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基于外部知识的药物相互作用关系抽取方法
引用本文:王芳,龙欣,周刚,刘宁宁.基于外部知识的药物相互作用关系抽取方法[J].四川大学学报(自然科学版),2021,58(6):062003.
作者姓名:王芳  龙欣  周刚  刘宁宁
作者单位:四川省医学科学院四川省人民医院辅助生殖医学中心,四川大学计算机学院,四川大学计算机学院,四川大学计算机学院
基金项目:四川省新一代人工智能重大专项(2018GZDZX0039); 四川省重点研发项目(2019YFG0521)
摘    要:药物相互作用是指药物之间存在的抑制或促进等作用. 针对目前方法在不同关系类别上的抽取结果差异较大的问题,论文提出了一种利用外部知识的关系抽取模型,该方法首先对外部药物数据库中的信息进行处理,构建带有药物描述信息的数据集,然后在该数据集上进行模型训练,并保存最优模型,最后将该最优模型与药物关系抽取模型相结合,进行药物关系抽取,从而更好的利用了药物数据库中已有的知识,缓解了不同关系类别抽取结果差异较大的问题,提高了抽取效果. 在DDIExtraction 2013数据集上的实验结果表明,论文方法的F1值优于目前最优方法2.47%.

关 键 词:药物关系抽取  外部知识  双向长短期记忆网络  胶囊网络
收稿时间:2021/6/28 0:00:00
修稿时间:2021/7/15 0:00:00

An Extraction Method for Drug-Drug Relationships based on External Knowledge
WANG Fang,LONG Xin,ZHOU Gang,LIU Ning-Ning.An Extraction Method for Drug-Drug Relationships based on External Knowledge[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2021,58(6):062003.
Authors:WANG Fang  LONG Xin  ZHOU Gang  LIU Ning-Ning
Abstract:
Keywords:Drug Relationship Extraction  External Knowledge  Bidirectional Long Short Term Memory  Capsule network
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