遗传指纹图谱技术对微生物群落的分析

微生物培养技术无法获得自然生境中99％以上的微生物，而可培养的微生物也仅提供极少的形态学线索，鉴定和生理学特性经常是模糊的。分子生物学技术对不可培养微生物的研究，开启了探索微生物多样性和新资源的大门。DNA杂交、rRNA分子标记测序等已经成为研究分子微生物生态学的常规手段，可以鉴定和描述微生物群落的种群，但却不适于探索微生物复杂群落的动力学。遗传指纹图谱技术允许同时进行多样本的分析，可比较不同生境和随时间变化的微生物群落行为，是传统手段的有力补充。     

扩增片段长度多态性技术在动物遗传多样性研究中的应用

扩增片段长度多态性(AFLP)是一种有效的分子遗传标记方法,具有快速、经济、简便、模板需要量少、重复性高、结果可靠等优点。目前AFLP在动物方面的应用还不是很多,处于初级阶段,主要用于鉴定分类关系、种群遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建等方面。     

分子生物学方法在微生物生态学研究中的应用

由于传统分离培养微生物的局限，分子生物学技术避开了传统微生物培养分析的环节，直接从样品中抽取总DNA，然后通过PCR扩增及其相关技术、核酸杂交技术、RNA基因序列分析等方法对直接提取的总DNA进行分析，了解其中微生物信息．这些通过遗传物质进行研究的分子方法，为微生态的研究开辟了新的途径，并已经得到广泛的应用．     

晶体结构预测的新方法和典型应用

物质的微观结构直接或间接决定了材料的几乎所有物理和化学性质.这也是后续材料设计的重要基础.近年来,随着多种晶体结构预测方法的发展和改进,仅根据化学组分就从理论上确定物质结构的研究已经取得了长足进步.本文概述了当前主流的晶体结构理论预测方法,并对基于自适应遗传算法(AGA)以及利用"结构单元(Motifs)"(XMsearch)的新型结构预测方法做了重点介绍.近年来,基于不同算法的AGA,XMsearch等程序包得到了开发与完善,只需给定化学组分和压力等条件,便能对材料的稳态、亚稳态结构进行预测研究.目前,这些新工具已在高压材料、电池材料、磁性材料、界面材料等凝聚态物质结构研究中得到了广泛应用.     

中国柳树遗传育种研究进展

柳树是我国重要的乡土树种,具有数量众多、分布广泛、变异丰富、生长迅速、易于繁殖等特点,可作为园林景观、速生用材、生态防护、生物质能源、生物修复、柳编工艺等多功能树种。柳树具有广泛而重要的生态与经济价值。近年来,我国柳树研究发展迅速,通过常规育种选育了一大批良种和新品种,在遗传学与基因组学方面也取得重大进展,在国际上处于领先地位。笔者从柳树的分类与分布、种质资源收集与保存、重要性状评价、遗传改良、分子遗传学等方面对近60年来我国柳树遗传育种的研究进展进行了系统总结,并分析了目前我国柳树遗传育种工作中存在的问题,展望了今后的重点研究方向,旨在进一步提高我国柳树遗传育种工作的水平,也为其他木本植物的遗传育种研究提供有益参考。     

生态学研究的新领域——分子生态学

扼要介绍了这个新学科的定义、基本内容、研究方法、应用和展望;分子生态学利用分子生物学的方法在分子水平上分析生物与环境的相互关系,所涉及的分子标记是DNA标记.     

