人PSF蛋白结合长非编码RNA的筛选及鉴定

通过RNA亲和层析（RNA affinity chromatograph）,4种可能与人PSF（human polypyrimidine tractbinding proteinassociated splicing factor,hPSF）蛋白结合的长非编码RNA（long noncoding RNA,lncRNA）片段在人黑色素瘤细胞yusac细胞核RNA文库中被筛选得到. 它们分别定位于人内源性逆转座子L1PA16、MER11C、非编码基因MALAT1以及一个未知基因(unknown g     

cdk2反义RNA对乳腺癌细胞增殖及致瘤性的抑制作用

为了研究cdk2对乳腺癌细胞生长及cyclinA,cyclinB1和ckdl（cdc2)mRNA表达水平的影响,利用直接表达载体p XJ41-neo构建了表达cdk2反义RNA的重组载体,并用此载体转染了人乳腺癌细胞系Bcap37,获得了ckd2受到抑制的细胞模型Bcap37-CDK2AS,然后将Bcap37-CDK2AS细胞的生长能力及cyclinA,cyclinB1和cdk1 mRNA折水平与转入空载体的对照细胞进行了对比分析,结果显示,cdk2表达受到抑制时,细胞生长速率下降,根据测定出的细胞生长曲线,细胞培养至第7天时,细胞生长抑制率为64％,在流式细胞术的分析结果中,G1期细胞中的百分比从39％增加到47％,S期细胞由51％下降到39％,裸鼠接种的实验表明,Bcap37－CDK2AS的致瘤性明显减弱,在对cyclinA,cyclinB1和cdk1mRNA折分析中发现,Bcap37－CDK2AS中这3种基因的mRAN水平均有不同程度的下降,依据这些结果可以推测,ckd2反义RNA可使乳腺癌细胞生长及致瘤性受到抑制,并且cdk2表达的抑制将cyclinA,cyclinB和cdk14的表达水平。     

长非编码RNA以及与疾病发生的研究进展

调节性非编码RNA是指不被翻译为蛋白且具调节作用的功能性RNA分子,常见的具调控作用的非编码RNA(ncRNA)包括si RNA、miRNA、piRNA以及长链非编码RNA(lncRNA).lncRNA是目前调节性非编码RNA研究的热点.lncRNA与物种进化、胚胎发育、物质代谢以及肿瘤发生等有密切的联系,对其功能深入了解可促进细胞内基因表达调控网络的研究,也为临床疾病尤其是肿瘤的诊断和治疗以及新药的研发提供科学依据.本文主要对lncRNA的功能研究以及与疾病的发生研究现状进行探讨.     

长链非编码RNA:与植物发育和胁迫响应相关的新型调控因子

长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是指在基因组序列中长度大于200 nt,没有明显的开放阅读框,并且不具备蛋白编码能力的转录本.早期阶段,lncRNA一度被认为是遗传物质中的“转录噪声”.然而,随着越来越多的研究在不同物种中被报道,以及对lncRNA的功能研究逐渐深入,lncRNA已经逐渐成为基因组学领域的研究热点.该文系统地介绍了lncRNA的分类方法,总结了lncRNA参与调控植物发育与逆境胁迫响应的特征和机制,分析了lncRNA的主要研究技术和策略,并讨论了当前存在的主要问题以及未来的研究方向,旨在为后续的植物lncRNA研究及其在育种领域中的实际运用提供一定的指导依据.     

非编码RNA在肌肉生长发育中的调控作用研究进展

非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)在肌肉生长发育过程中发挥着重要的作用,参与调控骨骼肌干细胞的增殖、分化和肌纤维的肥大等过程.利用30篇文献综述了3类非编码RNA(长链非编码RNA、miRNA和环状RNA)在骨骼肌生长发育中的最新研究进展,旨在为肌肉疾病的治疗和农业动物生产性能的改良提供新思路.     

