| 基于智能检测的DNA序列载体片段清除工具 |
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| 引用本文： | 李生林,谢洪涛,高黎.基于智能检测的DNA序列载体片段清除工具[J].西南师范大学学报(自然科学版),2010,35(4). |
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| 作者姓名： | 李生林 谢洪涛 高黎 |
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| 作者单位： | 中国人民解放军后勤工程学院,重庆,401311 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目 |
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| 摘 要： | 针对传统DNA载体检测和清除工具的不足,实现一种基于智能检测的DNA载体检测新工具.该工具的核心思想是无需预先给定克隆载体序列模版、剪接位点和克隆适配片段等信息,通过建立从载体出现概率到序列权重的映射,把载体片段的检测转化为求给定序列中具有最大权重的k个不重叠相交的子序列问题,并且引入了罚函数控制避免对载体序列的过度清除.实验结果表明该工具能显著提高载体清除的效率和准确性,在超长序列处理的时候更稳定、错误率更低.
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| 关 键 词： | 智能检测 载体片段 DNA序列 载体清除 |
Intelligent Detection Based on Vector Segments Removal Tool for DNA Sequence |
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| LI Sheng-lin,XIE Hong-tao,GAO Li.Intelligent Detection Based on Vector Segments Removal Tool for DNA Sequence[J].Journal of Southwest China Normal University(Natural Science),2010,35(4). |
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| Authors: | LI Sheng-lin XIE Hong-tao GAO Li |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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