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柳树NAC基因的克隆与表达模式分析
引用本文:田雪瑶,周洁,王保松,何开跃,何旭东. 柳树NAC基因的克隆与表达模式分析[J]. 南京林业大学学报(自然科学版), 2020, 44(1): 119-124. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201905031
作者姓名:田雪瑶  周洁  王保松  何开跃  何旭东
作者单位:南京林业大学生物与环境学院,江苏 南京210037;江苏省林业科学研究院,江苏 南京211153;江苏省林业科学研究院,江苏 南京211153;江苏省农业种质资源保护与利用平台柳树资源圃,江苏 南京211153;南京林业大学生物与环境学院,江苏 南京210037
基金项目:国家自然科学基金项目(31300556);江苏省林业科学研究院自主科研项目(BM2018022-01)
摘    要:【目的】研究柳树重要抗逆转录因子基因家族,为揭示柳树抗逆分子机制提供理论依据。【方法】以‘苏柳2345’的转录组测序数据为基础,克隆了柳树NAC家族,并分析其序列结构、组织表达特异性以及不同胁迫条件下的表达模式。【结果】克隆的两个柳树NAC转录因子基因分别命名为SlNAC1和SlNAC2。生物信息学分析表明:SlNAC1序列全长为1 126 bp,编码产物含343个氨基酸残基,为稳定的亲水蛋白,定位于细胞核;SlNAC2序列全长为1 139 bp,编码产物含291个氨基酸残基,为稳定的亲水蛋白,定位于叶绿体。两个基因均具有典型的NAM结构域及A、B、C、D、E 5个亚结构域,还包括共同的LPPG、YPNG 和DEE保守基序及NAC抑制结构域。系统进化树分析显示, SlNAC1基因与木薯亲缘关系最近,SlNAC2基因与茄子亲缘关系最近。定量PCR结果显示SlNAC1和SlNAC2均在叶片表达,根中没有表达,为叶片特异性转录因子。定量PCR结果显示SlNAC1基因在脱落酸(ABA)和赤霉素(GA)处理24 h后显著上调,SlNAC2基因在聚乙二醇(PEG)、ABA和GA胁迫后显著上调。【结论】柳树SlNAC1基因在非生物胁迫下表达较为稳定,受ABA和GA胁迫诱导;SlNAC2受干旱、ABA和GA胁迫诱导,受影响明显高于SlNAC1,不受乙烯剂(ETH)胁迫影响。推测SlNAC1和SlNAC2参与GA、ABA信号传导,可能不参与ETH的信号途径。

关 键 词:柳树  NAC基因家族  基因克隆  基因表达
收稿时间:2019-05-22

Cloning and expression pattern analysis of NAC genes in Salix
TIAN Xueyao,ZHOU Jie,WANG Baosong,HE Kaiyue,HE Xudong. Cloning and expression pattern analysis of NAC genes in Salix[J]. Journal of Nanjing Forestry University(Natural Sciences ), 2020, 44(1): 119-124. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201905031
Authors:TIAN Xueyao  ZHOU Jie  WANG Baosong  HE Kaiyue  HE Xudong
Affiliation:(College of Biology and the Environment,Nanjing Forestry University,Nanjing 210037,China;Jiangsu Academy of Forestry,Nanjing 211153,China;Willow Nursery of the Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilization of Agricultural Germplasm,Nanjing 211153,China)
Abstract:
Keywords:Salix  NAC gene family  gene cloning  gene expression
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