| 基于低氧-免疫DNA甲基化标记在肺腺癌预后中的开发 |
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| 引用本文： | 熊曙光,周晴,熊沿,高英杰,屈小敏,彭确昆.基于低氧-免疫DNA甲基化标记在肺腺癌预后中的开发[J].四川大学学报(自然科学版),2023,60(1):016001-164. |
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| 作者姓名： | 熊曙光 周晴 熊沿 高英杰 屈小敏 彭确昆 |
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| 作者单位： | 成都医学院第二附属医院呼吸与重症医学科,成都医学院第二附属医院呼吸与重症医学科,成都医学院第二附属医院呼吸与重症医学科,成都医学院生物科学与技术学院,成都医学院生物科学与技术学院,成都医学院生物科学与技术学院 |
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| 基金项目： | 四川省卫健委自然科学基金(20PJ169); 成都医学院 成都市郫都区人民医院联合科研基金(2021LHPG-08); 成都医学院 成都市第七人民医院联合科研基金重点项目(2020LHJYZD-02) |
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| 摘 要： | 为了探究缺氧和免疫联合分析DNA甲基化位点在肺癌预后中的作用，提高肺癌免疫治疗的有效性，本研究基于甲基化和转录组二维数据，构建了一个用于预后评估的风险评分模型．从TCGA数据库中下载了247个与缺氧、免疫状态相关的去冗余肺癌样本作为训练集．然后对低缺氧-强免疫状态的样本、高缺氧-弱免疫状态的样本进行了差异基因表达、甲基化位点和临床生存率分析．生存曲线分析显示，低缺氧状态-强免疫状态组中的肺腺癌患者的1、3、5年生存率均优于高缺氧状态-弱免疫状态组（log-rank检验，P<0.05、P<0.001、P<0.001）．使用LASSO回归构建的多基因预后模型包含9个甲基化位点，在肺腺癌测试数据集和验证数据集中均显示出良好的预后预测能力（AUC=0.83,0.80,0.82）．这9个甲基化位点分别分布在PEBP4、FLI1、HLA-DMB、MYO1F、ABCC2、AKNA、ETS1、CCR7和TXNRD1基因上．此外，我们从5年生存曲线中发现，在低缺氧-强免疫状态组中高表达的PEBP4、CCR7、FLI1、AKNA、HLA-DMB、MYO1F和低表达的ABCC2基因也可作为...
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| 关 键 词： | 肺腺癌 低氧 免疫 DNA甲基化 生存率 |
| 收稿时间： | 2022/7/11 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/9/21 0:00:00 |
Development of a hypoxia-immune-based DNA methylation signature for prognosis in the lung adenocarcinoma |
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| XIONG Shu-Guang,ZHOU Qing,XIONG Yan,GAO Ying-Jie,QU Xiao-Min and PENG Que-Kun.Development of a hypoxia-immune-based DNA methylation signature for prognosis in the lung adenocarcinoma[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2023,60(1):016001-164. |
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| Authors: | XIONG Shu-Guang ZHOU Qing XIONG Yan GAO Ying-Jie QU Xiao-Min and PENG Que-Kun |
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| Institution: | Department of Respiratory and Critical Care Medicine, The Second Affiliated Hospital of Chengdu Medical College,Department of Respiratory and Critical Care Medicine, The Second Affiliated Hospital of Chengdu Medical College,Department of Respiratory and Critical Care Medicine, The Second Affiliated Hospital of Chengdu Medical College,School of Bioscience and Technology, Chengdu Medical College,School of Bioscience and Technology, Chengdu Medical College,School of Bioscience and Technology, Chengdu Medical College |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Lung adenocarcinoma Hypoxia Immune DNA methylation Survival rate |
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