DNA遗传标记与绵山羊遗传育种

综述了分子遗传标记限制性片段长度多态、随机扩增多态DNA、DNA指纹、微卫星DNA、线粒体DNA限制性片段长度多态、扩增片段长度多态DNA等技术的原理、遗传特点，及其在绵羊和山羊遗传育种中的研究现状，并对其在绵羊和山羊育种中的应用前景作了展望。     

DNA fingerprinting in birds

Several regions of the human genome are highly variable in populations because the number of repeats in these regions of a short 'minisatellite' sequence varies at high frequency. Different minisatellites have a core sequence in common, however, and probes made up of tandem repeats of this core sequence detect many highly variable DNA fragments in several species including humans, cats, dogs and mice. The hypervariable sequences detected in this way are dispersed in the genome and their variability means that they can be used as a DNA 'fingerprint', providing a novel method for the identification of individuals, confirmation of biological relationships and human genetic analysis. We show here that human minisatellite-derived probes also detect highly variable regions in bird DNAs. Segregation analysis in a house sparrow family confirms that these regions comprise many mostly heterozygous dispersed loci and we conclude that house sparrow DNA fingerprints are analogous to those of humans. Fingerprint analysis identified one nestling, with fingerprint bands not present in the parent pair's fingerprints, which we conclude resulted from an extrapair copulation. Extrabond copulations have been described in many wild bird species, but their success and hence adaptive significance have rarely been quantifiable. DNA fingerprinting will be of great significance to studies of the sociobiology, demography and ecology of wild birds.     

基于遗传距离的粘孢子虫分类研究

以18SrDNA作为分子际记研究了以粘孢子虫（Myxosporidia）常见属为代表的不同分类水平下的遗传距离分布规律。结果表明,粘孢子虫亲缘关系的远近与遗传距离具有明显的相关性,即粘孢子虫亲缘关系越远遗传距离越大,反之亦然;同时表明,本研究所涉及的种内、种间和属间阶元的遗传距离虽在一定范围内有重叠,但遗传距离由小到大排列依次为种内、种间、属间。研究认为物种之间在遗传距离上可能并不存在绝对的界限,但基于18SrDNA遗传距离的分歧在一定范围内对大多数物种的鉴定是有效的。     

杂种优势遗传基础的研究进展

由于杂种优势的利用是农业增产的重要途径，杂种优势的遗传基础研究一直受到高度重视。近十年来发展的分子标记技术及构建的高密度遗传图谱，为阐明杂种优势的遗传基础提供了有力的工具，杂种优势研究有了新进展，通过对已有资料的分析研究，从遗传差异，基因表达调控、基因效应、基因网络系统等方面探讨了杂种优势的遗传基础及其研究进展。     

GMOs： The new hotspot in ecological research

Gene flow is an important ecological and genetic process, and the fitness conferred by the insertion of a foreiga gene could be important in ecology after it becomes introgressed into the wild genetic background of organisms,which is the determinative factor for the fate of GMOs or foreign genes in natural ecosystem and for the competition with native species. Trophic interrelation fulfilled by food chains is the most important correlation between species in ecosystem and could be affected by the modified genotypes after the introduction of GMOs. The technology enabling the precise manipulation of genotype is a great opportunity for the stndy of ecological genetics in an unknown way prior to the biotechnology era. Especially interesting is the impact of genes on ecosystem function when GMOs are released into environment. A variety of ecological terminology has been frequently used in assessment of ecological risks related to the release of GMOs in environment, e.g. gene flow, fitness,interspecific competition and food chain. The value of GMOs in ecological research is illustrated through several examples in biasafety assessment related to those terms here. It is proposed that ecolegists should pay attention to the study of gene function in ecosystem and take the opportunity to enrich ecological theory with the release of GMOs.     

优质红锥种源遗传多样性的RAPD分析

采用从100个随机引物中筛选出的30个有效引物，利用RAPD技术对不同地区的10个不同生态型优质红锥种源进行遗传多样性研究．结果表明：（1）30个有效引物共扩增出290条清晰谱带，平均每个引物扩增出9．67条带．多态性条带为254条，比率为87．59％；（2）10个不同生态型红锥之间的遗传相似系数介于0．5946～0．7148之间，但不同地区红锥也存在着一定的遗传差异（遗传差异在0．2852～0.4054）；（3）用引物S3扩增出的带谱可在一次实验中区别10种不同生态地区的优质红锥，同时S3也可作为10种优质红锥材料的指纹图谱，鉴定优质红锥的种源；（4）聚类分析表明，10种优质红锥种源可聚成3个独立的类群．本文作者对它们的亲缘关系进行了推测．     

