达尔文主义与进化学说的发展

查理·达尔文(Charles Darwin)死于1882年4月19日,已去世100年,可是他的名字仍然使原教旨主义者战栗,并使科学家们扩展其战线。什么是达尔文主义? 达尔文常说他的生物学工作包含着两个不同的目标:证实进化的这一事实,并提出自然选择是它的主要机制。他写道;”我的心目中有两个明确的目的:第一,证明物种并非各自独立创造,第二,自然选择是变化的主要起因。     

分子进化的中立学说

基于分子遗传学的成就提倡的中立学说在发表后的十多年中,对中立学说越发有利的观察事实正在增多。本文个别地方作了删节。     

四条分子进化规律与相应分子进化学说

进化、发育、遗传为有机体三大基本的生命活动,而进化又是有机体发育与遗传的源泉。近两个世纪以来,进化论历经拉马克、达尔文、新综合论者和中性论者等数代人的努力,虽然取得了对进化及其机制的丰富认识,但同人们对发育与遗传的认识相比,存在明显的不足,其分子     

非达尔文自然选择—一种新的进化动力

本文从作者之一于１９９１年提出的基因表达的诱导和阻遏效应的数学模型中引出一种新的生物进化动力假说，即环境因素对基因表达的选择。此种选择机制在选择对象，选择水平和选择效应等方面都不同于达尔文提出的自然选择。所以称为非达尔文自然选择。它的理论依据是一个物种所含有的遗传信息量远远大于其整个形态结构所表现的遗传信息量以及基因表达的操纵子诱导和阻遏模型。本文认为一个祖先种的基因库可能含有许多可选择的基因表达系统，且基因库容量越大，就越有可能存在有序度越高的基因表达系统内形成有序度越高的形态结构。此外，本文还提出了绝对遗传型和相对遗传型概念，讨论了非达尔文自然选择与达尔文自然选择及中性进化的关系。     

达尔文主义与分子进化论

中性学说的出现是进化论发展的必然结果,它对在分子水平上生物进化的现象和规律的探索是有积极意义的。看来,中性突变是存在的,它是潜在的有利突变,是遗传的一种稳定机制。分子进化的主角不是中性突变,而是有利突变,有利突变通过自然选择,促进生物进化。生物进化是偶然性与必然性的统一。所谓基因突变的偶然性是,突变不考虑对生物生存是否有利或有害。偶然性为生物进化     

蛋白质超家族分子进化研究的一种新方法

选取丝氨酸蛋白酶超家族作为研究对象,采用ＳＳＡＰ算法从结构比较的层次上进行蛋白质超家庭分子进行化的研究,分子相同或相似物中酶和功能的演化,鼠类胰鼠白酶突变体结构的聚类关系以及不同抑制对牛β－胰蛋白酶天然结构的影响,探索了结构比较对于蛋白质工程中定点突变改造蛋白质结构与细胞以及蛋白质抑制剂设计等方面的指导作用,基于结构比较的方法是蛋白分子进化的一种新方法。     

科学家们发现一种新的碳分子

美国亚利桑那大学的物理学家达罗·霍夫曼和德国核物理研究院的博根·克罗奇迈尔最近共同发现了一种新的碳分子。这种碳分子由60个碳原子构成,这60个碳原子相互连接成近似球形的32面体。众所周知,碳是最普通的元素,它与其他元素形成的化合物是地球上最常见的物质。过去,人们仅知道有2种形式的纯碳,一种是石墨,另一种是金刚石。这次两位科学家创立了一种大量生产新型碳分子的简便方法,他们首先将石墨棒放入一个密封的容器,然后抽干容器中所有的空气,再使电流通过石墨棒,电     

“反”达尔文主义与非线性进化生物学

“反”达尔文主义与非线性进化生物学上海市肿瘤研究所研究员吕宝忠科学巨人达尔文在１８５９年创建的进化论不仅对生命科学，而且对整个自然科学乃至哲学都具有极深刻和极广泛的巨大影响，被誉为上世纪自然科学最伟大的三大发现之一。然而时代的局限性使达尔文进化论的两...     

一种新的比较分子/虚拟受体相互作用分析法

将虚拟受体的概念与比较分子场法有机结合起来, 得到了一种新颖的3D-QSAR研究方法: 比较分子/虚拟受体相互作用分析法(CoMPIA). 该方法通过定义受体原子探针并利用遗传算法优化探针在药物分子周围的最佳分布情况来找寻模型最优解和虚拟受体模式, 从而有效提高了建模的质量和结果的可解释性. 使用CoMPIA对31个经典甾体化合物进行了系统的QSAR研究, 所得模型拟合复相关系数R²、交叉检验Q2以及对测试集预测结果的均方根误差RMSEP分别为0.940, 0.868和0.502, 该结果优于多数文献报道.     

