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相似文献
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1.
利用抑制性消减杂交(Suppressive subraction hybridization,SSH)分离本实验室获得的一株水稻矮化突变体dwarf69与其野生型对照品系特光矮-2(Rryza sativa,TGA-2 indica)间表达有差异的cDNA片段,分别以dwarf69作为驱赶子,TGA-2为检测子,以及以dwarf69作为检测子,TGA-2为驱赶子建立了两个差异表达cNDA文库,分别代表在TGA-2和dwarf69中特异表达的cDNA,经反式Northern检测这两个文库共得到10个阳性克隆。  相似文献   

2.
水稻甘油醛—3—磷酸脱氢酶cDNA结构分析和分子进化   总被引:1,自引:0,他引:1  
甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)是糖代谢中的核心酶之一,首次完成了水稻中编码此酶CDNA1325bp的全顺序分析,它含有1014bp组成的完整的编码区,编码一个由337个氨基酸组成的肽链,与来源于其他77个牿上的GAPDH的同源性比较显示基因间核苷酸同源性高达70%,与美洲龙虾GAPDH三结构比较说明水稻GAPDH有高度保守性可形成相似的构象,并模建了水稻GAPDH的空间结构。此外,对17种不  相似文献   

3.
用~(32)P标记的互补DNA探针进行分子杂交是基因重组和分子克隆中常用技术,然而由于~(32)P的半衰期短,从而为供应和保存带来不便,致使这一技术的应用受到一定限制。近年来国内外均十分重视研究应用非同位素标记DNA探针的技术。我们用Biotin—11—dUTP(Bethesda Research Laboratories)以缺口平移(Nick translation)标记了pST-B14和pST-B5 DNA中的PSTV cDNA插入顺序,制备出生物素标记的DNA  相似文献   

4.
用盐酸胍法和寡聚(dT)-纤维素亲和层析法从人胚肾细胞中提取了poly(A)-RNA,该poly(A)-RNA经麦胚无细胞体系测定其体外翻译活性,~3H-亮氨酸掺入量为空白对照的11.5倍。以此poly(A)-RNA为模板,合成了人胚肾细胞总cDNA,并用多聚物加尾法,与pUC19质粒重组,转化到E, Coli JM107中,进行分子克隆,其转化效率约为2×10~4克隆子/μg cDNA。  相似文献   

5.
为检测黄瓜花叶病毒的存在,应用Northernblot,将提取的黄瓜花叶病毒RNA样品,经甲醛变性凝胶电泳分离,使RNA解离成单链,然后用上行毛细管转移法,将凝胶上的单链RNA片段转移到尼龙膜上.经适当洗涤、干燥后,在烤箱中80℃保温2h,用于杂交.以带有黄瓜花叶病毒目的片段的细菌质粒制备DNA探针,用放射性同位素32P标记探针DNA,100℃变性处理用于杂交的探针,然后进行杂交.结果表明,在杂交膜上显示与特异性探针结合的阳性RNA条带,检测到了黄瓜花叶病毒的存在.  相似文献   

6.
以杂交狼尾草叶片为材料,用0.05 mol NaOH溶液在沸水浴中加热处理10 min,进而用pH3.0的TE溶液进行中和获得DNA提取液,并用该DNA提取液为模板进行RAPD-PCR和SSR-PCR扩增.结果显示:用该方法提取的DNA与常规CTAB法提取的DNA质量相当,可用于以PCR技术为基础的DNA分子标记分析与96孔板技术相结合,可以实现DNA高通量提取.  相似文献   

7.
通过对平颏海蛇毒腺cDNA文库的随机测序和PCR筛选,克隆得到两种分别长为1309和1307bp的编码半胱氨酸丰富毒蛋白(cysteine-rich venom protein,CRVP)的全长cDNA序列。这两种crvp基因同源性为97%,分别编码238和199个氨基酸残基,其中包括一段相同的由19个氨基酸残基组成的信号肽。氨基酸序列分析表明,这两种CRVP蛋白与蜥蜴helothermine毒素蛋白以及台湾饭铲倩CRVP毒蛋白高度同源,而且具有半胱氨酸丰富分泌蛋白(cysteine-rich secretory protein,CRISP)家族的典型结构特征。  相似文献   

8.
9.
为克隆和筛选肝癌特异表达基因.应用抑制消减杂交技术对肝癌及癌旁组织进行消减杂交,产物PCR扩增后,进行克隆.共得到1820个克隆,1776个克隆有100~800bp的插入片断,阳性率达98%,说明人肝癌组织特异表达cDNA消减文库构建成功,同时我们对cDNA克隆进行测序,证明这些克隆的功能是和肝癌的发生高度相关的.抑制消减杂交是克隆特异表达基因的有效方法.  相似文献   

10.
利用薄层层析和气相色谱测定12株细胞的脂肪酸组份,通过UPGMA聚类分析绘制其树状图谱;用双相薄层层斫获得特征性的极性酯图谱;经光敏生物素非放射性标记DNA进行分子杂交测定实验菌株间的DNA同源值,一致的结果表明,12株菌株应分别划归短状杆菌属的3个种,其中有2上被使命名为新种即Brachybacterium conglomeratumIFO15472^T和B.paraconglomeratumI  相似文献   

