| 尼克酰胺核苷构象稳定性的理论研究 |
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| 引用本文： | 李强根,薛英.尼克酰胺核苷构象稳定性的理论研究[J].四川大学学报(自然科学版),2015,52(1):123-133. |
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| 作者姓名： | 李强根 薛英 |
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| 作者单位： | 1. 四川师范大学化学与材料科学学院,成都,610066
2. 四川大学化学学院,成都,610064 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(21173151)；四川省教育厅基金(13ZB0160) |
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| 摘 要： | 采用从头算(HF与MP2)和密度泛函理论(DFT)方法,在3-21G 和6-31+G?水平上研究了尼克酰胺核苷(NR)的构象.分别探讨了在气相及液相(水和氯仿)中 NR 分子和一水合物异构体的相对稳定性,分析了溶剂分子的参与对NR异构体的相对稳定性和几何结构参数的影响.结果表明：孤立的NR分子在气相中存在36种稳定构象,其中最稳定的为南式构象NR-S,而最稳定的北式构象为NR-K’,能量比前者高出10.6 kJ/mol (ΔG298K).NR 分子中酰胺基团优势构象为反式,ω,P 或γ参数的改变可以为 NR 分子提供大约8.4~23.7 kJ/mol(ΔG298K )稳定化能.不管是南式还是北式褶皱,最稳定 NR 分子构象中都存在多根分子内氢键,且5’-OH 基团都为顺式构象(γ≈-63°).溶剂效应使一部分NR分子构象相对稳定性降低,而一部分则升高,改变了NR分子各构象的相对稳定性顺序.水分子的加入与酰胺基团结合形成氢键,对NR分子的构型影响较大,而与糖环上羟基结合形成氢键,则影响较小.
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| 关 键 词： | 尼克酰胺核苷 构象稳定性 平滑势能面扫描 格子搜寻方法 密度泛函理论 从头算 Hartree-Fock方法 溶剂效应 |
| 收稿时间： | 2013/9/25 0:00:00 |
Theoretical studies on the conformational preferences of nicotinamide riboside |
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| LI Qiang-Gen and XUE Ying.Theoretical studies on the conformational preferences of nicotinamide riboside[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2015,52(1):123-133. |
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| Authors: | LI Qiang-Gen and XUE Ying |
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| Institution: | College of Chemistry and Material Science, Sichuan Normal University;College of Chemistry, Sichuan University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Nicotinamide riboside Conformational preference Relaxed potential energy surface scan GRID search method Density functional theory Ab initio Hartree Fock method Solvent effect |
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