分子水平的非中性进化——cDNA编码区与非翻译区间的协调进化

蛋白质的cDNA分为编码区和非翻译区(Nontranslated region,简称NTR),NTR又分为5'NTR和3'NTR。根据分子进化的中性理论(Neutral theory of molecular evolution)。(1)NTR的进化速率应高于编码区;(2)编码区的进化变异中同义(Synonymous)变异应多于异义(Nonsynonymous)变异;(3)所有变异中转换(Transition)应多于颠换(Transversion)。鉴于我们近期发现的“造血细胞生成素的发育相关进化现象嘲”和“相互作用     

地洼学说——一种地壳演化理论

一、研究简史关于地壳演化规律问题,从十九世纪后半期起,已经受到许多大地构造学者的注意,并提出了不同的理论.这些理论都曾在生产实践运用中作出了贡献,为后来进一步研究这一问题提供了有用的依据. (一)地槽-地台说1859年,美国学者赫尔(J.Hall)开始提出了地槽的概念.至1873年,德那(J.D.Dana)把它加以确立.从这时起,关于地壳演化规律的看法,最有影     

进化生物学——生物学新的综合部门

六十年代初,随着分子生物学、发展生物学这些综合学科的产生,生物学新的综合部门——进化生物学也随之产生,并获得了最广泛的发展。它的形成过程反映出现代生物学认识某种反复的特点,值得科学方法论专家们特别重视。的确,存在过生物化学,如果把它变为分子生物学是不是更简单?也存在过胚胎学,如果把它变为发育生物学不是更简单吗?达尔文主义存在于它的现代形式——综合进化论中,如果把它变为进化生物学不是也更简单吗?     

一种新的酸雨

为了拯救美国的森林免于酸雨之害而作出的需耗资千百亿元的立法,可能指错了目标.从烧煤的发电站和工厂的烟囱中排出的含硫氧化物("SOX"),长期以来被认为是酸雨中最具伤害作用的成分,但最近对阿帕拉契亚山脉中的树木和德国的树木研究表明,从发电站、机动车辆、肥沃的田野和料场中散发出来的含     

一种进化人工神经网络的研究

目前,神经网络的进化设计主要集中在基于遗传算法和进化规划两种方法,采用进化策略的较少.对神经网络的遗传进化研究得最多最早,而近来越来越多的研究者支持采用进化规划并取得了好的结果,同时声称在理论上遗传算法并不适合于神经网络的设计.然而,在充分研究了这两者的     

分子进化研究上的争论及分子进化的意义

分子生物学的蓬勃发展,推动了生物学其他分支深化到分子水平,进化历史和进化机制的研究亦不例外,这就是分子进化这一新颖领域在进化生物学的涌现。迄今为止,分子进化研究取得的成就已大大推进了进化生物学的前进,如在分子钟假说基础上以分子数据构建的系统树,极大地改善了昔日主要依靠难以猎取的零星化石资料批论的系统树,而且可以构建基因系统树(这是传统的进化生物学无法做到的);更有意义的是,对进化机制的探讨,进入到一个新的水平。随着进化生物学研究的深入,对一些基本问题如生物进化主要动力的争论,愈来愈激烈也愈来愈深刻了。     

讥讽是一种进化技能

美国加州大学的神经生理学家凯瑟琳·冉金发现，讥讽是人类进化的一种生存技能，在社交方面具有重要的作用。如果你不能感知讥讽的话语，可能就表明存在某种心理或生理缺陷。她表示，患老年痴呆症或海马旁回受损的人通常没有感知讥讽的能力，因而对别人的讥讽也没有反应。这表明讥讽可能是促进人类进化及进化过程中形成的不可或却的东西。     

关于分子进化理论

本文阐述了现代分子生物学的成就对综合进化论的发展。生物分子顺序的分析,可以重建物种之间的亲缘关系。遗传密码的发现,证实了所有物种基本的生命机制的统一性。所有物种和个体的遗传和形态发生,都可归诸于基因组的信息。基因组的信息也是自然选择得以作用的唯一信息。核酸遗传信息向蛋白质传递的顺序的不可逆性,证明了“获得性状”是不可能的。分子生物学表明,生命体具有一种结构和机制以保证一模一样地复制自身结构以及复制在这个结构中发生的突变类型。由此可见,生命的特权是保守,进化不是生物的一个规律。有三类与选择进化论格格不入的理论:一是认为物理规律不能说明生命的存在和进化的活力论;二是认为进化不仅是生物的规律,而且是整个宇宙向上渐进的规律的泛灵论;三是以某些热力学家为代表的、主张地球上生命的出现和进化的必然性的泛灵论。如果接受选择的进化论,必须认为生命在地球上的出现,任何物种以及人类、社会的存在,都是在整个宇宙中只发生一次的事件,是完全不可预言的。     

分子进化与生物进化

分子与物种、恒速进化和非恒速进化、基因树与物种树，是分子进化中三个最基本的方面。如果不搞清其中的基本概念，就会产生一些纠缠不清的误解，挑起一些毫无意义的争论。     

分子进化中立说

在分子进化改变的产生中,机遇比自然选择更为重要。大多数突变在选择上都是中性的,既非有利又非不利。     

杂交瘤——一种新的强有力的生物技术

一种具有长远实际用途的新的生物技术现正在商业上产生较大的影响。杂交瘤(hybridoma)技术与重组DNA技术几乎同时发明出来,但前者是在后者的阴影里成长起来的。而且这种技术有希望使免疫学及其包括的一切研究领域和医学革命化。