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将小鼠Cacng2基因的编码区与EST数据库进行同源性分析,得到一个与小鼠Cacng2基因在 435 bp中有 75%同源的 EST(GenBank: W29095).在该 EST中设计引物与 cDNA文库载体臂上引物行巢式 PCR和 RACE反应,在人脑前叶皮质 cDNA文库和人脑 Ready cDNA中获得 cDNA序列 1545 bp,其中包含一个 948 bp的可读框,编码 315个氨基酸.该可读框经确证命名为 CACNG3.CACNG3基因与大规模测序中定位于16p12-p13.1的BAC克隆AC004125完全一致,从而将该基因定位于16p12-p13.1,并由此获得它的基因组结构,编码区由4个外显子组成.经RT-PCR分析,CACNG3在成人脑和胎脑有表达.运用PCR-SSCP在视网膜色素变性家系、视网膜色素变性伴耳聋和癫痫家系进行突变检测,未检测到突变. 相似文献
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蛋白质结构中某些氨基酸的氧化和还原是生物体内对蛋白功能的一种调控方式.甲硫氨酸(Met)被氧化则变为甲硫氨酸亚砜(Met(O)),它可导致所在蛋白质的生物学活性降低或丧失,但肽-甲硫氨酸亚砚还原酶(Peptide methionine sulfoxide reductase, msrA)则可使甲硫氨酸亚砜还原为甲硫氨酸,使其所在蛋白质重新恢复活性.为了研究人体中Met氧化还原的机制,以牛msrA cDNA序列为信息探针,筛选人EST数据库,依据若干同源EST的信息从人cDNA分子库中克隆到一个长1255hp的人MSRA cDNA.该CDNA包含一个长705 bp的可读框,它编码了 235个氨基酸残基.同源性比较表明,该基因与牛和大肠杆菌的msrA基因的氨基酸一致性分别为88%和61%.表达谱分析发现,该基因在人体大多数组织中均有一条长约1.6kb的转录本,并在肾中呈高表达.应用辐射杂种细胞株定位系统(radiation hybrid mapping panel, RH mapping)将该基因精确定位在人染色体8p22~23区带的DSS518和D85550位标之间,由于此前已有Keratolyticwintereryth 相似文献
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耐旱植物厚叶旋蒴苣苔BDN1脱水素基因的克隆及表达特性分析 总被引:8,自引:0,他引:8
根据已知植物脱水素基因保守区域设计引物,采用RT-PCR方法从耐旱植物厚叶旋蒴苣苔的总cDNA中扩增出一个500bp的与植物脱水素基因同源的序列。结合5’RACE获得了植物脱水素基因家族一个新成员BDN1的全长cDNA(1148bp)。Southern杂交分析表明,BDN1基因在厚叶旋蒴苣苔基因组中以单拷贝形式存在,Northern杂交结果表明,该基因的表达受干旱,寒冷及ABA的诱导。推测该基因与 相似文献
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在胚胎性横纹肌肉瘤中呈下调表达的新基因HUMCyr61的分离与克隆 总被引:1,自引:0,他引:1
横纹肌肉瘤是软组织中较常见的恶性肿瘤,它包括胚胎性横纹肌肉瘤、腺泡型横纹肌肉瘤和多形性横纹肌肉瘤3种类型.其中,胚胎性横纹肌肉瘤常见于小儿,多侵犯眼眶、鼻咽部、泌尿生殖道、胆道、腹膜后和四肢等部位.恶性程度比多形性横纹肌肉瘤高,预后极差,极易复发,晚期常发生转移.我们在同源扩增筛选人类新型细胞因子基因的过程中,从人胚胎骨骼肌cDNA分子库中分离到一个新的cDNA片段(BA_1克隆).经在Genbank库中查新,发现它与Genini等人1996年注册的一个EST序列(长304bp,Genbank注册号Z50168)呈100%同源.他… 相似文献
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人纺锤体素cDNA 的克隆定位和组织表达谱分析 总被引:2,自引:0,他引:2
纺锤体是细胞有丝分裂及配子成熟分裂过程中特有的亚细胞结构,它的结构和功能物正常与直接影响生物个体的发育、分化、生长和繁殖、最近的研究表明,小鼠Mos/MAPK途径对纺锤体的作用与纺锤体素蛋白的磷酸化过程密切相关,采用同源筛选方法从人睾丸CDNA分子克隆到一个与小鼠纺锤体素基因编码序列高度同源,长1929bp的cDNA片段,计算机软件分析发现,该cDNA的271-984nt是一个完整的开放阅读框(O 相似文献
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水稻减数分裂相关基因OsDMC1的克隆 总被引:2,自引:0,他引:2
酵母DMC1基因是一个在减数分裂前期 I表达的减数分裂特异基因,其产物是减数分裂同源染色体配对所必需的.根据在酵母Dmc1与拟南芥AtDmc1中保守的氨基酸motifs合成的简并性引物,以cDNA作模板,通过套式PCR(nested PCR)和RACEs克隆了水稻中酵母DMC1的同源基因 OsDMC1.OsDMC1全长的 cDNA是 1348 bp,编码 344个氨基酸组成的多肽(OsDmc1). OsDmc1与 Dmc1和AtDmc1的氨基酸序列一致性分别是51.8%和81.7%.OsDMC1在生殖器官中表达量较高,在根中有少量表达,而在叶和幼芽中不表达. Southern blot分析结果表明水稻基因组中有两个拷贝的 OsDMC1. 相似文献
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一个与人鼻咽癌相关新基因的克隆 总被引:16,自引:0,他引:16
利用高密度cDNA微阵列表达检测技术,筛选出在成人正常鼻咽组织高表达而在成人咎咽低分化鳞状细胞癌组织中低表达的ESTN27741,用RT-PCR技术证实之,进而由该EST克隆出长度为1096bp的新基因,利用生物信息学分析发现,该序列有含有完整的阅读横架,编码256个氨基酸,在5'端起始密友子上游有终止密友子TAA,3'端有加尾信号AATAAA和poly A尾,该新序列在非宙余的核酸序列数据 比 相似文献
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应用抑制差减杂交法分离水稻幼穗发育早期特异表达的基因 总被引:16,自引:0,他引:16
以水稻茎尖分生组织为对照群体,幼穗分生组织为目标群体,进行抑制差减杂交。用经过SAM cDNA差减的Pb/Sb cDNA群体构建了一个差减文库,通过差示筛选鉴定了40个在Pb/Sb中特异表达或表达增强的候选克隆,Northern杂交验证,至少40%的候选克隆代表了在Pb/Sb中特异表达或表达增强的基因,同时,相当一部分克隆为你荐度转录本。对40个cDNA克隆单向测序后,与GenBank中同源序列进 相似文献
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用RT-PCR方法从猪脾脏中分离到于段1425bp的DNA片段,该片段编码免疫球蛋白基因。经全序列分析证明此片段与前人报道的序列有较高同源性,其C区属于猪Igγ链基因亚类3。用EcoRI和NsiI切点将该片段切焉插入pET-3b(NSEB)(-_中,表达出约52ku的蛋白质,表达量约为21%。 相似文献
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烟草花器官实体基因的部分序列及其表达 总被引:1,自引:1,他引:0
以烟草花芽的cDNA一链为模板扩增出3个花器官实体基因的同源序列NTSQUA4,NTSQUA12和NTSQUA15。这3个克隆都包含有典型的花器官实体基因所拥的的结构域:I区,K区和C末端区。同A类基因AP1和SQUA的氨基酸序列相比,这3个克隆有50%-60%的残基与它们相同。 相似文献