中位芳基吡唑卟啉荧光量子产率与分子结构的定量关系研究

化合物的发光性能主要由该物质的分子结构确定.卟啉作为重要的光化学和光生物学化合物一直备受关注.从实验室合成的中位芳基吡唑卟啉的分子结构描述参数出发,着重考察了前线轨道能级、旋转半径等参数与卟啉荧光量子产率之间的关系,并建立了各参数与该类化合物荧光量子产率之间的线性模型,从理论上定量阐述了不同取代基对化合物荧光量子产率的影响.     

含氮杂环衍生物的摩擦学定量构效关系研究

以从头计算Hartree-Fock分子轨道法计算了苯并恶唑、苯并咪唑、苯并噻唑、二氢噻唑以及哌嗪5种母核的17种含氮杂环衍生物润滑油添加剂的量子化学结构参数,通过多元线性回归分析研究了这些分子的摩擦系数与量子化学结构参数之间的关系,建立了具有良好拟合效果和预测能力的摩擦学定量构效关系模型.结果表明,含氮杂环衍生物的总能量和偶极矩是影响其减摩性能的主要量子化学结构参数,并对减摩机理进行了探讨.     

苯的硝基衍生物结构与活性相关性研究

应用量子化学ＣＮＤＯ／２法计算了２４种苯的硝基衍生物的最低空轨道能ＥＬＵＭＯ。用所得ＥＬＵＭＯ代替半波还原电位Ｅ１／２进行定量结构活性相关性（ＱＳＡＲ）研究，得到满意结果。     

亲脂性叶酸拮抗剂喹唑啉类化合物的三维定量构效关系研究

在亲脂性叶酸拮抗剂喹啉类化合物的ＣｏＭＦＡ方法的研究中,尝试引入与化合物结构相关的理化参数与ＣｏＭＦＡ模型的建立。用该型预测了４个新化合物的活性,根据目前得到的其中２个化合的知则定结果,预测与测定值基本符合,初步显示了该模靠性。     

氯代苯对水生生物毒性的定量构效关系研究

在烷烃分子距离－边数矢量（ＭＤＥ）的基础上,定义并计算了氯代苯的结构参数。借助多元线回归技术建立 ＭＤＥ矢量与氯代苯类对水生生物毒性的定量结构－毒性相关关系（ＱＳＴＲ）模型,并运用所建模型对外部样本的毒性进行了预测,结果表明模型具有较强的预测能力。     

吡唑类转化生长因子-β受体激酶抑制剂的定量构效关系研究

用分子力学、分子模拟退火动力学、量子化学等方法对转化生长因子-β受体激酶（TβR-Ⅰ）的取代吡唑类抑制剂进行了结构优化．用遗传算法（GFA）并结合多元线性回归方法（MLR）,对该类抑制剂进行了定量构效关系研究,筛选出了影响抑制剂活性的主要因素,建立了定量构效关系方程（QSAR）.结果表明,分子的总偶极矩的Y分量的平方（μy）^2、分子中喹啉环上的氮原子的净电荷QN3、Jurs的相对负电荷表面积RNCS描述等是影响该类化合物抑制活性的主要因素．所得模型对该类化合物关于Tim-Ⅰ的抑制活性有较好的预测效果（R^2=0．834,Rcv^2=0．575,s=0．243,F=13．439）．     

