| GenExtractor:一个基于Web的生物信息挖掘系统 |
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| 引用本文： | 忻健,陆巍,朱景德,王翼飞. GenExtractor:一个基于Web的生物信息挖掘系统[J]. 应用科学学报, 2005, 23(1): 75-81 |
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| 作者姓名： | 忻健 陆巍 朱景德 王翼飞 |
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| 作者单位： | 1. 上海大学理学院, 上海 200444;2. 上海市肿瘤研究所, 上海 200032 |
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| 摘 要： | GenExtractor是一个新的基于Web的生物信息挖掘系统,该系统通过Internet对网上生物学数据库中的生物序列数据和基因表达数据进行挖掘,在指定的人染色体区域内搜寻具有特定功能的基因.该系统可为分子生物学家寻找候选基因、收集相关信息等提供有效帮助.通过对人DNA修复基因的查寻,验证了该系统的实用效果.
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| 关 键 词： | 生物学数据库 向量空间模型 数据挖掘 文本分类 Web |
| 文章编号： | 0255-8297(2005)01-0075-07 |
| 收稿时间： | 2003-10-31 |
| 修稿时间： | 2004-02-16 |
The GenExtractor: A Web-Based Bioinformation Mining System |
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| XIN Jian,LU Wei,ZHU Jing-de,WANG Yi-fei. The GenExtractor: A Web-Based Bioinformation Mining System[J]. Journal of Applied Sciences, 2005, 23(1): 75-81 |
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| Authors: | XIN Jian LU Wei ZHU Jing-de WANG Yi-fei |
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| Affiliation: | 1. School of Science, Shanghai University, Shanghai 200444, China;2. Shanghai Cancer Institute, Shanghai 200032, China |
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| Abstract: | GenExtractor is a new Web-based bioinformaition mining system. It can be employed to search for genes with specialized function in the designated chromosome region by mining biology sequence data and gene express data in the online biology databases through the Internet. The molecular biologists can apply this system to identify the candidate genes and gather the relevant information. The actual effect of this system has been validated by screening the Human DNA repair genes. |
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| Keywords: | Web data mining biology databases text classification VSM |
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