用三联数字探讨64种遗传密码的进化规律

本文通过三联数字论证得出GCU是遗传密码进化的第一个密码子,并阐明了64种遗传密码为什么只编码20种氨基酸.还论述了64种遗传密码的进化规律,最后创建了DNA、蛋白质的数字模型.     

分子生物学中“遗传密码”概念在中国的传播

在1953-1968年间遗传密码表建立过程的历史背景下,揭示遗传密码概念的演变及其在中国的传播.从内史角度厘清"基因"与"遗传密码"在概念上的不同;利用文献研究法、概念分析法和比较研究法,揭示了20世纪70年代后遗传密码在中国中学生物教科书中出现的历史进程,结果显示,遗传密码概念在中国基础教育层面的渗透和传播反映了人们在分子水平上理解遗传现象的意识的提高;凭借数理统计法分析,说明了"遗传密码"作为分子生物学中的核心问题之一在学术界激起了一定程度的研究兴趣.     

遗传密码的由来

从生物学角度阐明遗传密码的由来,首先是用酶促(成)合成PolyU作模板,合成了多肽多聚苯丙氨酸,打开遗传密码的突破口.相继用顺序随机的共聚物作模板,又测出很多密码子.通过三联体结合测定法,发现了核糖体结合技术,解决了密码子该苷酸顺序问题.总之,用外源RNA作多肽链合成的模板,为遗传密码的阐明,提供了一个强有力的手段,并导致著名的遗传密码表的确定.     

线粒体非标准密码表的进化稳定性

根据突变危险性极小化的方法,导出各物种线粒体非标准遗传密码表的总体突变危险性极小表,证明了各非标准遗传密码表是在一些约束条件下的总体突变危险性极小表,体现了分子进化遵循稳定性原理,并受冻结偶然性制约.     

细胞核非标准密码表的进化稳定性

根据突变危险性极小化法,导出现有相关物种的细胞核非标准遗传密码表的总体突变危险性极小表,证明了各非标准遗传密码表是在一些约束条件下的总体突变危险性极小表,这体现了分子进化遵循稳定性原理,并受冻结偶然性制约.     

遗传信息从核酸到蛋白质构象的传输效率

从密码学的观点研究了遗传信息从核酸流各氨基酸和从蛋白质一级结构流向三级结构的信息传输问题，引入了信息传输效率的概念，其对数负正丝 系统的抗干扰能力。导出了信息传输效率与序列长度的关系。发现了信息从核酸流向氨基酸（第一遗传密码）的传输效率和从氨基酸序列流向蛋白质三级结构（第二遗传密码）的传输效率大体相等，这说明了遗传信息的传输效率和抗干扰能力在以上两步传输过程中的匹配性。     

遗传密码的解析与生命公式的完善

作为遗传学发展中的重要事件,遗传密码的解析和遗传“中心法则”的完善经历了长时间的探索。通过梳理遗传密码发现、生命公式建立过程的历史史实,总结遗传密码的解析过程,还原生命公式从提出伊始时的线性结构发展到三角形结构的全过程。     

周易立体模型与生物遗传密码

德国学者M.Schonberger于1973年首次阐明64遗传密码子与周易64卦之间的对应关系.有关遗传密码与64卦关系的研究,虽然许多人付出过心力,但是,都未能对应当依据什么标准来把64密码子与64卦一一对应作出科学阐述.上世纪80年代末以来,一批中国学者构建了"立体易模型",这项研究将中国易学从平面引向立体.应用"立体易模型"探讨64密码子与64卦之对应关系.不仅找到64密码子与64卦一一对应的依据标准,并能解释通用密码子的简并性、变偶性等特征.     

遗传密码突变危险性的全局极小

建立遗传密码稳定性的数学理论,给出遗传密码总体突变危险性的一个数学定义,由此出发讨论它的全局极化化,求出突变危险性全局极小化的密码表,并研究在什么条件下可以导出标准密码表。     

遗传基因解人体之谜

美国哈佛大学的一些科学家们认为。他们可能已经发现了人类如何成为一个独特的物种的确切原因。他们认为,使一些灵长类动物区别于其它哺乳类动物的不过是两种基因,这两种基因在数千万年前融为一体,形成了独一无二的遗传密码,这种遗传密码可     

遗传密码的对称性和氨基酸的疏水性

根据四种核苷酸的对偶性(阴阳)假设,给出类似于64卦的遗传密码图示,利用这种表示导出了氨基酸的亲水-疏水分类、亲水-疏水畴和反义密码子的相反疏水性.     