Lorenz曲线及其在植物生态研究中的应用

由Lorenz曲线派生的基尼系数和洛伦茨不对称系数在植物生态研究中可用来描述植物大小或其它数量性状的不均匀性，以揭示不同环境条件下植物数量性状在群体中的分布特性和生态学意义。笔者介绍了这两个参数以及用Jackknife和Bootstrap两种重新取样法来估算该统计量的精度和误差的数学计算方法，并采用作者自行开发的统计软件，对盐胁迫条件下Iris hexagona天然群体生长和繁殖性状进行了不均匀性分析。结果表明，Iris hexagona植株的地上部分生物量、地下部分生物量和总生物量随盐浓度的增加均呈递减趋势，但不均匀性均呈递增趋势。盐胁迫对植株个体间花量的不均匀性影响不大，而植株在浓度为2和4μg／g的盐胁迫条件下，个体间种子数量的不均匀性下降。另外，Iris hexagona两个繁殖性状的不均匀性均远大于生长性状的不均匀性。基尼系数揭示了均值背后隐藏的生物学意义，它直接反映了植物数量性状在植株间的不均匀性的程度，但产生不均匀性的原因可能包括遗传、生理和(或)生态等因素。若要从遗传角度弄清其本质，需要进行分子生物学特别是有关植物数量性状基因位点及其与环境互作等方面的研究。     

柳杉无性系指纹图谱的构建及遗传多样性分析

【目的】为了构建柳杉无性系的DNA指纹图谱,准确区分柳杉无性系。【方法】利用SSR标记分析了柳杉89个无性系的遗传多样性和指纹图谱。【结果】11对引物共检测出53个等位点,平均每个SSR位点有5个,变化范围为3～6个; 有效等位基因数(N_e)变化范围为1.887 0～4.295 6,平均为3.041 1; Shannon信息指数(I)变化范围为0.774 9～1.556 3,平均为1.208 1。表明SSR标记具有较高的多态性。根据SSR标记特点及引物的顺序,将SSR引物扩增统计的“0”、“1”转换成基因型,通过不同基因型组合,构建了柳杉89个无性系的 DNA 分子指纹图谱,使每个无性系都获得了 1 个 22 位数的指纹图谱号码,同时基于个体间的遗传距离将柳杉89个无性系分为 5 类。【结论】SSR标记适用于柳杉无性系遗传多样性分析及鉴定,柳杉的遗传多态性处于中等偏高水平。     

水生生态调控及水污染治理中微生物的应用

微生物是地球生态系统中最重要的分解者,也是开发潜力最大、人类最宝贵的资源库,在污染物的降解转化、资源的再生利用、无公害产品的生产开发、生态环境的建设保护等方面都能发挥重要作用．当今人类所面临的诸如环境污染、资源短缺、生态破坏、健康受害等许多重大问题,都有可能从微生物资源的开发研究中寻找到解决的办法,生物技术对人类社会的持续发展将产生重要影响．本文论述影响水生生态的主要因素及其相互作用,重点分析微生物在生态调控中的功能、演变及应用前景．结合国情探讨生物技术在环境保护中的研究、技术开发及产业化发展方向,分析微生物高级技术如基因工程技术、克隆技术等在环境领域中应用和产业化的可行性．文中着重介绍维持生态平衡、环境资源化和环境无害化不同层次微生物技术的作用,从微生物的多样性和功能性特点发展各种专门技术,实现废水资源化和无害化的综合协调与优化,实现其环境领域中的广泛应用．     