长链非编码RNA CASC15与肿瘤的研究进展

长非编码RNA(lncRNA)负责各种细胞功能,如转录和转化调节以及基因表达的变异。lncRNA CASC15是染色体6p22.3中一个长的异源性非编码RNA(lncRNA)位点。先前的研究表明,lncRNA CASC15与神经母细胞瘤和黑色素瘤等几种癌症的生物行为有关。本综述结合近期文献,总结lncRNA CASC15参与肿瘤的发生发展作用与分子机制,以期为肿瘤的诊断和治疗提供新的理论依据。     

与m6A修饰和免疫基因相关的长链非编码RNA在前列腺癌中的作用

前列腺癌是男性癌症死亡的第二大原因,前列腺癌患者五年生存率仅为30%。m6A修饰和长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)在前列腺癌的预后中起着非常重要的作用。因此,研究m6A与lncRNA之间的关系对改善前列腺癌患者的预后生存将有所帮助。本文研究了与m6A相关的lncRNA和与免疫基因相关的lncRNA,通过LASSO分析构建了基于六个lncRNA基因的预后模型,将前列腺癌样本分为高、低风险组,KM生存分析显示高风险组患者预后较差。通过单因素和多因素分析发现该模型可能是预测前列腺癌患者的独立因素。通过突变数据分析发现肿瘤突变负荷与该模型存在密切联系;免疫浸润分析得出高、低风险组中免疫细胞浸润存在差异;GO和KEGG分析结果发现m6A修饰主要富集在肌肉收缩、离子通道活性上。这些研究结论有望提高前列腺癌患者的预后生存率。     

正链RNA病毒基因组的复制

许多正链RNA病毒是严重危害人类健康的病原体,是造成经济植物动物死亡的致病因子.正链RNA病毒的基因组为正链RNA,其复制酶是依赖RNA的RNA聚合酶,非编码区是病毒基因组复制的主要调控位点,3’非编码区是复制酶的第一结合位点,正链RNA病毒基因组大多可能按copy-back模型进行复制.瘟病毒基因组的复制过程出现正链复制本的数量大于负链复制本的数量,这可能是以RF中间体的负链RNA为模板、正链RNA被置换的形式进行复制的结果.本文概述了HCV细胞培养系统的研究进展.     

番茄ACC合成酶基因的反义RNA—核酶嵌合基因植物表达载体的构建及对番茄的转

将克隆的番茄ACC合成酶基因的反义RNA－核酶联合的DNA序列用Hind Ⅲt KpnI切割后重组于植物表达载体pGA643中,用三亲融全导入农杆菌LBA4404中,采用叶盘法转化茄子叶,诱导出再生小植株,获得了卡那霉素的抗性植株。提取植物总DNA,用pGA643作探针,通过斑点杂交,已筛选出整合有外源基因的工程植株。为进一步研究该嵌合基因对ACC合成酶基因表达的影响及获得商品化的转基因番茄奠定了基础。     

聚乙烯亚胺-整合素配体复合物介导bcl-2反义核酸对结肠癌细胞的作用

目的:观察聚乙烯亚胺(PEI) -整合素蛋白的配体(Arg -Gly -Asp ,RGD)介导的bcl - 2反义核酸(antisenseoligodeoxynucleotide ,ASODN)对结肠癌细胞caco - 2的作用效果。方法:将阳离子复合物jetPEI-RGD与bcl- 2反义核酸混合形成ASODN -PEI-RGD三聚体复合物,转染caco - 2细胞。用台盼蓝拒染法计数活细胞,观察ASODN -PEI-RGD对caco - 2细胞的生长抑制作用,用流式细胞仪检测细胞的亚二倍体百分率,Heochst332 5 8染色观察细胞凋亡。结果:与ASODN对照组和jetPEI-RGD对照组相比,ASODN -PEI -RGD能够明显抑制caco - 2细胞增殖和诱导细胞凋亡(P<0 0 5 ) ,呈剂量和时间-效应关系。ASODN -PEI-RGD作用4 8h ,荧光染色可见大量的caco - 2细胞核固缩、核碎裂。结论:jetPEI-RGD介导的bcl- 2反义核酸能抑制caco - 2细胞增殖和诱导细胞凋亡。     