11.
利用反转录多聚酶链式反应(RT-PCR)技术克隆了褐飞虱羧酸酯酶基因编码区的cDNA片段,并进行了序列测定.结果表明,所克隆到的cDNA片段长度为396 bp,经BLAST查找比对发现,该片段所编码的氨基酸序列与来自铜绿蝇、家蝇、沟鼠、黑腹果蝇、线虫和埃及伊蚊的羧酸酯酶的片段存在高度同源性.Northern杂交分析显示,在褐飞虱取食抗性水稻后,羧酸酯酶基因表达水平明显升高.以上结果表明,羧酸酯酶基因的表达受抗性水稻的诱导,该基因在有毒化学物质解毒及增强褐飞虱对抗性水稻的耐受性方面可能起着重要作用.  相似文献   

12.
猪生长激素cDNA基因的改建   总被引:2,自引:0,他引:2  
为了将猪生称激素cDNA基因在表达后能一步纯化获得表达产物,对于来自质粒的猪生长激素cDNS基因通过PCR技术进步了改建,进一步的序列分析表明,与GenBank登录的序列不同,改建后的基因不带有突变。  相似文献   

13.
山羊与岩羊间特异RAPD片段分析   总被引:1,自引:1,他引:0  
在两组40个随机引物中,筛选出16个重复性好的多态引物,对山羊与岩羊闻RAPD片段分析表明,16个引物扩增出67条带,其中54条带表现多态,多态率80.60%,山羊各群体共有条带为23条,山羊和岩羊共有条带为13条,岩羊有4条特异带,不同引物所扩增出的片段在各群体中分布频率不同.岩羊特异RAPD片段,OPA-10724的序列与人类全基因组比较,同源的短序列较多,最太长度为86bp,唯有30bp的长度与绵羊ZFZ基因和牛ZFY基因内含子同源。  相似文献   

14.
15.
谷胱苷肽转移酶是昆虫体内重要的解毒酶系之一,研究水稻害虫褐飞虱的谷胱苷肽转移酶基因在褐飞虱与水稻互作中的表达变化,可为有效防治褐飞虱提供新的理论依据。利用反转录多聚酶链式反应(RTPCR)技术克隆了褐飞虱谷胱苷肽转移酶基因编码区的eDNA片段,并使用Northern杂交技术检测了该基因对两种不同抗性水稻的分子反应。结果表明,所克隆到的eDNA片段长度为201bp,该片段所编码的氨基酸序列与来自大劣按蚊、细小按蚊、冈比亚按蚊、果蝇和木瓜果实蝇的谷胱苷肽转移酶的片段存在高度同源性。Northern杂交显示,在褐飞虱取食抗性水稻后,谷胱苷肽转移酶基因表达水平明显升高,但褐飞虱取食感虫水稻TN1后,该基因的表达水平没有明显变化。  相似文献   

16.
介绍用SEM观察土壤中硅藻的方法,并对土壤的元素组成进行了EDX分析,对土壤的中Mg,P、S,Fe,Ni等元素对硅藻种类的影响作了简单探讨。  相似文献   

17.
城市有机污染对嘉陵江南充段硅藻多样性影响   总被引:1,自引:0,他引:1  
采集了嘉陵江南充“段5个城市15个采样点藻类样品,研究城市有机污染对硅藻多样性的影响.结果表明:有机污染程度的增加,导致硅藻物种数减少、细胞密度增加、多样性指数值和均匀度指数值降低;硅藻群落相似性聚类图表明,15个采样点根据有机污染程度及水质状况分成3类,B-7.5由清洁水体的LZ1,LZ3和NB1组成,C-7.5由污染较严重(α-中污)的NC2和NC3组成,A-7.5主要由污染较轻(β-中污或微污)的LZ2,NB3,NC1等10个采样点组成;聚类结果与其它指标及实际观测的水环境状况相吻合,较好地揭示了有机污染对硅藻多样性的影响.  相似文献   

18.
从GenBank数据库查询发表的鱼类转铁蛋白cDNA或基因序列,根据铁离子结合转运功能位点,设计并合成了两对引物P1、P4以及P2、P3,克隆出鲫血清转铁蛋白cDNA中的核心片段,长度为866bp。再根据克隆出的核心片段分别设计上游及下游两对引物P5、P6以及P7、P8,随后用RACE方法分别克隆出鲫血清转铁蛋白cDNA的5’端(787bp)和3’端(1081bp)以及全长cDNA,最后用计算机程序排列出鲫血清转铁蛋白全长cDNA,长度为2444bp。比较了12种鱼类血清转铁蛋白cDNA序列的同源性。  相似文献   

19.
从疣粒野生稻cDNA扩增文库中随机挑取500个噬菌斑,通过载体环化,选择120个菌样进行测序,获得的95条序列,分别采用Blast、ORFfinder、UniGene和EntrezGene系统等软件进行序列分析,结果为:与栽培稻日本晴序列比较匹配碱基数>400 bp的占27.37%;确定可阅读框(>100 bp,具有起始和终止密码子)的占90%;与拟南芥的功能基因比较,相似性大于60%的有46个;确定功能、代谢过程和编码蛋白部位的cDNA片段分别有34个、31个和31个.  相似文献   

20.
凤尾菇线粒体DNA片段的克隆与同源性分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
将Sau3AI部分酶切的凤尾菇线粒体DNA插入质粒载体的pBS^+的BamHI位点,然后以凤尾基线粒体DNA为探针与重组质粒DNA进行斑点杂交,筛选到6个阳性克隆,选取其中2个阳性克隆的插入片段分别与来6个属的13个食用菌品种的线粒体DNA进行Southern杂交,其结果显示两探针能与所有测定的侧耳属品种的线粒体DNA杂交,并具多态性,但与其它属线粒体DNA只有不同程度的杂交,两探针中H4的杂交范  相似文献   

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