用通用引物从HPV基因组中扩增出目的片断,与13型荧光微球偶联探针杂交,通过LuminexTM100检测HPV的型别.结果 检测十三型标准株质粒,对单一标准品和混合标准品均可准确分型.结论 初步建立了高通量、快速、可靠、适用于临床的人乳头瘤病毒分型基因诊断方法.     

DNA purification and genetyping： Based on multifunc-tional nanobeads

In this report, a universal protocol for extract-ing genomie DNA from whole blood, saliva, and bacterialculture by using magnetic nanobeads as solid-phase absor-bents was presented. The enrichment of target cells and ad-sorption of DNA have been functionally integrated onto thesurfaces of the earboxyl-modified magnetic nano-beads, andthe DNA segments bound on the surface of the beads can bedirectly used as PCR templates to amplify a target geue. ThePCR products were applied to an oligonueleotide array toperform gene typing. The protocol proves to be simple, rapid,biologically and chemically nonhazardous, and promising forthe mierofabrieation of DNA preparation chip.     

基于ActA基因的单核细胞增多性李斯特菌的序列分型研究

根据单核细胞增多性李斯特菌ActA基因序列保守区设计一对引物,对21个菌株进行PCR扩增,得到长度为820bp的片段。PCR产物经过纯化后直接测序,并对其中的506bp进行同源性分析。结果表明单核细胞增多性李斯特菌分离株具有5个明显不同的克隆谱系,每个谱系的同源性均在95％～100％。16个单核细胞增多性李斯特菌奶相关和环境分离株可被分成4个谱系,其中2个谱系（C、D）均为奶相关分离株和成品奶分离株;加工厂地面污水分离株为独立的一个谱系。初步表明,成品奶中污染的单核细胞增多性李斯特菌来自于奶牛场,而非加工环境。     

HLA仿真系统设计中的模型问题

首先对HLA与面向对象分析与设计（OOAD）的相关概念进行了比较,然后详细介绍了仿真系统设计过程中将要涉及到的五类模型的概念及它们之间的相互关系,并简要介绍了这几类模型的VV＆A．     

基于HLA的无人战斗机巡航高度仿真系统设计

基于HLA(High Level Architecture)提供的通用框架和开放标准,对无人战斗机的仿真方法进行了研究,介绍了无人战斗机作战仿真系统联邦结构,给出了联邦对象模型/成员对象模型设计和时间管理方法,从实时RTI终端系统、通讯保证体系和增强型可预测的RTI服务等3个方面,解决了该半实物仿真系统的实时性要求,建立了影响巡航高度因素的数学模型,对各因素进行了详细的分析,并通过软件在整个系统中实现了各联邦成员。根据仿真流程,采用M KTechnologies公司的M K RTI,借助Visual C 6.0实现联邦仿真平台的设计。通过对无人战斗机巡航高度的仿真可知,结论真实可信,丰富详实,该系统为下一步完成无人战斗机作战任务的模拟奠定了理论及应用基础,并为今后类似仿真系统的研制提供了借鉴。     

基于HLA的可动态调配测试仿真系统

论文以CZ系列运载火箭发射前的系统测试为背景,设计并实现了一套完整的测试仿真系统.首先建立了控制系统、动力系统,遥测系统和利用系统的全数值测试仿真模型库.在此基础上通过对Matlab和RTI通信机制的研究,提出了一种HLA和simulink综合仿真建模的方法,实现了数值模型在HLA体系下的可动态调配.通过对单机模型的动...     

Genetic typing of mitochondrial DNA in sheep (Ovis aries )

Using PCR-RFLP and DNA sequencing, this study confirmed that HinfI polymorphism in the ovine mitochondrial COI gene resulted from the T-C substitution at the nucleotide 234 but this mutation did not encode another amino acid, which was actually a synonymous mutation. This single nucleotide polymorphism can be used as gene typing marker for mitochondrial genome in the research of the interactions between mitochondria and nucleus, extranuclear gene effects, and as molecular discriminating marker for embryo or individual in the research area of gene transfer and animal cloning.     

HLA系统及其研究现状

HLA(人类白细胞抗原)是人类主要组织相容性抗原系统.HLA的化学本质是糖蛋白,可分作两类:第一类是由一条重链和一条轻链构成,第二类是一条α链和一条β链.编码HLA的基因是一个基因复合体,它的4个主要基因均为复等位基因系列.几乎所有的人此座位皆为杂型合子;由于每一单倍型组合方式的巨大变异性,使得HLA基因型相同者极为罕见. 关于HLA的研究,领域十分广泛.抗原活性及其独特表位的研究表明,只有当β_2-m存在时重链才显免疫活性,似乎β_2-m的作用在于保持重链在细胞膜上的构型.因而,β_2-m的微小差异都将影响HLA的活性.许多疾病与特定的HLA基因型有联系,HLA与寿命或衰老的关系是自70年代发展起来的一个热门课题. 关于HLA的研究显示了巨大的潜势.除上述,有如在法医学中亲子关系的确定,以及对人类的进化与种族的形成,都将提供有价值的资料。     

一种基于HLA的CAN总线仿真系统

基于HLA和OPNET仿真技术,以CAN总线为研究对象,建立一个联合分布式仿真系统.系统由三部分构成,一个OPNET工程用于模拟CAN总线的仿真网络;一个WINDOWS工程是CAN总线控制台,用于设置OPNET仿真网络中CAN总线设备的工作参数;另一个WINDOWS工程是CAN总线设备的参数显示终端,用于显示仿真CAN总线设备的工作参数.系统中WINDOWS控制台和参数显示终端的真实数据与OPNET仿真网络的虚拟数据之间的数据交互依靠HLA技术实现.这样,传统的全数字OPNET仿真软件就可以在运行过程中实现与用户交互.