| 中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的可变剪切基因分析 |
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| 引用本文： | 郭睿,李龙,熊翠玲,郑燕珍,付中民,王海朋,赵红霞,陈大福.中华蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的可变剪切基因分析[J].四川大学学报(自然科学版),2018,55(6):1313-1318. |
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| 作者姓名： | 郭睿 李龙 熊翠玲 郑燕珍 付中民 王海朋 赵红霞 陈大福 |
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| 作者单位： | 福建农林大学蜂学学院,福建农林大学蜂学学院,福建农林大学蜂学学院,福建农林大学蜂学学院,福建农林大学蜂学学院,福建农林大学蜂学学院,广东省生物资源应用研究所,福建农林大学蜂学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31702190）; 现代农业产业技术体系建设专项资金（CARS 44 KXJ7）; 福建省教育厅中青年教师教育科研项目（JAT170158）; 福建农林大学科技创新专项基金项目 |
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| 摘 要： | 基于前期已获得的中华蜜蜂(简称中蜂)幼虫肠道转录组数据,利用TopHat2软件在正常(AcCK)及球囊菌胁迫的中蜂幼虫肠道样品(AcT1、AcT2、AcT3)中共鉴定出发生于9124个基因的57327个可变剪切事件,其中以基因间(17.68%)、可变3′端剪切(15.32%)、外显子跨越(14.12%)和可变5′端剪切(12.81%)类型为主.Venn分析结果显示4个肠道样品的共有可变剪切基因数为8111个,特有可变剪切基因数分别为272、189和385个.GO分类结果显示共有可变剪切基因涉及47个条目,AcT1、AcT2、AcT3的特有可变剪切基因分别富集于24、20和34个条目.KEGG代谢通路富集分析结果显示,共有可变剪切基因富集在327个代谢通路,基因富集数最多的是RNA转运、内质网蛋白加工及核糖体;AcT1、AcT2、AcT3的特有可变剪切基因分别富集在22、46和83个代谢通路.结果揭示了可变剪切基因在宿主的胁迫响应过程中的重要作用.
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| 关 键 词： | 中华蜜蜂 幼虫肠道 球囊菌 胁迫 可变剪切 |
| 收稿时间： | 2017/11/9 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/1/10 0:00:00 |
Analysis of the alternatively spliced genes in Apis cerana cerana larval gut under the Ascosphaera apis stress |
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| GUO Rui,LI Long,XIONG Cui-Ling,ZHENG Yan-Zhen,FU Zhong-Min,WANG Hai-Peng,ZHAO Hong-Xia and CHEN Da-Fu.Analysis of the alternatively spliced genes in Apis cerana cerana larval gut under the Ascosphaera apis stress[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2018,55(6):1313-1318. |
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| Authors: | GUO Rui LI Long XIONG Cui-Ling ZHENG Yan-Zhen FU Zhong-Min WANG Hai-Peng ZHAO Hong-Xia and CHEN Da-Fu |
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| Institution: | College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University,Guangdong Institute of Applied Biological Resources,College of Bee Science, Fujian Agriculture and Forestry University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Apis cerana cerana Larval gut Ascosphaera apis Stress Alternative splicing |
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