Effects of CIITA antisense RNA on the expression of HLA class Ⅱ molecules

To study the effect of the major histocompatibility complex class Ⅱ (MHCⅡ) transactivator (CIITA) antisense RNA on the expression of the human leukemia (HLA) class Ⅱ molecules, 5′ end cDNA sequence of CIITA gene was cloned, and antisense RNA expression vector pcDNA-Ⅱ was constructed. HeLa cells transfected with pcDNA-Ⅱ and pcDNA3 were induced by IFN-g for 3 d. The expression of HLA class Ⅱ molecules on HeLa/pcDNA-Ⅱ cells was significantly decreased, while it has no effect on the expression of HLA class Ⅰ molecules. This result suggests that the CIITA antisense RNA can inhibit the expression of HLA class Ⅱ molecules in HeLa cells. It also implies a promising approach to generate immune tolerance in graft transplantation.     

聚乙烯亚胺介导的生存素反义核酸提高肝癌细胞对化疗药物的敏感性

目的:探讨聚乙烯亚胺(polyethyleneimine,PEI)介导的生存素(survivin)反义核酸(antisense-oligonucleotides,ASODN)联合5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil,5-FU)、三氧化二砷(arsenic trioxide)或羟基喜树碱(hydroxycamptothecine,HCPT)对人肝癌SMMC-7721细胞增殖的抑制作用.方法:单独应用不同浓度的5-FU,As2O3,HCPT,或这些药物分别与survivin ASODN或PEI-ASODN联合应用,作用于SMMC-7721细胞,采用WST-8法检测SMMC-7721细胞的增殖抑制率,并计算药物作用的IC50.以金正均的概率和法进行协同作用分析.结果:不同浓度的5-FU,As2O3或HCPT联合PEI-ASODN(ASODN终浓度为0.125μmol/L)均明显降低这些化疗药物的IC50,提高SMMC-7721细胞对5-FU,As2O3或HCPT的敏感性,增敏倍数分别为36.1、4.16、18.8.金正均Q值法分析表明,5-FU,As2O3或HCPT与PEI-ASODN联合使用,均表现出协同作用.结论:PEI介导的低浓度的生存素反义核酸可提高人肝癌细胞SMMC-7721对5-FU,As2O3和HCPT的敏感性,PEI介导的生存素反义核酸与5-FU联合的作用效果最佳.     

P53和MDM2蛋白表达对肝细胞肝癌预后判断的意义

目的 :研究肝细胞肝癌中突变型P5 3和MDM2蛋白的表达对临床预后判断的意义。方法 :应用免疫组织化学方法 ,检测 72例原发性肝细胞肝癌手术切除标本突变型P5 3、MDM2蛋白的表达 ;与临床病理学指标和术后生存期进行分析比较。结果 :突变型P5 3蛋白阳性 2 8例(38 89% ) ,MDM2蛋白阳性 2 3例 (31 94 % ) ,二者阳性表达有相关性 (r =0 2 4 8,P <0 0 5 )。突变型P5 3、MDM2蛋白阳性表达病例生存率明显低于突变型P5 3、MDM2蛋白阴性表达病例 (P <0 0 1)。突变型P5 3和MDM2蛋白表达均阳性病例 13例 (18 0 6 % ) ,中位生存期的生存率最低。单因素及多因素分析显示 ,突变型P5 3蛋白表达、MDM2蛋白表达、肿瘤大小与中位生存期的生存率有关 ,MDM2是统计学上最有意义的独立预后指标 (P <0 0 0 0 1)。结论 :应用免疫组织化学方法检测突变型P5 3和MDM2蛋白的表达可作为原发性肝细胞肝癌预后判断的指标。     

Effects of CIITA antisense RNA on the expression of HLA class II molecules

To study the effect of the major histocompatibility complex class II (MHC II) transactivator (CIITA) antisense RNA on the expression of the human leukemia (HLA) class II molecules, 5′ end cDNA sequence of CIITA gene was cloned, and antisense RNA expression vector pcDNA-II was constructed. HeLa cells transfected with pcDNA-II and pcDNA3 were induced by IFN-γ for 3 d. The expression of HLA class II molecules on HeLa/pcDNA-II cells was significantly decreased, while it has no effect on the expression of HLA class I molecules. This result suggests that the CIITA antisense RNA can inhibit the expression of HLA class II molecules in HeLa cells. It also implies a promising approach to generate immune tolerance in graft transplantation.     

