蜜蜂球囊菌菌丝和孢子的比较转录组分析 |
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引用本文: | 蒋海宾,杜宇,范小雪,王杰,祝智威,范元婵,熊翠玲,付中民,徐国钧,陈大福,郭睿.蜜蜂球囊菌菌丝和孢子的比较转录组分析[J].四川大学学报(自然科学版),2020,57(6):1177-1185. |
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作者姓名: | 蒋海宾 杜宇 范小雪 王杰 祝智威 范元婵 熊翠玲 付中民 徐国钧 陈大福 郭睿 |
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作者单位: | 福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福建农林大学动物科学学院(蜂学学院);福建农林大学蜂产品加工与应用教育部工程研究中心,福建农林大学动物科学学院(蜂学学院);福建农林大学蜂产品加工与应用教育部工程研究中心,福建农林大学动物科学学院(蜂学学院);福建农林大学蜂产品加工与应用教育部工程研究中心,福建农林大学动物科学学院(蜂学学院);福建农林大学蜂产品加工与应用教育部工程研究中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31702190);国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS 44 KXJ7);福建省自然科学基金(2018J05042);福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JAT170158);福建农林大学杰出青年科研人才计划项目(xjq201814);福建农林大学硕士生导师团队项目;福建农林大学优秀硕士学位论文资助基金(杜宇) |
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摘 要: | 为探究实验室条件下纯培养的蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis)菌丝(AaM)和孢子(AaM)的共有基因、特有基因以及差异表达基因(differentially expressed gene, DEG)与真菌的生长、发育、生殖和致病性的相关性,利用RNA-seq技术和生物信息学方法对AaM和AaS进行比较转录组分析,并结合实时荧光定量PCR验证转录组数据的可靠性.分析结果显示AaM和AaS的共有基因为7 362个,涉及44个功能条目和122条通路;二者的特有基因分别为195和278个.AaM vs AaS比较组含有977个上调基因和687个下调基因,分别涉及32和32个功能条目;此外,上述DEG还涉及糖酵解/糖异生、次级代谢物的生物合成等113条通路.基于比较转录组分析发现球囊菌菌丝和孢子的共有基因、特有基因和DEG可能通过调节细胞活动、代谢进程、内吞作用以及MAPK信号通路等关键途径参与球囊菌的生长、发育和生殖过程.
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关 键 词: | 蜜蜂球囊菌 菌丝 孢子 信号通路 差异表达基因 |
收稿时间: | 2020/1/29 0:00:00 |
修稿时间: | 2020/5/21 0:00:00 |
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