遗传密码的简并及其高维空间的拓扑结构

根据遗传密码子的简并度（对称性）,可将６４个遗传密码子分为高简并度和低简并度两大类。高简并度的氨基酸,其分子量一般比较小,等电点（ｐＩ值）的分布比较集中,而低简并度氨基酸的情况恰好相反。根据ＵＣＡＧ编码的简并度分析,得出４个碱基的二进制编码为：Ｃ（００）,Ｕ（０１）,Ａ（１０）,Ｇ（１１）。应用碱基二进制码对２０个氨基酸及终止密码进行编码,可得出十分规律和优美的六维空间。并由此得出遗传密码子的拓扑     

周易立体模型与生物遗传密码

德国学者M.Schonberger于1973年首次阐明64遗传密码子与周易64卦之间的对应关系。有关遗传密码与64卦关系的研究,虽然许多人付出过心力,但是,都未能对应当依据什么标准来把64密码子与64卦一一对应作出科学阐述。上世纪80年代末以来,一批中国学者构建了“立体易模型“,这项研究将中国易学从平面引向立体。应用“立体易模型“探讨64密码子与64卦之对应关系。不仅找到64密码子与64卦一一对应的依据标准,并能解释通用密码子的简并性、变偶性等特征。     

论遗传密码的简并规则

从突变率极小——密码的稳定性——和扩大氨基酸信息量两方面的要求,讨论了遗传密码的简并规则。     

基因组信息、密码进化、折叠动力学和熵产生——理论生物学的几个基本问题

以信息为主线论述了生命科学的理性化途径,着重总结了作者及其研究小组在理论生物学领域的工作,包括基因组序列识别码的形成和构建,基因组的进化方向和最大信息原理,遗传密码的适应性进化,基于量子跃迁的蛋白质折叠动力学,细胞开关相变和熵产生.     

遗传密码和进化稳定性

本文用数学的 Brouwer 不动点定理解释 DNA 分子中不同类型碱基的稳定配对,用进化稳定性的观点解释遗传密码由四种碱基组成。     

无义密码对线粒体密码进化的影响

遗传密码的起源与进化是理论生物学研究的一个基本问题.以线粒体密码为例,讨论密码进化关系构建的不同规则,分析密码进化中重要影响因素——无义密码子的再定义及其逆过程.终止信号与氨基酸间的距离是密码进化关系构建中的关键,在密码进化中无义密码子突变可以频繁进行,存在干涉现象,且进化倾向于无义密码子减少的方向.     

基于蛋白质序列的氨基酸字母表简化

蛋白质的结构和功能特性由其氨基酸序列编码,控制序列结构映射的规则被认为是二级遗传密码,氨基酸字母表的简化可以减少蛋白质序列中的冗余,有助于揭示编码规则.基于氨基酸的单体特征、成对相互作用和相似性,可以简化氨基酸字母表.目前,仅基于蛋白质的序列信息,根据最近邻氨基酸的出现频率构建了一个氨基酸的嵌入表示.在此基础上,提出一...     

周易立体模型与生物遗传密码

德国学者M．Schonberger于1973年首次阐明64遗传密码子与周易64卦之间的对应关系。有关遗传密码与64卦关系的研究，虽然许多人付出过心力，但是，都未能对应当依据什么标准来把64密码子与64卦一一对应作出科学阐述。上世纪80年代末以来，一批中国学者构建了“立体易模型”，这项研究将中国易学从平面引向立体。应用“立体易模型”探讨64密码子与64卦之对应关系。不仅找到64密码子与64卦一一对应的依据标准，并能解释通用密码子的简并性，变偶性等特征。     

生物技术进入后基因时代

生物技术是当前最活跃的高科技领域,其核心——基因工程正酝酿着重大突破。不久前,包括我国科学家在内的6国16个基因组中心负责人在纽约宣布,从2000年5月9日开始,人类基因组测序进入第二阶段,完全解析人类基因组30亿碱基对的顺序,将人类基因组整体序排的准确率提高到99.99%。到2003年,精确的人类基因组测序工作将全部完成。今年6月26日,6国科学家向全世界公布了人类基因组的工作草图。人类基因组遗传密码的基本破译,昭示着人类对