海洋微藻分类生态及生物活性物质研究

海洋微藻是海洋中的主要初级生产者,它们的盛衰直接或间接地影响着整个海洋生态系的生产力,因此,与渔业资源、水产养殖、环保、地质等密切相关;海洋微藻的分类和生态研究是海洋生态系统结构和功能研究的基础。另一方面,近年来,随着陆地资源的衰竭和环境问题的日益突出,海洋微藻资源成了人们关注的热点,尤其是利用现代生物技术开发利用微藻资源及微藻与环境的关系问题等方面研究得到了科学家和各国政府的高度重视。我国海洋微灌资源丰富,过去对海洋微藻的分类学和生态学研究已取得一定成果,这些成果的应用和开拓新的研究课题是目前海洋微藻研究的2个重要方向。厦门大学在海洋硅藻研究方面的成果一直处于国内领先水平。近年来,在分类生态基础上,不断开展新的研究,在海洋微藻分类学和生态学、微型硅藻和微型浮植物生态、海洋微藻生物活性物质、微藻生物分子标记物、微藻胞外产物、及有害赤潮微藻的分离培养和生物学特性等方面研究取得了较好的进展。     

A preliminary study on S．asotus linnaeus and S．soldatovi meridionalis Chen by DNA fingerprinting

ＡｐｒｅｌｉｍｉｎａｒｙｓｔｕｄｙｏｎＳ．ａｓｏｔｕｓｌｉｎｎａｅｕｓａｎｄＳ．ｓｏｌｄａｔｏｖｉｍｅｒｉｄｉｏｎａｌｉｓＣｈｅｎｂｙＤＮＡｆｉｎｇｅｒＰｒｉｎｔｉｎｇ￥ＬｉｕＹｏｎｇ；ＨｏｎｇＸｉｊｕｎ（ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃ...     

分子序列的突变危险性与遗传密码的编码规则

定义了分子序列（碱基序更和对应的氨基酸序列）的突变危险性函数，通过危险性函数的极小化可以导出遗传密码的简并规则，终止密码子在密码表上的位置及亲－水畴排布，氨基酸在密码表上的定位接近标准密码表，各个生物类别的突变危险性函数值差别不超过５％，可看作守恒量，Ｒａｓ家庭癌基因产物具有较大的突变危险性函数值，这提示分子序列的突变危险性函数可能有重要的应用价值和理论意义。     

蓝鳍金枪鱼和黄鳍金枪鱼遗传多样性的AFLP分析

利用选择性扩增片断长度多态性分子标记技术(Amplified fragment length polymorphism,AFLP),分析了采自日本九州海域蓝鳍金枪鱼(Thunnus thynnus)和台湾海域黄鳍金枪鱼(Thunnus albacares)野生群体的遗传多样性水平.结果表明:9 对选择性引物在 2 种金枪鱼中共扩增出675个位点(100～750 bp),其中蓝鳍金枪鱼和黄鳍金枪鱼多态位点分别为388个和368个.蓝鳍金枪鱼和黄鳍金枪鱼的多态位点比例、Shannon 遗传多样性指数分别为57.48%和54.52%,0.330 1和0.301 8.AMOVA分子方差分析显示:种间遗传分化中,83.79%的遗传变异由种间贡献,而16.21%的变异分布于种内个体之间.同其他鱼类比较,2 种金枪鱼显示了较为丰富的遗传多样性水平,其种质资源处于较好的水平.研究结果将为我国蓝鳍金枪鱼和黄鳍金枪鱼的资源保护与合理利用提供重要的理论依据.     

荷木种群在不同群落中的分子生态研究

用扩增片段长度多态性（ＡＦＬＰ,ａｍｐｌｉｆｉｅｄ ｆｒａｇｍｅｎｔ ｌｅｎｇｔｈ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）方法对荷木（Ｓｃｈｉｍａ ｓｕｐｅｒｂａ）在３个不同群落中的遗传变异进行了研究。ＡＦＬＰ分析结果表明其遗传多样性较高。用ＡＭＯＶＡ（ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｖａｒｉａｎｃｅ）分析表明,９５．９９％的遗传变化表现在种群内,４．０１％的遗传分化表现在种群间（Ｐ〈０．００１）