| 影响口腔癌发生潜在MicroRNAs的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 赵之新,卢轩,杨铭,赵冰,唐川. 影响口腔癌发生潜在MicroRNAs的生物信息学分析[J]. 华南师范大学学报(自然科学版), 2021, 53(6): 68-73. DOI: 10.6054/j.jscnun.2021095 |
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| 作者姓名： | 赵之新 卢轩 杨铭 赵冰 唐川 |
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| 作者单位： | 大连大学生命科学与技术学院,大连116600 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目21606030辽宁省教育厅科学研究经费项目LJKZ1178大连市高层次人才创新支持计划项目2019RQ118大连大学优秀青年创新创业团队项目XQN202004 |
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| 摘 要： | 为获得口腔癌组织和正常组织之间差异表达的miRNAs，从分子水平研究相关的miRNAs在肿瘤发生发展中的作用，从GEO数据库筛选并下载口腔癌及正常组织的基因芯片，运用GEO2R工具分析筛选口腔癌与正常组织间的差异表达miRNAs. 采用FunRich软件对将所得差异miRNAs进行GO功能注释、KEGG信号通路分析. 通过对GSE124566和GSE113956两个芯片数据进行分析，分别筛选得到109、1 079个差异表达miRNAs，分别包括41、673个上调基因和68、406个下调基因，筛选得到共同差异表达miRNAs有30个，其中上调16个，参与的生物过程主要有细胞间通讯等，细胞成分主要有细胞核等，分子功能主要有转录因子活性等；下调14个，参与的生物过程主要有信号转导等，细胞成分主要有细胞质等，分子功能主要有转录因子活性等. 通过对口腔癌芯片数据的生物信息学分析，发现30个差异表达miRNAs是口腔癌发生、发展的重要miRNAs，囊泡介导的转运，核苷酸的代谢等过程. 最后预测出了13 796个靶基因，并通过PPI互作分析筛选出了联系最紧密的10个靶基因.
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| 关 键 词： | 生物信息学 口腔癌 差异表达miRNAs |
| 收稿时间： | 2020-12-24 |
A Bioinformatics Analysis of Potential MicroRNAs Affecting Oral Cancer Development |
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| Affiliation: | School of Life Sciences and Technologies, Dalian University, Dalian 116600, China |
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