KLF4沉默与阿霉素诱导的DNA损伤协同抑制肝癌HepG2细胞的生长

探究KLF4沉默与经不同作用浓度阿霉素处理诱导的DNA损伤对肝癌HepG2细胞增殖凋亡的影响及其作用机制.应用RNA干扰技术,采用siRNA转染HepG2细胞以沉默KLF4基因.采用MTT法检测KLF4沉默前后对HepG2细胞增殖的影响,使用流式细胞术检测KLF4沉默前后对HepG2细胞周期变化影响,应用Western blot法检测转染前后HepG2细胞中KLF4蛋白及细胞周期相关蛋白表达变化.Western blot检测到高浓度的阿霉素促进KLF4的表达,并且低浓度的阿霉素可使得细胞停滞在G2/M期,高浓度的阿霉素则使部分细胞凋亡(19.31%).将KLF4沉默后,发现细胞生长变缓,低浓度的阿霉素处理后,细胞随时间增加而出现更多的细胞凋亡;高浓度的阿霉素处理后,细胞数明显减少,更多的细胞发生凋亡(28.89%),且在KLF4沉默前后均发现低浓度阿霉素促进p53与p21表达,高浓度阿霉素抑制其表达.阿霉素诱导的DNA损伤可提高KLF4的表达,KLF4依赖于DNA损伤激活的p53促进p21的表达,进而引起G1/S期细胞周期阻滞.沉默KLF4与阿霉素诱导的DNA损伤可协同抑制肝癌细胞的增殖、促进凋亡,其在肝癌细胞 HepG2中扮演十分重要的角色.     

Effects of CDK4 antisense RNA on Human breast cancer cell proliferation and expression of cyclinDl, cyclinE and CDK2

The role of CDK4 in human breast cancer cell proliferation and expression of cyclinD1, cy-clinE and CDK2 has been investigated using inhibition of CDK4 expression by antisense RNA. When CDK4 expression was inhibited, the rate of cell proliferation and tumorigenecity decreased apparently. This indicates that CDK4 plays an important role in formation and development of breast tumor. The results of Northern blot analysis showed that the levels of cyclinDl and CDK2 mRNAs changed slightly whereas the level of cyclinE mRNA decreased obviously. It is suggested that the expression of CDK4 is necessary for induction of cyclinE expression. Thus, inhibition of CDK4 expression affects not only the role of CDK4 itself but also the role of other genes.     

Effects of CDK4 antisense RNA on Human breast cancer cell proliferation and expression of cyclinD1, cyclinE and CDK2

The role of CDK4 in human breast cancer cell proliferation and expression of cyclinD1, cyclinE and CDK2 has been investigated using inhibition of CDK4 expression by antisense RNA. When CDK4 expression was inhibited, the rate of cell proliferation and tumorigenecity decreased apparently. This indicates that CDK4 plays an important role in formation and development of breast tumor. The results of Northern blot analysis showed that the levels of cyclinDl and CDK2 mRNAs changed slightly whereas the level of cyclinE mRNA decreased obviously. It is suggested that the expression of CDK4 is necessary for imction of cyclinE expression. Thus, inhibition of CDK4 expression affects not only the role of CDK4 itself but also the role of other genes.     

螺旋CT双期增强扫描诊断原发性肝细胞癌的临床分析(附42例报告)

目的探讨原发性肝细胞癌的螺旋CT双期增强特征及其诊断意义。方法回顾性分析42例原发性肝细胞癌螺旋CT双期增强扫描表现。结果42例病灶,平扫呈低密度或等密度;双期增强40例有强化,2例无明显强化,病灶强化密度呈＂早进早出＂的变化特点。结论螺旋CT双期扫描可充分反映原发性肝细胞癌的特征,对肝癌的检出和定性准确率的提高有重要价值。