分子电距矢量(MEDV)用于肽模拟物的定量构效关系研究

利用电距矢量(MEDV)表征肽模拟物的分子结构,并与包含N、0、S杂原子,饱和与不饱和键或共轭体系的二肽分子的生物活性相关.利用多元线性回归方法,构建了两组二肽分子的定量构效关系(QSAR)模型.对于58个二肽组,模型相关系数和均方根误差分别为R=0.842 3和RMS=0.535.对于48个二肽组,R=0.819 9,RMS=0.357.为了检验QSAR模型的预测能力,对两个二肽组数据集进行了交叉校验(CV).采用LOO法即每次从n个样本中抽出n-1个样本建立0SAR模型继而用该模型去预测余下的1个样本的生物活性的方法.对于58肽组,58次预测的生物活性与原实验活性之间的R=0.790 6,RMS=0.608,而48肽组的R=0.742 2和RMS=0.417.MEDV只利用了分子二维拓扑图中元素电负性和相对化学键长的有关信息,不需要任何三维结构知识或分子校准步骤或有关物理化学性质的信息.此外构建QSAR模型时只利用MLR方法而不需应用主成分回归或偏最小二乘技术.方法简便快速,模型稳定有预测能力.     

苯砜基羧酸酯类化合物急性毒性的QSAR研究

采用密度泛函理论方法,在B3LYP/6-31G(d)水平下,计算了35种苯砜基羧酸酯化合物的量子化学参数.采用统计学软件Statistic 6.0进行多元线性回归,得到描述此类化合物对发光菌急性毒性的预测模型-lgEC50=-0.01×P+1.92×q1-5.63×q10-0.087×μ+2.34,模型的相关性分析如下R=0.92,r2adj=0.82,F=40.96,q2=0.837.得到以下结论苯砜基羧酸酯类化合物急性毒性随着亲水性的增强而减弱;分子越大,毒性越小;取代基的电负性越大,毒性越小.该研究为探讨化合物急性毒性的机理起到借鉴作用.     

三苯基丙烯腈衍生物的构效关系研究

应用分子力学方法MM 和半经验量子化学AM1法得到了22种三苯基丙烯腈衍生物的优势构象,利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构参数和几何结构参数,采用多元线性回归分析和人工神经网络误差反传算法,将这些参数和三苯基丙烯腈衍生物在0℃下与小牛子宫雌激素受体间的亲和力相关.结果表明,三苯基丙烯腈衍生物在0℃下与小牛子宫雌激素受体间亲和力大小与X位羟基指示数、1号碳原子与5号碳原子间键级、15号碳原子与16号碳原子间键长和衍生物疏水性参数的相关性较好,建立了22种三苯基丙烯腈衍生物的构效关系式.     

三唑类农药对大型蚤急性毒性二维QSAR研究

测定了16个三唑类农药对大型蚤（D．magna）的48h急性运动抑制毒性活性pI50（-lg EC50）,并结合计算得到的各种量子化学参数建立了相应的QSAR模型,为预测具有相似结构化合物的pI50提供理论依据;同时希望通过建立各种预测模型,能够初步了解该类化合物对大型蚤的致毒机制,并从分子结构角度为设计合成高效低毒农药提供科学依据。     

硝基苯类化合物对隆线蚤急性毒性的构效关系

摘要：采用标准实验方法测定了21种硝基苯类化合物对隆线蚤(Daphnia carinata)的48h半致死浓度值,结果lg(1／LCso)的范围在3．49—5．40之间;采用量子化学方法MOPAC6．0软件计算了分子最低空轨道能ELUMO,,分子最高占有轨道能EHOM0、范德华面积Svdw和偶极矩卢;通过毒性与结构参数的线性回归分析,得到方程lg(1／LC50)=一1．86ELUM0—0．44EHOM0—0．301gP一2．13(R。：0．85),且模型拟合效果很好．结果表明：所研究的化合物对隆线蚤的毒性主要与分子的轨道能有关;硝基苯类可以作为亲电试剂,在细胞内发生还原反应,从而产生潜在毒性更强的亚硝基化合物,而部分含有氨基和羟基的化合物,其毒性亦与疏水性有关．     

应用多维标度法预测硝基苯化合物的生物毒性

将6种基团参数用于硝基苯化合物取代基结构参数化,应用林知己夫多维标度法,从一组对象之间的相似性度量或非相似性度量出发,求出这组对象在某低维空间中的标度对它们进行了定量构效关系研究,同时将所得的结果映射到二维空间以得到更直观的图像．研究结果表明,该方法能将样本数分成明显的高活性区、中活性区及低活性区三个部分,与实验结果完全吻合．     

