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室温下的小蛋白折叠研究
引用本文:孙淑臻,段莉莉,张庆刚.室温下的小蛋白折叠研究[J].山东师范大学学报(自然科学版),2011,26(4).
作者姓名:孙淑臻  段莉莉  张庆刚
作者单位:山东师范大学物理与电子科学学院,250014,济南
基金项目:国家自然科学基金,中国博士后科学基金
摘    要:目前,无论在实验还是理论研究方面,研究蛋白质的从头折叠即使是小蛋白的折叠也非常困难.在室温下研究蛋白质的折叠过程可以有效的阐述蛋白质折叠机制.笔者从2I9M的线性结构出发,在室温下运行了15 ns的分子动力学模拟,发现它在6.4 ns时成功折叠到了天然态结构,此时的结构与天然态结构的均方根偏差为1.17(A),模拟结构与天然态结构符合的非常好.折叠过程是首先在C端出现了螺旋,随后N端又出现了螺旋,然后螺旋从N端鱼贯式生成,最终形成天然态结构.

关 键 词:蛋白质折叠  219M  均方根偏差(RMSD)  自然接触比例

INSIGHTS INTO FOLDING SIMULATION OF A MINIATURE PROTEIN AT ROOM TEMPERATURE
Sun Shuzhen , Duan Lili , Zhang Qinggang.INSIGHTS INTO FOLDING SIMULATION OF A MINIATURE PROTEIN AT ROOM TEMPERATURE[J].Journal of Shandong Normal University(Natural Science),2011,26(4).
Authors:Sun Shuzhen  Duan Lili  Zhang Qinggang
Abstract:
Keywords:
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