| 基于小波变换的蛋白质与DNA相互作用的计算机预测 |
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| 引用本文： | 江浩,冯铁男,秦殿刚,王翼飞. 基于小波变换的蛋白质与DNA相互作用的计算机预测[J]. 上海大学学报(自然科学版), 2010, 16(3): 281-285. DOI: 10.3969/j.issn.1007-2861.2010.03.013 |
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| 作者姓名： | 江浩 冯铁男 秦殿刚 王翼飞 |
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| 作者单位： | （上海大学 理学院，上海 200444） |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，上海市重点学科建设资助项目，上海市教委重点学科建设资助项目 |
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| 摘 要： | 蛋白质与DNA的相互作用在细胞的转录调控和DNA修饰等活动中至关重要.将改进的共鸣识别模型应用于预测酵母蛋白质与DNA的相互作用，运用小波变换找出阳性数据和随机数据的信噪比分布的差异，并通过阈值的选取达到了较好的预测结果.同时，将阳性数据与相应复合物的序列进行序列联配，找到了保守位点，进而从结合位点的角度验证了本方法的正确性.
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| 关 键 词： | 共鸣识别模型；离散小波变换；蛋白质与DNA相互作用；信噪比 |
Computational Prediction of Protein-DNA Interaction Based on Wavelet Transform |
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| JIANG Hao,FENG Tie-nan,QIN Dian-gang,WANG Yi-fei. Computational Prediction of Protein-DNA Interaction Based on Wavelet Transform[J]. Journal of Shanghai University(Natural Science), 2010, 16(3): 281-285. DOI: 10.3969/j.issn.1007-2861.2010.03.013 |
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| Authors: | JIANG Hao FENG Tie-nan QIN Dian-gang WANG Yi-fei |
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| Affiliation: | (College of Sciences, Shanghai University, Shanghai 200444, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | resonant recognition model discrete wavelet transform protein-DNA interaction signal-to-noise ratio (SNR), |
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