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基于表达序列标签的萝卜ACA36基因簇鉴定
引用本文:徐玲,程加富,胡娜,殷秋平.基于表达序列标签的萝卜ACA36基因簇鉴定[J].四川大学学报(自然科学版),2009,46(5):1543-1547.
作者姓名:徐玲  程加富  胡娜  殷秋平
作者单位:江西科技师范学院生命科学学院,南昌,330013
基金项目:江西省高等学校教学研究省级立项课题,江西科技师范学院自然科学立项课题 
摘    要:利用国际公用的表达序列标签(EST)数据库资源,运用生物信息学分析方法,在萝卜(Raphanus sativus)一条表达序列标签中发现一个新的snoRNA基因簇。此基因簇含有一个box H/ACA snoRNA基因和两个box C/D snoRNA基因,分别命名为RsACA36、RssnoR66和RsSNORD88。ACA36可形成典型的box H/ACA snoRNA双茎环二级结构;snoR66和SNORD88都具有典型的C盒与D盒保守元件,末端存在反向互补序列;三个snoRNA都含有能和核糖体RNA互补配对的反向互补序列。RsACA36和RsSNORD88均为在植物中首次发现。基于EST数据库、运用生物信息学方法鉴定snoRNA基因既保留了计算机RNA组学快捷、高效的优点,又使结果因为有了实验支撑而更直接、可信。

关 键 词:核仁小分子RNA  表达序列标签  生物信息学  ACA36基因簇
修稿时间:6/15/2008 5:54:01 PM

Identification of ACA36 gene cluster in Raphanus sativus from Expressed sequence tags
XU Ling,CHENG Jia-Fu,HU Na,YIN Qiu-Ping.Identification of ACA36 gene cluster in Raphanus sativus from Expressed sequence tags[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2009,46(5):1543-1547.
Authors:XU Ling  CHENG Jia-Fu  HU Na  YIN Qiu-Ping
Institution:School of Life Science, Jiangxi Science and Technology Normal University,School of Life Science, Jiangxi Science and Technology Normal University,School of Life Science, Jiangxi Science and Technology Normal University
Abstract:
Keywords:snoRNA  EST  bioinformatics  ACA36 cluster
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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