一溴代烷的MCI与部分物理性质的定量关系研究

用自编程序计算了２４种一溴代烷的１￣４阶共２０种分子连接性指数（ＭＣＩ）及价分子连续性指数（ＶＭＣＩ）,用逐步咽归法将其与标题化合物的密度折光度和沸点等物理性质相关分析,得到了１０个有显著意义的定量结构－性能关系式（ＱＳＰＲ）,各方程的预报值与实验值符合得较好,表明这些关系不仅从分子水平上较好地描述了标题化合物的定量构效关系,而且对该类化合物中未知物的上述物理化学性质的预报有实际意义。     

分子的结构矩阵及其与物性的相关性研究

继分子拓扑图的距离矩阵、邻接矩阵之后,创建了分子的结构矩阵。借助于分子的结构矩阵建立了预测化合物性质的数学模型,并预测了醇类化合物、手性有机酸的色谱保留指数以及氯代苯的辛醇/水分配系数。研究表明,分子结构矩阵既适合于链状化合物性质的预测,也适合于某些母体为单环和手性化合物性质的预测,与分子的距离矩阵和邻接矩阵相比具有较高的结构选择性。     

基于QSAR和PCA方法的硝基芳烃综合毒性评价

化学品的风险评价与管理应该关注基于多种生物体效应的综合毒性。为了评价毒性数据稀缺化合物的综合毒性,以50种硝基芳烃为研究对象,收集了它们的多种生物毒性数据,建立了稳健的定量结构活性相关(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型,预测缺失毒性数据,解释了硝基芳烃的致毒机理——硝基芳烃与生物受体分子的亲电反应活性是决定其毒性的主要因素。然后应用主成分分析(principle componentan alysis,PCA)方法对基于QSAR模型计算获得的50种硝基芳烃的各种生物毒性数据进行分析,计算综合毒性因子(integrated toxicity index,ITI),对综合毒性因子进行QSAR分析,得到可直接由硝基芳烃结构参数预测综合毒性因子的单参数QSAR模型。结果表明,QSAR与PCA方法的结合可以成功地评价和预测硝基芳烃的综合毒性。     

Combining docking and comparative molecular similarity indices analysis （COMSIA） to predict estrogen activity and probe molecular mechanisms of estrogen activity for estrogen compounds

Estrogen compounds are suspected of disrupting endocrine functions by mimicking natural hormones, and such compounds may pose a serious threat to the health of humans and wildlife. Close attention has been paid to the prediction and molecular mechanisms of estrogen activity for estrogen com- pounds. In this article, estrogen receptor a subtype （ERa） -based comparative molecular similarity indices analysis （COMSIA） was performed on 44 estrogen compounds with structural diversity to find out the structural relationship with the activity and to predict the activity. The model with the significant correlation and the best predictive power （R^2= 0.965, Q^2 LOO： 0.599, R^2 pred ： 0.825） was achieved. The COMSIA and docking results revealed the structural features for estrogen activity and key amino acid residues in binding pocket, and provided an insight into the interaction between the ligands and these amino acid residues.     

Claisen-Schmidt反应合成的查耳酮类化合物及其生物活性研究进展

查耳酮类化合物是一类自然分布广泛、药理活性多样的重要物质,一直是化学及药物学家研究的热点之一.Claisen-Schmidt反应作为合成及修饰查耳酮小分子的主要方法被广泛运用,以简单的芳香醛和芳香酮缩合即可得到结构多样的查耳酮分子,该方法具有操作简便、反应条件温和等特点.以查耳酮活性为分类,综述了近年来以Claisen-Schmidt反应合成的查耳酮类化合物及其生物活性研究进展.整理了该类化合物抗癌、抗炎、抗菌、抗氧化等生物活性,并发掘提出了其生物活性构效关系,为后续查耳酮类化合物研究开发提供参考.